FuNGI

A0A4S4LCU1

Protein Details

Accession

A0A4S4LCU1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MSSLRNSLHRRNHKERSQLSHRTKFG	Hydrophilic
39-63	RDYHSKQDRIHKLRQKAADRNKDEF	Basic
154-176	IIQPSKFSKSKPRRASKHLIFVD	Hydrophilic
210-233	DLGWKAKGSKKSKKEKAVGTKGDE	Basic
530-555	EEQQREQMARDKRKQRPPFNFEKEKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
214-229	KAKGSKKSKKEKAVGT
503-547	RRKREERGEKEEAKRKAKEAKEEEKRKREEQQREQMARDKRKQRP

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008942 ENTH_VHS IPR044103 GAT_LSB5 IPR045007 LSB5 IPR007144 SSU_processome_Utp11 IPR002014 VHS_dom
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0035091 F:phosphatidylinositol binding GO:0043130 F:ubiquitin binding GO:0007015 P:actin filament organization GO:0006897 P:endocytosis GO:0006886 P:intracellular protein transport GO:0006364 P:rRNA processing GO:0007034 P:vacuolar transport
Pfam	View protein in Pfam PF03998 Utp11 PF00790 VHS
PROSITE	View protein in PROSITE PS50179 VHS
CDD	cd14232 GAT_LSB5 cd16980 VHS_Lsb5

Amino Acid Sequences

MSSLRNSLHRRNHKERSQLSHRTKFGILEKHKDYVLRARDYHSKQDRIHKLRQKAADRNKDEFYFGMNRQKTQSGVHVQDRGNPSMQVDLVKVLKTQDENYVRTMRAAGLKKIEKLKAQLTVLADLIAPHIAYDNGQEDGLNEEELTVLSQAAIIQPSKFSKSKPRRASKHLIFVDNEDEAQTYASRQVSLGKPIATPLMDELEGSDTTDLGWKAKGSKKSKKEKAVGTKGDEEKTAADVQERREIAKKHRTRLLKELSARLTRDTQLRYAERELAMQRMLMGKGGSMKLRGVEKVEDGDNENELNEDELDSMKIKXVGTTARAEGQGIQASRVQMETGEEKMTADVIRMMSVLHLVEILTSPSYDAEAFDGIPELVESINLQPTGPAEASRAIRKKLKHGDAHRQYRALVLLKATVENGGQRFQTTFADGQLTDAIKNLVTDPGTDPKVKRKLISVLGAWHQQFEGDVRMSLVANLYKSIPHTPTSRASLHIGIAPESEYDRRKREERGEKEEAKRKAKEAKEEEKRKREEQQREQMARDKRKQRPPFNFEKEKPQILQAIAETSQAANNLVNALTLVNIEHESVQESLRVKECIENAKLARKRVVRYIQEIEQLVENEELIGTLLETNERVIASLQMYDKLIKPAMTNEDVEEMQQHMATVNLQNSGELNRLQEKQRAAVERQISRKRDRERTSERDVSPPNSACLHPDLQDLSFGELGSNQGDRNLPPPLRPDVRSSDEEDYDARGSLSDYSDYGSSDEGTHNRRVAASSSTQPTSGSHSASLSRPYVDESDEEVDTRKDTRQALLQEDPFADPFADQQEVETPGIVSKKGMMW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.85
3	0.84
4	0.84
5	0.85
6	0.84
7	0.83
8	0.78
9	0.72
10	0.66
11	0.61
12	0.59
13	0.59
14	0.55
15	0.55
16	0.56
17	0.54
18	0.54
19	0.5
20	0.47
21	0.45
22	0.47
23	0.45
24	0.43
25	0.46
26	0.54
27	0.58
28	0.64
29	0.64
30	0.64
31	0.63
32	0.71
33	0.77
34	0.75
35	0.8
36	0.78
37	0.78
38	0.78
39	0.82
40	0.81
41	0.8
42	0.84
43	0.84
44	0.82
45	0.78
46	0.75
47	0.67
48	0.59
49	0.48
50	0.43
51	0.39
52	0.37
53	0.42
54	0.39
55	0.4
56	0.41
57	0.44
58	0.4
59	0.36
60	0.4
61	0.39
62	0.43
63	0.47
64	0.5
65	0.48
66	0.54
67	0.55
68	0.5
69	0.43
70	0.37
71	0.32
72	0.27
73	0.28
74	0.22
75	0.18
76	0.19
77	0.19
78	0.19
79	0.19
80	0.17
81	0.2
82	0.21
83	0.22
84	0.28
85	0.32
86	0.33
87	0.37
88	0.41
89	0.37
90	0.36
91	0.35
92	0.28
93	0.3
94	0.33
95	0.32
96	0.36
97	0.4
98	0.45
99	0.51
100	0.52
101	0.48
102	0.49
103	0.5
104	0.48
105	0.45
106	0.43
107	0.38
108	0.35
109	0.31
110	0.26
111	0.21
112	0.14
113	0.14
114	0.1
115	0.08
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.09
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.13
127	0.14
128	0.11
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.06
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.07
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.12
144	0.15
145	0.2
146	0.22
147	0.24
148	0.34
149	0.44
150	0.54
151	0.62
152	0.7
153	0.73
154	0.8
155	0.88
156	0.84
157	0.84
158	0.79
159	0.72
160	0.63
161	0.57
162	0.51
163	0.41
164	0.33
165	0.23
166	0.18
167	0.13
168	0.13
169	0.1
170	0.08
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.18
176	0.19
177	0.24
178	0.26
179	0.24
180	0.23
181	0.24
182	0.25
183	0.19
184	0.17
185	0.13
186	0.13
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.1
194	0.07
195	0.08
196	0.12
197	0.11
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.17
202	0.24
203	0.33
204	0.39
205	0.49
206	0.58
207	0.68
208	0.77
209	0.8
210	0.81
211	0.82
212	0.84
213	0.84
214	0.8
215	0.74
216	0.73
217	0.67
218	0.6
219	0.51
220	0.41
221	0.31
222	0.28
223	0.24
224	0.16
225	0.16
226	0.18
227	0.2
228	0.26
229	0.26
230	0.25
231	0.3
232	0.34
233	0.38
234	0.46
235	0.5
236	0.5
237	0.57
238	0.62
239	0.61
240	0.67
241	0.67
242	0.64
243	0.61
244	0.61
245	0.59
246	0.57
247	0.53
248	0.45
249	0.4
250	0.35
251	0.36
252	0.32
253	0.29
254	0.31
255	0.32
256	0.34
257	0.33
258	0.34
259	0.29
260	0.3
261	0.28
262	0.23
263	0.22
264	0.18
265	0.16
266	0.15
267	0.14
268	0.12
269	0.1
270	0.09
271	0.12
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.14
277	0.16
278	0.17
279	0.16
280	0.15
281	0.16
282	0.17
283	0.17
284	0.15
285	0.16
286	0.16
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.06
294	0.06
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.11
304	0.12
305	0.15
306	0.16
307	0.18
308	0.18
309	0.18
310	0.18
311	0.15
312	0.16
313	0.16
314	0.14
315	0.13
316	0.14
317	0.13
318	0.13
319	0.12
320	0.1
321	0.07
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.11
376	0.13
377	0.19
378	0.21
379	0.22
380	0.26
381	0.27
382	0.36
383	0.41
384	0.47
385	0.49
386	0.53
387	0.61
388	0.67
389	0.74
390	0.67
391	0.58
392	0.51
393	0.44
394	0.4
395	0.31
396	0.22
397	0.14
398	0.13
399	0.12
400	0.12
401	0.11
402	0.09
403	0.07
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.11
419	0.11
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.09
430	0.13
431	0.15
432	0.17
433	0.17
434	0.24
435	0.32
436	0.33
437	0.32
438	0.31
439	0.35
440	0.37
441	0.39
442	0.32
443	0.27
444	0.28
445	0.31
446	0.28
447	0.22
448	0.18
449	0.14
450	0.13
451	0.11
452	0.11
453	0.07
454	0.08
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.09
466	0.12
467	0.12
468	0.14
469	0.16
470	0.19
471	0.22
472	0.26
473	0.26
474	0.25
475	0.26
476	0.24
477	0.23
478	0.21
479	0.18
480	0.14
481	0.13
482	0.11
483	0.09
484	0.1
485	0.12
486	0.14
487	0.17
488	0.21
489	0.25
490	0.27
491	0.33
492	0.42
493	0.5
494	0.54
495	0.59
496	0.64
497	0.67
498	0.72
499	0.74
500	0.71
501	0.67
502	0.61
503	0.57
504	0.57
505	0.54
506	0.56
507	0.56
508	0.59
509	0.63
510	0.72
511	0.77
512	0.77
513	0.79
514	0.73
515	0.74
516	0.73
517	0.73
518	0.73
519	0.74
520	0.75
521	0.73
522	0.71
523	0.69
524	0.69
525	0.67
526	0.66
527	0.66
528	0.65
529	0.73
530	0.8
531	0.83
532	0.84
533	0.82
534	0.84
535	0.84
536	0.84
537	0.76
538	0.76
539	0.71
540	0.64
541	0.57
542	0.48
543	0.43
544	0.33
545	0.32
546	0.22
547	0.2
548	0.16
549	0.16
550	0.14
551	0.1
552	0.1
553	0.09
554	0.1
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.08
571	0.09
572	0.09
573	0.11
574	0.12
575	0.14
576	0.16
577	0.17
578	0.16
579	0.18
580	0.21
581	0.25
582	0.25
583	0.28
584	0.28
585	0.37
586	0.4
587	0.39
588	0.43
589	0.42
590	0.43
591	0.47
592	0.54
593	0.49
594	0.52
595	0.55
596	0.51
597	0.51
598	0.48
599	0.4
600	0.33
601	0.29
602	0.23
603	0.18
604	0.14
605	0.1
606	0.09
607	0.08
608	0.06
609	0.05
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.08
621	0.09
622	0.12
623	0.12
624	0.13
625	0.14
626	0.15
627	0.16
628	0.18
629	0.19
630	0.16
631	0.17
632	0.19
633	0.24
634	0.25
635	0.24
636	0.22
637	0.23
638	0.22
639	0.22
640	0.18
641	0.14
642	0.12
643	0.11
644	0.1
645	0.07
646	0.08
647	0.09
648	0.11
649	0.11
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.14
654	0.15
655	0.16
656	0.14
657	0.15
658	0.18
659	0.22
660	0.25
661	0.29
662	0.3
663	0.32
664	0.37
665	0.4
666	0.37
667	0.41
668	0.45
669	0.47
670	0.55
671	0.59
672	0.59
673	0.62
674	0.68
675	0.7
676	0.73
677	0.73
678	0.73
679	0.75
680	0.76
681	0.77
682	0.78
683	0.7
684	0.68
685	0.66
686	0.59
687	0.57
688	0.51
689	0.44
690	0.38
691	0.36
692	0.3
693	0.3
694	0.29
695	0.22
696	0.24
697	0.23
698	0.21
699	0.24
700	0.22
701	0.2
702	0.18
703	0.17
704	0.14
705	0.12
706	0.13
707	0.12
708	0.12
709	0.09
710	0.11
711	0.13
712	0.13
713	0.16
714	0.23
715	0.23
716	0.24
717	0.29
718	0.35
719	0.39
720	0.41
721	0.43
722	0.43
723	0.48
724	0.48
725	0.49
726	0.46
727	0.42
728	0.41
729	0.36
730	0.32
731	0.26
732	0.24
733	0.18
734	0.13
735	0.13
736	0.13
737	0.15
738	0.12
739	0.11
740	0.13
741	0.13
742	0.14
743	0.14
744	0.12
745	0.11
746	0.12
747	0.16
748	0.19
749	0.23
750	0.27
751	0.28
752	0.28
753	0.28
754	0.29
755	0.28
756	0.27
757	0.28
758	0.3
759	0.34
760	0.34
761	0.34
762	0.32
763	0.31
764	0.34
765	0.32
766	0.27
767	0.23
768	0.24
769	0.27
770	0.29
771	0.33
772	0.26
773	0.25
774	0.23
775	0.25
776	0.25
777	0.23
778	0.22
779	0.22
780	0.24
781	0.23
782	0.23
783	0.22
784	0.21
785	0.21
786	0.21
787	0.2
788	0.22
789	0.24
790	0.27
791	0.33
792	0.37
793	0.41
794	0.47
795	0.46
796	0.44
797	0.43
798	0.41
799	0.34
800	0.3
801	0.24
802	0.16
803	0.16
804	0.16
805	0.16
806	0.14
807	0.15
808	0.18
809	0.22
810	0.22
811	0.21
812	0.17
813	0.19
814	0.21
815	0.2
816	0.16

A0A4S4LCU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer