FuNGI

A0A4V3XA49

Protein Details

Accession

A0A4V3XA49

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
161-194	TTDAKGKEEDKKKKDDKSKDTKPQQQQQQAQSAF	Hydrophilic
677-701	VPTPEPTTCPKRNRKLTRRAKGLEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
101-123	GGSGRGGGRGRGRGRGGRGSRGR
171-174	KKKK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, cysk 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

LDEIEQTKERLDDLGHAINDASYISAIVKATPKAFQSIIDSSTNAIDTYNLINPVAPRRLTPTMLLTALREGHSKHNLLNPVKKSEQANYANNNSNSGKEGGSGRGGGRGRGRGRGGRGSRGRGSNQGSVYSERKCYNCGGKGHYSKMCPSPKRDQANEATTDAKGKEEDKKKKDDKSKDTKPQQQQQQAQSAFIEEITDETAWSAQTDQHIRIDAFDSGASLHLTPEKERLLNIRSCDPVSIRAANGSTFQANLEGELNLVIPNGNNRSVIPLRNVKYAPAMHSTLISISKLDADGYKVLIGNNRLTISSPSGKFLGSIERFNDIYATRWHGHCASLADTAFSAEKLSLSDIHRRLGHVNYGYLRKMIRDGKLVGMALDETRSEEEECIPCVLAKIRHTPIPHQRQSELATAFGDRFHMDIWGPAKVRASGHGLYALTIVDDATRWLQMSVMQRKSDSFARYVAWQTFLKTNFGITIKQLQSDNDGAFLSSEFKSYLESMGTEQRLTVHDTPQQNGVAERTHGTIFNAIRANMNNSALPTWLWGECLGYVTFIYNRTPNAALNYRSPYEARFGQIPDLSDIYQFGQPCVVRLETAPKLGDRGTMCRWLGPDEKSNGHRIYHPTQHKISIERNIVMLKPQTPDIQEEKECVDIGPDSENVENLQQQTNLPSVPDERVPTPEPTTCPKRNRKLTRRAKGLELMDEDPDDQSAEEEANEVNRVEAMIASGGDPLDDPTTISQLGKRTDGDYWWSAMHEEVRILEKRGTWEYAYPPPNSNIIESKFVFRTKRNADGSIEKYKARLVARGFTQVDGVDYYSDDTFAPVTRLSSVRSILSYAAANNWEIHQIDIKSAYLYGELEDDETIFMRPPQHYELNGIQPGQVLRLRKALYGLKQAGRRCILFSHVDDLTLISNETSRIRMLKDKIGAQVEYTDGGEINWLLGVEIKRDRAKRTIMMCQFSYLETILTRYGFKDAHPTNTPMDPHLRLSIEQCPTTNDEIAEMSKRPYAAAVGALRYAADVTRPDIAYAVGQLASIYARRRKTDGMSTEGRHAISGYVFKLFGSAISWSSKRQTLVVLSTTEAEYVALTHAAREAIWLRALLSQVFKLKHLPVEIHCDNQSAIALSAENHFHARTKHIDIQYHFIRQCVADGKILVPYVPTDDQEADIFTKALPPIKVKRFTDRLGLRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.26
4	0.25
5	0.23
6	0.23
7	0.18
8	0.12
9	0.06
10	0.06
11	0.06
12	0.09
13	0.09
14	0.12
15	0.16
16	0.18
17	0.2
18	0.23
19	0.24
20	0.26
21	0.27
22	0.26
23	0.29
24	0.29
25	0.31
26	0.29
27	0.28
28	0.25
29	0.26
30	0.24
31	0.18
32	0.14
33	0.11
34	0.11
35	0.14
36	0.17
37	0.16
38	0.16
39	0.17
40	0.2
41	0.27
42	0.31
43	0.28
44	0.26
45	0.33
46	0.37
47	0.38
48	0.38
49	0.36
50	0.34
51	0.35
52	0.34
53	0.28
54	0.27
55	0.28
56	0.26
57	0.23
58	0.22
59	0.28
60	0.33
61	0.34
62	0.34
63	0.38
64	0.46
65	0.51
66	0.57
67	0.54
68	0.56
69	0.56
70	0.57
71	0.54
72	0.5
73	0.53
74	0.52
75	0.54
76	0.53
77	0.58
78	0.62
79	0.59
80	0.58
81	0.5
82	0.43
83	0.39
84	0.33
85	0.27
86	0.2
87	0.23
88	0.2
89	0.21
90	0.22
91	0.19
92	0.25
93	0.25
94	0.27
95	0.3
96	0.35
97	0.36
98	0.41
99	0.46
100	0.45
101	0.5
102	0.56
103	0.55
104	0.57
105	0.61
106	0.62
107	0.63
108	0.63
109	0.6
110	0.58
111	0.59
112	0.55
113	0.5
114	0.46
115	0.42
116	0.41
117	0.43
118	0.38
119	0.38
120	0.36
121	0.35
122	0.34
123	0.38
124	0.42
125	0.44
126	0.46
127	0.47
128	0.53
129	0.58
130	0.62
131	0.61
132	0.56
133	0.54
134	0.58
135	0.61
136	0.57
137	0.59
138	0.62
139	0.66
140	0.72
141	0.7
142	0.69
143	0.67
144	0.67
145	0.64
146	0.55
147	0.48
148	0.39
149	0.39
150	0.31
151	0.25
152	0.2
153	0.2
154	0.28
155	0.36
156	0.46
157	0.49
158	0.6
159	0.66
160	0.74
161	0.81
162	0.82
163	0.82
164	0.82
165	0.87
166	0.87
167	0.9
168	0.9
169	0.9
170	0.89
171	0.88
172	0.87
173	0.85
174	0.81
175	0.8
176	0.71
177	0.62
178	0.52
179	0.44
180	0.34
181	0.25
182	0.19
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.14
195	0.18
196	0.19
197	0.21
198	0.24
199	0.24
200	0.24
201	0.25
202	0.2
203	0.17
204	0.15
205	0.13
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.08
210	0.08
211	0.11
212	0.13
213	0.14
214	0.18
215	0.2
216	0.2
217	0.21
218	0.26
219	0.28
220	0.31
221	0.33
222	0.33
223	0.33
224	0.33
225	0.34
226	0.3
227	0.28
228	0.29
229	0.28
230	0.23
231	0.23
232	0.23
233	0.22
234	0.22
235	0.19
236	0.15
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.11
241	0.12
242	0.11
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.09
252	0.12
253	0.13
254	0.13
255	0.14
256	0.2
257	0.23
258	0.26
259	0.27
260	0.33
261	0.35
262	0.4
263	0.41
264	0.35
265	0.38
266	0.37
267	0.35
268	0.31
269	0.3
270	0.24
271	0.24
272	0.24
273	0.2
274	0.19
275	0.16
276	0.11
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.12
286	0.11
287	0.12
288	0.15
289	0.17
290	0.16
291	0.18
292	0.18
293	0.17
294	0.18
295	0.19
296	0.21
297	0.25
298	0.24
299	0.24
300	0.24
301	0.23
302	0.22
303	0.21
304	0.25
305	0.21
306	0.23
307	0.22
308	0.24
309	0.25
310	0.24
311	0.25
312	0.16
313	0.16
314	0.17
315	0.21
316	0.2
317	0.21
318	0.23
319	0.22
320	0.23
321	0.22
322	0.21
323	0.18
324	0.19
325	0.18
326	0.16
327	0.15
328	0.15
329	0.13
330	0.11
331	0.09
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.08
336	0.11
337	0.13
338	0.22
339	0.23
340	0.27
341	0.27
342	0.28
343	0.3
344	0.28
345	0.31
346	0.24
347	0.26
348	0.26
349	0.28
350	0.27
351	0.26
352	0.24
353	0.19
354	0.24
355	0.26
356	0.25
357	0.26
358	0.27
359	0.28
360	0.3
361	0.29
362	0.23
363	0.18
364	0.16
365	0.11
366	0.1
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.12
374	0.13
375	0.14
376	0.13
377	0.13
378	0.11
379	0.12
380	0.15
381	0.15
382	0.17
383	0.23
384	0.25
385	0.29
386	0.31
387	0.37
388	0.44
389	0.51
390	0.54
391	0.5
392	0.49
393	0.48
394	0.5
395	0.48
396	0.38
397	0.28
398	0.23
399	0.2
400	0.2
401	0.16
402	0.14
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.09
409	0.11
410	0.14
411	0.14
412	0.15
413	0.16
414	0.17
415	0.17
416	0.17
417	0.2
418	0.17
419	0.17
420	0.18
421	0.17
422	0.16
423	0.16
424	0.13
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.1
437	0.19
438	0.27
439	0.3
440	0.3
441	0.3
442	0.31
443	0.34
444	0.35
445	0.28
446	0.21
447	0.19
448	0.19
449	0.21
450	0.23
451	0.21
452	0.2
453	0.18
454	0.18
455	0.21
456	0.21
457	0.21
458	0.18
459	0.17
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.13
464	0.2
465	0.19
466	0.21
467	0.21
468	0.19
469	0.21
470	0.23
471	0.21
472	0.14
473	0.13
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.1
478	0.08
479	0.09
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.1
485	0.07
486	0.08
487	0.09
488	0.14
489	0.14
490	0.13
491	0.12
492	0.13
493	0.14
494	0.18
495	0.18
496	0.16
497	0.21
498	0.23
499	0.24
500	0.25
501	0.24
502	0.2
503	0.19
504	0.17
505	0.13
506	0.12
507	0.12
508	0.11
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.14
513	0.13
514	0.16
515	0.17
516	0.15
517	0.16
518	0.17
519	0.19
520	0.16
521	0.17
522	0.13
523	0.12
524	0.12
525	0.11
526	0.11
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.08
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.11
545	0.12
546	0.12
547	0.15
548	0.18
549	0.19
550	0.21
551	0.24
552	0.22
553	0.22
554	0.22
555	0.19
556	0.18
557	0.18
558	0.16
559	0.15
560	0.14
561	0.16
562	0.16
563	0.16
564	0.14
565	0.14
566	0.13
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.11
571	0.1
572	0.09
573	0.11
574	0.1
575	0.11
576	0.12
577	0.11
578	0.09
579	0.1
580	0.15
581	0.13
582	0.15
583	0.15
584	0.13
585	0.14
586	0.14
587	0.17
588	0.13
589	0.16
590	0.16
591	0.2
592	0.2
593	0.2
594	0.21
595	0.2
596	0.23
597	0.22
598	0.24
599	0.22
600	0.25
601	0.26
602	0.3
603	0.28
604	0.25
605	0.26
606	0.28
607	0.3
608	0.35
609	0.38
610	0.38
611	0.38
612	0.41
613	0.39
614	0.37
615	0.36
616	0.35
617	0.32
618	0.28
619	0.27
620	0.24
621	0.23
622	0.21
623	0.19
624	0.14
625	0.12
626	0.13
627	0.14
628	0.14
629	0.18
630	0.19
631	0.22
632	0.2
633	0.2
634	0.2
635	0.19
636	0.18
637	0.14
638	0.11
639	0.08
640	0.08
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.09
648	0.09
649	0.09
650	0.1
651	0.09
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.11
656	0.09
657	0.09
658	0.09
659	0.1
660	0.12
661	0.12
662	0.12
663	0.16
664	0.18
665	0.2
666	0.21
667	0.21
668	0.22
669	0.27
670	0.34
671	0.38
672	0.45
673	0.53
674	0.6
675	0.69
676	0.77
677	0.81
678	0.84
679	0.87
680	0.88
681	0.87
682	0.8
683	0.73
684	0.68
685	0.59
686	0.52
687	0.44
688	0.35
689	0.26
690	0.24
691	0.2
692	0.14
693	0.13
694	0.09
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.04
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.05
715	0.05
716	0.04
717	0.04
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.07
724	0.08
725	0.08
726	0.1
727	0.13
728	0.15
729	0.16
730	0.17
731	0.17
732	0.17
733	0.18
734	0.2
735	0.17
736	0.17
737	0.15
738	0.15
739	0.13
740	0.13
741	0.13
742	0.09
743	0.09
744	0.08
745	0.12
746	0.13
747	0.15
748	0.15
749	0.16
750	0.19
751	0.21
752	0.22
753	0.19
754	0.2
755	0.23
756	0.29
757	0.32
758	0.3
759	0.29
760	0.29
761	0.31
762	0.29
763	0.27
764	0.23
765	0.22
766	0.25
767	0.24
768	0.26
769	0.25
770	0.28
771	0.3
772	0.28
773	0.34
774	0.34
775	0.42
776	0.42
777	0.42
778	0.42
779	0.47
780	0.5
781	0.48
782	0.46
783	0.37
784	0.34
785	0.33
786	0.35
787	0.28
788	0.27
789	0.22
790	0.25
791	0.27
792	0.33
793	0.33
794	0.27
795	0.27
796	0.22
797	0.21
798	0.16
799	0.15
800	0.08
801	0.07
802	0.09
803	0.08
804	0.08
805	0.07
806	0.07
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.07
811	0.08
812	0.1
813	0.11
814	0.12
815	0.14
816	0.15
817	0.15
818	0.15
819	0.16
820	0.14
821	0.14
822	0.13
823	0.11
824	0.11
825	0.11
826	0.11
827	0.11
828	0.11
829	0.12
830	0.11
831	0.12
832	0.14
833	0.13
834	0.13
835	0.14
836	0.14
837	0.12
838	0.12
839	0.11
840	0.08
841	0.08
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.07
848	0.06
849	0.07
850	0.07
851	0.06
852	0.08
853	0.11
854	0.11
855	0.15
856	0.2
857	0.23
858	0.23
859	0.28
860	0.31
861	0.33
862	0.34
863	0.31
864	0.26
865	0.24
866	0.24
867	0.22
868	0.2
869	0.16
870	0.17
871	0.23
872	0.23
873	0.22
874	0.27
875	0.29
876	0.31
877	0.38
878	0.41
879	0.41
880	0.45
881	0.47
882	0.49
883	0.46
884	0.42
885	0.35
886	0.31
887	0.29
888	0.28
889	0.27
890	0.25
891	0.22
892	0.22
893	0.2
894	0.19
895	0.16
896	0.13
897	0.11
898	0.07
899	0.07
900	0.08
901	0.1
902	0.1
903	0.1
904	0.12
905	0.14
906	0.22
907	0.25
908	0.3
909	0.33
910	0.36
911	0.4
912	0.42
913	0.39
914	0.33
915	0.3
916	0.24
917	0.21
918	0.17
919	0.12
920	0.09
921	0.08
922	0.08
923	0.07
924	0.06
925	0.05
926	0.05
927	0.04
928	0.08
929	0.09
930	0.12
931	0.15
932	0.2
933	0.26
934	0.29
935	0.34
936	0.36
937	0.4
938	0.43
939	0.46
940	0.52
941	0.52
942	0.54
943	0.5
944	0.47
945	0.42
946	0.36
947	0.32
948	0.22
949	0.17
950	0.12
951	0.13
952	0.12
953	0.12
954	0.12
955	0.11
956	0.15
957	0.14
958	0.15
959	0.23
960	0.24
961	0.3
962	0.33
963	0.35
964	0.35
965	0.39
966	0.39
967	0.32
968	0.35
969	0.31
970	0.29
971	0.31
972	0.29
973	0.26
974	0.28
975	0.33
976	0.31
977	0.3
978	0.28
979	0.28
980	0.3
981	0.32
982	0.31
983	0.23
984	0.2
985	0.2
986	0.22
987	0.21
988	0.18
989	0.17
990	0.17
991	0.17
992	0.16
993	0.15
994	0.15
995	0.13
996	0.17
997	0.18
998	0.17
999	0.17
1000	0.17
1001	0.16
1002	0.15
1003	0.14
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.1
1008	0.15
1009	0.16
1010	0.16
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.13
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.11
1022	0.16
1023	0.21
1024	0.26
1025	0.29
1026	0.33
1027	0.37
1028	0.42
1029	0.49
1030	0.48
1031	0.49
1032	0.51
1033	0.51
1034	0.53
1035	0.51
1036	0.45
1037	0.35
1038	0.3
1039	0.24
1040	0.2
1041	0.2
1042	0.16
1043	0.15
1044	0.15
1045	0.14
1046	0.15
1047	0.13
1048	0.11
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.11
1052	0.16
1053	0.18
1054	0.19
1055	0.24
1056	0.27
1057	0.27
1058	0.26
1059	0.28
1060	0.28
1061	0.31
1062	0.32
1063	0.29
1064	0.26
1065	0.27
1066	0.26
1067	0.22
1068	0.17
1069	0.12
1070	0.09
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.09
1079	0.12
1080	0.13
1081	0.14
1082	0.15
1083	0.15
1084	0.15
1085	0.17
1086	0.18
1087	0.17
1088	0.18
1089	0.2
1090	0.25
1091	0.26
1092	0.26
1093	0.28
1094	0.3
1095	0.33
1096	0.33
1097	0.34
1098	0.31
1099	0.39
1100	0.41
1101	0.41
1102	0.38
1103	0.35
1104	0.32
1105	0.29
1106	0.26
1107	0.18
1108	0.16
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.11
1112	0.14
1113	0.14
1114	0.14
1115	0.15
1116	0.15
1117	0.18
1118	0.19
1119	0.24
1120	0.27
1121	0.33
1122	0.41
1123	0.45
1124	0.52
1125	0.51
1126	0.58
1127	0.59
1128	0.61
1129	0.54
1130	0.45
1131	0.42
1132	0.35
1133	0.36
1134	0.33
1135	0.29
1136	0.24
1137	0.24
1138	0.25
1139	0.26
1140	0.26
1141	0.21
1142	0.17
1143	0.16
1144	0.18
1145	0.19
1146	0.19
1147	0.19
1148	0.2
1149	0.22
1150	0.22
1151	0.23
1152	0.19
1153	0.18
1154	0.17
1155	0.14
1156	0.17
1157	0.18
1158	0.22
1159	0.23
1160	0.29
1161	0.38
1162	0.47
1163	0.56
1164	0.56
1165	0.64
1166	0.66
1167	0.66
1168	0.69

A0A4V3XA49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer