Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LHU1

Protein Details
Accession A0A4S4LHU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-39STEDKGPSKNELKKRAKEEEKNRKAAERKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-49SKNELKKRAKEEEKNRKAAERKAKEEKAAKAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004364  Aa-tRNA-synt_II  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004523  Asp-tRNA_synthase_2  
IPR002312  Asp/Asn-tRNA-synth_IIb  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004815  F:aspartate-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0006422  P:aspartyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00152  tRNA-synt_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
CDD cd04320  AspRS_cyto_N  
cd00776  AsxRS_core  
Amino Acid Sequences MSEPTLNPTESTEDKGPSKNELKKRAKEEEKNRKAAERKAKEEKAAKAKAAAEDAADFAKQYYGKLPLHQSQERPNRPRNDVALLSEKVGENVLIRARIQTSRATGNKMVFLMLRQKIDTIQGILTVDEESVSRPMVKWVAGLPDESIVLVEGVVDKPKEEIKSATVKDVEIKISQIHLISAPEVRLPFTLDDASRAENEIENSEKQFNNVLLETRLNNRVLDLRTTTNQAVFKLQGSITDFFREFLSSQGFVEIHTPKLQAAATESGASVFKVSYFKGNAYLAQSPQLAKQMAIASDFERVYEIGPVFRAEDSNTHRHLTEFIGLDLEMTIEEHYHEVMELLDQLFLSIFKNLRAKCQKEVEIVGRQFPAEEFKWLEGPEGTLKLTFAQAVDLLVEDGVDRSVLDDINTENEKRLGRIVKGKYDTDYFIIDKFPAELRPFYTMPDPNDPKLTNSYDFFMRGEEILSGAQRVHDPQLLAERMRSKGIDPESMKGYMDGFRLGCPPHGGGGIGLERVLMLFLKLNNIRRATMFPRDPKRLEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.39
3 0.39
4 0.42
5 0.49
6 0.53
7 0.58
8 0.65
9 0.71
10 0.74
11 0.81
12 0.83
13 0.85
14 0.86
15 0.88
16 0.88
17 0.88
18 0.88
19 0.83
20 0.81
21 0.77
22 0.76
23 0.76
24 0.74
25 0.73
26 0.75
27 0.77
28 0.77
29 0.77
30 0.77
31 0.76
32 0.72
33 0.64
34 0.59
35 0.57
36 0.51
37 0.47
38 0.38
39 0.28
40 0.24
41 0.23
42 0.19
43 0.15
44 0.12
45 0.1
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.15
50 0.21
51 0.23
52 0.28
53 0.35
54 0.38
55 0.46
56 0.5
57 0.51
58 0.54
59 0.64
60 0.69
61 0.7
62 0.72
63 0.71
64 0.72
65 0.74
66 0.68
67 0.64
68 0.56
69 0.53
70 0.51
71 0.44
72 0.4
73 0.35
74 0.3
75 0.24
76 0.22
77 0.17
78 0.11
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.18
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.23
89 0.3
90 0.33
91 0.36
92 0.37
93 0.37
94 0.38
95 0.34
96 0.31
97 0.23
98 0.23
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.24
103 0.24
104 0.24
105 0.26
106 0.25
107 0.18
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.1
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.16
149 0.18
150 0.27
151 0.27
152 0.3
153 0.28
154 0.27
155 0.29
156 0.29
157 0.27
158 0.19
159 0.19
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.13
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.14
189 0.13
190 0.15
191 0.18
192 0.17
193 0.17
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.16
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.2
208 0.19
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.23
214 0.22
215 0.21
216 0.21
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.15
225 0.16
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.14
274 0.14
275 0.17
276 0.14
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.1
284 0.13
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.1
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.13
300 0.17
301 0.22
302 0.24
303 0.24
304 0.24
305 0.24
306 0.25
307 0.21
308 0.2
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.11
339 0.17
340 0.18
341 0.27
342 0.36
343 0.39
344 0.43
345 0.49
346 0.49
347 0.46
348 0.5
349 0.46
350 0.46
351 0.43
352 0.39
353 0.33
354 0.29
355 0.26
356 0.22
357 0.22
358 0.14
359 0.16
360 0.15
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.19
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.1
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.12
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.24
403 0.23
404 0.26
405 0.35
406 0.38
407 0.44
408 0.47
409 0.48
410 0.45
411 0.44
412 0.41
413 0.34
414 0.32
415 0.24
416 0.21
417 0.21
418 0.18
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.16
423 0.18
424 0.18
425 0.2
426 0.25
427 0.25
428 0.25
429 0.3
430 0.31
431 0.33
432 0.41
433 0.44
434 0.4
435 0.46
436 0.45
437 0.42
438 0.43
439 0.43
440 0.36
441 0.33
442 0.34
443 0.29
444 0.3
445 0.27
446 0.23
447 0.19
448 0.16
449 0.15
450 0.12
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.13
459 0.15
460 0.17
461 0.17
462 0.18
463 0.26
464 0.28
465 0.28
466 0.3
467 0.32
468 0.31
469 0.33
470 0.32
471 0.25
472 0.3
473 0.33
474 0.37
475 0.35
476 0.37
477 0.38
478 0.38
479 0.37
480 0.3
481 0.28
482 0.22
483 0.21
484 0.2
485 0.17
486 0.18
487 0.21
488 0.22
489 0.22
490 0.22
491 0.21
492 0.2
493 0.2
494 0.19
495 0.15
496 0.18
497 0.18
498 0.15
499 0.14
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.06
505 0.06
506 0.09
507 0.1
508 0.18
509 0.24
510 0.31
511 0.38
512 0.4
513 0.41
514 0.4
515 0.47
516 0.44
517 0.49
518 0.51
519 0.54
520 0.61
521 0.68