Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4L1W8

Protein Details
Accession A0A4S4L1W8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
370-393TAFQCGKCKKWETRYRQAQTRSADHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022617  Rad60/SUMO-like_dom  
IPR003617  TFIIS/CRSP70_N_sub  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF11976  Rad60-SLD  
PF01096  TFIIS_C  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS51319  TFIIS_N  
PS50053  UBIQUITIN_2  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd16116  Ubl_Smt3_like  
cd13749  Zn-ribbon_TFIIS  
Amino Acid Sequences MSDEEQHPPAQDEHNEEQVPKTEDANAPINIKVVSAAGEEIFFKIKRSTKLSKLQAAYASKVGKEVGTIRFLFDGSRINEDDTPASLDMEENDTIDVMVELDTKAYVGIDRQDWNSRAEQDMSDVVELKKLAKALQTGTPEILKKDAVVTESALRQSKAGLAVGKLRSHPSKDVADLAKELVKKWKTDVQKQSGPAKVGSSSSTANPIPSRKASVADSIASPTTPIGSSFNKGQGRSAKTDGVIIKVTGDKTRDKCIELIYDSLSFDSGAPNDLILEQATSIEAVVLSDHNHDTGKDYKGKIRSLYLNLKDKNNPSLRNDIVSGDLAVSKFCRMTSQEMASEERKAADKAIQEENFHKSLGAEEQQAETTAFQCGKCKKWETRYRQAQTRSADEPMTTFVTYVSLVTHQRCIRIYYSPPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.4
4 0.39
5 0.4
6 0.41
7 0.34
8 0.31
9 0.29
10 0.31
11 0.35
12 0.37
13 0.34
14 0.31
15 0.3
16 0.3
17 0.24
18 0.22
19 0.18
20 0.12
21 0.11
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.14
29 0.13
30 0.15
31 0.2
32 0.26
33 0.32
34 0.39
35 0.46
36 0.52
37 0.62
38 0.68
39 0.7
40 0.66
41 0.64
42 0.64
43 0.59
44 0.53
45 0.48
46 0.42
47 0.33
48 0.32
49 0.28
50 0.21
51 0.19
52 0.22
53 0.2
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.21
60 0.18
61 0.21
62 0.18
63 0.22
64 0.22
65 0.24
66 0.25
67 0.26
68 0.25
69 0.2
70 0.21
71 0.16
72 0.16
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.13
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.09
96 0.11
97 0.14
98 0.17
99 0.23
100 0.24
101 0.27
102 0.29
103 0.28
104 0.27
105 0.26
106 0.24
107 0.2
108 0.2
109 0.18
110 0.15
111 0.16
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.16
122 0.21
123 0.23
124 0.23
125 0.23
126 0.25
127 0.23
128 0.22
129 0.21
130 0.15
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.17
150 0.2
151 0.21
152 0.2
153 0.23
154 0.24
155 0.25
156 0.27
157 0.25
158 0.25
159 0.24
160 0.28
161 0.26
162 0.24
163 0.22
164 0.2
165 0.19
166 0.17
167 0.17
168 0.2
169 0.21
170 0.2
171 0.22
172 0.28
173 0.31
174 0.41
175 0.49
176 0.48
177 0.52
178 0.55
179 0.59
180 0.55
181 0.5
182 0.41
183 0.33
184 0.26
185 0.22
186 0.19
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.19
198 0.16
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.11
216 0.13
217 0.2
218 0.22
219 0.22
220 0.25
221 0.29
222 0.32
223 0.34
224 0.35
225 0.29
226 0.27
227 0.31
228 0.28
229 0.23
230 0.2
231 0.16
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.13
236 0.15
237 0.19
238 0.21
239 0.28
240 0.29
241 0.28
242 0.29
243 0.29
244 0.3
245 0.25
246 0.24
247 0.19
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.13
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.12
281 0.17
282 0.21
283 0.24
284 0.26
285 0.32
286 0.37
287 0.41
288 0.39
289 0.4
290 0.41
291 0.42
292 0.5
293 0.51
294 0.55
295 0.55
296 0.58
297 0.58
298 0.55
299 0.57
300 0.55
301 0.52
302 0.47
303 0.51
304 0.48
305 0.45
306 0.43
307 0.34
308 0.29
309 0.25
310 0.21
311 0.14
312 0.14
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.13
320 0.14
321 0.21
322 0.26
323 0.3
324 0.32
325 0.34
326 0.38
327 0.36
328 0.35
329 0.29
330 0.25
331 0.23
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.22
336 0.24
337 0.33
338 0.33
339 0.34
340 0.37
341 0.4
342 0.37
343 0.33
344 0.29
345 0.2
346 0.2
347 0.22
348 0.22
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.21
355 0.16
356 0.13
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.22
361 0.26
362 0.31
363 0.39
364 0.46
365 0.52
366 0.61
367 0.71
368 0.73
369 0.79
370 0.85
371 0.85
372 0.87
373 0.84
374 0.81
375 0.76
376 0.72
377 0.65
378 0.57
379 0.49
380 0.4
381 0.35
382 0.31
383 0.28
384 0.22
385 0.18
386 0.15
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.12
391 0.13
392 0.18
393 0.2
394 0.28
395 0.29
396 0.33
397 0.35
398 0.37
399 0.35
400 0.38
401 0.41