Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PDT9

Protein Details
Accession A0A5C3PDT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-172VGKERYKLGRGKRMKKWPRNPISKAQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-164ERYKLGRGKRMKKWPRN
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025340  DUF4246  
Pfam View protein in Pfam  
PF14033  DUF4246  
Amino Acid Sequences MVRTKDTDSESDIEVHGDTDDDISAVDEDSDEDIQDSDEDPASINGDITDGEEEAAGVNDAEQAHQEVPEDSDDEEDYRPRGFPSQFDFISRHPFTLVELRMRLFSGKIRSKPNWWEKVYDSSLVAKWREEMVEQDRALVEKLWVGKERYKLGRGKRMKKWPRNPISKAQLDYIFEQLKYEAAQRDPETGIFATAIGGVYSSRSLIPSGLKSELLQGVALLENIPDEEKDWHPGSNKQVLDLVHPSLYCLRIGESRFRADATDEDSLEILTLEAYENRRPDAINLNRSWNSSRRWIMSRKYQWLPTDFTVSPSGDVKPLGYINNLHPTRHAALYQPIASILGRFIPLFERVLSDVLSREPPRAIKVNPYKWYSHEPEAPDWRDSKAYKAWERKHHWPRIPQPAPFTPPDTTTRVQYPLKGRKVQVIVKLANIVLTPENPRYAGGAWHVEGMANENIVATGLYYYACENITESRLDFRVTVGTADGSGMRYQQDDHRGFVVAYGFGRDDHQNQELGHIVAEEDKCVAFPNIYQHHVDAFELADPTKPGHRKILCFFLVDPDLEILSTTDVPPQQEDWLTEEIEQLPRMKDLPPELYGIIMDYVKPTVISREQAEKHRAKLMKERSAFVMKHNERVYQTSFSMCEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.13
4 0.11
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.07
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.22
69 0.22
70 0.25
71 0.3
72 0.36
73 0.35
74 0.37
75 0.39
76 0.34
77 0.43
78 0.39
79 0.33
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.31
84 0.32
85 0.28
86 0.29
87 0.29
88 0.29
89 0.3
90 0.28
91 0.21
92 0.23
93 0.28
94 0.34
95 0.39
96 0.47
97 0.5
98 0.56
99 0.65
100 0.7
101 0.7
102 0.64
103 0.62
104 0.57
105 0.62
106 0.58
107 0.49
108 0.4
109 0.34
110 0.34
111 0.35
112 0.32
113 0.24
114 0.23
115 0.23
116 0.22
117 0.19
118 0.22
119 0.22
120 0.28
121 0.28
122 0.27
123 0.26
124 0.26
125 0.26
126 0.2
127 0.16
128 0.11
129 0.14
130 0.16
131 0.2
132 0.23
133 0.27
134 0.31
135 0.39
136 0.41
137 0.45
138 0.49
139 0.53
140 0.6
141 0.66
142 0.7
143 0.73
144 0.79
145 0.83
146 0.87
147 0.89
148 0.89
149 0.9
150 0.9
151 0.87
152 0.85
153 0.83
154 0.78
155 0.7
156 0.63
157 0.55
158 0.47
159 0.43
160 0.38
161 0.31
162 0.25
163 0.24
164 0.2
165 0.17
166 0.16
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.2
171 0.2
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.21
176 0.18
177 0.17
178 0.12
179 0.11
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.18
200 0.18
201 0.15
202 0.13
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.09
215 0.09
216 0.14
217 0.15
218 0.17
219 0.19
220 0.24
221 0.28
222 0.32
223 0.31
224 0.27
225 0.29
226 0.28
227 0.29
228 0.27
229 0.23
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.13
239 0.15
240 0.21
241 0.22
242 0.23
243 0.24
244 0.24
245 0.23
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.06
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.05
261 0.08
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.14
268 0.22
269 0.26
270 0.31
271 0.31
272 0.37
273 0.37
274 0.39
275 0.4
276 0.34
277 0.31
278 0.31
279 0.32
280 0.3
281 0.34
282 0.38
283 0.4
284 0.46
285 0.5
286 0.5
287 0.51
288 0.51
289 0.49
290 0.47
291 0.46
292 0.37
293 0.36
294 0.29
295 0.28
296 0.26
297 0.23
298 0.21
299 0.18
300 0.17
301 0.12
302 0.12
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.22
317 0.21
318 0.13
319 0.15
320 0.17
321 0.17
322 0.14
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.07
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.17
349 0.21
350 0.2
351 0.26
352 0.35
353 0.41
354 0.46
355 0.48
356 0.46
357 0.45
358 0.51
359 0.46
360 0.41
361 0.38
362 0.35
363 0.37
364 0.43
365 0.42
366 0.37
367 0.33
368 0.3
369 0.3
370 0.28
371 0.27
372 0.24
373 0.29
374 0.35
375 0.44
376 0.5
377 0.55
378 0.62
379 0.69
380 0.74
381 0.76
382 0.75
383 0.74
384 0.75
385 0.77
386 0.75
387 0.67
388 0.62
389 0.58
390 0.55
391 0.48
392 0.43
393 0.33
394 0.31
395 0.32
396 0.32
397 0.28
398 0.27
399 0.28
400 0.29
401 0.29
402 0.31
403 0.37
404 0.42
405 0.48
406 0.5
407 0.48
408 0.5
409 0.55
410 0.54
411 0.51
412 0.49
413 0.43
414 0.38
415 0.39
416 0.31
417 0.26
418 0.21
419 0.16
420 0.1
421 0.1
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.13
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.13
436 0.12
437 0.14
438 0.12
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.09
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.11
478 0.16
479 0.25
480 0.25
481 0.26
482 0.27
483 0.27
484 0.26
485 0.26
486 0.22
487 0.14
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.14
493 0.14
494 0.16
495 0.19
496 0.2
497 0.21
498 0.21
499 0.23
500 0.22
501 0.2
502 0.17
503 0.13
504 0.12
505 0.14
506 0.14
507 0.12
508 0.11
509 0.1
510 0.1
511 0.12
512 0.13
513 0.08
514 0.1
515 0.19
516 0.23
517 0.26
518 0.27
519 0.26
520 0.27
521 0.27
522 0.26
523 0.17
524 0.13
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.2
532 0.23
533 0.24
534 0.33
535 0.38
536 0.43
537 0.47
538 0.54
539 0.48
540 0.47
541 0.44
542 0.41
543 0.38
544 0.32
545 0.28
546 0.2
547 0.18
548 0.15
549 0.15
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.09
554 0.13
555 0.14
556 0.16
557 0.17
558 0.18
559 0.2
560 0.21
561 0.22
562 0.22
563 0.22
564 0.22
565 0.2
566 0.21
567 0.21
568 0.21
569 0.22
570 0.2
571 0.19
572 0.2
573 0.21
574 0.21
575 0.23
576 0.26
577 0.29
578 0.28
579 0.3
580 0.28
581 0.28
582 0.26
583 0.22
584 0.18
585 0.13
586 0.12
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.1
592 0.15
593 0.19
594 0.23
595 0.26
596 0.35
597 0.4
598 0.47
599 0.57
600 0.56
601 0.55
602 0.6
603 0.6
604 0.56
605 0.61
606 0.63
607 0.64
608 0.62
609 0.61
610 0.59
611 0.63
612 0.58
613 0.54
614 0.55
615 0.48
616 0.53
617 0.52
618 0.51
619 0.46
620 0.51
621 0.49
622 0.43
623 0.42
624 0.37