Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PQQ7

Protein Details
Accession A0A5C3PQQ7    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-43RERAGYRGGRRSRSRSPPRRGERDRRAPDRTDBasic
49-77RGEDRRDRRDDRRDDRRRDDRDRRDYDRDBasic
195-216GGVDVKKQRTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-105RERAGYRGGRRSRSRSPPRRGERDRRAPDRTDYYARDRGEDRRDRRDDRRDDRRRDDRDRRDYDRDGRRDPPPPPRGDADRDRDRSKHDRDRDR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRHDYGRSERERAGYRGGRRSRSRSPPRRGERDRRAPDRTDYYARDRGEDRRDRRDDRRDDRRRDDRDRRDYDRDGRRDPPPPPRGDADRDRDRSKHDRDRDRDGRPADRASEHDSKAPLAAQRDKQQTPTGTPDHEPSASRPREDSEVPTEDVEEGEAMDASNEDDAAMMAIMGLTGFGTTKGKHVDGNQEGGVDVKKQRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.55
3 0.52
4 0.53
5 0.59
6 0.63
7 0.65
8 0.67
9 0.72
10 0.72
11 0.76
12 0.8
13 0.8
14 0.84
15 0.85
16 0.88
17 0.91
18 0.91
19 0.91
20 0.9
21 0.91
22 0.9
23 0.88
24 0.84
25 0.77
26 0.73
27 0.69
28 0.64
29 0.6
30 0.54
31 0.53
32 0.55
33 0.51
34 0.47
35 0.43
36 0.44
37 0.47
38 0.52
39 0.51
40 0.54
41 0.61
42 0.64
43 0.71
44 0.74
45 0.74
46 0.74
47 0.8
48 0.79
49 0.81
50 0.84
51 0.85
52 0.83
53 0.83
54 0.85
55 0.84
56 0.84
57 0.83
58 0.8
59 0.77
60 0.75
61 0.74
62 0.72
63 0.68
64 0.62
65 0.59
66 0.56
67 0.55
68 0.54
69 0.55
70 0.52
71 0.49
72 0.47
73 0.47
74 0.46
75 0.47
76 0.49
77 0.47
78 0.49
79 0.51
80 0.51
81 0.48
82 0.51
83 0.52
84 0.54
85 0.55
86 0.55
87 0.6
88 0.62
89 0.71
90 0.72
91 0.67
92 0.65
93 0.59
94 0.54
95 0.46
96 0.43
97 0.34
98 0.28
99 0.27
100 0.27
101 0.29
102 0.26
103 0.25
104 0.24
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.16
109 0.15
110 0.2
111 0.21
112 0.28
113 0.34
114 0.34
115 0.35
116 0.38
117 0.35
118 0.33
119 0.35
120 0.3
121 0.26
122 0.27
123 0.26
124 0.24
125 0.24
126 0.22
127 0.2
128 0.28
129 0.28
130 0.27
131 0.26
132 0.26
133 0.28
134 0.29
135 0.29
136 0.25
137 0.26
138 0.27
139 0.26
140 0.24
141 0.2
142 0.19
143 0.15
144 0.09
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.03
168 0.04
169 0.06
170 0.07
171 0.11
172 0.15
173 0.16
174 0.19
175 0.22
176 0.31
177 0.32
178 0.36
179 0.33
180 0.3
181 0.29
182 0.27
183 0.25
184 0.19
185 0.19
186 0.2
187 0.23
188 0.3
189 0.39
190 0.47
191 0.54
192 0.61
193 0.69
194 0.75
195 0.82
196 0.86
197 0.83
198 0.79
199 0.75
200 0.74
201 0.7
202 0.69
203 0.66