Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PDR0

Protein Details
Accession A0A5C3PDR0    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-36SPEPEVVTKKSKKPKDKQKKAYAAADVHydrophilic
241-265GADGSKKKRKGDVSSPKKKKVKTTSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-29KKSKKPKDKQKK
244-262GSKKKRKGDVSSPKKKKVK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSSSRSSSASPEPEVVTKKSKKPKDKQKKAYAAADVGEHAKNEGDDHDLAYRPPEGFVLMKHKNEEGDFDWDAINGDDKVELWVVRVPDGLKPKHLEGLKIEASASSSTSRVGLIERKHTAYDVWSLGEDETEAVGGDELRAVSCLLPRRKKDGKLYQAPKPIARRLVISARPTIPTPPQSTPGSTPVLHQNPARPRHPKELLTHRFMPLGSLAPVDDSAAMDVDSPAVGDAPKLHKDAEGADGSKKKRKGDVSSPKKKKVKTTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.4
4 0.43
5 0.5
6 0.58
7 0.65
8 0.71
9 0.78
10 0.85
11 0.87
12 0.91
13 0.93
14 0.94
15 0.94
16 0.9
17 0.87
18 0.8
19 0.71
20 0.6
21 0.5
22 0.41
23 0.33
24 0.27
25 0.19
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.15
45 0.22
46 0.25
47 0.27
48 0.29
49 0.29
50 0.3
51 0.29
52 0.31
53 0.24
54 0.25
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.19
59 0.19
60 0.15
61 0.14
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.21
77 0.21
78 0.23
79 0.25
80 0.25
81 0.3
82 0.3
83 0.27
84 0.23
85 0.29
86 0.26
87 0.24
88 0.23
89 0.17
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.09
100 0.12
101 0.14
102 0.19
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.17
109 0.18
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.07
132 0.14
133 0.21
134 0.28
135 0.3
136 0.39
137 0.45
138 0.51
139 0.58
140 0.61
141 0.63
142 0.67
143 0.7
144 0.69
145 0.7
146 0.66
147 0.61
148 0.56
149 0.5
150 0.44
151 0.4
152 0.35
153 0.31
154 0.36
155 0.36
156 0.34
157 0.33
158 0.31
159 0.31
160 0.3
161 0.29
162 0.26
163 0.26
164 0.29
165 0.27
166 0.3
167 0.31
168 0.32
169 0.33
170 0.32
171 0.31
172 0.26
173 0.25
174 0.3
175 0.31
176 0.31
177 0.3
178 0.34
179 0.39
180 0.45
181 0.49
182 0.48
183 0.5
184 0.57
185 0.62
186 0.6
187 0.6
188 0.65
189 0.66
190 0.65
191 0.63
192 0.54
193 0.49
194 0.44
195 0.37
196 0.27
197 0.22
198 0.16
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.09
219 0.15
220 0.18
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.24
226 0.25
227 0.25
228 0.23
229 0.28
230 0.34
231 0.38
232 0.45
233 0.48
234 0.47
235 0.5
236 0.57
237 0.6
238 0.64
239 0.71
240 0.74
241 0.81
242 0.86
243 0.88
244 0.88
245 0.84