FuNGI

A0A4S4KJW6

Protein Details

Accession

A0A4S4KJW6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-55	RQQVHRTLLNRHNNKRQHPLRVD	Hydrophilic
364-390	KGKEEDKKKKDDKSKDTKPQQQQQQAQ	Hydrophilic
874-900	ERVPTPEPTTRPKRNRKLTRRAKGLEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
300-323	GGSGRGGGRGRGRGRGGRGGRGRG
370-373	KKKK
884-896	RPKRNRKLTRRAK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MQTRSNASLINSFNSVLHPDNNLFFVPYQTYHRQQVHRTLLNRHNNKRQHPLRVDQALQDLQYLFPSATVHARNKLDMSVDVAKTFANVPKFAEDGSNYTIFSTHITLAIRAAKGSFALTRVPNPVQQDEVEKDEQLLNAIVSLLPDKVFRKFLKKDKTFAMLEALKAHYDIKSTASVAITEAHLFMIECKNDKHFDKTLDEIEQTKERLDDLGHAINDASYISAIVKATPKAFQSIIDSSTNAIDTYNLINPVAPRRLTPTMLLTALREGHSKHNLLNPVKKSEQANYANNNSNSGKEGGSGRGGGRGRGRGRGGRGGRGRGSNQGSAYSERKCYNCGGKGHYSKMCPSPKCDQANEATTDAKGKEEDKKKKDDKSKDTKPQQQQQQAQSAFIEEITDETAWSAQMDQHIHIDAFDSGTSLHLTPEKDRLLNIRSCDPVSIRAANGSTFQANLEGELNLVIPNGNNRSVIPLQNVKYAPAMHSTLISISKLDADSYKVLIGNNRLTISSPSGKFLGSIERFNDIYATRWHGHCASLADTAFSAEKLSLSDIHRRLGHVNYGYLQKMIRDGKLVGMALDETRSEEEECVPCILAKIRRTPIPHQRQSELATAFGNRFHMDIWGPAKVCASGHGLYALTIVDDATRWLQMSVMQRKSDSFARYVAWQTFLKTNFGITIKQLQSDNDGAFLSSEFKSYLESMGTEQRLTVHDTPQQNGVAERTHGTIFNAIRANMNNSALPTWLWGECLGYVTFIYNRTPNATLNYRSPYEARFGQIPDLSDIYQFGQPCVVRLETAPKLGDRGTMCRWLGPDEKSNGHRIYHPTQHKISIERNIVMLKPQTPDVQEEKECVDIGPDSENVENLQQQTNLPSVPDERVPTPEPTTRPKRNRKLTRRAKGLELMDEDPDDQPAEEEEANEVNRVEAMLASGGDPLDDPTTISQLGKRADGDYWWSAMHEEVRILEKRGTWEYAYPPPNSNIIESKFVFRTKRNADGSIEKYKARLVARGFTQVDGVDYYSDDTFAPVTRLSSVRSILSYAAANNWEIHQIDIKSAYLYGELEDDETIFMRPPQHYELDGIQPGQVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.25
3	0.21
4	0.21
5	0.22
6	0.23
7	0.24
8	0.25
9	0.24
10	0.22
11	0.2
12	0.2
13	0.2
14	0.2
15	0.26
16	0.31
17	0.36
18	0.43
19	0.5
20	0.55
21	0.58
22	0.66
23	0.68
24	0.69
25	0.68
26	0.69
27	0.71
28	0.75
29	0.79
30	0.78
31	0.78
32	0.79
33	0.82
34	0.83
35	0.82
36	0.82
37	0.79
38	0.77
39	0.77
40	0.76
41	0.71
42	0.62
43	0.61
44	0.52
45	0.45
46	0.39
47	0.3
48	0.23
49	0.21
50	0.19
51	0.12
52	0.11
53	0.12
54	0.11
55	0.17
56	0.23
57	0.26
58	0.33
59	0.35
60	0.36
61	0.37
62	0.37
63	0.33
64	0.27
65	0.3
66	0.3
67	0.29
68	0.26
69	0.25
70	0.23
71	0.22
72	0.24
73	0.22
74	0.18
75	0.18
76	0.21
77	0.23
78	0.24
79	0.24
80	0.24
81	0.22
82	0.22
83	0.26
84	0.25
85	0.22
86	0.21
87	0.21
88	0.18
89	0.18
90	0.16
91	0.12
92	0.14
93	0.15
94	0.15
95	0.18
96	0.23
97	0.21
98	0.19
99	0.19
100	0.16
101	0.16
102	0.17
103	0.15
104	0.12
105	0.17
106	0.19
107	0.22
108	0.27
109	0.29
110	0.31
111	0.34
112	0.35
113	0.32
114	0.31
115	0.33
116	0.31
117	0.34
118	0.32
119	0.27
120	0.27
121	0.26
122	0.25
123	0.2
124	0.18
125	0.12
126	0.1
127	0.11
128	0.09
129	0.08
130	0.09
131	0.08
132	0.08
133	0.11
134	0.13
135	0.16
136	0.23
137	0.26
138	0.35
139	0.43
140	0.52
141	0.6
142	0.63
143	0.65
144	0.64
145	0.67
146	0.59
147	0.52
148	0.5
149	0.41
150	0.37
151	0.35
152	0.3
153	0.24
154	0.23
155	0.23
156	0.15
157	0.15
158	0.15
159	0.14
160	0.15
161	0.15
162	0.17
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.15
167	0.13
168	0.12
169	0.11
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.1
174	0.14
175	0.15
176	0.17
177	0.18
178	0.22
179	0.27
180	0.3
181	0.34
182	0.33
183	0.36
184	0.38
185	0.41
186	0.41
187	0.39
188	0.38
189	0.33
190	0.33
191	0.32
192	0.28
193	0.25
194	0.21
195	0.19
196	0.18
197	0.17
198	0.16
199	0.17
200	0.21
201	0.2
202	0.2
203	0.19
204	0.18
205	0.18
206	0.14
207	0.09
208	0.04
209	0.05
210	0.05
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.12
215	0.13
216	0.15
217	0.17
218	0.18
219	0.2
220	0.2
221	0.19
222	0.22
223	0.23
224	0.24
225	0.23
226	0.22
227	0.2
228	0.2
229	0.19
230	0.14
231	0.11
232	0.08
233	0.08
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.13
239	0.15
240	0.2
241	0.23
242	0.21
243	0.2
244	0.26
245	0.29
246	0.3
247	0.3
248	0.28
249	0.26
250	0.27
251	0.27
252	0.21
253	0.2
254	0.2
255	0.19
256	0.17
257	0.16
258	0.21
259	0.26
260	0.26
261	0.26
262	0.3
263	0.37
264	0.41
265	0.48
266	0.45
267	0.46
268	0.46
269	0.48
270	0.45
271	0.41
272	0.45
273	0.43
274	0.46
275	0.44
276	0.49
277	0.52
278	0.5
279	0.5
280	0.41
281	0.35
282	0.31
283	0.28
284	0.22
285	0.16
286	0.18
287	0.15
288	0.16
289	0.16
290	0.14
291	0.19
292	0.19
293	0.2
294	0.22
295	0.28
296	0.29
297	0.33
298	0.36
299	0.34
300	0.38
301	0.44
302	0.43
303	0.44
304	0.47
305	0.47
306	0.47
307	0.46
308	0.44
309	0.42
310	0.44
311	0.38
312	0.34
313	0.31
314	0.3
315	0.3
316	0.31
317	0.26
318	0.26
319	0.27
320	0.27
321	0.27
322	0.29
323	0.32
324	0.35
325	0.36
326	0.38
327	0.44
328	0.48
329	0.52
330	0.51
331	0.46
332	0.44
333	0.49
334	0.51
335	0.43
336	0.44
337	0.45
338	0.5
339	0.53
340	0.5
341	0.45
342	0.42
343	0.45
344	0.42
345	0.36
346	0.28
347	0.23
348	0.24
349	0.21
350	0.17
351	0.14
352	0.13
353	0.21
354	0.31
355	0.41
356	0.44
357	0.54
358	0.59
359	0.67
360	0.75
361	0.76
362	0.76
363	0.77
364	0.82
365	0.83
366	0.86
367	0.86
368	0.86
369	0.84
370	0.83
371	0.82
372	0.78
373	0.73
374	0.73
375	0.63
376	0.55
377	0.46
378	0.37
379	0.28
380	0.2
381	0.15
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.12
399	0.11
400	0.11
401	0.08
402	0.08
403	0.07
404	0.06
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.06
409	0.07
410	0.09
411	0.1
412	0.12
413	0.17
414	0.18
415	0.18
416	0.18
417	0.22
418	0.24
419	0.26
420	0.26
421	0.24
422	0.24
423	0.24
424	0.25
425	0.22
426	0.2
427	0.2
428	0.2
429	0.16
430	0.16
431	0.16
432	0.15
433	0.16
434	0.13
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.06
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.14
456	0.16
457	0.17
458	0.18
459	0.22
460	0.22
461	0.27
462	0.27
463	0.23
464	0.23
465	0.22
466	0.2
467	0.17
468	0.17
469	0.12
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.08
476	0.06
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.12
488	0.14
489	0.14
490	0.15
491	0.15
492	0.14
493	0.14
494	0.15
495	0.17
496	0.19
497	0.17
498	0.17
499	0.17
500	0.17
501	0.16
502	0.16
503	0.2
504	0.17
505	0.18
506	0.17
507	0.19
508	0.19
509	0.19
510	0.2
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.16
515	0.15
516	0.15
517	0.17
518	0.16
519	0.17
520	0.16
521	0.16
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.09
529	0.08
530	0.06
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.08
536	0.1
537	0.18
538	0.19
539	0.21
540	0.22
541	0.22
542	0.24
543	0.22
544	0.24
545	0.17
546	0.17
547	0.16
548	0.18
549	0.17
550	0.16
551	0.14
552	0.11
553	0.15
554	0.16
555	0.14
556	0.14
557	0.14
558	0.14
559	0.16
560	0.16
561	0.1
562	0.09
563	0.09
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.07
571	0.07
572	0.09
573	0.1
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.09
578	0.09
579	0.13
580	0.15
581	0.17
582	0.23
583	0.25
584	0.29
585	0.34
586	0.4
587	0.47
588	0.53
589	0.58
590	0.55
591	0.53
592	0.52
593	0.51
594	0.49
595	0.39
596	0.29
597	0.22
598	0.2
599	0.18
600	0.16
601	0.14
602	0.09
603	0.08
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.1
608	0.11
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.13
613	0.12
614	0.12
615	0.11
616	0.13
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.09
624	0.05
625	0.04
626	0.04
627	0.03
628	0.03
629	0.04
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.1
636	0.19
637	0.26
638	0.29
639	0.3
640	0.3
641	0.3
642	0.33
643	0.34
644	0.28
645	0.21
646	0.19
647	0.19
648	0.21
649	0.23
650	0.21
651	0.2
652	0.18
653	0.18
654	0.22
655	0.22
656	0.21
657	0.18
658	0.18
659	0.17
660	0.18
661	0.17
662	0.14
663	0.21
664	0.2
665	0.22
666	0.22
667	0.19
668	0.22
669	0.23
670	0.22
671	0.14
672	0.14
673	0.12
674	0.11
675	0.11
676	0.11
677	0.08
678	0.09
679	0.08
680	0.08
681	0.1
682	0.1
683	0.11
684	0.08
685	0.09
686	0.1
687	0.15
688	0.16
689	0.14
690	0.14
691	0.14
692	0.15
693	0.2
694	0.2
695	0.18
696	0.23
697	0.25
698	0.26
699	0.28
700	0.27
701	0.22
702	0.21
703	0.2
704	0.15
705	0.14
706	0.14
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.12
711	0.16
712	0.15
713	0.19
714	0.19
715	0.18
716	0.19
717	0.2
718	0.23
719	0.2
720	0.21
721	0.17
722	0.16
723	0.16
724	0.14
725	0.13
726	0.1
727	0.1
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.1
734	0.09
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.09
739	0.1
740	0.12
741	0.12
742	0.12
743	0.15
744	0.17
745	0.17
746	0.21
747	0.25
748	0.26
749	0.29
750	0.32
751	0.3
752	0.3
753	0.3
754	0.26
755	0.26
756	0.25
757	0.23
758	0.21
759	0.21
760	0.23
761	0.23
762	0.23
763	0.21
764	0.2
765	0.18
766	0.15
767	0.15
768	0.14
769	0.15
770	0.13
771	0.12
772	0.14
773	0.14
774	0.15
775	0.17
776	0.15
777	0.13
778	0.14
779	0.21
780	0.19
781	0.22
782	0.21
783	0.19
784	0.2
785	0.2
786	0.24
787	0.19
788	0.22
789	0.23
790	0.28
791	0.28
792	0.28
793	0.29
794	0.28
795	0.31
796	0.3
797	0.33
798	0.3
799	0.36
800	0.36
801	0.42
802	0.39
803	0.36
804	0.37
805	0.37
806	0.4
807	0.44
808	0.49
809	0.49
810	0.49
811	0.53
812	0.51
813	0.49
814	0.49
815	0.47
816	0.44
817	0.39
818	0.38
819	0.34
820	0.32
821	0.3
822	0.27
823	0.22
824	0.19
825	0.21
826	0.22
827	0.22
828	0.26
829	0.28
830	0.31
831	0.29
832	0.29
833	0.28
834	0.27
835	0.26
836	0.21
837	0.17
838	0.12
839	0.12
840	0.12
841	0.11
842	0.12
843	0.12
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.14
848	0.14
849	0.16
850	0.14
851	0.15
852	0.17
853	0.17
854	0.16
855	0.14
856	0.14
857	0.14
858	0.16
859	0.18
860	0.19
861	0.19
862	0.24
863	0.27
864	0.28
865	0.31
866	0.34
867	0.35
868	0.42
869	0.5
870	0.56
871	0.64
872	0.71
873	0.77
874	0.83
875	0.9
876	0.91
877	0.93
878	0.93
879	0.93
880	0.92
881	0.85
882	0.8
883	0.76
884	0.68
885	0.62
886	0.55
887	0.46
888	0.37
889	0.34
890	0.3
891	0.22
892	0.2
893	0.15
894	0.1
895	0.09
896	0.09
897	0.12
898	0.11
899	0.11
900	0.12
901	0.14
902	0.14
903	0.15
904	0.14
905	0.11
906	0.1
907	0.1
908	0.09
909	0.06
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.06
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.08
919	0.08
920	0.08
921	0.08
922	0.09
923	0.11
924	0.12
925	0.13
926	0.14
927	0.18
928	0.2
929	0.21
930	0.22
931	0.21
932	0.21
933	0.22
934	0.25
935	0.22
936	0.21
937	0.19
938	0.18
939	0.17
940	0.18
941	0.18
942	0.14
943	0.13
944	0.13
945	0.18
946	0.2
947	0.23
948	0.23
949	0.24
950	0.28
951	0.31
952	0.32
953	0.28
954	0.3
955	0.33
956	0.4
957	0.42
958	0.4
959	0.39
960	0.38
961	0.41
962	0.38
963	0.36
964	0.33
965	0.32
966	0.36
967	0.34
968	0.37
969	0.36
970	0.4
971	0.41
972	0.39
973	0.46
974	0.46
975	0.54
976	0.54
977	0.54
978	0.54
979	0.58
980	0.6
981	0.59
982	0.56
983	0.47
984	0.43
985	0.42
986	0.42
987	0.35
988	0.35
989	0.3
990	0.34
991	0.37
992	0.45
993	0.43
994	0.38
995	0.37
996	0.31
997	0.28
998	0.22
999	0.2
1000	0.12
1001	0.11
1002	0.13
1003	0.12
1004	0.12
1005	0.11
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.11
1009	0.12
1010	0.11
1011	0.12
1012	0.15
1013	0.16
1014	0.18
1015	0.22
1016	0.23
1017	0.23
1018	0.23
1019	0.24
1020	0.21
1021	0.21
1022	0.2
1023	0.17
1024	0.18
1025	0.17
1026	0.17
1027	0.17
1028	0.17
1029	0.19
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.21
1033	0.2
1034	0.21
1035	0.22
1036	0.22
1037	0.19
1038	0.19
1039	0.18
1040	0.14
1041	0.13
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.1
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.12
1053	0.16
1054	0.17
1055	0.21
1056	0.26
1057	0.28
1058	0.29
1059	0.32
1060	0.34
1061	0.36
1062	0.37
1063	0.33

A0A4S4KJW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer