FuNGI

A0A4S4LCH2

Protein Details

Accession

A0A4S4LCH2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
221-247	SMDRSPTPERRPTRRIKQIRQRLPESG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013868 Cut8/Sts1_fam IPR038422 Cut8/Sts1_sf IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR037431 REX4_DEDDh_dom IPR047021 REXO1/3/4-like IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0008408 F:3'-5' exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0071630 P:nuclear protein quality control by the ubiquitin-proteasome system GO:0031144 P:proteasome localization GO:0015031 P:protein transport GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08559 Cut8
CDD	cd06144 REX4_like

Amino Acid Sequences

MQPSSHLSRTLDGVDTEVVIQKYADRILVLVSQLGKVGNLIQASIPPTTPLDPPSYTSDDIPLFEPPSSIELIPLLGGAPSQHLAALHPLYASHIATLIWTVSTQAGDGAGRPSVVVGLALKKRPGDDGGNASLSISTQNTFKGIMKMVSDLQNKTVLKSAVTHSPSPLGFGFGLSTAALPGWQPPAMQPPAFLPSPSHQAFSAQKTAQKRRHDDADDDESMDRSPTPERRPTRRIKQIRQRLPESGSHEGGDHDKPNKENKSPGCDPGDGVDIGMLLASLPPQSLLPILTSLLSENPSLMPTVLSLIPRPTLDTALNAINQAAKKLRDEYPYSVSSPLPLSQQSTTSPFGSGSNVFGTNRSNISTSLTTTSGFGRSSHSPAHNTGMRDSYVLSRLRPLIAEFVSTAFSYMPYFSYRSESSASQPTLPGKEKVYAHPTETFGYLSVLTDHLLCQNSLCQSTLGPLILPRLLQEWMAWVNRVDMVLKQGGIFGSGVAQSWVEALDRYAEAKLQGVNGELGDGLKTDELEQYCLSLVILPHACFNMRFRSIARKHFFIFHTAIRALNKTTSAQASVDRSSADPDVVDAHDIIDTYDNLTASGRPKGGVRNLAISDTAIRVEPEQAGYTASQCMSSLHVTPEGKSPRGISQHTLSSQEYPSAIDGHHPVKFTQNVAPLDVDTLAPHEHSGLSEEHFSEPWIPDTELRGLLKSAVSRPYKWISRPRLFHPVTPEELELRLHQALTRSPLPSLSHLIFYHNAYPLLQSASSYNFLIQLAIRHTTYTVAFRLLKSLQANNIEPNSYTKQLFVRLLVRIGRWDQAWSFVHRELSFGDKQDQLQLLLEMFGRSKPEEFHGKPPSTEYTLPGVALGQPDRVPQIHDTRTQCTIPQDVQSLILPSLSFFLPASGLPPDRFVLVVVRYLLQKSHVEVARAVTLEWISRIPKRLSLHRKSRCLYILHLHLGYSRTGLKAHFANRKFVNTFLEHQPHLRPTSSTLLLLLGSLKQARPKPTYHALQLVYAFRKKWGRAMVDRRVRRRIVTIAEQEGHIKVAKEWLSVENRALVWRKIRALQREVIGDQNSMLPRRIRRIQSRKVLFLALGTVCCGVGPGGSTSMVARVSLIDYRGNTILDTYVHPTMPVTDYRTSTTGIEAKHLNSDSAMQFNAVQSLVAEYIKGKILVGHSLWQDLSVLGIPHPAVATRDVALYMPFRNALQSPNQAVGLQTLVWHLMRRRIQYGKLDSVENARAALDLYRSDATSWESSVSSAKWAVHPPTFLVQQAMASLSFTTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.17
4	0.19
5	0.17
6	0.15
7	0.15
8	0.14
9	0.16
10	0.17
11	0.17
12	0.12
13	0.12
14	0.14
15	0.17
16	0.16
17	0.16
18	0.15
19	0.15
20	0.16
21	0.16
22	0.13
23	0.11
24	0.13
25	0.13
26	0.12
27	0.12
28	0.12
29	0.14
30	0.17
31	0.17
32	0.16
33	0.14
34	0.17
35	0.18
36	0.2
37	0.2
38	0.23
39	0.24
40	0.27
41	0.32
42	0.35
43	0.34
44	0.33
45	0.35
46	0.31
47	0.31
48	0.29
49	0.25
50	0.22
51	0.2
52	0.19
53	0.16
54	0.17
55	0.18
56	0.16
57	0.14
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.08
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.1
72	0.16
73	0.16
74	0.15
75	0.14
76	0.14
77	0.16
78	0.19
79	0.18
80	0.12
81	0.12
82	0.11
83	0.11
84	0.12
85	0.09
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.15
106	0.21
107	0.24
108	0.26
109	0.27
110	0.28
111	0.3
112	0.33
113	0.3
114	0.3
115	0.34
116	0.36
117	0.36
118	0.34
119	0.32
120	0.27
121	0.22
122	0.19
123	0.13
124	0.1
125	0.1
126	0.11
127	0.12
128	0.14
129	0.17
130	0.18
131	0.2
132	0.21
133	0.21
134	0.23
135	0.26
136	0.32
137	0.35
138	0.32
139	0.32
140	0.37
141	0.36
142	0.35
143	0.36
144	0.29
145	0.25
146	0.27
147	0.28
148	0.29
149	0.33
150	0.33
151	0.29
152	0.33
153	0.31
154	0.31
155	0.28
156	0.22
157	0.18
158	0.17
159	0.16
160	0.12
161	0.13
162	0.1
163	0.09
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.12
173	0.2
174	0.24
175	0.24
176	0.22
177	0.22
178	0.26
179	0.27
180	0.25
181	0.21
182	0.21
183	0.29
184	0.3
185	0.28
186	0.24
187	0.29
188	0.33
189	0.35
190	0.39
191	0.33
192	0.37
193	0.45
194	0.55
195	0.58
196	0.62
197	0.64
198	0.63
199	0.7
200	0.69
201	0.64
202	0.62
203	0.61
204	0.53
205	0.48
206	0.42
207	0.33
208	0.29
209	0.25
210	0.18
211	0.11
212	0.17
213	0.22
214	0.28
215	0.38
216	0.46
217	0.54
218	0.64
219	0.72
220	0.77
221	0.81
222	0.84
223	0.86
224	0.88
225	0.9
226	0.91
227	0.89
228	0.84
229	0.78
230	0.71
231	0.67
232	0.62
233	0.57
234	0.48
235	0.4
236	0.35
237	0.31
238	0.31
239	0.28
240	0.25
241	0.24
242	0.27
243	0.29
244	0.38
245	0.43
246	0.43
247	0.48
248	0.5
249	0.54
250	0.54
251	0.57
252	0.53
253	0.47
254	0.44
255	0.37
256	0.35
257	0.25
258	0.22
259	0.16
260	0.1
261	0.09
262	0.08
263	0.06
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.09
288	0.08
289	0.06
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.12
295	0.14
296	0.14
297	0.16
298	0.14
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.16
303	0.17
304	0.17
305	0.15
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.16
310	0.17
311	0.16
312	0.18
313	0.22
314	0.27
315	0.29
316	0.34
317	0.36
318	0.38
319	0.39
320	0.39
321	0.36
322	0.31
323	0.27
324	0.24
325	0.2
326	0.17
327	0.16
328	0.17
329	0.16
330	0.18
331	0.19
332	0.21
333	0.22
334	0.21
335	0.2
336	0.18
337	0.18
338	0.18
339	0.17
340	0.14
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.15
345	0.16
346	0.16
347	0.16
348	0.16
349	0.15
350	0.14
351	0.18
352	0.18
353	0.18
354	0.18
355	0.18
356	0.17
357	0.16
358	0.17
359	0.15
360	0.14
361	0.13
362	0.15
363	0.17
364	0.2
365	0.24
366	0.26
367	0.27
368	0.28
369	0.33
370	0.33
371	0.31
372	0.3
373	0.27
374	0.25
375	0.22
376	0.22
377	0.18
378	0.2
379	0.2
380	0.18
381	0.19
382	0.2
383	0.2
384	0.2
385	0.18
386	0.17
387	0.16
388	0.16
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.13
393	0.12
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.11
401	0.11
402	0.16
403	0.16
404	0.18
405	0.2
406	0.2
407	0.21
408	0.27
409	0.27
410	0.23
411	0.25
412	0.25
413	0.27
414	0.29
415	0.27
416	0.22
417	0.27
418	0.28
419	0.3
420	0.34
421	0.31
422	0.31
423	0.32
424	0.32
425	0.28
426	0.27
427	0.22
428	0.16
429	0.15
430	0.13
431	0.1
432	0.09
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.09
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.11
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.11
446	0.1
447	0.12
448	0.13
449	0.1
450	0.09
451	0.08
452	0.09
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.09
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.11
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.1
469	0.08
470	0.1
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.09
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.05
512	0.08
513	0.08
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.09
520	0.07
521	0.07
522	0.09
523	0.11
524	0.1
525	0.11
526	0.11
527	0.12
528	0.11
529	0.13
530	0.15
531	0.15
532	0.16
533	0.16
534	0.27
535	0.32
536	0.41
537	0.42
538	0.39
539	0.39
540	0.43
541	0.43
542	0.37
543	0.34
544	0.26
545	0.26
546	0.23
547	0.24
548	0.2
549	0.2
550	0.17
551	0.15
552	0.15
553	0.12
554	0.13
555	0.12
556	0.12
557	0.12
558	0.13
559	0.15
560	0.15
561	0.14
562	0.13
563	0.13
564	0.13
565	0.13
566	0.11
567	0.08
568	0.07
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.05
579	0.06
580	0.07
581	0.06
582	0.06
583	0.07
584	0.08
585	0.09
586	0.11
587	0.11
588	0.1
589	0.12
590	0.15
591	0.18
592	0.21
593	0.2
594	0.22
595	0.22
596	0.22
597	0.21
598	0.17
599	0.15
600	0.1
601	0.1
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.07
618	0.08
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.13
623	0.13
624	0.14
625	0.2
626	0.21
627	0.21
628	0.2
629	0.21
630	0.21
631	0.25
632	0.25
633	0.21
634	0.21
635	0.24
636	0.24
637	0.26
638	0.22
639	0.2
640	0.19
641	0.17
642	0.15
643	0.12
644	0.11
645	0.09
646	0.08
647	0.08
648	0.1
649	0.12
650	0.13
651	0.14
652	0.13
653	0.16
654	0.17
655	0.18
656	0.18
657	0.22
658	0.21
659	0.21
660	0.21
661	0.17
662	0.17
663	0.16
664	0.12
665	0.06
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.07
674	0.07
675	0.08
676	0.09
677	0.1
678	0.1
679	0.1
680	0.1
681	0.1
682	0.1
683	0.1
684	0.11
685	0.11
686	0.11
687	0.13
688	0.15
689	0.15
690	0.15
691	0.14
692	0.12
693	0.12
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.17
698	0.19
699	0.2
700	0.24
701	0.29
702	0.31
703	0.36
704	0.43
705	0.45
706	0.5
707	0.53
708	0.54
709	0.59
710	0.56
711	0.53
712	0.51
713	0.45
714	0.4
715	0.38
716	0.34
717	0.24
718	0.23
719	0.22
720	0.15
721	0.14
722	0.12
723	0.1
724	0.11
725	0.11
726	0.12
727	0.15
728	0.18
729	0.15
730	0.15
731	0.17
732	0.18
733	0.19
734	0.21
735	0.17
736	0.18
737	0.17
738	0.2
739	0.19
740	0.19
741	0.19
742	0.17
743	0.16
744	0.13
745	0.13
746	0.12
747	0.12
748	0.1
749	0.08
750	0.08
751	0.1
752	0.11
753	0.11
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.11
762	0.11
763	0.1
764	0.11
765	0.12
766	0.12
767	0.12
768	0.11
769	0.13
770	0.14
771	0.14
772	0.18
773	0.17
774	0.19
775	0.19
776	0.2
777	0.21
778	0.24
779	0.25
780	0.24
781	0.25
782	0.21
783	0.2
784	0.22
785	0.22
786	0.2
787	0.19
788	0.18
789	0.19
790	0.22
791	0.23
792	0.21
793	0.21
794	0.19
795	0.22
796	0.22
797	0.21
798	0.2
799	0.2
800	0.19
801	0.16
802	0.17
803	0.14
804	0.18
805	0.2
806	0.2
807	0.22
808	0.22
809	0.25
810	0.24
811	0.24
812	0.19
813	0.23
814	0.22
815	0.2
816	0.21
817	0.19
818	0.2
819	0.23
820	0.22
821	0.17
822	0.16
823	0.15
824	0.12
825	0.11
826	0.11
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.09
831	0.09
832	0.1
833	0.1
834	0.14
835	0.23
836	0.26
837	0.34
838	0.4
839	0.41
840	0.4
841	0.42
842	0.42
843	0.37
844	0.35
845	0.29
846	0.25
847	0.24
848	0.23
849	0.2
850	0.17
851	0.13
852	0.14
853	0.12
854	0.09
855	0.09
856	0.1
857	0.12
858	0.12
859	0.13
860	0.15
861	0.22
862	0.24
863	0.31
864	0.33
865	0.35
866	0.38
867	0.37
868	0.35
869	0.3
870	0.3
871	0.25
872	0.24
873	0.23
874	0.2
875	0.2
876	0.19
877	0.17
878	0.14
879	0.13
880	0.1
881	0.08
882	0.09
883	0.08
884	0.08
885	0.06
886	0.07
887	0.07
888	0.07
889	0.09
890	0.1
891	0.11
892	0.11
893	0.13
894	0.13
895	0.13
896	0.13
897	0.12
898	0.12
899	0.12
900	0.13
901	0.12
902	0.13
903	0.14
904	0.14
905	0.14
906	0.14
907	0.14
908	0.14
909	0.21
910	0.21
911	0.22
912	0.22
913	0.24
914	0.23
915	0.22
916	0.2
917	0.14
918	0.13
919	0.12
920	0.12
921	0.12
922	0.12
923	0.14
924	0.2
925	0.2
926	0.26
927	0.29
928	0.39
929	0.48
930	0.55
931	0.63
932	0.67
933	0.74
934	0.7
935	0.73
936	0.67
937	0.59
938	0.53
939	0.49
940	0.46
941	0.41
942	0.39
943	0.33
944	0.3
945	0.29
946	0.25
947	0.2
948	0.15
949	0.12
950	0.13
951	0.13
952	0.15
953	0.18
954	0.26
955	0.33
956	0.33
957	0.4
958	0.41
959	0.47
960	0.45
961	0.42
962	0.39
963	0.34
964	0.37
965	0.37
966	0.4
967	0.34
968	0.36
969	0.38
970	0.37
971	0.36
972	0.33
973	0.26
974	0.25
975	0.31
976	0.3
977	0.26
978	0.22
979	0.2
980	0.18
981	0.18
982	0.14
983	0.08
984	0.09
985	0.1
986	0.11
987	0.16
988	0.21
989	0.28
990	0.31
991	0.33
992	0.38
993	0.45
994	0.49
995	0.47
996	0.49
997	0.44
998	0.43
999	0.43
1000	0.42
1001	0.38
1002	0.35
1003	0.32
1004	0.31
1005	0.36
1006	0.34
1007	0.37
1008	0.39
1009	0.42
1010	0.49
1011	0.59
1012	0.63
1013	0.67
1014	0.75
1015	0.75
1016	0.76
1017	0.71
1018	0.63
1019	0.59
1020	0.55
1021	0.51
1022	0.52
1023	0.5
1024	0.48
1025	0.46
1026	0.44
1027	0.41
1028	0.35
1029	0.29
1030	0.22
1031	0.17
1032	0.12
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.18
1036	0.19
1037	0.24
1038	0.27
1039	0.28
1040	0.29
1041	0.25
1042	0.25
1043	0.28
1044	0.3
1045	0.27
1046	0.27
1047	0.3
1048	0.33
1049	0.36
1050	0.43
1051	0.46
1052	0.48
1053	0.49
1054	0.48
1055	0.48
1056	0.46
1057	0.44
1058	0.39
1059	0.31
1060	0.27
1061	0.27
1062	0.26
1063	0.23
1064	0.25
1065	0.25
1066	0.28
1067	0.36
1068	0.43
1069	0.47
1070	0.56
1071	0.65
1072	0.71
1073	0.77
1074	0.79
1075	0.76
1076	0.7
1077	0.62
1078	0.51
1079	0.41
1080	0.36
1081	0.26
1082	0.2
1083	0.16
1084	0.13
1085	0.12
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.06
1089	0.05
1090	0.06
1091	0.07
1092	0.08
1093	0.08
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.11
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.09
1100	0.08
1101	0.1
1102	0.12
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.19
1107	0.2
1108	0.19
1109	0.17
1110	0.16
1111	0.16
1112	0.14
1113	0.16
1114	0.17
1115	0.17
1116	0.17
1117	0.17
1118	0.17
1119	0.18
1120	0.19
1121	0.2
1122	0.21
1123	0.22
1124	0.24
1125	0.28
1126	0.29
1127	0.28
1128	0.26
1129	0.28
1130	0.27
1131	0.23
1132	0.25
1133	0.24
1134	0.24
1135	0.28
1136	0.29
1137	0.24
1138	0.21
1139	0.25
1140	0.23
1141	0.23
1142	0.22
1143	0.16
1144	0.17
1145	0.17
1146	0.18
1147	0.13
1148	0.11
1149	0.09
1150	0.1
1151	0.11
1152	0.1
1153	0.1
1154	0.09
1155	0.11
1156	0.13
1157	0.13
1158	0.11
1159	0.13
1160	0.15
1161	0.19
1162	0.2
1163	0.23
1164	0.22
1165	0.24
1166	0.24
1167	0.21
1168	0.2
1169	0.15
1170	0.15
1171	0.11
1172	0.11
1173	0.09
1174	0.11
1175	0.11
1176	0.11
1177	0.11
1178	0.11
1179	0.11
1180	0.12
1181	0.14
1182	0.12
1183	0.13
1184	0.13
1185	0.13
1186	0.15
1187	0.15
1188	0.15
1189	0.15
1190	0.15
1191	0.15
1192	0.18
1193	0.18
1194	0.2
1195	0.25
1196	0.3
1197	0.31
1198	0.33
1199	0.33
1200	0.3
1201	0.3
1202	0.27
1203	0.21
1204	0.15
1205	0.12
1206	0.11
1207	0.12
1208	0.13
1209	0.17
1210	0.18
1211	0.26
1212	0.32
1213	0.37
1214	0.43
1215	0.47
1216	0.53
1217	0.58
1218	0.63
1219	0.63
1220	0.59
1221	0.56
1222	0.5
1223	0.5
1224	0.47
1225	0.38
1226	0.3
1227	0.22
1228	0.19
1229	0.18
1230	0.18
1231	0.14
1232	0.11
1233	0.15
1234	0.16
1235	0.16
1236	0.17
1237	0.17
1238	0.2
1239	0.2
1240	0.2
1241	0.18
1242	0.17
1243	0.18
1244	0.2
1245	0.19
1246	0.18
1247	0.19
1248	0.2
1249	0.22
1250	0.29
1251	0.33
1252	0.34
1253	0.35
1254	0.35
1255	0.38
1256	0.39
1257	0.35
1258	0.31
1259	0.26
1260	0.23
1261	0.22
1262	0.2
1263	0.14
1264	0.13

A0A4S4LCH2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer