FuNGI

A0A4S4KMJ3

Protein Details

Accession

A0A4S4KMJ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
243-270	RRDARESILKQRKEKREKGKERANAAQQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
246-264	ARESILKQRKEKREKGKER

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MSESSSADLLSFTKLGESNYPTWEYDMCAALQVKKLWRLTSGNESKPSSPPEKVELWEEKAEQAAGLIYQKLEHGMQILVQKYMDDPIKMWGELEKMQHQDNPASRFIAYDQFFSITKKEDESLTALTARVEDALHKMRNSRNSALTLKDFEDELAAVALVRALPMEYSSFRSALLLLTNFDFKTVKDAFLQEQKNRQPRAADSALALSSALKVSTPARPSSQSVVCKFCDIKGHTEAQCFKRRDARESILKQRKEKREKGKERANAAQQETSASASTSVQSAEFAGNASTHDYTNPHSPLLSDAGSDWIVDTGATCHMTPHRHWFNTYTPNHTPIQLANNQIIYSVGLGSVRFQPVINGKPGRLLEFERVLHVPDLRNNLLSVLYLTRAKSYIVTIQHDQIFFKHNGVLLFTAAINSNNAASINGQVVPMTQFSGMVSTCPLDLTLWHQCFAHLNHGDVKKLIQEDLVKGIVVKSMDLPDPICEPCIAGKQHRSNVSKLASHHASGLLELVHSDVHGPLPVQTRHGYHYWITFIDDHSRHWAVMPLKKKSDAFAAFKHFKAYAENQLNLKIKATHDDKGGEYMPREWDQFCNSEGIHRQHTIRAEPHQNGVAERANWTLVEGITTMLNEAHLPATFWWDAVAAFVHVHNRSPTSAVQGKTPFELWHKSKPDVSHFRVFGCTSYVHVKKDLRRQLESHTQKCVFLGYPAHFKGWTFWNPITCKEVISDSAQFDERVFPGNSRTPVDLQVPSPPETSDPIEQVGVESNSDDDDTVPLPPLPDSPATPPMPPPQNSPPPVTPVTPAHPSTKQERSPSDLPPESAKKPKVQSSAPEWRPRSRPLTSFRDALINPLMDYPGRRIPRPAPEIHPAPQPAPVSDTEPVQVQQSDEEDRDELDLMSEDEMQAEALMFTGLMDFGANAGLEDQYIAFEDAFNYVLKSTNHFEHVFSAEVCKQYGPEPYQWKDIRERPDAHLWEQAAMEEFISLVENGTFTPVRLPSDRKTIGCRWVFKLKRKADGSVDRYKARLVAKGFSQRPGLEFSQVFAPTAKWAALRAILALAALEDLELYSIDISTAFLNGDLDHDVYMDQPEGFEEY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.21
4	0.26
5	0.26
6	0.31
7	0.34
8	0.31
9	0.32
10	0.31
11	0.27
12	0.24
13	0.23
14	0.18
15	0.2
16	0.22
17	0.23
18	0.27
19	0.3
20	0.33
21	0.38
22	0.42
23	0.39
24	0.42
25	0.44
26	0.44
27	0.5
28	0.54
29	0.53
30	0.56
31	0.59
32	0.56
33	0.57
34	0.58
35	0.53
36	0.48
37	0.45
38	0.43
39	0.44
40	0.43
41	0.45
42	0.45
43	0.44
44	0.44
45	0.42
46	0.37
47	0.35
48	0.33
49	0.24
50	0.18
51	0.13
52	0.1
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.11
63	0.14
64	0.19
65	0.2
66	0.18
67	0.18
68	0.18
69	0.17
70	0.22
71	0.22
72	0.17
73	0.17
74	0.22
75	0.25
76	0.25
77	0.24
78	0.21
79	0.22
80	0.25
81	0.29
82	0.3
83	0.29
84	0.32
85	0.34
86	0.34
87	0.38
88	0.4
89	0.4
90	0.36
91	0.35
92	0.32
93	0.31
94	0.3
95	0.31
96	0.26
97	0.23
98	0.22
99	0.23
100	0.24
101	0.25
102	0.25
103	0.21
104	0.21
105	0.22
106	0.22
107	0.21
108	0.23
109	0.25
110	0.24
111	0.22
112	0.21
113	0.19
114	0.18
115	0.17
116	0.14
117	0.12
118	0.1
119	0.09
120	0.15
121	0.22
122	0.25
123	0.26
124	0.32
125	0.37
126	0.45
127	0.51
128	0.5
129	0.47
130	0.49
131	0.51
132	0.5
133	0.48
134	0.43
135	0.38
136	0.33
137	0.29
138	0.23
139	0.21
140	0.16
141	0.12
142	0.09
143	0.08
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.05
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.05
153	0.08
154	0.09
155	0.15
156	0.17
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.17
161	0.15
162	0.18
163	0.13
164	0.13
165	0.14
166	0.17
167	0.16
168	0.17
169	0.16
170	0.13
171	0.19
172	0.19
173	0.19
174	0.19
175	0.22
176	0.25
177	0.34
178	0.4
179	0.38
180	0.46
181	0.53
182	0.6
183	0.59
184	0.57
185	0.53
186	0.49
187	0.53
188	0.46
189	0.38
190	0.31
191	0.31
192	0.28
193	0.24
194	0.21
195	0.12
196	0.1
197	0.1
198	0.08
199	0.05
200	0.07
201	0.1
202	0.16
203	0.19
204	0.21
205	0.24
206	0.27
207	0.31
208	0.35
209	0.4
210	0.42
211	0.43
212	0.44
213	0.42
214	0.43
215	0.4
216	0.36
217	0.38
218	0.33
219	0.35
220	0.35
221	0.41
222	0.39
223	0.45
224	0.5
225	0.48
226	0.54
227	0.51
228	0.5
229	0.52
230	0.53
231	0.53
232	0.54
233	0.54
234	0.55
235	0.61
236	0.68
237	0.69
238	0.71
239	0.73
240	0.75
241	0.78
242	0.78
243	0.8
244	0.81
245	0.83
246	0.88
247	0.89
248	0.89
249	0.85
250	0.82
251	0.8
252	0.77
253	0.72
254	0.65
255	0.56
256	0.47
257	0.41
258	0.35
259	0.28
260	0.21
261	0.14
262	0.11
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.21
283	0.21
284	0.19
285	0.18
286	0.18
287	0.19
288	0.21
289	0.18
290	0.12
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.12
295	0.1
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.13
306	0.17
307	0.19
308	0.28
309	0.34
310	0.35
311	0.37
312	0.39
313	0.42
314	0.49
315	0.49
316	0.47
317	0.41
318	0.44
319	0.43
320	0.4
321	0.34
322	0.26
323	0.3
324	0.25
325	0.25
326	0.23
327	0.23
328	0.22
329	0.21
330	0.18
331	0.12
332	0.09
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.07
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.13
343	0.17
344	0.2
345	0.25
346	0.24
347	0.23
348	0.28
349	0.29
350	0.28
351	0.25
352	0.25
353	0.22
354	0.25
355	0.26
356	0.23
357	0.23
358	0.22
359	0.21
360	0.2
361	0.18
362	0.17
363	0.23
364	0.21
365	0.21
366	0.19
367	0.19
368	0.17
369	0.15
370	0.13
371	0.08
372	0.09
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.12
380	0.16
381	0.17
382	0.21
383	0.22
384	0.25
385	0.27
386	0.27
387	0.25
388	0.21
389	0.23
390	0.19
391	0.19
392	0.16
393	0.16
394	0.15
395	0.16
396	0.15
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.1
433	0.17
434	0.18
435	0.18
436	0.18
437	0.18
438	0.22
439	0.23
440	0.27
441	0.19
442	0.2
443	0.26
444	0.27
445	0.27
446	0.24
447	0.23
448	0.17
449	0.17
450	0.16
451	0.12
452	0.12
453	0.13
454	0.15
455	0.15
456	0.12
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.09
461	0.08
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.14
475	0.15
476	0.16
477	0.24
478	0.29
479	0.34
480	0.42
481	0.43
482	0.39
483	0.44
484	0.43
485	0.38
486	0.34
487	0.35
488	0.28
489	0.26
490	0.25
491	0.2
492	0.17
493	0.14
494	0.13
495	0.07
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.05
506	0.07
507	0.12
508	0.13
509	0.15
510	0.16
511	0.17
512	0.2
513	0.2
514	0.19
515	0.15
516	0.17
517	0.15
518	0.14
519	0.14
520	0.12
521	0.13
522	0.17
523	0.16
524	0.16
525	0.19
526	0.19
527	0.18
528	0.17
529	0.21
530	0.19
531	0.24
532	0.29
533	0.29
534	0.3
535	0.32
536	0.32
537	0.28
538	0.31
539	0.31
540	0.28
541	0.28
542	0.34
543	0.34
544	0.34
545	0.34
546	0.28
547	0.23
548	0.24
549	0.23
550	0.25
551	0.26
552	0.28
553	0.27
554	0.32
555	0.34
556	0.3
557	0.28
558	0.21
559	0.17
560	0.22
561	0.24
562	0.2
563	0.2
564	0.22
565	0.21
566	0.22
567	0.23
568	0.18
569	0.16
570	0.15
571	0.16
572	0.16
573	0.17
574	0.15
575	0.15
576	0.16
577	0.17
578	0.16
579	0.15
580	0.13
581	0.15
582	0.2
583	0.21
584	0.21
585	0.22
586	0.22
587	0.23
588	0.25
589	0.26
590	0.23
591	0.26
592	0.29
593	0.28
594	0.29
595	0.29
596	0.28
597	0.25
598	0.25
599	0.21
600	0.15
601	0.15
602	0.14
603	0.11
604	0.11
605	0.11
606	0.09
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.05
612	0.06
613	0.05
614	0.04
615	0.05
616	0.04
617	0.05
618	0.05
619	0.04
620	0.05
621	0.05
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.05
631	0.05
632	0.06
633	0.09
634	0.09
635	0.1
636	0.11
637	0.12
638	0.12
639	0.14
640	0.14
641	0.17
642	0.22
643	0.21
644	0.25
645	0.27
646	0.27
647	0.26
648	0.26
649	0.21
650	0.19
651	0.26
652	0.25
653	0.32
654	0.35
655	0.36
656	0.38
657	0.39
658	0.45
659	0.47
660	0.49
661	0.47
662	0.44
663	0.43
664	0.42
665	0.39
666	0.3
667	0.24
668	0.18
669	0.14
670	0.21
671	0.22
672	0.21
673	0.26
674	0.3
675	0.35
676	0.44
677	0.49
678	0.47
679	0.48
680	0.48
681	0.5
682	0.56
683	0.58
684	0.51
685	0.51
686	0.47
687	0.44
688	0.42
689	0.37
690	0.27
691	0.2
692	0.22
693	0.17
694	0.22
695	0.23
696	0.24
697	0.22
698	0.22
699	0.22
700	0.24
701	0.25
702	0.24
703	0.24
704	0.3
705	0.31
706	0.33
707	0.34
708	0.28
709	0.25
710	0.21
711	0.21
712	0.16
713	0.18
714	0.19
715	0.16
716	0.17
717	0.17
718	0.17
719	0.16
720	0.16
721	0.13
722	0.15
723	0.15
724	0.14
725	0.17
726	0.22
727	0.24
728	0.24
729	0.26
730	0.23
731	0.25
732	0.28
733	0.25
734	0.21
735	0.25
736	0.25
737	0.25
738	0.24
739	0.22
740	0.19
741	0.21
742	0.23
743	0.19
744	0.17
745	0.17
746	0.16
747	0.16
748	0.15
749	0.15
750	0.12
751	0.1
752	0.09
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.05
758	0.06
759	0.07
760	0.07
761	0.08
762	0.08
763	0.08
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.11
768	0.13
769	0.16
770	0.22
771	0.24
772	0.24
773	0.26
774	0.31
775	0.37
776	0.36
777	0.38
778	0.4
779	0.48
780	0.5
781	0.52
782	0.47
783	0.45
784	0.46
785	0.41
786	0.36
787	0.31
788	0.32
789	0.32
790	0.32
791	0.32
792	0.33
793	0.35
794	0.38
795	0.43
796	0.44
797	0.45
798	0.46
799	0.49
800	0.49
801	0.5
802	0.52
803	0.45
804	0.42
805	0.42
806	0.45
807	0.42
808	0.47
809	0.46
810	0.44
811	0.47
812	0.53
813	0.53
814	0.51
815	0.52
816	0.53
817	0.61
818	0.61
819	0.65
820	0.61
821	0.62
822	0.63
823	0.63
824	0.6
825	0.55
826	0.55
827	0.54
828	0.58
829	0.55
830	0.53
831	0.47
832	0.47
833	0.41
834	0.38
835	0.34
836	0.25
837	0.22
838	0.2
839	0.2
840	0.15
841	0.16
842	0.17
843	0.21
844	0.23
845	0.24
846	0.28
847	0.33
848	0.43
849	0.47
850	0.48
851	0.45
852	0.5
853	0.54
854	0.52
855	0.52
856	0.44
857	0.39
858	0.39
859	0.35
860	0.28
861	0.26
862	0.25
863	0.23
864	0.22
865	0.22
866	0.17
867	0.18
868	0.18
869	0.17
870	0.16
871	0.13
872	0.13
873	0.15
874	0.17
875	0.16
876	0.18
877	0.16
878	0.16
879	0.16
880	0.15
881	0.12
882	0.1
883	0.1
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.08
888	0.07
889	0.08
890	0.07
891	0.06
892	0.05
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.04
897	0.03
898	0.04
899	0.04
900	0.03
901	0.04
902	0.03
903	0.03
904	0.04
905	0.04
906	0.04
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.06
914	0.07
915	0.06
916	0.07
917	0.07
918	0.08
919	0.09
920	0.09
921	0.08
922	0.08
923	0.13
924	0.13
925	0.17
926	0.2
927	0.23
928	0.27
929	0.28
930	0.28
931	0.27
932	0.29
933	0.27
934	0.23
935	0.25
936	0.23
937	0.23
938	0.23
939	0.2
940	0.18
941	0.19
942	0.27
943	0.26
944	0.31
945	0.38
946	0.4
947	0.5
948	0.52
949	0.53
950	0.54
951	0.57
952	0.57
953	0.57
954	0.58
955	0.54
956	0.61
957	0.61
958	0.55
959	0.53
960	0.46
961	0.4
962	0.36
963	0.31
964	0.23
965	0.19
966	0.16
967	0.1
968	0.09
969	0.08
970	0.09
971	0.08
972	0.06
973	0.06
974	0.06
975	0.06
976	0.11
977	0.1
978	0.1
979	0.14
980	0.16
981	0.2
982	0.25
983	0.31
984	0.31
985	0.41
986	0.46
987	0.44
988	0.5
989	0.52
990	0.56
991	0.58
992	0.59
993	0.55
994	0.61
995	0.66
996	0.68
997	0.73
998	0.7
999	0.73
1000	0.71
1001	0.71
1002	0.69
1003	0.72
1004	0.69
1005	0.69
1006	0.68
1007	0.6
1008	0.58
1009	0.53
1010	0.49
1011	0.41
1012	0.4
1013	0.33
1014	0.32
1015	0.38
1016	0.47
1017	0.48
1018	0.47
1019	0.49
1020	0.44
1021	0.43
1022	0.44
1023	0.38
1024	0.34
1025	0.32
1026	0.29
1027	0.31
1028	0.3
1029	0.29
1030	0.24
1031	0.23
1032	0.19
1033	0.2
1034	0.2
1035	0.14
1036	0.15
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.18
1040	0.16
1041	0.15
1042	0.14
1043	0.13
1044	0.11
1045	0.09
1046	0.06
1047	0.05
1048	0.04
1049	0.04
1050	0.04
1051	0.04
1052	0.04
1053	0.05
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.05
1057	0.05
1058	0.06
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.07
1064	0.07
1065	0.09
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.12
1073	0.11
1074	0.09
1075	0.09

A0A4S4KMJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer