FuNGI

A0A4S4K9R3

Protein Details

Accession

A0A4S4K9R3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
224-250	HDARESILKQRKEKREKGKERANAAQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
231-244	LKQRKEKREKGKER

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, pero 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MSESSSADLLSFTKLGESNYPTWEYDMRAALQVKKLWRLTSGNESKPSSPPEKVELWEEKAEQAAGLIYQKLEHGMQILVQKYMDDPIKMWGELEKMQHQDNPASRFIAYDQFFSITKKEDESLTALTARVEDALHKMRNSRNSALTLKDFEDELAAVALVRALPMEYSSFRSALLLLTNFDFKTVKDAFLQEQKNRQPRAADSALALSSAHKGHTEAQCFKRHDARESILKQRKEKREKGKERANAAQQETSASAPTSVQSAEFAGNASTHDYTNPHSPLLSDAGSDWIVDTGATCHMTPHRHWFNTYTPNHTPIQLANNQIIYSVGLGSVRFQPVINGKPGRLLEFERVLHVPDLRNNLLSVLYLTRAKSYIVTIQHDQIFFKRNGALLFTAAINSNNAASINGQVVPMTQFSGMVSTCPLDLTLWHRRFAHLNHGDVKKLIQEDLVKGIVVKSKDLPDPICEPCIAGKQHRSNVSKLASHHASGLLELVHSDVHGPLPVQTRHGYHYWITFIDDHSRHWAVMPLKKKSDAFAAFKHFKAYAENQLNLKIKATRDDKGGEYMPREWDQFCNSEGIHRQHTIRAEPHQNGVAERANRTLVEGITTMLNEAHLPATFWWDAVAAFVHVHNRSPTSAVQGKTPFELWHKSKPDVSHFRVFGCTSYVHVKKDLRRQLESHTQKCVFLGYPAHFKGWTFWNPITCKEVISDICQGNGISFATNGVAERANRTLVEGITTMLNEAHLPATFWWDAVAAFVHVHNRSPTSAVQGKTPFELWHKSKPDVSHFRVFGCTSYVHVKKDLRRQLESHTQKCVFLGYPAHFKGWTFWNPITCKEVISDSAQFDERVFPGNSRTPVDLQVPSPPETSDPIEQVGVESNSDDDDTVPLPPLPDSPATPPMPPPQNSPPPVTPVTPAHPSTKRERSPSDLPPESPKKPKVQSSAPEWRPRPRPLTSFRDALINPLMDYPGRRIPRPAPEIHPAPQPAPVSETEPVQVQQSDEEDRDELDLMSEDEMQAEALMFTGLMDFGANAGLEDQYIAFEDAFDYVLKSTNHFQHVFSAEVRKQYGPEPYQWKDIRGRPDAHLWEQAAMEEFISLVENGTFTPVRLPSDRKTIGCRWVFKLKRKADGSVDRYKARLVAKGFSQRPGLEFSQVFAPTAKW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.21
4	0.26
5	0.26
6	0.31
7	0.34
8	0.31
9	0.33
10	0.33
11	0.31
12	0.29
13	0.29
14	0.26
15	0.29
16	0.32
17	0.34
18	0.38
19	0.39
20	0.4
21	0.45
22	0.47
23	0.43
24	0.45
25	0.45
26	0.45
27	0.51
28	0.55
29	0.54
30	0.56
31	0.59
32	0.56
33	0.57
34	0.58
35	0.53
36	0.48
37	0.45
38	0.43
39	0.44
40	0.43
41	0.45
42	0.45
43	0.44
44	0.45
45	0.42
46	0.37
47	0.35
48	0.33
49	0.24
50	0.18
51	0.14
52	0.1
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.11
63	0.14
64	0.19
65	0.2
66	0.19
67	0.18
68	0.18
69	0.17
70	0.22
71	0.22
72	0.17
73	0.17
74	0.22
75	0.25
76	0.25
77	0.24
78	0.21
79	0.22
80	0.25
81	0.3
82	0.3
83	0.29
84	0.32
85	0.34
86	0.34
87	0.38
88	0.41
89	0.4
90	0.36
91	0.35
92	0.33
93	0.31
94	0.3
95	0.31
96	0.26
97	0.23
98	0.22
99	0.23
100	0.24
101	0.25
102	0.25
103	0.21
104	0.21
105	0.22
106	0.22
107	0.21
108	0.23
109	0.25
110	0.24
111	0.22
112	0.21
113	0.19
114	0.18
115	0.17
116	0.15
117	0.12
118	0.1
119	0.09
120	0.15
121	0.22
122	0.25
123	0.26
124	0.32
125	0.37
126	0.46
127	0.51
128	0.5
129	0.47
130	0.5
131	0.52
132	0.51
133	0.49
134	0.43
135	0.38
136	0.34
137	0.29
138	0.23
139	0.21
140	0.16
141	0.13
142	0.1
143	0.08
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.05
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.05
153	0.08
154	0.09
155	0.15
156	0.17
157	0.17
158	0.17
159	0.18
160	0.17
161	0.16
162	0.18
163	0.14
164	0.13
165	0.14
166	0.17
167	0.16
168	0.17
169	0.17
170	0.13
171	0.19
172	0.19
173	0.19
174	0.19
175	0.22
176	0.25
177	0.34
178	0.41
179	0.39
180	0.46
181	0.54
182	0.6
183	0.6
184	0.58
185	0.53
186	0.5
187	0.53
188	0.47
189	0.39
190	0.31
191	0.32
192	0.29
193	0.25
194	0.21
195	0.13
196	0.14
197	0.13
198	0.12
199	0.1
200	0.12
201	0.19
202	0.25
203	0.31
204	0.37
205	0.42
206	0.5
207	0.53
208	0.56
209	0.57
210	0.54
211	0.53
212	0.51
213	0.5
214	0.51
215	0.53
216	0.6
217	0.6
218	0.62
219	0.65
220	0.69
221	0.75
222	0.75
223	0.8
224	0.8
225	0.83
226	0.88
227	0.9
228	0.9
229	0.86
230	0.83
231	0.81
232	0.78
233	0.73
234	0.66
235	0.58
236	0.48
237	0.42
238	0.37
239	0.29
240	0.22
241	0.15
242	0.12
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.11
260	0.12
261	0.14
262	0.21
263	0.22
264	0.2
265	0.19
266	0.19
267	0.2
268	0.22
269	0.19
270	0.12
271	0.11
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.11
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.05
281	0.07
282	0.09
283	0.08
284	0.1
285	0.14
286	0.18
287	0.2
288	0.29
289	0.36
290	0.36
291	0.38
292	0.4
293	0.44
294	0.5
295	0.51
296	0.48
297	0.43
298	0.45
299	0.44
300	0.41
301	0.35
302	0.27
303	0.31
304	0.27
305	0.26
306	0.24
307	0.24
308	0.23
309	0.22
310	0.19
311	0.13
312	0.1
313	0.08
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.1
322	0.13
323	0.18
324	0.22
325	0.27
326	0.25
327	0.25
328	0.3
329	0.3
330	0.3
331	0.27
332	0.26
333	0.24
334	0.27
335	0.27
336	0.24
337	0.24
338	0.23
339	0.22
340	0.22
341	0.19
342	0.18
343	0.24
344	0.22
345	0.22
346	0.21
347	0.2
348	0.18
349	0.16
350	0.13
351	0.08
352	0.09
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.12
359	0.13
360	0.17
361	0.18
362	0.22
363	0.23
364	0.26
365	0.29
366	0.28
367	0.27
368	0.24
369	0.26
370	0.22
371	0.22
372	0.2
373	0.19
374	0.18
375	0.2
376	0.18
377	0.13
378	0.13
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.08
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.05
411	0.06
412	0.13
413	0.22
414	0.24
415	0.27
416	0.27
417	0.28
418	0.32
419	0.33
420	0.37
421	0.31
422	0.33
423	0.38
424	0.39
425	0.38
426	0.34
427	0.33
428	0.24
429	0.21
430	0.18
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.16
435	0.16
436	0.13
437	0.12
438	0.13
439	0.14
440	0.13
441	0.13
442	0.12
443	0.15
444	0.17
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.23
449	0.23
450	0.22
451	0.19
452	0.18
453	0.17
454	0.21
455	0.2
456	0.19
457	0.26
458	0.31
459	0.36
460	0.44
461	0.45
462	0.41
463	0.46
464	0.45
465	0.4
466	0.36
467	0.37
468	0.3
469	0.28
470	0.27
471	0.21
472	0.18
473	0.15
474	0.14
475	0.08
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.08
487	0.13
488	0.14
489	0.16
490	0.17
491	0.18
492	0.21
493	0.22
494	0.21
495	0.16
496	0.18
497	0.17
498	0.15
499	0.15
500	0.13
501	0.14
502	0.18
503	0.17
504	0.17
505	0.2
506	0.2
507	0.19
508	0.18
509	0.22
510	0.2
511	0.25
512	0.31
513	0.3
514	0.31
515	0.34
516	0.34
517	0.3
518	0.33
519	0.33
520	0.3
521	0.29
522	0.35
523	0.35
524	0.35
525	0.36
526	0.29
527	0.24
528	0.24
529	0.24
530	0.25
531	0.27
532	0.28
533	0.27
534	0.33
535	0.34
536	0.31
537	0.29
538	0.22
539	0.19
540	0.24
541	0.27
542	0.23
543	0.23
544	0.25
545	0.25
546	0.25
547	0.27
548	0.21
549	0.2
550	0.2
551	0.2
552	0.19
553	0.19
554	0.17
555	0.16
556	0.17
557	0.16
558	0.15
559	0.14
560	0.13
561	0.14
562	0.19
563	0.2
564	0.2
565	0.2
566	0.21
567	0.22
568	0.24
569	0.24
570	0.21
571	0.24
572	0.27
573	0.26
574	0.27
575	0.27
576	0.26
577	0.23
578	0.23
579	0.21
580	0.17
581	0.16
582	0.16
583	0.14
584	0.13
585	0.14
586	0.13
587	0.09
588	0.09
589	0.08
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.05
595	0.06
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.04
600	0.05
601	0.05
602	0.09
603	0.08
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.04
611	0.05
612	0.05
613	0.08
614	0.08
615	0.09
616	0.1
617	0.11
618	0.11
619	0.13
620	0.13
621	0.16
622	0.21
623	0.2
624	0.24
625	0.25
626	0.25
627	0.24
628	0.25
629	0.2
630	0.18
631	0.24
632	0.24
633	0.3
634	0.33
635	0.33
636	0.36
637	0.37
638	0.43
639	0.45
640	0.47
641	0.44
642	0.41
643	0.41
644	0.4
645	0.38
646	0.29
647	0.22
648	0.17
649	0.13
650	0.19
651	0.21
652	0.2
653	0.24
654	0.28
655	0.32
656	0.42
657	0.47
658	0.44
659	0.45
660	0.46
661	0.48
662	0.54
663	0.56
664	0.49
665	0.49
666	0.45
667	0.42
668	0.4
669	0.36
670	0.25
671	0.19
672	0.2
673	0.15
674	0.2
675	0.21
676	0.22
677	0.2
678	0.2
679	0.2
680	0.22
681	0.24
682	0.22
683	0.22
684	0.28
685	0.29
686	0.31
687	0.32
688	0.27
689	0.23
690	0.19
691	0.22
692	0.16
693	0.18
694	0.22
695	0.18
696	0.18
697	0.18
698	0.17
699	0.14
700	0.14
701	0.11
702	0.06
703	0.05
704	0.06
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.07
710	0.07
711	0.1
712	0.1
713	0.11
714	0.1
715	0.11
716	0.11
717	0.09
718	0.1
719	0.08
720	0.08
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.05
725	0.06
726	0.04
727	0.05
728	0.05
729	0.04
730	0.05
731	0.05
732	0.09
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.08
740	0.04
741	0.05
742	0.05
743	0.08
744	0.08
745	0.09
746	0.1
747	0.11
748	0.11
749	0.13
750	0.13
751	0.16
752	0.21
753	0.2
754	0.24
755	0.25
756	0.25
757	0.24
758	0.25
759	0.2
760	0.18
761	0.24
762	0.24
763	0.3
764	0.33
765	0.33
766	0.36
767	0.37
768	0.43
769	0.45
770	0.47
771	0.44
772	0.41
773	0.41
774	0.4
775	0.38
776	0.29
777	0.22
778	0.17
779	0.13
780	0.19
781	0.21
782	0.2
783	0.24
784	0.28
785	0.32
786	0.42
787	0.47
788	0.44
789	0.45
790	0.46
791	0.48
792	0.54
793	0.56
794	0.49
795	0.49
796	0.45
797	0.42
798	0.4
799	0.36
800	0.25
801	0.19
802	0.2
803	0.15
804	0.2
805	0.21
806	0.22
807	0.2
808	0.2
809	0.2
810	0.22
811	0.24
812	0.22
813	0.22
814	0.28
815	0.29
816	0.31
817	0.32
818	0.27
819	0.23
820	0.2
821	0.2
822	0.16
823	0.19
824	0.2
825	0.17
826	0.19
827	0.19
828	0.18
829	0.17
830	0.17
831	0.14
832	0.16
833	0.16
834	0.15
835	0.19
836	0.24
837	0.26
838	0.26
839	0.28
840	0.25
841	0.28
842	0.31
843	0.28
844	0.23
845	0.27
846	0.27
847	0.27
848	0.26
849	0.23
850	0.21
851	0.22
852	0.25
853	0.21
854	0.19
855	0.18
856	0.18
857	0.17
858	0.16
859	0.17
860	0.13
861	0.11
862	0.1
863	0.09
864	0.09
865	0.1
866	0.09
867	0.06
868	0.07
869	0.07
870	0.08
871	0.09
872	0.09
873	0.09
874	0.09
875	0.1
876	0.11
877	0.12
878	0.14
879	0.17
880	0.24
881	0.25
882	0.26
883	0.28
884	0.33
885	0.39
886	0.38
887	0.41
888	0.43
889	0.5
890	0.52
891	0.55
892	0.49
893	0.48
894	0.49
895	0.43
896	0.38
897	0.33
898	0.35
899	0.34
900	0.34
901	0.36
902	0.39
903	0.42
904	0.47
905	0.53
906	0.54
907	0.56
908	0.58
909	0.58
910	0.6
911	0.65
912	0.65
913	0.59
914	0.55
915	0.58
916	0.61
917	0.6
918	0.61
919	0.58
920	0.57
921	0.6
922	0.66
923	0.64
924	0.65
925	0.66
926	0.66
927	0.72
928	0.7
929	0.73
930	0.69
931	0.7
932	0.69
933	0.69
934	0.66
935	0.62
936	0.63
937	0.62
938	0.66
939	0.62
940	0.58
941	0.51
942	0.52
943	0.45
944	0.4
945	0.36
946	0.28
947	0.24
948	0.22
949	0.22
950	0.16
951	0.18
952	0.18
953	0.22
954	0.25
955	0.25
956	0.3
957	0.36
958	0.45
959	0.5
960	0.5
961	0.48
962	0.52
963	0.56
964	0.54
965	0.54
966	0.46
967	0.41
968	0.41
969	0.37
970	0.3
971	0.28
972	0.26
973	0.24
974	0.23
975	0.23
976	0.19
977	0.19
978	0.19
979	0.18
980	0.18
981	0.14
982	0.15
983	0.17
984	0.19
985	0.18
986	0.2
987	0.17
988	0.17
989	0.18
990	0.16
991	0.13
992	0.11
993	0.11
994	0.09
995	0.1
996	0.1
997	0.09
998	0.08
999	0.08
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.05
1004	0.04
1005	0.04
1006	0.04
1007	0.04
1008	0.04
1009	0.04
1010	0.04
1011	0.04
1012	0.03
1013	0.04
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.04
1017	0.05
1018	0.05
1019	0.05
1020	0.06
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.07
1024	0.08
1025	0.07
1026	0.07
1027	0.07
1028	0.08
1029	0.09
1030	0.08
1031	0.08
1032	0.07
1033	0.13
1034	0.13
1035	0.16
1036	0.22
1037	0.28
1038	0.34
1039	0.34
1040	0.35
1041	0.36
1042	0.39
1043	0.38
1044	0.35
1045	0.37
1046	0.34
1047	0.37
1048	0.39
1049	0.33
1050	0.32
1051	0.34
1052	0.4
1053	0.35
1054	0.41
1055	0.45
1056	0.46
1057	0.54
1058	0.54
1059	0.56
1060	0.55
1061	0.58
1062	0.58
1063	0.57
1064	0.57
1065	0.52
1066	0.59
1067	0.6
1068	0.56
1069	0.55
1070	0.47
1071	0.42
1072	0.38
1073	0.35
1074	0.28
1075	0.22
1076	0.18
1077	0.11
1078	0.1
1079	0.08
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.06
1083	0.06
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.1
1089	0.15
1090	0.17
1091	0.22
1092	0.27
1093	0.32
1094	0.33
1095	0.43
1096	0.48
1097	0.46
1098	0.52
1099	0.54
1100	0.58
1101	0.6
1102	0.61
1103	0.57
1104	0.62
1105	0.67
1106	0.7
1107	0.74
1108	0.71
1109	0.74
1110	0.72
1111	0.72
1112	0.71
1113	0.73
1114	0.71
1115	0.7
1116	0.7
1117	0.62
1118	0.59
1119	0.54
1120	0.5
1121	0.42
1122	0.42
1123	0.35
1124	0.34
1125	0.4
1126	0.49
1127	0.5
1128	0.49
1129	0.51
1130	0.46
1131	0.45
1132	0.46
1133	0.4
1134	0.36
1135	0.33
1136	0.31
1137	0.32
1138	0.32
1139	0.3

A0A4S4K9R3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer