Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LJC0

Protein Details
Accession A0A4S4LJC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-280GSRYVSRSPSRSRSRSRSKSKSPYRSRSRSISPDRIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-224SERGRSKSRSRSRSADRSNRSSRSKSGTARRSKSA
251-270SPSRSRSRSRSKSKSPYRSR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, mito 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRNALSIHGQNPQFLVETIIRNRIYESQFWKEHCFALTAETLIDRAIELNAIGGIYANQKPTEFICLLLKLLQIQPEKEILIEYLQVDEFKYLRALAAMYIRMTFGAVEVYEILEPLLKDFRKLRLRHMGGYTLTYMDEFVDQLLNDERVCDTILPRIPKRGVLEENDELGPRKSLLLDAMDGKSERGRSKSRSRSRSADRSNRSSRSKSGTARRSKSAYRSVNGSRTPSRSGSVSDAGSRYVSRSPSRSRSRSRSKSKSPYRSRSRSISPDRIEADSPPPAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.3
4 0.3
5 0.23
6 0.19
7 0.22
8 0.17
9 0.23
10 0.25
11 0.32
12 0.31
13 0.3
14 0.32
15 0.35
16 0.35
17 0.35
18 0.39
19 0.4
20 0.44
21 0.47
22 0.51
23 0.45
24 0.44
25 0.38
26 0.33
27 0.25
28 0.24
29 0.22
30 0.17
31 0.15
32 0.13
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.04
46 0.05
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.2
55 0.16
56 0.16
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.15
63 0.16
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.17
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.11
110 0.1
111 0.12
112 0.15
113 0.23
114 0.3
115 0.32
116 0.38
117 0.43
118 0.46
119 0.48
120 0.47
121 0.42
122 0.35
123 0.35
124 0.28
125 0.18
126 0.15
127 0.11
128 0.1
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.11
146 0.15
147 0.19
148 0.2
149 0.24
150 0.24
151 0.27
152 0.29
153 0.3
154 0.29
155 0.27
156 0.33
157 0.29
158 0.3
159 0.28
160 0.25
161 0.21
162 0.18
163 0.16
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.17
179 0.19
180 0.24
181 0.3
182 0.41
183 0.51
184 0.59
185 0.64
186 0.67
187 0.71
188 0.75
189 0.79
190 0.78
191 0.78
192 0.75
193 0.76
194 0.78
195 0.76
196 0.74
197 0.67
198 0.62
199 0.59
200 0.59
201 0.58
202 0.61
203 0.63
204 0.66
205 0.67
206 0.68
207 0.65
208 0.63
209 0.63
210 0.63
211 0.6
212 0.52
213 0.54
214 0.54
215 0.56
216 0.54
217 0.53
218 0.48
219 0.46
220 0.48
221 0.43
222 0.39
223 0.33
224 0.33
225 0.32
226 0.3
227 0.28
228 0.26
229 0.25
230 0.24
231 0.24
232 0.21
233 0.18
234 0.19
235 0.22
236 0.24
237 0.3
238 0.38
239 0.46
240 0.56
241 0.63
242 0.69
243 0.74
244 0.81
245 0.85
246 0.88
247 0.88
248 0.89
249 0.91
250 0.92
251 0.93
252 0.92
253 0.93
254 0.92
255 0.91
256 0.87
257 0.84
258 0.82
259 0.82
260 0.81
261 0.8
262 0.74
263 0.72
264 0.68
265 0.63
266 0.56
267 0.48
268 0.43