Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PHL2

Protein Details
Accession A0A5C3PHL2    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-104DADGKKKAKKVKDPNAPKRPASBasic
240-259APTPAKEEGKKEKKHKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-101GKKRKSRGEDADGKKKAKKVKDPNAPKR
230-259PAKKSKKEVAAPTPAKEEGKKEKKHKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MNPEMQTQFDYQRLQLIGSITHIANSMREAAAAADQMINALTYGGQNPPFPQLPNGQYAMPVMPPLPVAQDEHGKKRKSRGEDADGKKKAKKVKDPNAPKRPASSYLLFQNDVRSELKTKHPNMRNNELLGYIAKLWSEMPQEQKDKYEQRNRTAKDEWLAHKAVYESSKVGATPVPATVAAPAVPAPIAAPIPVAAPVVAETSEEEDDDEEASSGSPEASSDEDASPPPAKKSKKEVAAPTPAKEEGKKEKKHKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.23
4 0.19
5 0.19
6 0.21
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.07
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.18
36 0.19
37 0.2
38 0.22
39 0.25
40 0.26
41 0.29
42 0.3
43 0.25
44 0.24
45 0.24
46 0.22
47 0.15
48 0.13
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.11
57 0.2
58 0.22
59 0.32
60 0.39
61 0.41
62 0.43
63 0.5
64 0.55
65 0.54
66 0.6
67 0.59
68 0.61
69 0.68
70 0.72
71 0.74
72 0.72
73 0.68
74 0.62
75 0.58
76 0.56
77 0.54
78 0.57
79 0.57
80 0.63
81 0.7
82 0.78
83 0.85
84 0.88
85 0.85
86 0.75
87 0.69
88 0.62
89 0.55
90 0.49
91 0.4
92 0.32
93 0.33
94 0.35
95 0.31
96 0.27
97 0.26
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.16
102 0.15
103 0.17
104 0.25
105 0.29
106 0.33
107 0.4
108 0.46
109 0.52
110 0.57
111 0.61
112 0.56
113 0.49
114 0.46
115 0.37
116 0.3
117 0.23
118 0.17
119 0.1
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.07
125 0.09
126 0.11
127 0.15
128 0.2
129 0.23
130 0.23
131 0.25
132 0.29
133 0.34
134 0.4
135 0.45
136 0.46
137 0.52
138 0.6
139 0.6
140 0.6
141 0.56
142 0.5
143 0.45
144 0.46
145 0.4
146 0.36
147 0.35
148 0.28
149 0.27
150 0.25
151 0.22
152 0.18
153 0.16
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.08
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.21
216 0.25
217 0.31
218 0.35
219 0.41
220 0.5
221 0.55
222 0.6
223 0.67
224 0.71
225 0.71
226 0.77
227 0.74
228 0.68
229 0.63
230 0.57
231 0.52
232 0.46
233 0.46
234 0.46
235 0.52
236 0.59
237 0.65
238 0.72
239 0.8