Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3P0T4

Protein Details
Accession A0A5C3P0T4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSHHGGHRRRQPRGASQTREBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MSHHGGHRRRQPRGASQTREADNFDRHEYNETPEQKLRKNIIHYGEVDPVQELPRLAAQIFEHVPANVPIVSEGFRIGVTEQPFKIPYYAALLRLLHDRPATEGASTSLGRQILEDFWKGFQAFLDKQAWRETRLCVQFFAHLTVARVISPPSLYELLKSFAAVFNEFSVSHTRASKAGLCIAEGLVIAGSVIKDDPALDISEIVNGLRTYIESTHEAKTLVQPITQLHSTKPSLEHAEEWLDCALAALQTLSASDFAQTADSVPQPYLESPPISDAAFDLPNVLVPPEVELDTESGGDAQVKKEEWPQCYIRLFDDDVTPDLTAPAGFMLRSNILDVVDIFEVNRKDCARLLLEYPKWTLPGTFKARPGAPPSPVVEGKNWDLDNTLIETILGACFVLPESTHKAIYYIALITELARSSPISIGPAVGKSIRKLYALLSDGLDVEVAHRFEEWFAVHMSNFSFSWPWKEWIPDLTLVSQHPKRVFMRRAIEYEIRLSYYDRILRIVPDDMAEPEAQVMPDQAPGAEFEYEEPGNPYYEPAQSVLNLLRGRAKPEDVMAHLEIVRNQLSETAEGDVNIDSLLRSIAVQSLLSIGSRSFSHFLNAIERYLPLLRNLAAGQISDNGPPHAEARTDIMSAVATVWRRSRHMILIVFDKLMQYQIVDPTDLVAWTFAHCPAVTSGQPKSTFNAFQWDLLKSALDKANGRVMVARRKVAALRREADDKAARAIAGESMEVDTEDKPDVVPAGESEQLTSALKASTVLTREQKSALARTLEGFAEFLAAESASPKVAEVITEHAWHNRANWEDDDWETWETWGWYRHWGRTYSPYLRNYIKTLEHLAASKVPVDQGDPVQTLFRRTWNIAVGHQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.79
3 0.78
4 0.78
5 0.74
6 0.69
7 0.62
8 0.56
9 0.52
10 0.48
11 0.47
12 0.41
13 0.38
14 0.41
15 0.38
16 0.39
17 0.42
18 0.42
19 0.42
20 0.46
21 0.51
22 0.51
23 0.59
24 0.59
25 0.57
26 0.6
27 0.62
28 0.61
29 0.61
30 0.58
31 0.53
32 0.51
33 0.45
34 0.38
35 0.31
36 0.27
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.14
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.2
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.18
51 0.21
52 0.18
53 0.2
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.14
66 0.17
67 0.22
68 0.22
69 0.25
70 0.27
71 0.27
72 0.27
73 0.23
74 0.2
75 0.22
76 0.24
77 0.23
78 0.26
79 0.25
80 0.25
81 0.3
82 0.3
83 0.26
84 0.25
85 0.23
86 0.22
87 0.26
88 0.25
89 0.2
90 0.2
91 0.17
92 0.2
93 0.2
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.2
102 0.21
103 0.19
104 0.19
105 0.22
106 0.22
107 0.2
108 0.18
109 0.21
110 0.2
111 0.24
112 0.3
113 0.28
114 0.3
115 0.38
116 0.39
117 0.37
118 0.38
119 0.37
120 0.39
121 0.46
122 0.45
123 0.38
124 0.37
125 0.37
126 0.36
127 0.36
128 0.29
129 0.23
130 0.23
131 0.24
132 0.23
133 0.19
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.14
140 0.16
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.15
148 0.15
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.17
158 0.19
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.23
163 0.25
164 0.22
165 0.26
166 0.23
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.13
172 0.11
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.13
200 0.14
201 0.18
202 0.19
203 0.2
204 0.21
205 0.19
206 0.22
207 0.26
208 0.23
209 0.21
210 0.2
211 0.2
212 0.25
213 0.27
214 0.23
215 0.18
216 0.24
217 0.24
218 0.25
219 0.25
220 0.25
221 0.26
222 0.27
223 0.27
224 0.23
225 0.26
226 0.24
227 0.23
228 0.19
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.18
292 0.23
293 0.24
294 0.28
295 0.3
296 0.33
297 0.34
298 0.34
299 0.28
300 0.27
301 0.25
302 0.21
303 0.21
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.14
333 0.12
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.16
338 0.17
339 0.2
340 0.24
341 0.26
342 0.26
343 0.27
344 0.25
345 0.24
346 0.22
347 0.2
348 0.15
349 0.22
350 0.27
351 0.29
352 0.3
353 0.33
354 0.34
355 0.35
356 0.39
357 0.34
358 0.29
359 0.28
360 0.27
361 0.29
362 0.29
363 0.28
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.23
368 0.21
369 0.17
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.11
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.06
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.12
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.16
424 0.17
425 0.17
426 0.14
427 0.13
428 0.13
429 0.12
430 0.11
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.07
452 0.13
453 0.14
454 0.16
455 0.16
456 0.17
457 0.17
458 0.18
459 0.2
460 0.17
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.19
466 0.19
467 0.2
468 0.19
469 0.23
470 0.25
471 0.32
472 0.36
473 0.37
474 0.42
475 0.42
476 0.44
477 0.44
478 0.43
479 0.35
480 0.34
481 0.27
482 0.21
483 0.18
484 0.17
485 0.14
486 0.15
487 0.16
488 0.14
489 0.15
490 0.15
491 0.15
492 0.16
493 0.15
494 0.12
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.11
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.12
531 0.12
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.2
536 0.2
537 0.24
538 0.24
539 0.24
540 0.19
541 0.21
542 0.23
543 0.18
544 0.22
545 0.18
546 0.18
547 0.17
548 0.17
549 0.16
550 0.15
551 0.14
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.09
563 0.08
564 0.07
565 0.06
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.12
587 0.13
588 0.14
589 0.18
590 0.19
591 0.17
592 0.16
593 0.16
594 0.17
595 0.18
596 0.17
597 0.13
598 0.14
599 0.13
600 0.14
601 0.14
602 0.14
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.11
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.11
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.11
615 0.1
616 0.1
617 0.13
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.09
627 0.11
628 0.15
629 0.17
630 0.19
631 0.23
632 0.25
633 0.27
634 0.32
635 0.34
636 0.33
637 0.35
638 0.34
639 0.31
640 0.28
641 0.24
642 0.17
643 0.15
644 0.12
645 0.08
646 0.09
647 0.12
648 0.13
649 0.13
650 0.13
651 0.13
652 0.13
653 0.12
654 0.11
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.09
659 0.09
660 0.1
661 0.1
662 0.11
663 0.12
664 0.16
665 0.17
666 0.19
667 0.21
668 0.25
669 0.28
670 0.27
671 0.29
672 0.29
673 0.3
674 0.27
675 0.34
676 0.28
677 0.3
678 0.32
679 0.29
680 0.26
681 0.24
682 0.23
683 0.15
684 0.2
685 0.2
686 0.2
687 0.21
688 0.22
689 0.29
690 0.28
691 0.28
692 0.27
693 0.29
694 0.36
695 0.38
696 0.38
697 0.32
698 0.35
699 0.39
700 0.42
701 0.44
702 0.42
703 0.41
704 0.43
705 0.46
706 0.44
707 0.46
708 0.43
709 0.37
710 0.32
711 0.29
712 0.25
713 0.22
714 0.22
715 0.17
716 0.13
717 0.12
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.1
723 0.08
724 0.09
725 0.1
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.11
734 0.14
735 0.14
736 0.14
737 0.14
738 0.15
739 0.15
740 0.15
741 0.12
742 0.09
743 0.1
744 0.1
745 0.1
746 0.13
747 0.15
748 0.2
749 0.26
750 0.29
751 0.3
752 0.31
753 0.34
754 0.33
755 0.36
756 0.35
757 0.31
758 0.29
759 0.29
760 0.3
761 0.27
762 0.23
763 0.19
764 0.13
765 0.12
766 0.1
767 0.09
768 0.07
769 0.06
770 0.06
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.08
777 0.08
778 0.09
779 0.09
780 0.14
781 0.17
782 0.19
783 0.2
784 0.22
785 0.24
786 0.24
787 0.25
788 0.26
789 0.27
790 0.29
791 0.3
792 0.29
793 0.3
794 0.32
795 0.32
796 0.28
797 0.26
798 0.22
799 0.2
800 0.19
801 0.18
802 0.19
803 0.21
804 0.2
805 0.28
806 0.33
807 0.39
808 0.43
809 0.44
810 0.46
811 0.51
812 0.58
813 0.58
814 0.61
815 0.58
816 0.59
817 0.62
818 0.61
819 0.55
820 0.52
821 0.47
822 0.43
823 0.44
824 0.4
825 0.36
826 0.34
827 0.33
828 0.31
829 0.28
830 0.25
831 0.21
832 0.2
833 0.18
834 0.19
835 0.19
836 0.19
837 0.23
838 0.23
839 0.23
840 0.27
841 0.27
842 0.3
843 0.28
844 0.3
845 0.31
846 0.33
847 0.37
848 0.38
849 0.4
850 0.39