Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LDR6

Protein Details
Accession A0A4S4LDR6    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-49TKPAVFRADRKAKLKRKTEDBasic
64-85VDEDQKPVKRKGKKGEKADLVIBasic
120-166HESLKKSTLKKKASTKKKVCTRGRNSRAARRKKYIRRQFASPCRQKQHydrophilic
424-443SEKLKFAKRTLRVQRCKTIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-60ADRKAKLKRKTEDAAEKQSSKKSR
68-79QKPVKRKGKKGE
124-156KKSTLKKKASTKKXKVCTRGRNSRAARRKKYIR
498-535KESRKEAKATDTARVARRLAKKXGARSFGEGWRKRGTR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, mito_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLTQVLASKKVDKSLDDIFKSSAGPSSLTKPAVFRADRKAKLKRKTEDAAEKQSSKKSRVSEVDEDQKPVKRKGKKGEKADLVIEVDVEKEEEEEAIDESEDLHVVSDSASDDGEIPEHESLKKSTLKKKASTKKXKVCTRGRNSRAARRKKYIRRQFASPCRQKQTSNETIKTSYLVFRSLSQNRIDDSKEGPSTKQQRQQKRASEWRDQTTSSKREKEEAAEDKKGEKTFMMPAEKRRLAAIKGDLHLHSGATTNAYVVFAYFTPQDSEAHVPRKDVMDPFDAAREATRKCDGSLFAERTIRVDLVGKTKEKEGEGRPLTDPKLSVFIGNLDFATSDDDLRAFFEKVLCEERGHPKGEPEANEEEAESSGQDGVKKKEVLRKPTWVTRVRVVRDRETQLGKGFAYVQFSDRECVDEMLALESEKLKFAKRTLRVQRCKTIPGATAKVKSQAALKAPSSASGGTVSTPRSRTKTPASVVLPKGDPMLGSRIAGLPKESRKEAKATDTARVARRLAKKXGARSFGEGWRKRGTREGTHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.42
3 0.48
4 0.44
5 0.44
6 0.39
7 0.37
8 0.37
9 0.33
10 0.27
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.23
15 0.28
16 0.29
17 0.29
18 0.27
19 0.31
20 0.38
21 0.39
22 0.38
23 0.44
24 0.52
25 0.58
26 0.65
27 0.71
28 0.71
29 0.78
30 0.83
31 0.79
32 0.78
33 0.78
34 0.79
35 0.8
36 0.79
37 0.79
38 0.76
39 0.72
40 0.68
41 0.69
42 0.65
43 0.58
44 0.56
45 0.5
46 0.52
47 0.56
48 0.59
49 0.59
50 0.61
51 0.66
52 0.62
53 0.62
54 0.57
55 0.56
56 0.53
57 0.54
58 0.55
59 0.54
60 0.61
61 0.69
62 0.76
63 0.79
64 0.83
65 0.84
66 0.83
67 0.78
68 0.7
69 0.63
70 0.53
71 0.43
72 0.34
73 0.23
74 0.16
75 0.12
76 0.11
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.19
111 0.26
112 0.31
113 0.39
114 0.47
115 0.54
116 0.6
117 0.69
118 0.75
119 0.79
120 0.83
121 0.84
122 0.84
123 0.87
124 0.89
125 0.89
126 0.89
127 0.88
128 0.89
129 0.87
130 0.87
131 0.84
132 0.84
133 0.84
134 0.84
135 0.82
136 0.8
137 0.83
138 0.83
139 0.88
140 0.88
141 0.88
142 0.82
143 0.82
144 0.83
145 0.83
146 0.83
147 0.82
148 0.79
149 0.76
150 0.74
151 0.68
152 0.65
153 0.63
154 0.62
155 0.61
156 0.56
157 0.52
158 0.51
159 0.48
160 0.42
161 0.34
162 0.27
163 0.19
164 0.18
165 0.16
166 0.17
167 0.25
168 0.27
169 0.29
170 0.28
171 0.29
172 0.28
173 0.3
174 0.28
175 0.22
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.23
180 0.23
181 0.29
182 0.36
183 0.42
184 0.47
185 0.5
186 0.57
187 0.65
188 0.73
189 0.73
190 0.74
191 0.77
192 0.76
193 0.77
194 0.72
195 0.69
196 0.63
197 0.56
198 0.52
199 0.5
200 0.51
201 0.48
202 0.48
203 0.43
204 0.44
205 0.44
206 0.41
207 0.41
208 0.43
209 0.42
210 0.39
211 0.39
212 0.38
213 0.4
214 0.37
215 0.29
216 0.21
217 0.17
218 0.18
219 0.23
220 0.27
221 0.26
222 0.31
223 0.39
224 0.4
225 0.38
226 0.35
227 0.32
228 0.27
229 0.28
230 0.28
231 0.23
232 0.23
233 0.25
234 0.24
235 0.23
236 0.22
237 0.18
238 0.12
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.13
258 0.15
259 0.21
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.21
264 0.21
265 0.19
266 0.19
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.14
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.13
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.25
284 0.25
285 0.25
286 0.26
287 0.26
288 0.25
289 0.25
290 0.2
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.17
295 0.21
296 0.21
297 0.21
298 0.23
299 0.24
300 0.22
301 0.26
302 0.23
303 0.3
304 0.3
305 0.32
306 0.32
307 0.33
308 0.33
309 0.29
310 0.26
311 0.17
312 0.19
313 0.17
314 0.15
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.1
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.2
340 0.28
341 0.3
342 0.32
343 0.3
344 0.28
345 0.33
346 0.36
347 0.33
348 0.3
349 0.3
350 0.29
351 0.29
352 0.27
353 0.21
354 0.18
355 0.16
356 0.1
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.11
361 0.13
362 0.16
363 0.22
364 0.24
365 0.28
366 0.36
367 0.43
368 0.48
369 0.5
370 0.56
371 0.57
372 0.62
373 0.66
374 0.64
375 0.6
376 0.6
377 0.63
378 0.59
379 0.6
380 0.58
381 0.56
382 0.57
383 0.57
384 0.55
385 0.51
386 0.48
387 0.43
388 0.4
389 0.33
390 0.27
391 0.24
392 0.2
393 0.2
394 0.18
395 0.17
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.18
400 0.19
401 0.16
402 0.16
403 0.15
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.17
416 0.22
417 0.31
418 0.36
419 0.46
420 0.55
421 0.65
422 0.72
423 0.77
424 0.81
425 0.76
426 0.73
427 0.67
428 0.61
429 0.55
430 0.53
431 0.53
432 0.49
433 0.49
434 0.46
435 0.48
436 0.43
437 0.38
438 0.35
439 0.33
440 0.32
441 0.34
442 0.33
443 0.33
444 0.33
445 0.33
446 0.31
447 0.25
448 0.21
449 0.17
450 0.17
451 0.12
452 0.15
453 0.17
454 0.2
455 0.23
456 0.27
457 0.31
458 0.34
459 0.4
460 0.46
461 0.52
462 0.5
463 0.55
464 0.56
465 0.6
466 0.59
467 0.58
468 0.5
469 0.41
470 0.39
471 0.31
472 0.25
473 0.19
474 0.21
475 0.17
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.2
480 0.21
481 0.22
482 0.24
483 0.3
484 0.36
485 0.4
486 0.42
487 0.44
488 0.5
489 0.51
490 0.52
491 0.53
492 0.5
493 0.51
494 0.53
495 0.57
496 0.56
497 0.55
498 0.5
499 0.5
500 0.56
501 0.56
502 0.59
503 0.6
504 0.64
505 0.68
506 0.74
507 0.69
508 0.67
509 0.64
510 0.65
511 0.67
512 0.63
513 0.6
514 0.61
515 0.6
516 0.56
517 0.61
518 0.59