FuNGI

A0A5C3PT88

Protein Details

Accession

A0A5C3PT88

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
271-307	SDDERSAKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRSSSPSGS	Basic
310-393	DSESEDERERRRRKKKSRSRAASSDEDSDSERERRRKKKKRSRENSDVEMSDDESSRRSKSKSKSKSKRKKSRRSHSSDEDSDS	Basic
396-424	ESDRSRSRSRSKASSSKRKRSPSPGEDIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-301	AKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRS
317-332	RERRRRKKKSRSRAAS
339-352	SERERRRKKKKRSR
366-384	RRSKSKSKSKSKRKKSRRS
400-416	SRSRSRSKASSSKRKRS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNTHELKLHQAALADPKHTLTQQECDAIVPDAAARTAALNFLLGTGLLKAMKDAKGAVSFRAVMKKELEVKKDLTGEEAMILSYIQAAKNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLIKTVKSKNYPTRKIYMLYHLQPSEEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACVRFIRDRSTPKQKNADSSSSSNQPLYPISAAPQYPTAQQVQSFLSKSRITETELSVDNVETLLNVLVLDGDIERVPAFGAASWDTSDNAARASDVSDDERSAKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRSSSPSGSDSDSESEDERERRRRKKKSRSRAASSDEDSDSERERRRKKKKRSRENSDVEMSDDESSRRSKSKSKSKSKRKKSRRSHSSDEDSDSGSESDRSRSRSRSKASSSKRKRSPSPGEDITASFLQEGYGAYVYRAVRQELAAGGGGGLSQTPCVRCPTFDFCKGGGPVNPQECEYYGTWLSAAEVAKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.38
3	0.34
4	0.36
5	0.34
6	0.26
7	0.24
8	0.24
9	0.26
10	0.26
11	0.28
12	0.24
13	0.27
14	0.29
15	0.32
16	0.3
17	0.28
18	0.29
19	0.25
20	0.21
21	0.16
22	0.13
23	0.1
24	0.1
25	0.09
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.18
47	0.25
48	0.26
49	0.26
50	0.24
51	0.25
52	0.27
53	0.34
54	0.32
55	0.28
56	0.29
57	0.33
58	0.4
59	0.44
60	0.45
61	0.41
62	0.42
63	0.44
64	0.45
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.2
70	0.18
71	0.13
72	0.1
73	0.09
74	0.06
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.1
80	0.1
81	0.13
82	0.15
83	0.16
84	0.17
85	0.2
86	0.25
87	0.28
88	0.33
89	0.33
90	0.35
91	0.38
92	0.44
93	0.5
94	0.54
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.47
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.37
109	0.4
110	0.43
111	0.44
112	0.51
113	0.56
114	0.52
115	0.51
116	0.52
117	0.51
118	0.55
119	0.62
120	0.63
121	0.68
122	0.74
123	0.72
124	0.68
125	0.62
126	0.59
127	0.54
128	0.51
129	0.48
130	0.43
131	0.44
132	0.39
133	0.36
134	0.33
135	0.31
136	0.25
137	0.18
138	0.14
139	0.09
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.16
163	0.2
164	0.23
165	0.26
166	0.3
167	0.35
168	0.41
169	0.45
170	0.53
171	0.56
172	0.59
173	0.65
174	0.62
175	0.64
176	0.62
177	0.59
178	0.52
179	0.5
180	0.47
181	0.42
182	0.41
183	0.33
184	0.28
185	0.24
186	0.2
187	0.17
188	0.14
189	0.1
190	0.1
191	0.13
192	0.13
193	0.12
194	0.14
195	0.13
196	0.13
197	0.15
198	0.15
199	0.13
200	0.13
201	0.15
202	0.14
203	0.16
204	0.16
205	0.15
206	0.18
207	0.18
208	0.18
209	0.19
210	0.18
211	0.19
212	0.2
213	0.2
214	0.19
215	0.19
216	0.2
217	0.17
218	0.16
219	0.12
220	0.1
221	0.08
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.03
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.17
264	0.24
265	0.31
266	0.38
267	0.49
268	0.59
269	0.69
270	0.74
271	0.81
272	0.85
273	0.88
274	0.91
275	0.92
276	0.92
277	0.89
278	0.91
279	0.9
280	0.89
281	0.89
282	0.89
283	0.89
284	0.89
285	0.88
286	0.89
287	0.87
288	0.84
289	0.79
290	0.72
291	0.64
292	0.55
293	0.5
294	0.39
295	0.32
296	0.26
297	0.21
298	0.18
299	0.14
300	0.15
301	0.16
302	0.2
303	0.24
304	0.32
305	0.4
306	0.5
307	0.6
308	0.69
309	0.77
310	0.84
311	0.9
312	0.91
313	0.94
314	0.93
315	0.91
316	0.88
317	0.84
318	0.79
319	0.7
320	0.63
321	0.52
322	0.43
323	0.36
324	0.29
325	0.26
326	0.25
327	0.29
328	0.34
329	0.43
330	0.53
331	0.63
332	0.72
333	0.8
334	0.86
335	0.9
336	0.93
337	0.95
338	0.94
339	0.94
340	0.91
341	0.86
342	0.8
343	0.69
344	0.6
345	0.49
346	0.4
347	0.31
348	0.23
349	0.17
350	0.14
351	0.15
352	0.16
353	0.19
354	0.21
355	0.28
356	0.38
357	0.48
358	0.57
359	0.67
360	0.75
361	0.83
362	0.91
363	0.94
364	0.95
365	0.95
366	0.95
367	0.95
368	0.96
369	0.95
370	0.93
371	0.91
372	0.9
373	0.88
374	0.81
375	0.75
376	0.65
377	0.55
378	0.46
379	0.38
380	0.29
381	0.2
382	0.19
383	0.15
384	0.19
385	0.21
386	0.27
387	0.31
388	0.39
389	0.46
390	0.53
391	0.59
392	0.62
393	0.67
394	0.72
395	0.77
396	0.8
397	0.83
398	0.84
399	0.87
400	0.86
401	0.86
402	0.86
403	0.86
404	0.82
405	0.81
406	0.75
407	0.68
408	0.61
409	0.54
410	0.47
411	0.37
412	0.3
413	0.2
414	0.16
415	0.12
416	0.11
417	0.11
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.14
423	0.15
424	0.19
425	0.21
426	0.2
427	0.21
428	0.21
429	0.23
430	0.18
431	0.2
432	0.15
433	0.13
434	0.11
435	0.09
436	0.09
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.06
441	0.09
442	0.11
443	0.13
444	0.19
445	0.2
446	0.22
447	0.29
448	0.36
449	0.41
450	0.46
451	0.49
452	0.44
453	0.5
454	0.49
455	0.47
456	0.43
457	0.42
458	0.44
459	0.45
460	0.45
461	0.39
462	0.39
463	0.36
464	0.36
465	0.3
466	0.28
467	0.23
468	0.23
469	0.21
470	0.19
471	0.19
472	0.19

A0A5C3PT88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer