Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PVK4

Protein Details
Accession A0A5C3PVK4    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-134VAKPADQKDNEKKQRRVKKRTGRRGSKSVPGBasic
154-180ASGDAAKPKKKKKARKPKRKSSDGEAPBasic
189-211GDAAKKPKPRKARTPRPPRPAGEBasic
246-270NVKSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-130EKKQRRVKKRTGRRGSK
159-208AKPKKKKKARKPKRKSSDGEAPAEGASAAEGDAAKKPKPRKARTPRPPRP
251-264RIVRRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.833, cyto 13.5, nucl 13, mito_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVTENGVPPAAQEAVVEETPGFKVFAGNLAYTTTDEGLKTFFEPVQSEVLSAQVIMRGGNRSAGYGFVSFTTAEAAQKAVELLDKKELDGRTVIVEVAKPADQKDNEKKQRRVKKRTGRRGSKSVPGEVSEAEANGDASTDAAKGDASGDAAKPKKKKKARKPKRKSSDGEAPAEGASAAEGDAAKKPKPRKARTPRPPRPAGEDPLGEPSKTVLFVANLGFNIDDAGLAALFTEAGINVKSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVGDEAEQKKALEALQGKEVGGRAIAVKIAVNPLNDGDVSEGNEGNDVQAEEKKEEQAEEKKEQQAEEQAEAAPVAAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.18
4 0.15
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.13
16 0.08
17 0.1
18 0.1
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.16
26 0.17
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.15
38 0.17
39 0.2
40 0.19
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.06
74 0.09
75 0.1
76 0.12
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.24
81 0.24
82 0.22
83 0.21
84 0.2
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.17
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.63
102 0.71
103 0.74
104 0.83
105 0.86
106 0.86
107 0.86
108 0.87
109 0.89
110 0.92
111 0.93
112 0.92
113 0.89
114 0.88
115 0.81
116 0.79
117 0.71
118 0.63
119 0.53
120 0.44
121 0.38
122 0.28
123 0.26
124 0.17
125 0.14
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.11
145 0.14
146 0.19
147 0.25
148 0.32
149 0.41
150 0.5
151 0.6
152 0.66
153 0.75
154 0.82
155 0.87
156 0.91
157 0.93
158 0.94
159 0.92
160 0.85
161 0.81
162 0.8
163 0.73
164 0.65
165 0.53
166 0.44
167 0.34
168 0.3
169 0.22
170 0.11
171 0.06
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.07
178 0.09
179 0.11
180 0.16
181 0.21
182 0.28
183 0.39
184 0.45
185 0.54
186 0.63
187 0.73
188 0.79
189 0.86
190 0.89
191 0.87
192 0.87
193 0.78
194 0.75
195 0.69
196 0.63
197 0.55
198 0.46
199 0.38
200 0.38
201 0.37
202 0.28
203 0.22
204 0.19
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.11
237 0.18
238 0.24
239 0.28
240 0.36
241 0.47
242 0.55
243 0.64
244 0.72
245 0.76
246 0.8
247 0.88
248 0.89
249 0.87
250 0.83
251 0.82
252 0.79
253 0.73
254 0.63
255 0.54
256 0.45
257 0.37
258 0.33
259 0.24
260 0.17
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.15
269 0.19
270 0.2
271 0.24
272 0.25
273 0.24
274 0.25
275 0.25
276 0.19
277 0.14
278 0.13
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.16
292 0.15
293 0.13
294 0.12
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.1
305 0.13
306 0.16
307 0.18
308 0.2
309 0.23
310 0.23
311 0.24
312 0.3
313 0.35
314 0.39
315 0.43
316 0.48
317 0.52
318 0.53
319 0.52
320 0.49
321 0.49
322 0.46
323 0.41
324 0.36
325 0.3
326 0.27
327 0.26
328 0.22