FuNGI

A0A4S4LH49

Protein Details

Accession

A0A4S4LH49

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
617-641	CVPTPEPTTRPKRNRKLTRRAKGLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
628-638	PKRNRKLTRRA

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 4, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MPKAFQSIIDSSTNAIDTYNLINPAAPRRLTPTMLLMALHEGHSKHNLLNPVKKSEQANYANNNSNSGKEGGSGRGGGHGRGRGQGGRGSQSRGSNQGSAYSERKCYNCGGKGHYLKMCPLPKRDQANEAMTDAKGKEEDKKRETINPKTLNRSSSSNSKHTQTDQHIRIDAFDSGASLHLTPEKNRLLNVRSCNPVSICATNGSTFQANLEGELNLVIPNGNNQSVIPLRNVKYAPAMHSTLISILKLDADGYKVLIGNNCLTISSPSGKFLGSIEHFNDIYATRWHGHCASLTDTAFSVEKLSLSNIHRHLGHVNYGYLRKMFRDGKLVGMALDETRLEEEECVPCVLAKIRPFGDHFHMDIWGPAKVRASGHGLYALTIVDDATRWLQMSVMQRKSDSFARYVAWQTFLKTNFGITIKQLQSDNNGAFLSSKFKSYLESMGTEQRLTVHDTPQQNGVAERXHGTIFNAIRANMNNSALPTWLWGECLGYVTFIYNRTPNAALNYRSPYEARFGQIPDLSDIYQFGQPCVVRLETAPKLGDCGTMCRWLGPDEKSNGHRIYHPTQHKISIERNIVMLKPQTPDVQEEKECVDIGPDSENVENLQQQTNLPSVPDECVPTPEPTTRPKRNRKLTRRAKGLELMDEDPDDQPAEEEANEVNRVEAMLASGGDPLDDPTTISQLGKRADGDYWWSAMHEEVRILEKRGTWEYVYPPPNSNIIESKFVFRTKRNADGSIEKYKARLVARGFTQVDGVDYYSDDTFAPVTRLSSVRSILSYAAANNWEIHQIDIKLAYLYGELEDDETIFMRPPQHYELDGIQPGQVLRLRKALYGLKQAGRRWYQVLVNTLTNAGMTRSDYDNAVFYRHHPNGDISILFSHVDDLTLISNETSRIRMLKDKIGAQVEYTDGGEINWLLGVEIKRDRTKRTIMMRQFSYLETILTRYGFKDARPTNTPMDPHLRLSIEQCPTTNDEIAEMSKRPYAAAVGALRYAADVTWPDIAYAVGQLARYLRNPGFTHWTACKHVYQYLRSTKENWLVFGGNGYGLIGYSDADGMSTEGRHAISGYVFKLFGSAISWSSKRQTLVVLSTTEAEYVALTHAAREAIWLCALLSQVFKLESLPVEIHCDNQSAIALSAENRFHARTKHIDIQYHFIRQCVADGKILVPYVPTDDQEADIFTKALPPIKVKRFTDRLGLRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.15
3	0.11
4	0.11
5	0.15
6	0.17
7	0.17
8	0.16
9	0.18
10	0.21
11	0.28
12	0.32
13	0.29
14	0.27
15	0.34
16	0.39
17	0.39
18	0.38
19	0.36
20	0.33
21	0.33
22	0.31
23	0.25
24	0.23
25	0.22
26	0.21
27	0.19
28	0.16
29	0.18
30	0.23
31	0.24
32	0.22
33	0.26
34	0.34
35	0.39
36	0.47
37	0.49
38	0.53
39	0.53
40	0.56
41	0.55
42	0.52
43	0.54
44	0.53
45	0.55
46	0.54
47	0.59
48	0.63
49	0.6
50	0.59
51	0.51
52	0.44
53	0.4
54	0.34
55	0.27
56	0.21
57	0.23
58	0.21
59	0.22
60	0.22
61	0.19
62	0.24
63	0.25
64	0.24
65	0.27
66	0.28
67	0.28
68	0.3
69	0.33
70	0.29
71	0.31
72	0.33
73	0.32
74	0.35
75	0.36
76	0.38
77	0.39
78	0.42
79	0.43
80	0.45
81	0.45
82	0.4
83	0.38
84	0.39
85	0.37
86	0.37
87	0.38
88	0.35
89	0.37
90	0.38
91	0.39
92	0.36
93	0.39
94	0.43
95	0.45
96	0.47
97	0.48
98	0.54
99	0.58
100	0.63
101	0.61
102	0.54
103	0.51
104	0.55
105	0.56
106	0.52
107	0.53
108	0.54
109	0.58
110	0.65
111	0.64
112	0.61
113	0.6
114	0.59
115	0.55
116	0.48
117	0.42
118	0.33
119	0.33
120	0.27
121	0.22
122	0.19
123	0.18
124	0.26
125	0.33
126	0.43
127	0.44
128	0.5
129	0.52
130	0.6
131	0.67
132	0.67
133	0.68
134	0.69
135	0.7
136	0.73
137	0.73
138	0.67
139	0.62
140	0.57
141	0.51
142	0.52
143	0.52
144	0.51
145	0.5
146	0.5
147	0.51
148	0.5
149	0.54
150	0.53
151	0.56
152	0.54
153	0.55
154	0.55
155	0.51
156	0.48
157	0.42
158	0.33
159	0.24
160	0.19
161	0.14
162	0.11
163	0.12
164	0.11
165	0.09
166	0.09
167	0.13
168	0.16
169	0.17
170	0.25
171	0.29
172	0.29
173	0.32
174	0.37
175	0.37
176	0.42
177	0.48
178	0.46
179	0.46
180	0.46
181	0.48
182	0.42
183	0.41
184	0.37
185	0.32
186	0.27
187	0.24
188	0.25
189	0.22
190	0.22
191	0.21
192	0.17
193	0.16
194	0.15
195	0.16
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.08
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.15
213	0.18
214	0.2
215	0.2
216	0.25
217	0.26
218	0.32
219	0.32
220	0.29
221	0.32
222	0.33
223	0.33
224	0.31
225	0.31
226	0.25
227	0.26
228	0.25
229	0.21
230	0.2
231	0.16
232	0.12
233	0.1
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.07
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.1
243	0.11
244	0.12
245	0.13
246	0.13
247	0.14
248	0.14
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.15
253	0.17
254	0.17
255	0.17
256	0.18
257	0.18
258	0.17
259	0.16
260	0.2
261	0.17
262	0.2
263	0.2
264	0.22
265	0.22
266	0.22
267	0.22
268	0.16
269	0.16
270	0.15
271	0.16
272	0.15
273	0.16
274	0.19
275	0.19
276	0.19
277	0.19
278	0.2
279	0.2
280	0.23
281	0.22
282	0.2
283	0.19
284	0.2
285	0.18
286	0.15
287	0.13
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.14
293	0.16
294	0.23
295	0.24
296	0.26
297	0.26
298	0.27
299	0.29
300	0.26
301	0.28
302	0.23
303	0.22
304	0.23
305	0.24
306	0.24
307	0.23
308	0.21
309	0.18
310	0.23
311	0.26
312	0.25
313	0.31
314	0.3
315	0.32
316	0.33
317	0.32
318	0.25
319	0.21
320	0.19
321	0.12
322	0.12
323	0.08
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.1
330	0.1
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.1
335	0.11
336	0.13
337	0.15
338	0.16
339	0.19
340	0.2
341	0.23
342	0.24
343	0.27
344	0.3
345	0.29
346	0.27
347	0.23
348	0.23
349	0.2
350	0.2
351	0.18
352	0.15
353	0.13
354	0.13
355	0.13
356	0.14
357	0.15
358	0.16
359	0.2
360	0.18
361	0.18
362	0.2
363	0.18
364	0.17
365	0.17
366	0.14
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.11
379	0.2
380	0.28
381	0.31
382	0.32
383	0.32
384	0.32
385	0.36
386	0.37
387	0.3
388	0.23
389	0.2
390	0.21
391	0.23
392	0.25
393	0.23
394	0.21
395	0.19
396	0.2
397	0.23
398	0.23
399	0.22
400	0.19
401	0.19
402	0.18
403	0.19
404	0.17
405	0.14
406	0.22
407	0.2
408	0.22
409	0.23
410	0.2
411	0.23
412	0.26
413	0.24
414	0.17
415	0.17
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.12
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.15
425	0.16
426	0.19
427	0.16
428	0.18
429	0.18
430	0.23
431	0.24
432	0.21
433	0.2
434	0.17
435	0.16
436	0.2
437	0.2
438	0.17
439	0.22
440	0.24
441	0.25
442	0.27
443	0.26
444	0.21
445	0.21
446	0.19
447	0.16
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.14
460	0.17
461	0.17
462	0.17
463	0.15
464	0.14
465	0.14
466	0.12
467	0.12
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.08
474	0.07
475	0.09
476	0.08
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.1
483	0.1
484	0.1
485	0.12
486	0.13
487	0.13
488	0.17
489	0.2
490	0.2
491	0.23
492	0.26
493	0.24
494	0.24
495	0.24
496	0.2
497	0.2
498	0.19
499	0.17
500	0.16
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.18
505	0.16
506	0.15
507	0.14
508	0.12
509	0.12
510	0.11
511	0.12
512	0.11
513	0.09
514	0.11
515	0.11
516	0.12
517	0.13
518	0.12
519	0.1
520	0.1
521	0.17
522	0.15
523	0.17
524	0.16
525	0.14
526	0.15
527	0.15
528	0.17
529	0.11
530	0.14
531	0.14
532	0.17
533	0.17
534	0.16
535	0.16
536	0.16
537	0.19
538	0.18
539	0.21
540	0.21
541	0.24
542	0.26
543	0.3
544	0.29
545	0.26
546	0.27
547	0.28
548	0.3
549	0.35
550	0.39
551	0.38
552	0.38
553	0.41
554	0.39
555	0.38
556	0.36
557	0.35
558	0.32
559	0.27
560	0.27
561	0.24
562	0.23
563	0.21
564	0.18
565	0.13
566	0.12
567	0.13
568	0.13
569	0.13
570	0.17
571	0.18
572	0.21
573	0.19
574	0.2
575	0.19
576	0.18
577	0.17
578	0.13
579	0.11
580	0.07
581	0.07
582	0.08
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.08
587	0.07
588	0.08
589	0.09
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.11
605	0.13
606	0.14
607	0.15
608	0.16
609	0.18
610	0.24
611	0.33
612	0.4
613	0.48
614	0.58
615	0.66
616	0.75
617	0.83
618	0.86
619	0.88
620	0.9
621	0.89
622	0.88
623	0.8
624	0.72
625	0.67
626	0.57
627	0.49
628	0.41
629	0.33
630	0.24
631	0.22
632	0.19
633	0.14
634	0.13
635	0.09
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.06
644	0.07
645	0.07
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.03
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.12
669	0.13
670	0.13
671	0.14
672	0.14
673	0.13
674	0.14
675	0.17
676	0.13
677	0.13
678	0.12
679	0.12
680	0.11
681	0.11
682	0.12
683	0.08
684	0.07
685	0.07
686	0.11
687	0.12
688	0.13
689	0.14
690	0.14
691	0.17
692	0.19
693	0.2
694	0.17
695	0.18
696	0.21
697	0.27
698	0.3
699	0.28
700	0.28
701	0.27
702	0.29
703	0.27
704	0.25
705	0.22
706	0.2
707	0.23
708	0.22
709	0.24
710	0.23
711	0.26
712	0.27
713	0.25
714	0.32
715	0.32
716	0.4
717	0.4
718	0.4
719	0.4
720	0.44
721	0.47
722	0.46
723	0.44
724	0.35
725	0.33
726	0.31
727	0.33
728	0.27
729	0.26
730	0.21
731	0.23
732	0.25
733	0.31
734	0.3
735	0.25
736	0.25
737	0.2
738	0.19
739	0.15
740	0.14
741	0.07
742	0.07
743	0.08
744	0.07
745	0.08
746	0.07
747	0.06
748	0.07
749	0.07
750	0.08
751	0.07
752	0.07
753	0.09
754	0.1
755	0.11
756	0.13
757	0.14
758	0.14
759	0.14
760	0.14
761	0.13
762	0.13
763	0.12
764	0.1
765	0.1
766	0.1
767	0.1
768	0.1
769	0.1
770	0.1
771	0.1
772	0.1
773	0.11
774	0.11
775	0.11
776	0.11
777	0.11
778	0.09
779	0.08
780	0.08
781	0.06
782	0.06
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.05
788	0.05
789	0.05
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.1
795	0.1
796	0.13
797	0.16
798	0.18
799	0.18
800	0.2
801	0.22
802	0.23
803	0.23
804	0.2
805	0.17
806	0.16
807	0.15
808	0.15
809	0.15
810	0.13
811	0.14
812	0.2
813	0.2
814	0.2
815	0.25
816	0.27
817	0.29
818	0.35
819	0.39
820	0.38
821	0.42
822	0.44
823	0.48
824	0.46
825	0.43
826	0.37
827	0.35
828	0.34
829	0.32
830	0.35
831	0.3
832	0.27
833	0.25
834	0.24
835	0.2
836	0.17
837	0.13
838	0.09
839	0.07
840	0.07
841	0.1
842	0.11
843	0.12
844	0.13
845	0.13
846	0.15
847	0.15
848	0.16
849	0.14
850	0.15
851	0.24
852	0.25
853	0.25
854	0.23
855	0.25
856	0.25
857	0.27
858	0.24
859	0.16
860	0.15
861	0.15
862	0.14
863	0.12
864	0.1
865	0.08
866	0.08
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.07
872	0.06
873	0.07
874	0.08
875	0.09
876	0.1
877	0.1
878	0.11
879	0.14
880	0.21
881	0.24
882	0.29
883	0.32
884	0.35
885	0.39
886	0.4
887	0.38
888	0.31
889	0.29
890	0.23
891	0.2
892	0.17
893	0.12
894	0.08
895	0.08
896	0.08
897	0.06
898	0.06
899	0.05
900	0.05
901	0.04
902	0.08
903	0.09
904	0.12
905	0.16
906	0.2
907	0.27
908	0.3
909	0.35
910	0.37
911	0.43
912	0.47
913	0.54
914	0.59
915	0.61
916	0.66
917	0.63
918	0.6
919	0.55
920	0.48
921	0.42
922	0.32
923	0.24
924	0.17
925	0.16
926	0.15
927	0.14
928	0.14
929	0.11
930	0.16
931	0.17
932	0.17
933	0.25
934	0.28
935	0.34
936	0.38
937	0.41
938	0.41
939	0.44
940	0.45
941	0.4
942	0.43
943	0.39
944	0.37
945	0.36
946	0.33
947	0.29
948	0.31
949	0.34
950	0.3
951	0.29
952	0.27
953	0.27
954	0.29
955	0.31
956	0.3
957	0.22
958	0.19
959	0.19
960	0.21
961	0.2
962	0.17
963	0.16
964	0.16
965	0.16
966	0.15
967	0.15
968	0.14
969	0.12
970	0.16
971	0.17
972	0.16
973	0.16
974	0.16
975	0.15
976	0.14
977	0.13
978	0.07
979	0.07
980	0.07
981	0.08
982	0.11
983	0.11
984	0.11
985	0.11
986	0.11
987	0.1
988	0.1
989	0.09
990	0.07
991	0.07
992	0.08
993	0.1
994	0.12
995	0.13
996	0.19
997	0.19
998	0.25
999	0.26
1000	0.29
1001	0.35
1002	0.35
1003	0.39
1004	0.38
1005	0.42
1006	0.4
1007	0.42
1008	0.42
1009	0.36
1010	0.4
1011	0.41
1012	0.41
1013	0.45
1014	0.5
1015	0.53
1016	0.51
1017	0.52
1018	0.53
1019	0.55
1020	0.52
1021	0.44
1022	0.37
1023	0.33
1024	0.31
1025	0.29
1026	0.22
1027	0.14
1028	0.12
1029	0.11
1030	0.07
1031	0.06
1032	0.06
1033	0.05
1034	0.04
1035	0.05
1036	0.05
1037	0.05
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.06
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.09
1045	0.09
1046	0.09
1047	0.09
1048	0.1
1049	0.11
1050	0.14
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.15
1054	0.14
1055	0.15
1056	0.13
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.16
1062	0.18
1063	0.19
1064	0.24
1065	0.27
1066	0.27
1067	0.26
1068	0.28
1069	0.28
1070	0.31
1071	0.32
1072	0.29
1073	0.26
1074	0.27
1075	0.26
1076	0.22
1077	0.17
1078	0.12
1079	0.09
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.1
1086	0.1
1087	0.1
1088	0.11
1089	0.11
1090	0.11
1091	0.12
1092	0.11
1093	0.1
1094	0.11
1095	0.13
1096	0.11
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.12
1100	0.12
1101	0.12
1102	0.11
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.15
1106	0.16
1107	0.15
1108	0.22
1109	0.22
1110	0.24
1111	0.23
1112	0.24
1113	0.2
1114	0.2
1115	0.2
1116	0.14
1117	0.15
1118	0.12
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.17
1122	0.17
1123	0.18
1124	0.18
1125	0.2
1126	0.23
1127	0.26
1128	0.31
1129	0.34
1130	0.42
1131	0.5
1132	0.53
1133	0.59
1134	0.58
1135	0.63
1136	0.62
1137	0.63
1138	0.55
1139	0.45
1140	0.42
1141	0.35
1142	0.36
1143	0.33
1144	0.29
1145	0.24
1146	0.24
1147	0.25
1148	0.26
1149	0.26
1150	0.21
1151	0.17
1152	0.16
1153	0.18
1154	0.19
1155	0.19
1156	0.19
1157	0.2
1158	0.22
1159	0.22
1160	0.23
1161	0.19
1162	0.18
1163	0.17
1164	0.14
1165	0.17
1166	0.18
1167	0.22
1168	0.23
1169	0.29
1170	0.38
1171	0.47
1172	0.56
1173	0.56
1174	0.64
1175	0.66
1176	0.66
1177	0.69

A0A4S4LH49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer