Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PDH2

Protein Details
Accession A0A5C3PDH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-176VPLPPPREIRRQKARERARQALLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-172REIRRQKARERAR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MQPSRSSSSSSSSSSSSSLCPSPNYLHAALHHSPISIPTVFPGAFPTAPPPPRASAPTPTGRAVAPVFEPPKPLNAYILFRNAYILMVRKLQELRLIAPLEKPDYSQITADIWNDSRWTASKAQWYALYHKNREVYVAKKALYDQAVKDGRPTVPLPPPREIRRQKARERARQALLAKRIVCEADVGVMKGEQSRPSKRRRTDGHASSSATSPSSSRSSSSLGLMYMPDTPSTLGGALMHPSYNIFGLSWNMPSSSRNSGPWGLAQPQDYMGLPISGDGYPLPSNIDGAIYTAAFPGPHRGPPLGVPGLPQRTMQDQHDDASFDSTLAFDEVFAPAVSQAPPHDLGHAANVDSEDITLEEMIAEYSRQLYETPSVPQQSATCAQSADIVTAGGDALAASPTVEATAIPETTASPEATASSETTASPETTGSTTMSMTFEDPELFMPDGLLEGDDDDSVDFWFDLLDSQEAVDGGAAGFDTGSEQPDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.24
4 0.24
5 0.24
6 0.24
7 0.25
8 0.27
9 0.29
10 0.32
11 0.36
12 0.33
13 0.32
14 0.33
15 0.38
16 0.35
17 0.35
18 0.31
19 0.25
20 0.24
21 0.23
22 0.25
23 0.18
24 0.16
25 0.14
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.19
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.22
34 0.26
35 0.29
36 0.31
37 0.31
38 0.31
39 0.35
40 0.4
41 0.4
42 0.38
43 0.43
44 0.48
45 0.48
46 0.46
47 0.43
48 0.37
49 0.36
50 0.3
51 0.25
52 0.19
53 0.23
54 0.25
55 0.24
56 0.28
57 0.25
58 0.31
59 0.32
60 0.31
61 0.28
62 0.29
63 0.32
64 0.32
65 0.37
66 0.32
67 0.29
68 0.29
69 0.25
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.16
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.24
78 0.24
79 0.27
80 0.25
81 0.25
82 0.27
83 0.28
84 0.25
85 0.26
86 0.28
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.21
91 0.23
92 0.23
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.17
106 0.18
107 0.21
108 0.28
109 0.29
110 0.31
111 0.34
112 0.35
113 0.37
114 0.42
115 0.46
116 0.41
117 0.44
118 0.45
119 0.4
120 0.43
121 0.41
122 0.36
123 0.36
124 0.38
125 0.34
126 0.32
127 0.33
128 0.32
129 0.31
130 0.3
131 0.23
132 0.28
133 0.3
134 0.28
135 0.29
136 0.28
137 0.25
138 0.26
139 0.26
140 0.22
141 0.28
142 0.35
143 0.37
144 0.4
145 0.46
146 0.48
147 0.58
148 0.59
149 0.61
150 0.65
151 0.7
152 0.73
153 0.77
154 0.82
155 0.81
156 0.82
157 0.8
158 0.72
159 0.69
160 0.65
161 0.62
162 0.57
163 0.51
164 0.44
165 0.37
166 0.34
167 0.28
168 0.24
169 0.17
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.14
180 0.19
181 0.28
182 0.35
183 0.44
184 0.53
185 0.56
186 0.64
187 0.65
188 0.68
189 0.69
190 0.69
191 0.67
192 0.62
193 0.59
194 0.51
195 0.45
196 0.37
197 0.27
198 0.2
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.15
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.12
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.19
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.2
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.23
291 0.19
292 0.17
293 0.18
294 0.21
295 0.24
296 0.24
297 0.23
298 0.19
299 0.22
300 0.24
301 0.24
302 0.25
303 0.23
304 0.23
305 0.24
306 0.23
307 0.19
308 0.19
309 0.17
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.1
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.13
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.12
358 0.14
359 0.17
360 0.2
361 0.22
362 0.22
363 0.23
364 0.22
365 0.23
366 0.26
367 0.24
368 0.2
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.19
373 0.15
374 0.11
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.06
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.12
398 0.14
399 0.12
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.13
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.12
416 0.14
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.1
436 0.09
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.06
467 0.07