FuNGI

A0A4S4KF94

Protein Details

Accession

A0A4S4KF94

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
607-632	AVIPRVCDKRVRRSQRPPPALFNKDR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MNFLRTNKVKYVKQLTNVERHQTNLDRIDDRIKEALSHVYQESQESNSDDDPPDRVSRYHMGCKGVAFHLHRWLHQHRFDPATKNFYVLLLDHLLARMMGRDPDDELVFSDEERRSVVIRNDRIYQLKRLQNHYTTYDLQRKYDSINPTSSNSDIMVLSQDSDPEQRRLCPFWYARVICVFHTEVHWKNDPYPHRVDFLWVRWFGRDTNHAFGDDTCRLERIRFVTEEDGSDPFGFIDPSSVVRAVHLIPCFHSGCSLTETYSCITEAGGVGHTTTFNSTLANHVPDGFHRAAGVMSSENIFEYENGVPDNLESEDDLDDSEMLDGSGADGCAADSSTAGSDVDIDISVRSRPTVTAXFLTKSKSIRIFQPLDLRRPPPLPSSSMPKRTRDDDVAALLDLEAGVASSDEDEDEDNFADTFINDEEVEFPSMLRGIYTQRSISPVATNVAGPSRMNMELDVGMLMPTHGPEFDVESMARRFQERSRREREREEPQTAFFLWMIRCVFSKEKETATRLQDRINELSKPWRTFAIRTLPGRFYIDAPSRKDVDFEEQDVVVQLRDGANMTTALRDYTVGDWVTVQHGLYKGDLGRVRNVMQNGIGDTVEVAVIPRVCDKRVRRSQRPPPALFNKDRMLFEYGADCLKQVSESGWIFRGRTNNLYNESDRLCYLRVQALHYI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.7
3	0.72
4	0.73
5	0.7
6	0.62
7	0.58
8	0.56
9	0.52
10	0.52
11	0.48
12	0.48
13	0.42
14	0.43
15	0.49
16	0.43
17	0.42
18	0.38
19	0.32
20	0.28
21	0.29
22	0.34
23	0.28
24	0.3
25	0.27
26	0.27
27	0.27
28	0.28
29	0.28
30	0.22
31	0.23
32	0.22
33	0.23
34	0.21
35	0.24
36	0.23
37	0.22
38	0.23
39	0.24
40	0.26
41	0.25
42	0.25
43	0.27
44	0.33
45	0.38
46	0.45
47	0.46
48	0.46
49	0.45
50	0.46
51	0.44
52	0.39
53	0.39
54	0.35
55	0.34
56	0.39
57	0.4
58	0.4
59	0.44
60	0.5
61	0.51
62	0.53
63	0.55
64	0.51
65	0.56
66	0.59
67	0.6
68	0.57
69	0.55
70	0.49
71	0.46
72	0.41
73	0.34
74	0.31
75	0.23
76	0.21
77	0.16
78	0.16
79	0.14
80	0.14
81	0.13
82	0.12
83	0.11
84	0.09
85	0.09
86	0.1
87	0.12
88	0.13
89	0.14
90	0.17
91	0.17
92	0.16
93	0.15
94	0.16
95	0.15
96	0.14
97	0.18
98	0.16
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.15
103	0.21
104	0.28
105	0.31
106	0.37
107	0.4
108	0.43
109	0.46
110	0.52
111	0.5
112	0.51
113	0.5
114	0.5
115	0.53
116	0.56
117	0.59
118	0.56
119	0.57
120	0.52
121	0.49
122	0.47
123	0.49
124	0.51
125	0.45
126	0.42
127	0.4
128	0.38
129	0.37
130	0.39
131	0.38
132	0.32
133	0.36
134	0.37
135	0.37
136	0.39
137	0.35
138	0.3
139	0.24
140	0.21
141	0.16
142	0.14
143	0.13
144	0.1
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.15
150	0.18
151	0.2
152	0.22
153	0.24
154	0.28
155	0.3
156	0.31
157	0.34
158	0.33
159	0.36
160	0.44
161	0.4
162	0.39
163	0.41
164	0.4
165	0.32
166	0.35
167	0.29
168	0.2
169	0.22
170	0.27
171	0.25
172	0.29
173	0.33
174	0.3
175	0.33
176	0.39
177	0.41
178	0.41
179	0.43
180	0.39
181	0.37
182	0.36
183	0.37
184	0.34
185	0.35
186	0.36
187	0.31
188	0.3
189	0.29
190	0.3
191	0.26
192	0.26
193	0.28
194	0.25
195	0.28
196	0.28
197	0.28
198	0.27
199	0.27
200	0.29
201	0.25
202	0.23
203	0.18
204	0.19
205	0.19
206	0.19
207	0.21
208	0.18
209	0.2
210	0.19
211	0.21
212	0.23
213	0.24
214	0.24
215	0.23
216	0.2
217	0.17
218	0.16
219	0.13
220	0.1
221	0.09
222	0.08
223	0.06
224	0.07
225	0.06
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.11
232	0.1
233	0.14
234	0.13
235	0.12
236	0.13
237	0.17
238	0.18
239	0.16
240	0.17
241	0.14
242	0.14
243	0.17
244	0.16
245	0.13
246	0.12
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.11
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.09
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.16
275	0.14
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.05
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.08
341	0.12
342	0.13
343	0.19
344	0.2
345	0.24
346	0.26
347	0.27
348	0.25
349	0.26
350	0.28
351	0.23
352	0.26
353	0.28
354	0.29
355	0.31
356	0.4
357	0.39
358	0.41
359	0.43
360	0.41
361	0.36
362	0.35
363	0.34
364	0.29
365	0.28
366	0.27
367	0.25
368	0.33
369	0.37
370	0.45
371	0.47
372	0.48
373	0.48
374	0.47
375	0.5
376	0.44
377	0.4
378	0.32
379	0.29
380	0.25
381	0.22
382	0.18
383	0.14
384	0.1
385	0.07
386	0.05
387	0.03
388	0.02
389	0.02
390	0.02
391	0.02
392	0.02
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.06
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.09
412	0.1
413	0.09
414	0.08
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.06
419	0.06
420	0.08
421	0.11
422	0.13
423	0.14
424	0.14
425	0.17
426	0.18
427	0.18
428	0.17
429	0.15
430	0.15
431	0.14
432	0.14
433	0.12
434	0.12
435	0.12
436	0.1
437	0.09
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.09
446	0.06
447	0.06
448	0.05
449	0.05
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.08
457	0.09
458	0.11
459	0.1
460	0.13
461	0.15
462	0.16
463	0.16
464	0.15
465	0.16
466	0.21
467	0.32
468	0.36
469	0.44
470	0.53
471	0.62
472	0.66
473	0.72
474	0.73
475	0.74
476	0.74
477	0.71
478	0.63
479	0.55
480	0.52
481	0.44
482	0.38
483	0.28
484	0.23
485	0.16
486	0.19
487	0.18
488	0.16
489	0.16
490	0.19
491	0.22
492	0.22
493	0.27
494	0.26
495	0.3
496	0.35
497	0.38
498	0.41
499	0.44
500	0.49
501	0.46
502	0.47
503	0.46
504	0.46
505	0.47
506	0.44
507	0.38
508	0.32
509	0.4
510	0.42
511	0.4
512	0.36
513	0.36
514	0.36
515	0.37
516	0.42
517	0.43
518	0.43
519	0.45
520	0.49
521	0.45
522	0.44
523	0.45
524	0.39
525	0.31
526	0.31
527	0.36
528	0.37
529	0.39
530	0.41
531	0.41
532	0.4
533	0.4
534	0.34
535	0.34
536	0.32
537	0.3
538	0.28
539	0.25
540	0.25
541	0.25
542	0.23
543	0.14
544	0.11
545	0.09
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.08
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.15
561	0.13
562	0.13
563	0.13
564	0.14
565	0.15
566	0.14
567	0.13
568	0.12
569	0.14
570	0.15
571	0.15
572	0.17
573	0.16
574	0.22
575	0.25
576	0.24
577	0.28
578	0.3
579	0.32
580	0.34
581	0.34
582	0.29
583	0.27
584	0.27
585	0.23
586	0.21
587	0.19
588	0.13
589	0.12
590	0.11
591	0.09
592	0.07
593	0.06
594	0.07
595	0.08
596	0.09
597	0.16
598	0.18
599	0.2
600	0.29
601	0.35
602	0.44
603	0.54
604	0.64
605	0.68
606	0.77
607	0.86
608	0.89
609	0.92
610	0.86
611	0.85
612	0.85
613	0.83
614	0.78
615	0.74
616	0.7
617	0.65
618	0.6
619	0.54
620	0.49
621	0.41
622	0.36
623	0.32
624	0.26
625	0.23
626	0.22
627	0.18
628	0.14
629	0.13
630	0.13
631	0.11
632	0.1
633	0.16
634	0.17
635	0.2
636	0.24
637	0.26
638	0.26
639	0.29
640	0.35
641	0.33
642	0.39
643	0.41
644	0.43
645	0.47
646	0.52
647	0.5
648	0.49
649	0.46
650	0.41
651	0.37
652	0.33
653	0.28
654	0.25
655	0.27
656	0.28
657	0.28

A0A4S4KF94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer