Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4K514

Protein Details
Accession A0A4S4K514    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-82RFVPAHRWYKFQKRRPQQQLWTLEEAEKMMAKKKKESERWLMRERSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Amino Acid Sequences VGDGGRDGGRRCGRGXMEDAEKSEVHALFMPAPENIFRFVPAHRWYKFQKRRPQQQLWTLEEAEKMMAKKKKESERWLMRERSGSGSGSGGGGRSLVYEVGGRSLAPGGRRLRTVDTGMRGLFDEDDEEGMEERRRRERERGGEGDLDEMEYEEDFADDEEKMDPDGAEDEEAKELEERLKREYRNANKSREGYVDESEDEDAENLTGAGKDMKKLVRKIEKNAAYDSDEEKNPYASSEEEEEEDETPQTTATGPAVQDQSTPQTPGQSKPGSVTTSKAASRVTSRTGSPAPAPPLSGGREDQKRGELEPAGAASTPAVAGSWDGRALCR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.42
4 0.42
5 0.42
6 0.43
7 0.37
8 0.36
9 0.34
10 0.28
11 0.23
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.2
16 0.2
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.23
27 0.28
28 0.35
29 0.34
30 0.39
31 0.45
32 0.55
33 0.64
34 0.66
35 0.71
36 0.74
37 0.83
38 0.88
39 0.9
40 0.88
41 0.87
42 0.86
43 0.81
44 0.75
45 0.65
46 0.56
47 0.46
48 0.38
49 0.29
50 0.23
51 0.18
52 0.21
53 0.24
54 0.26
55 0.33
56 0.41
57 0.5
58 0.57
59 0.64
60 0.67
61 0.74
62 0.79
63 0.8
64 0.76
65 0.68
66 0.64
67 0.58
68 0.52
69 0.43
70 0.36
71 0.28
72 0.24
73 0.22
74 0.17
75 0.15
76 0.1
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.16
94 0.19
95 0.2
96 0.22
97 0.24
98 0.26
99 0.27
100 0.3
101 0.28
102 0.27
103 0.28
104 0.26
105 0.24
106 0.21
107 0.19
108 0.15
109 0.11
110 0.09
111 0.06
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.1
118 0.12
119 0.15
120 0.22
121 0.26
122 0.3
123 0.38
124 0.46
125 0.51
126 0.56
127 0.57
128 0.52
129 0.5
130 0.46
131 0.39
132 0.3
133 0.21
134 0.13
135 0.1
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.1
163 0.13
164 0.13
165 0.18
166 0.24
167 0.24
168 0.3
169 0.4
170 0.45
171 0.53
172 0.58
173 0.59
174 0.6
175 0.61
176 0.57
177 0.5
178 0.44
179 0.36
180 0.31
181 0.26
182 0.21
183 0.19
184 0.17
185 0.15
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.13
199 0.18
200 0.23
201 0.27
202 0.35
203 0.42
204 0.46
205 0.52
206 0.58
207 0.6
208 0.57
209 0.56
210 0.49
211 0.41
212 0.39
213 0.36
214 0.3
215 0.24
216 0.23
217 0.22
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.15
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.13
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.1
240 0.09
241 0.13
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.2
247 0.19
248 0.22
249 0.19
250 0.24
251 0.26
252 0.29
253 0.35
254 0.32
255 0.31
256 0.32
257 0.36
258 0.32
259 0.31
260 0.3
261 0.26
262 0.29
263 0.29
264 0.28
265 0.25
266 0.24
267 0.28
268 0.29
269 0.3
270 0.28
271 0.28
272 0.32
273 0.33
274 0.33
275 0.32
276 0.34
277 0.34
278 0.32
279 0.33
280 0.28
281 0.3
282 0.3
283 0.3
284 0.26
285 0.29
286 0.36
287 0.38
288 0.39
289 0.4
290 0.4
291 0.38
292 0.41
293 0.35
294 0.29
295 0.28
296 0.26
297 0.21
298 0.19
299 0.18
300 0.12
301 0.11
302 0.09
303 0.07
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.08
308 0.09
309 0.11