FuNGI

A0A4S4LDA9

Protein Details

Accession

A0A4S4LDA9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-59	RSKSAFARAREAKRNRSEDT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13.5, nucl 9, cyto_mito 9, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MAQPPLQLVGPVFERPAYSRPSFSVARTAPSSGFPSVQHRSKSAFARAREAKRNRSEDTQTQRRRDVPSVQKSGMLLAENQDHVKQVDEPLEITNKALKSQSSPQSQSESTSEDKWIAQMKRDNDRAIEAMTEEEREQHRSEILEQLGPNIEELLRNARETRVAKQAENDALRSQTEHVGVNGEDAQEKHGDDNDVLQPTPSRPQSYSKELVSHPRGILVTNSPPDSRSSTPGKATRKLRFAEVTPNDVHIFQSEPSSPRRPIGLLPPPPSQRSDEGASVETIEDISESRSGTLTSTVEPEEGTPEDIRRRFFPHLLPNDPTLEWIEAGDLLEQGNSDSEPRFDLTGAPISLAQRASLPTHLGLHHHGGPAAAGYTLKDLLLLARSSVPAQRATVLGVLAKIVRRLAHREPEVAELSNRENIRSKALAVGLVALIEKGSLGVQAVDLVWTCIVLWDKEFVDGLEGVELRPLNPKTIQHEEDEDEDENGSLSSTDILSSLPFSVLLPQIAAHLHVPNLPPESLSQLLAISHRLARHSVAIATAISETPQFVANIVRTFLLTPIPPVEGRPLPDPLSLQLLHTLVLSSRTVARSLEGPVDALLRFVITSTPLSASPFPRPLAEALLRKTLEIYAALARYGIYSSVATTAVEHFGRFSVHVFSDAEVSDGLKVTWLNLQSEWMVCARDPHRTTPTHDLLWSQVLGWTWGDELLSYRRSLITKGSNTEARVWSALWGSLAVWLEGCRVNSAKAGQDEHDAVNTAVAETWNLCPQGGPEKVAVKSMVASLRQELSIWPVKDCTFQEWKGHLVTIAELTQTLSEFTRFALACAHMRTPDPAGTVKAETPSVVTIPWILDAFSILSPVVREVISNCIWEQDYNKSDHYDLSARILSLHLRSASAFLALYIRLSHVLSSGDEWCPLGAVVLERLLPGDEESAQWLVNEIIKFEGSRTYSRIKLTLLEPFFKYTIRPDEDIYMVPRSTTPQSIQLCTTQCFPADHLPSAASRRARFGLPLSRDWPCVALDHLLRSGTSPVLTNSDSVPDSWNASETELVQASLILLKHLQDRINSSYFQQFAVGLEHMAFVCMKVIMLEHNQQQSDSIEEVFRDQYVGQLMDDLLRPFSYEKSRWSNRPTTVPPNLEDVSKGFLGSGTPFYQFYTDFVALYDAISFSHRTFARLLLLPASMSYALDYRKHLWGDFGHVLRTIQTPIDDVLVHDFDSYLWPFETDAEMIGWYLRALIKWPLDGFVRFLAIHHVSCNIWSDLREGCGFVRESRARMLLLAVINQAKTDVVKDVVCYAQIRGSNVRLPPDCFGCDGDRKAARLAYVREWGVVQAVGTVEKIFFEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.25
4	0.28
5	0.28
6	0.3
7	0.32
8	0.37
9	0.38
10	0.36
11	0.41
12	0.35
13	0.38
14	0.38
15	0.38
16	0.33
17	0.34
18	0.36
19	0.28
20	0.29
21	0.26
22	0.31
23	0.37
24	0.42
25	0.42
26	0.41
27	0.44
28	0.48
29	0.53
30	0.55
31	0.54
32	0.51
33	0.58
34	0.64
35	0.68
36	0.72
37	0.74
38	0.74
39	0.76
40	0.8
41	0.75
42	0.74
43	0.73
44	0.72
45	0.74
46	0.75
47	0.74
48	0.74
49	0.76
50	0.73
51	0.72
52	0.68
53	0.68
54	0.68
55	0.69
56	0.7
57	0.64
58	0.61
59	0.54
60	0.5
61	0.42
62	0.33
63	0.24
64	0.2
65	0.22
66	0.22
67	0.23
68	0.21
69	0.21
70	0.2
71	0.2
72	0.19
73	0.19
74	0.21
75	0.21
76	0.21
77	0.23
78	0.26
79	0.25
80	0.24
81	0.26
82	0.22
83	0.24
84	0.25
85	0.23
86	0.25
87	0.34
88	0.42
89	0.45
90	0.49
91	0.49
92	0.53
93	0.53
94	0.5
95	0.44
96	0.39
97	0.33
98	0.31
99	0.3
100	0.25
101	0.25
102	0.25
103	0.3
104	0.28
105	0.33
106	0.37
107	0.42
108	0.5
109	0.55
110	0.54
111	0.47
112	0.49
113	0.43
114	0.37
115	0.32
116	0.23
117	0.2
118	0.18
119	0.19
120	0.15
121	0.19
122	0.2
123	0.23
124	0.24
125	0.22
126	0.24
127	0.24
128	0.26
129	0.27
130	0.27
131	0.28
132	0.26
133	0.27
134	0.27
135	0.25
136	0.23
137	0.17
138	0.16
139	0.12
140	0.14
141	0.19
142	0.18
143	0.19
144	0.21
145	0.21
146	0.28
147	0.3
148	0.33
149	0.35
150	0.37
151	0.37
152	0.4
153	0.45
154	0.45
155	0.45
156	0.42
157	0.35
158	0.34
159	0.33
160	0.3
161	0.25
162	0.21
163	0.21
164	0.19
165	0.18
166	0.19
167	0.18
168	0.19
169	0.18
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.16
174	0.15
175	0.15
176	0.14
177	0.16
178	0.17
179	0.15
180	0.2
181	0.22
182	0.23
183	0.22
184	0.22
185	0.21
186	0.21
187	0.29
188	0.28
189	0.27
190	0.27
191	0.35
192	0.41
193	0.48
194	0.51
195	0.46
196	0.47
197	0.46
198	0.53
199	0.51
200	0.49
201	0.41
202	0.39
203	0.37
204	0.32
205	0.32
206	0.27
207	0.28
208	0.27
209	0.29
210	0.26
211	0.27
212	0.29
213	0.32
214	0.29
215	0.29
216	0.32
217	0.34
218	0.41
219	0.48
220	0.51
221	0.54
222	0.6
223	0.62
224	0.63
225	0.61
226	0.59
227	0.56
228	0.51
229	0.54
230	0.49
231	0.46
232	0.39
233	0.4
234	0.35
235	0.32
236	0.29
237	0.19
238	0.18
239	0.13
240	0.16
241	0.16
242	0.18
243	0.24
244	0.29
245	0.29
246	0.29
247	0.31
248	0.29
249	0.29
250	0.36
251	0.4
252	0.42
253	0.46
254	0.51
255	0.53
256	0.53
257	0.53
258	0.47
259	0.41
260	0.37
261	0.36
262	0.31
263	0.3
264	0.29
265	0.26
266	0.23
267	0.2
268	0.15
269	0.11
270	0.08
271	0.06
272	0.05
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.12
281	0.11
282	0.11
283	0.13
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.12
288	0.13
289	0.12
290	0.14
291	0.13
292	0.15
293	0.23
294	0.25
295	0.27
296	0.27
297	0.32
298	0.34
299	0.37
300	0.41
301	0.43
302	0.48
303	0.51
304	0.51
305	0.48
306	0.46
307	0.42
308	0.36
309	0.28
310	0.22
311	0.16
312	0.13
313	0.12
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.06
323	0.05
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.11
332	0.12
333	0.17
334	0.16
335	0.15
336	0.16
337	0.15
338	0.18
339	0.17
340	0.14
341	0.11
342	0.12
343	0.14
344	0.13
345	0.14
346	0.13
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.17
351	0.2
352	0.21
353	0.2
354	0.19
355	0.16
356	0.16
357	0.14
358	0.12
359	0.08
360	0.05
361	0.05
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.09
372	0.1
373	0.11
374	0.14
375	0.15
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.14
382	0.12
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.12
391	0.14
392	0.21
393	0.26
394	0.33
395	0.34
396	0.36
397	0.36
398	0.38
399	0.38
400	0.32
401	0.26
402	0.2
403	0.2
404	0.23
405	0.21
406	0.19
407	0.21
408	0.21
409	0.25
410	0.23
411	0.22
412	0.2
413	0.2
414	0.19
415	0.15
416	0.15
417	0.1
418	0.09
419	0.08
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.09
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.14
457	0.15
458	0.15
459	0.18
460	0.21
461	0.25
462	0.33
463	0.34
464	0.29
465	0.32
466	0.31
467	0.31
468	0.31
469	0.25
470	0.18
471	0.16
472	0.14
473	0.11
474	0.1
475	0.07
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.07
498	0.07
499	0.08
500	0.1
501	0.1
502	0.11
503	0.13
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.15
508	0.14
509	0.14
510	0.12
511	0.1
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.09
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.11
520	0.12
521	0.13
522	0.13
523	0.12
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.1
550	0.09
551	0.1
552	0.13
553	0.13
554	0.15
555	0.16
556	0.18
557	0.18
558	0.19
559	0.19
560	0.15
561	0.18
562	0.16
563	0.14
564	0.14
565	0.12
566	0.12
567	0.11
568	0.1
569	0.06
570	0.08
571	0.08
572	0.06
573	0.08
574	0.09
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.11
580	0.12
581	0.1
582	0.09
583	0.09
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.05
594	0.06
595	0.07
596	0.07
597	0.09
598	0.11
599	0.13
600	0.15
601	0.18
602	0.18
603	0.17
604	0.17
605	0.16
606	0.19
607	0.21
608	0.21
609	0.2
610	0.25
611	0.24
612	0.23
613	0.23
614	0.19
615	0.15
616	0.12
617	0.11
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.08
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.06
626	0.04
627	0.04
628	0.05
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.08
640	0.07
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.1
648	0.1
649	0.09
650	0.07
651	0.07
652	0.06
653	0.06
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.07
659	0.08
660	0.09
661	0.09
662	0.1
663	0.09
664	0.1
665	0.1
666	0.08
667	0.07
668	0.06
669	0.11
670	0.11
671	0.19
672	0.2
673	0.23
674	0.28
675	0.29
676	0.34
677	0.37
678	0.39
679	0.32
680	0.31
681	0.28
682	0.24
683	0.23
684	0.19
685	0.11
686	0.09
687	0.08
688	0.09
689	0.08
690	0.07
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.04
695	0.06
696	0.08
697	0.09
698	0.08
699	0.09
700	0.1
701	0.11
702	0.12
703	0.15
704	0.19
705	0.21
706	0.23
707	0.26
708	0.27
709	0.27
710	0.3
711	0.27
712	0.21
713	0.19
714	0.17
715	0.15
716	0.13
717	0.12
718	0.08
719	0.07
720	0.06
721	0.08
722	0.08
723	0.07
724	0.06
725	0.06
726	0.08
727	0.09
728	0.09
729	0.08
730	0.08
731	0.09
732	0.1
733	0.11
734	0.13
735	0.14
736	0.15
737	0.14
738	0.16
739	0.17
740	0.16
741	0.15
742	0.13
743	0.11
744	0.1
745	0.09
746	0.07
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.05
751	0.06
752	0.08
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.09
757	0.16
758	0.16
759	0.16
760	0.16
761	0.19
762	0.2
763	0.21
764	0.2
765	0.13
766	0.13
767	0.14
768	0.14
769	0.12
770	0.12
771	0.12
772	0.13
773	0.12
774	0.12
775	0.1
776	0.13
777	0.18
778	0.18
779	0.17
780	0.18
781	0.18
782	0.22
783	0.22
784	0.23
785	0.22
786	0.24
787	0.28
788	0.28
789	0.29
790	0.26
791	0.26
792	0.21
793	0.15
794	0.14
795	0.1
796	0.09
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.06
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.11
808	0.1
809	0.11
810	0.12
811	0.13
812	0.15
813	0.17
814	0.18
815	0.14
816	0.15
817	0.16
818	0.16
819	0.16
820	0.15
821	0.14
822	0.15
823	0.15
824	0.16
825	0.15
826	0.14
827	0.13
828	0.11
829	0.11
830	0.1
831	0.09
832	0.08
833	0.07
834	0.06
835	0.06
836	0.07
837	0.06
838	0.06
839	0.05
840	0.06
841	0.07
842	0.06
843	0.06
844	0.05
845	0.05
846	0.06
847	0.06
848	0.07
849	0.05
850	0.06
851	0.06
852	0.11
853	0.12
854	0.13
855	0.13
856	0.13
857	0.14
858	0.14
859	0.16
860	0.18
861	0.19
862	0.21
863	0.22
864	0.22
865	0.22
866	0.22
867	0.23
868	0.19
869	0.17
870	0.18
871	0.18
872	0.16
873	0.16
874	0.16
875	0.15
876	0.13
877	0.15
878	0.11
879	0.11
880	0.11
881	0.12
882	0.11
883	0.1
884	0.09
885	0.07
886	0.08
887	0.07
888	0.07
889	0.06
890	0.07
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.07
895	0.08
896	0.08
897	0.1
898	0.12
899	0.11
900	0.11
901	0.11
902	0.1
903	0.09
904	0.09
905	0.07
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.06
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.07
917	0.06
918	0.07
919	0.08
920	0.09
921	0.09
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.11
926	0.1
927	0.09
928	0.1
929	0.1
930	0.1
931	0.1
932	0.14
933	0.14
934	0.16
935	0.19
936	0.22
937	0.25
938	0.27
939	0.28
940	0.24
941	0.25
942	0.25
943	0.29
944	0.28
945	0.28
946	0.27
947	0.28
948	0.28
949	0.25
950	0.24
951	0.21
952	0.26
953	0.27
954	0.28
955	0.26
956	0.28
957	0.3
958	0.3
959	0.28
960	0.23
961	0.18
962	0.17
963	0.16
964	0.17
965	0.18
966	0.19
967	0.18
968	0.24
969	0.27
970	0.28
971	0.3
972	0.31
973	0.31
974	0.29
975	0.3
976	0.23
977	0.22
978	0.21
979	0.22
980	0.25
981	0.26
982	0.25
983	0.24
984	0.23
985	0.24
986	0.26
987	0.29
988	0.25
989	0.23
990	0.26
991	0.27
992	0.27
993	0.27
994	0.29
995	0.33
996	0.33
997	0.37
998	0.37
999	0.37
1000	0.37
1001	0.36
1002	0.31
1003	0.23
1004	0.19
1005	0.16
1006	0.17
1007	0.16
1008	0.17
1009	0.18
1010	0.17
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.16
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.14
1019	0.15
1020	0.14
1021	0.13
1022	0.16
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.17
1026	0.14
1027	0.15
1028	0.15
1029	0.16
1030	0.13
1031	0.14
1032	0.14
1033	0.12
1034	0.14
1035	0.12
1036	0.12
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.09
1040	0.11
1041	0.1
1042	0.08
1043	0.08
1044	0.09
1045	0.13
1046	0.17
1047	0.19
1048	0.18
1049	0.23
1050	0.28
1051	0.3
1052	0.3
1053	0.28
1054	0.31
1055	0.29
1056	0.27
1057	0.23
1058	0.18
1059	0.16
1060	0.18
1061	0.16
1062	0.11
1063	0.1
1064	0.11
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.09
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.06
1071	0.06
1072	0.05
1073	0.06
1074	0.08
1075	0.12
1076	0.17
1077	0.22
1078	0.26
1079	0.26
1080	0.26
1081	0.27
1082	0.25
1083	0.24
1084	0.2
1085	0.16
1086	0.13
1087	0.13
1088	0.15
1089	0.14
1090	0.13
1091	0.12
1092	0.1
1093	0.11
1094	0.13
1095	0.14
1096	0.12
1097	0.12
1098	0.12
1099	0.13
1100	0.15
1101	0.13
1102	0.11
1103	0.1
1104	0.12
1105	0.12
1106	0.16
1107	0.22
1108	0.23
1109	0.3
1110	0.39
1111	0.46
1112	0.52
1113	0.59
1114	0.62
1115	0.6
1116	0.67
1117	0.66
1118	0.66
1119	0.67
1120	0.63
1121	0.57
1122	0.55
1123	0.51
1124	0.42
1125	0.36
1126	0.29
1127	0.24
1128	0.21
1129	0.19
1130	0.12
1131	0.12
1132	0.12
1133	0.13
1134	0.15
1135	0.13
1136	0.14
1137	0.15
1138	0.16
1139	0.17
1140	0.16
1141	0.16
1142	0.19
1143	0.18
1144	0.17
1145	0.17
1146	0.18
1147	0.16
1148	0.16
1149	0.15
1150	0.07
1151	0.07
1152	0.09
1153	0.1
1154	0.09
1155	0.17
1156	0.17
1157	0.18
1158	0.19
1159	0.21
1160	0.25
1161	0.26
1162	0.27
1163	0.22
1164	0.22
1165	0.2
1166	0.19
1167	0.19
1168	0.13
1169	0.11
1170	0.11
1171	0.11
1172	0.14
1173	0.16
1174	0.2
1175	0.21
1176	0.27
1177	0.28
1178	0.27
1179	0.29
1180	0.28
1181	0.33
1182	0.36
1183	0.34
1184	0.3
1185	0.29
1186	0.29
1187	0.27
1188	0.27
1189	0.21
1190	0.15
1191	0.15
1192	0.15
1193	0.15
1194	0.16
1195	0.14
1196	0.13
1197	0.16
1198	0.16
1199	0.15
1200	0.14
1201	0.13
1202	0.12
1203	0.16
1204	0.16
1205	0.13
1206	0.12
1207	0.12
1208	0.13
1209	0.14
1210	0.16
1211	0.12
1212	0.12
1213	0.11
1214	0.1
1215	0.1
1216	0.1
1217	0.09
1218	0.07
1219	0.08
1220	0.08
1221	0.08
1222	0.11
1223	0.17
1224	0.18
1225	0.21
1226	0.22
1227	0.23
1228	0.25
1229	0.26
1230	0.26
1231	0.22
1232	0.22
1233	0.19
1234	0.18
1235	0.23
1236	0.22
1237	0.22
1238	0.21
1239	0.21
1240	0.19
1241	0.2
1242	0.24
1243	0.19
1244	0.18
1245	0.18
1246	0.19
1247	0.19
1248	0.22
1249	0.21
1250	0.19
1251	0.17
1252	0.21
1253	0.22
1254	0.21
1255	0.29
1256	0.29
1257	0.31
1258	0.34
1259	0.36
1260	0.31
1261	0.3
1262	0.29
1263	0.24
1264	0.23
1265	0.22
1266	0.21
1267	0.22
1268	0.21
1269	0.2
1270	0.19
1271	0.15
1272	0.15
1273	0.14
1274	0.13
1275	0.14
1276	0.15
1277	0.16
1278	0.19
1279	0.19
1280	0.21
1281	0.2
1282	0.19
1283	0.21
1284	0.23
1285	0.26
1286	0.27
1287	0.3
1288	0.34
1289	0.36
1290	0.42
1291	0.41
1292	0.41
1293	0.42
1294	0.41
1295	0.39
1296	0.35
1297	0.36
1298	0.33
1299	0.37
1300	0.37
1301	0.41
1302	0.4
1303	0.41
1304	0.42
1305	0.41
1306	0.38
1307	0.38
1308	0.4
1309	0.38
1310	0.41
1311	0.39
1312	0.37
1313	0.36
1314	0.32
1315	0.27
1316	0.23
1317	0.16
1318	0.11
1319	0.11
1320	0.11
1321	0.11
1322	0.11
1323	0.09

A0A4S4LDA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer