Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4KXB0

Protein Details
Accession A0A4S4KXB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-77QCEAKSHTRAARGKRKRQTRHPQRKKQDESESEDEGGNSKKKAKTKNTSGKLLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-50RAARGKRKRQTRHPQRXKK
64-67KKKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07896  Adenylation_kDNA_ligase_like  
cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences MVANDELAVIDGITPTKYLADGDQCEAKSHTRAARGKRKRQTRHPQRXKKQDESESEDEGGNSKKKAKTKNTSGKLLSTNDSEEGSIKEDEDEGEEESNEEGKKSVELLLAVKWDLEKGIDPTGWWVSEKLDGVRVYWDGKRMLSRLGNPFTPPKWFVENLPKDVTLDGELFGGRGKFQSTVSTVKTLNSPHWKDVTLQIFDVPSMGKEPFEDRFNWLKSTFMKLSGERKEKHVMVVEHLKAKSREHVFEMLKEVEQLGGEGLMLRKPGSLYEGYRSFILQKVKTFYDAEAKVIGHVPGKGKNRGVMGALSCVMASGKTFNVGTGFSDKQRRAPPKVGAIIVYRFQELTSDGIPRFPSFVGEAPDKDQPSDAEIPERKKIEARTKASVDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.12
7 0.19
8 0.21
9 0.25
10 0.3
11 0.3
12 0.32
13 0.33
14 0.33
15 0.29
16 0.33
17 0.34
18 0.38
19 0.45
20 0.53
21 0.62
22 0.7
23 0.77
24 0.8
25 0.86
26 0.87
27 0.91
28 0.92
29 0.92
30 0.93
31 0.94
32 0.95
33 0.95
34 0.96
35 0.94
36 0.92
37 0.91
38 0.87
39 0.85
40 0.79
41 0.72
42 0.62
43 0.53
44 0.44
45 0.35
46 0.32
47 0.27
48 0.23
49 0.27
50 0.3
51 0.37
52 0.47
53 0.55
54 0.61
55 0.69
56 0.78
57 0.78
58 0.81
59 0.77
60 0.72
61 0.67
62 0.6
63 0.51
64 0.43
65 0.37
66 0.3
67 0.28
68 0.23
69 0.19
70 0.16
71 0.17
72 0.15
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.12
113 0.11
114 0.14
115 0.15
116 0.13
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.2
125 0.16
126 0.17
127 0.2
128 0.19
129 0.22
130 0.23
131 0.27
132 0.31
133 0.33
134 0.32
135 0.32
136 0.35
137 0.31
138 0.32
139 0.28
140 0.23
141 0.25
142 0.24
143 0.26
144 0.33
145 0.36
146 0.36
147 0.36
148 0.34
149 0.3
150 0.29
151 0.26
152 0.17
153 0.13
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.12
167 0.15
168 0.16
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.2
173 0.19
174 0.22
175 0.27
176 0.28
177 0.28
178 0.29
179 0.29
180 0.28
181 0.33
182 0.32
183 0.23
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.1
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.16
200 0.23
201 0.24
202 0.26
203 0.24
204 0.24
205 0.23
206 0.29
207 0.25
208 0.21
209 0.22
210 0.23
211 0.31
212 0.37
213 0.43
214 0.37
215 0.41
216 0.44
217 0.42
218 0.41
219 0.39
220 0.32
221 0.29
222 0.36
223 0.34
224 0.33
225 0.33
226 0.35
227 0.3
228 0.31
229 0.33
230 0.3
231 0.3
232 0.28
233 0.35
234 0.32
235 0.33
236 0.36
237 0.29
238 0.25
239 0.24
240 0.2
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.06
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.12
257 0.14
258 0.19
259 0.21
260 0.22
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.22
265 0.27
266 0.23
267 0.25
268 0.28
269 0.29
270 0.31
271 0.31
272 0.28
273 0.3
274 0.28
275 0.26
276 0.24
277 0.23
278 0.21
279 0.22
280 0.21
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.22
285 0.28
286 0.32
287 0.33
288 0.35
289 0.35
290 0.34
291 0.33
292 0.29
293 0.24
294 0.21
295 0.2
296 0.17
297 0.14
298 0.13
299 0.11
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.17
311 0.19
312 0.22
313 0.3
314 0.31
315 0.37
316 0.46
317 0.52
318 0.54
319 0.59
320 0.61
321 0.62
322 0.66
323 0.6
324 0.53
325 0.49
326 0.45
327 0.41
328 0.36
329 0.28
330 0.22
331 0.21
332 0.19
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.18
337 0.17
338 0.2
339 0.22
340 0.21
341 0.22
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.21
346 0.23
347 0.26
348 0.27
349 0.28
350 0.34
351 0.33
352 0.31
353 0.29
354 0.25
355 0.28
356 0.31
357 0.29
358 0.32
359 0.37
360 0.41
361 0.47
362 0.48
363 0.44
364 0.44
365 0.52
366 0.53
367 0.58
368 0.59
369 0.61