Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3PPH9

Protein Details
Accession A0A5C3PPH9    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-73ASQPAFKPRTLKKNKGEDYRDRAGEHydrophilic
429-453SEEAEKEEKRKARKEKKKGGGGGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-246EAKKAGKFKPIGFKPVGSGAEKGADGKVKRKKKVKAGELEENVERKKKRK
435-468EEKRKARKEKKKGGGGGGGGAGAGGSSEKDTKAK
481-486DKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences MDQTSFRQLLQTPKASSATSPATSSGHIRGSLLATVSAAGKKKQKTVDASQPAFKPRTLKKNKGEDYRDRAGERRLGVNNDFAQVEALAEDFERRHAEEEDRRAVDEQRKYLGGDSQHTVLVKGLDFALLEQNRARVAAETAATEDVSLEQAFLESTAQPKKRTKAEILSELKSKRGAGVPSAATAAAAAADKALEEAKKAGKFKPIGFKPVGSGAEKGADGKVKRKKKVKAGELEENVERKKKRKVAADATPAPTPASVPSEQVQEGQASATSSGDVAENVPVAGPSTTKPTATPIPEPEPVDEDFDIFAGAGEYTGIDLGDDDEGSEDEGPNPRPQEDEGVLRDGEAPRPGKWLATSDDEREPTPPPPAALTRDSKSATRSVSPQRHGPPSHLEDGEMDEEAEERPMRLQPLASSALPSIKDLLAMSEEAEKEEKRKARKEKKKGGGGGGGGAGAGGSSEKDTKAKIDRDYQRLKAYTDKKKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.43
3 0.4
4 0.37
5 0.35
6 0.3
7 0.29
8 0.26
9 0.25
10 0.26
11 0.29
12 0.27
13 0.24
14 0.23
15 0.22
16 0.22
17 0.23
18 0.23
19 0.2
20 0.16
21 0.13
22 0.13
23 0.15
24 0.17
25 0.17
26 0.21
27 0.27
28 0.31
29 0.38
30 0.44
31 0.5
32 0.53
33 0.59
34 0.65
35 0.68
36 0.68
37 0.67
38 0.65
39 0.64
40 0.58
41 0.52
42 0.49
43 0.47
44 0.55
45 0.59
46 0.65
47 0.68
48 0.77
49 0.84
50 0.85
51 0.85
52 0.84
53 0.82
54 0.8
55 0.75
56 0.67
57 0.62
58 0.57
59 0.54
60 0.46
61 0.45
62 0.42
63 0.42
64 0.4
65 0.43
66 0.39
67 0.35
68 0.32
69 0.25
70 0.21
71 0.16
72 0.15
73 0.09
74 0.07
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.14
83 0.16
84 0.24
85 0.3
86 0.37
87 0.42
88 0.41
89 0.42
90 0.41
91 0.44
92 0.45
93 0.43
94 0.39
95 0.34
96 0.35
97 0.34
98 0.34
99 0.32
100 0.27
101 0.25
102 0.24
103 0.22
104 0.23
105 0.22
106 0.21
107 0.18
108 0.16
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.15
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.09
144 0.17
145 0.2
146 0.25
147 0.31
148 0.36
149 0.42
150 0.47
151 0.49
152 0.5
153 0.53
154 0.58
155 0.57
156 0.55
157 0.54
158 0.49
159 0.45
160 0.37
161 0.31
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.17
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.2
170 0.17
171 0.13
172 0.11
173 0.09
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.12
186 0.16
187 0.18
188 0.2
189 0.25
190 0.28
191 0.32
192 0.4
193 0.38
194 0.4
195 0.39
196 0.38
197 0.32
198 0.34
199 0.32
200 0.23
201 0.21
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.11
207 0.13
208 0.12
209 0.2
210 0.28
211 0.34
212 0.42
213 0.49
214 0.56
215 0.62
216 0.71
217 0.71
218 0.72
219 0.71
220 0.72
221 0.66
222 0.62
223 0.53
224 0.46
225 0.38
226 0.34
227 0.29
228 0.25
229 0.3
230 0.34
231 0.38
232 0.44
233 0.52
234 0.55
235 0.62
236 0.67
237 0.63
238 0.59
239 0.54
240 0.45
241 0.37
242 0.28
243 0.2
244 0.13
245 0.12
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.21
281 0.23
282 0.26
283 0.25
284 0.29
285 0.32
286 0.33
287 0.3
288 0.28
289 0.25
290 0.25
291 0.2
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.08
297 0.07
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.05
317 0.07
318 0.1
319 0.12
320 0.15
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.18
325 0.22
326 0.2
327 0.23
328 0.22
329 0.24
330 0.23
331 0.22
332 0.24
333 0.2
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.18
338 0.22
339 0.21
340 0.2
341 0.2
342 0.21
343 0.2
344 0.25
345 0.27
346 0.27
347 0.32
348 0.32
349 0.32
350 0.3
351 0.29
352 0.24
353 0.25
354 0.22
355 0.18
356 0.2
357 0.23
358 0.26
359 0.29
360 0.32
361 0.3
362 0.35
363 0.36
364 0.34
365 0.33
366 0.33
367 0.31
368 0.29
369 0.34
370 0.39
371 0.46
372 0.48
373 0.53
374 0.55
375 0.6
376 0.59
377 0.56
378 0.54
379 0.51
380 0.53
381 0.45
382 0.4
383 0.32
384 0.34
385 0.31
386 0.23
387 0.17
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.13
392 0.09
393 0.08
394 0.1
395 0.12
396 0.14
397 0.15
398 0.16
399 0.15
400 0.2
401 0.23
402 0.22
403 0.21
404 0.2
405 0.23
406 0.22
407 0.22
408 0.19
409 0.15
410 0.16
411 0.14
412 0.15
413 0.13
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.19
420 0.18
421 0.19
422 0.27
423 0.33
424 0.37
425 0.47
426 0.56
427 0.65
428 0.75
429 0.83
430 0.86
431 0.9
432 0.92
433 0.89
434 0.84
435 0.79
436 0.69
437 0.6
438 0.5
439 0.39
440 0.28
441 0.21
442 0.14
443 0.07
444 0.06
445 0.04
446 0.04
447 0.06
448 0.08
449 0.1
450 0.12
451 0.14
452 0.2
453 0.29
454 0.35
455 0.39
456 0.47
457 0.55
458 0.63
459 0.71
460 0.71
461 0.71
462 0.68
463 0.64
464 0.64
465 0.65
466 0.66