Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4L129

Protein Details
Accession A0A4S4L129    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
502-542IRIPVARPKKETKEEKHARKQSVKDERQARRVEKKATKDHFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-124RIGGLKGKRKAR
300-302KRR
507-537ARPKKETKEEKHARKQSVKDERQARRVEKKA
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPSKSVFKQPGTRHFQLVHRSQRDPLIHDSDASQHVLKPIVRGKTRAELERMLAPEELAHDLERANIGEASQFGVYYDDTEYDYMQHLRQVGLREDGIDGVLIEAPVSSSSKRIGGLKGKRKARGEVEGDLLCDLPHEALPSVLERSREEVYNSQAAVPPALVGLQPDMDPHLRQTLEALEDDAFVDDNLDDDFFSSLVGEGDRGSCDDEESGFEFAEDGLEEDEGSGADAETGAEQRSKSHGLDKEQKEVEDNSWQARFAKFKKDHEAHSESDIASDIQSEGGDTVGQLPTASVIGGKKRRKGASDASGYSMSSSSMFRNEGLTLLDEHFNQVEKEYASNDEEEELSDDSDEASELITSREDFNTIMNDFLDNYEILGGKMRPVLAGETVADKLGTIRQSLKEIGYDAHEQLLQEDDEENDDMFETYVEEKAARWDCETVLSTYSKLENHPRLIRARETKIMPKIHLDPKTGLPSVKSVNDEEHLVTNGLASVESEAVRLIRIPVARPKKETKEEKHARKQSVKDERQARRVEKKATKDHFSTEKKQQLQVLANTSKKGIRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.64
4 0.65
5 0.65
6 0.61
7 0.61
8 0.59
9 0.62
10 0.59
11 0.55
12 0.52
13 0.49
14 0.43
15 0.41
16 0.39
17 0.36
18 0.34
19 0.33
20 0.26
21 0.21
22 0.22
23 0.26
24 0.26
25 0.28
26 0.32
27 0.38
28 0.41
29 0.43
30 0.45
31 0.5
32 0.55
33 0.54
34 0.52
35 0.46
36 0.46
37 0.48
38 0.45
39 0.37
40 0.31
41 0.26
42 0.21
43 0.2
44 0.19
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.14
71 0.15
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.19
77 0.22
78 0.22
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.21
83 0.2
84 0.17
85 0.12
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.12
99 0.14
100 0.17
101 0.23
102 0.31
103 0.41
104 0.49
105 0.57
106 0.62
107 0.67
108 0.68
109 0.68
110 0.64
111 0.63
112 0.58
113 0.52
114 0.5
115 0.43
116 0.4
117 0.33
118 0.27
119 0.18
120 0.14
121 0.11
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.18
134 0.2
135 0.2
136 0.22
137 0.22
138 0.24
139 0.26
140 0.26
141 0.23
142 0.24
143 0.23
144 0.2
145 0.16
146 0.12
147 0.08
148 0.09
149 0.07
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.1
226 0.13
227 0.13
228 0.19
229 0.23
230 0.28
231 0.39
232 0.4
233 0.44
234 0.43
235 0.42
236 0.38
237 0.35
238 0.3
239 0.25
240 0.23
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.18
246 0.21
247 0.19
248 0.29
249 0.31
250 0.35
251 0.45
252 0.46
253 0.48
254 0.5
255 0.52
256 0.42
257 0.4
258 0.37
259 0.27
260 0.24
261 0.22
262 0.14
263 0.09
264 0.08
265 0.06
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.11
284 0.2
285 0.24
286 0.28
287 0.34
288 0.37
289 0.38
290 0.43
291 0.44
292 0.45
293 0.47
294 0.44
295 0.4
296 0.38
297 0.35
298 0.3
299 0.23
300 0.15
301 0.1
302 0.09
303 0.07
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.09
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.1
385 0.14
386 0.15
387 0.18
388 0.2
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.17
393 0.17
394 0.18
395 0.16
396 0.16
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.15
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.15
420 0.2
421 0.19
422 0.2
423 0.21
424 0.21
425 0.25
426 0.26
427 0.2
428 0.19
429 0.19
430 0.18
431 0.18
432 0.2
433 0.18
434 0.2
435 0.28
436 0.31
437 0.38
438 0.43
439 0.46
440 0.49
441 0.52
442 0.57
443 0.56
444 0.55
445 0.54
446 0.54
447 0.57
448 0.59
449 0.59
450 0.52
451 0.5
452 0.52
453 0.54
454 0.55
455 0.5
456 0.46
457 0.47
458 0.52
459 0.48
460 0.41
461 0.34
462 0.33
463 0.33
464 0.34
465 0.31
466 0.26
467 0.27
468 0.28
469 0.28
470 0.25
471 0.23
472 0.21
473 0.19
474 0.17
475 0.14
476 0.13
477 0.11
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.12
490 0.14
491 0.18
492 0.28
493 0.38
494 0.43
495 0.49
496 0.56
497 0.62
498 0.71
499 0.77
500 0.75
501 0.76
502 0.82
503 0.87
504 0.89
505 0.88
506 0.87
507 0.86
508 0.84
509 0.84
510 0.85
511 0.81
512 0.79
513 0.81
514 0.8
515 0.8
516 0.81
517 0.79
518 0.78
519 0.78
520 0.8
521 0.78
522 0.79
523 0.81
524 0.8
525 0.79
526 0.72
527 0.71
528 0.71
529 0.71
530 0.69
531 0.69
532 0.7
533 0.68
534 0.69
535 0.66
536 0.63
537 0.62
538 0.6
539 0.59
540 0.58
541 0.56
542 0.53
543 0.51
544 0.48