FuNGI

A0A4S4LCH0

Protein Details

Accession

A0A4S4LCH0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-62	ECPARRHPCKAQHSICIRRW	Hydrophilic
88-108	ASPQTRRQRALPPRRPRATFF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 6, cyto 4, plas 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007852 Cdc73/Parafibromin IPR031336 CDC73_C IPR038103 CDC73_C_sf
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF05179 CDC73_C

Amino Acid Sequences

MQLVPALILLFWPGPYSLSLSHRDFFFTAVPVHDNERSPRSAECPARRHPCKAQHSICIRRWAMPHSRCRDPPRPLAIAFPPKGLADASPQTRRQRALPPRRPRATFFRLDAVLLAWLLRDASAAEYMKEARENGLLGAFVSNTERKGVAEWLDGKTRHYKGIVSLQSDSTTPPGTPPQKDATLPAAAGQSGIPSSTAPAKRRHVVDAADAEIVKKIRMNEVELSDRTSILRGTKPNNFNNVRIMYAEKLKKLKEASKGGTVSHSTTAPKMDMKAQARKARNMQPIIMISSSPTSLITMYNVRLFLQEATFENPTDARARANAEGNTRPEDMIPIYRKHTHIDSSGQERETQAKYLVVDGVEALAKFGTDAWDRVVAVLTTGQAWQFKPYKWAEPKTLFHHVKGFYVSWANDPPNVKIKDWNVTELKARRQVSSGELLEVAGFMDIGEQTVAHKVLIPVIPPLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.14
4	0.16
5	0.2
6	0.27
7	0.3
8	0.33
9	0.32
10	0.35
11	0.32
12	0.29
13	0.27
14	0.23
15	0.21
16	0.2
17	0.22
18	0.2
19	0.24
20	0.26
21	0.28
22	0.3
23	0.34
24	0.34
25	0.33
26	0.34
27	0.34
28	0.4
29	0.46
30	0.5
31	0.52
32	0.6
33	0.69
34	0.72
35	0.74
36	0.74
37	0.75
38	0.75
39	0.79
40	0.75
41	0.73
42	0.78
43	0.8
44	0.77
45	0.76
46	0.68
47	0.62
48	0.59
49	0.57
50	0.58
51	0.56
52	0.61
53	0.57
54	0.64
55	0.67
56	0.73
57	0.75
58	0.72
59	0.73
60	0.71
61	0.69
62	0.61
63	0.59
64	0.58
65	0.58
66	0.52
67	0.43
68	0.37
69	0.32
70	0.32
71	0.27
72	0.2
73	0.16
74	0.21
75	0.26
76	0.32
77	0.38
78	0.43
79	0.48
80	0.49
81	0.48
82	0.52
83	0.57
84	0.62
85	0.66
86	0.71
87	0.77
88	0.82
89	0.81
90	0.76
91	0.74
92	0.71
93	0.66
94	0.58
95	0.53
96	0.46
97	0.43
98	0.38
99	0.28
100	0.21
101	0.15
102	0.12
103	0.06
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.04
108	0.04
109	0.05
110	0.09
111	0.1
112	0.1
113	0.12
114	0.12
115	0.13
116	0.14
117	0.13
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.07
127	0.06
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.12
135	0.14
136	0.13
137	0.16
138	0.18
139	0.2
140	0.25
141	0.25
142	0.26
143	0.31
144	0.3
145	0.29
146	0.27
147	0.25
148	0.24
149	0.33
150	0.34
151	0.29
152	0.3
153	0.28
154	0.28
155	0.27
156	0.24
157	0.16
158	0.13
159	0.1
160	0.1
161	0.17
162	0.21
163	0.22
164	0.26
165	0.28
166	0.29
167	0.3
168	0.31
169	0.27
170	0.23
171	0.21
172	0.19
173	0.15
174	0.13
175	0.13
176	0.1
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.04
181	0.04
182	0.05
183	0.12
184	0.16
185	0.19
186	0.26
187	0.3
188	0.34
189	0.36
190	0.38
191	0.34
192	0.31
193	0.31
194	0.27
195	0.24
196	0.21
197	0.19
198	0.16
199	0.14
200	0.13
201	0.1
202	0.1
203	0.09
204	0.12
205	0.13
206	0.16
207	0.17
208	0.19
209	0.23
210	0.22
211	0.24
212	0.2
213	0.19
214	0.17
215	0.14
216	0.12
217	0.11
218	0.14
219	0.15
220	0.19
221	0.26
222	0.33
223	0.36
224	0.44
225	0.43
226	0.41
227	0.43
228	0.4
229	0.33
230	0.27
231	0.25
232	0.18
233	0.23
234	0.24
235	0.22
236	0.25
237	0.24
238	0.27
239	0.3
240	0.34
241	0.35
242	0.39
243	0.39
244	0.41
245	0.42
246	0.39
247	0.37
248	0.33
249	0.26
250	0.21
251	0.19
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.13
256	0.13
257	0.12
258	0.15
259	0.21
260	0.25
261	0.33
262	0.39
263	0.46
264	0.48
265	0.52
266	0.55
267	0.57
268	0.59
269	0.53
270	0.47
271	0.42
272	0.4
273	0.37
274	0.31
275	0.21
276	0.14
277	0.13
278	0.12
279	0.09
280	0.08
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.08
285	0.1
286	0.11
287	0.12
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.13
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.11
305	0.12
306	0.15
307	0.17
308	0.21
309	0.23
310	0.25
311	0.29
312	0.3
313	0.32
314	0.3
315	0.28
316	0.23
317	0.22
318	0.2
319	0.23
320	0.24
321	0.23
322	0.27
323	0.31
324	0.33
325	0.34
326	0.35
327	0.31
328	0.3
329	0.33
330	0.33
331	0.36
332	0.39
333	0.36
334	0.34
335	0.32
336	0.34
337	0.3
338	0.28
339	0.22
340	0.19
341	0.19
342	0.19
343	0.2
344	0.14
345	0.12
346	0.1
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.12
359	0.15
360	0.15
361	0.15
362	0.16
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.1
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.18
373	0.22
374	0.23
375	0.3
376	0.33
377	0.42
378	0.48
379	0.54
380	0.56
381	0.59
382	0.64
383	0.63
384	0.7
385	0.63
386	0.56
387	0.57
388	0.49
389	0.45
390	0.42
391	0.36
392	0.29
393	0.31
394	0.3
395	0.26
396	0.3
397	0.29
398	0.3
399	0.31
400	0.32
401	0.37
402	0.39
403	0.36
404	0.38
405	0.41
406	0.45
407	0.46
408	0.49
409	0.43
410	0.43
411	0.5
412	0.49
413	0.53
414	0.53
415	0.52
416	0.46
417	0.46
418	0.46
419	0.42
420	0.44
421	0.37
422	0.3
423	0.29
424	0.27
425	0.24
426	0.21
427	0.16
428	0.08
429	0.06
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.05
436	0.07
437	0.11
438	0.12
439	0.1
440	0.13
441	0.13
442	0.19
443	0.21
444	0.21

A0A4S4LCH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer