Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3PXR1

Protein Details
Accession A0A5C3PXR1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-37SEQSVATSPHPRKRQRLSDESDNDAHydrophilic
60-87EKEPVLSHAEKRRQKKKEKVSTKSADAAHydrophilic
353-375GGRGKQFGTKRERPSRPRQDDAQBasic
383-404EEAQDRPAKRRRSNAEDSKDRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-82EKRRQKKKEKVSTK
336-370RRGGGGPPRKEREQGETGGRGKQFGTKRERPSRPR
388-420RPAKRRRSNAEDSKDRGRDKGGKGARPRSKPGA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MVSSSSSSSASDSEQSVATSPHPRKRQRLSDESDNDASSSENDSEGSQSDSDSDAGSNAEKEPVLSHAEKRRQKKKEKVSTKSADAAPSADGKKAKVQNTAELPPSKVPKRQNSVWVGNLSFKTTPASLKSFFEGVGEITRVHMPMKMATGGPDGKPRKENRGFAYVDFASPDAKIIAITMSENPLDGRRLLIKDGDDFKGRPAATAGADGAEGAAAKSAGHSKTAQKILSVQKQPPAQTLFLGNLGFETTEETIRELFESHRAKAKEPAADGADTDKWIRKIRLGTFEDSGKCKGWAFVDFTSTEHATAALTNPRNHQLNGRKLVVEYASPEAVRRGGGGPPRKEREQGETGGRGKQFGTKRERPSRPRQDDAQGGGEEGEEEAQDRPAKRRRSNAEDSKDRGRDKGGKGARPRSKPGAALAMARREDVSIVPSQGKKIVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.19
6 0.26
7 0.32
8 0.4
9 0.49
10 0.57
11 0.65
12 0.74
13 0.81
14 0.81
15 0.83
16 0.83
17 0.84
18 0.81
19 0.77
20 0.7
21 0.59
22 0.5
23 0.4
24 0.32
25 0.23
26 0.21
27 0.15
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.18
52 0.19
53 0.25
54 0.33
55 0.43
56 0.51
57 0.6
58 0.68
59 0.72
60 0.81
61 0.84
62 0.86
63 0.87
64 0.9
65 0.89
66 0.89
67 0.86
68 0.8
69 0.76
70 0.67
71 0.58
72 0.48
73 0.41
74 0.32
75 0.31
76 0.26
77 0.23
78 0.22
79 0.21
80 0.29
81 0.34
82 0.37
83 0.39
84 0.4
85 0.44
86 0.49
87 0.51
88 0.48
89 0.44
90 0.42
91 0.39
92 0.44
93 0.41
94 0.41
95 0.46
96 0.5
97 0.56
98 0.58
99 0.63
100 0.63
101 0.64
102 0.62
103 0.57
104 0.49
105 0.45
106 0.41
107 0.35
108 0.27
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.22
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.22
119 0.21
120 0.19
121 0.16
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.24
141 0.25
142 0.27
143 0.34
144 0.35
145 0.42
146 0.47
147 0.52
148 0.47
149 0.53
150 0.51
151 0.44
152 0.47
153 0.37
154 0.3
155 0.25
156 0.21
157 0.14
158 0.12
159 0.12
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.17
182 0.2
183 0.21
184 0.2
185 0.19
186 0.19
187 0.22
188 0.22
189 0.18
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.1
210 0.13
211 0.19
212 0.23
213 0.23
214 0.2
215 0.26
216 0.31
217 0.38
218 0.39
219 0.35
220 0.36
221 0.39
222 0.39
223 0.37
224 0.33
225 0.25
226 0.22
227 0.21
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.11
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.15
247 0.18
248 0.18
249 0.25
250 0.25
251 0.27
252 0.33
253 0.36
254 0.31
255 0.29
256 0.31
257 0.26
258 0.26
259 0.24
260 0.2
261 0.17
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.16
266 0.2
267 0.21
268 0.22
269 0.28
270 0.32
271 0.4
272 0.41
273 0.4
274 0.39
275 0.42
276 0.4
277 0.37
278 0.34
279 0.25
280 0.23
281 0.2
282 0.2
283 0.17
284 0.18
285 0.2
286 0.18
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.22
291 0.2
292 0.17
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.15
299 0.18
300 0.2
301 0.23
302 0.28
303 0.31
304 0.31
305 0.37
306 0.4
307 0.45
308 0.49
309 0.49
310 0.44
311 0.42
312 0.44
313 0.36
314 0.27
315 0.2
316 0.17
317 0.16
318 0.15
319 0.16
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.11
325 0.14
326 0.22
327 0.3
328 0.36
329 0.44
330 0.5
331 0.51
332 0.54
333 0.53
334 0.53
335 0.5
336 0.47
337 0.44
338 0.45
339 0.45
340 0.46
341 0.43
342 0.36
343 0.31
344 0.34
345 0.34
346 0.36
347 0.43
348 0.47
349 0.57
350 0.67
351 0.76
352 0.78
353 0.83
354 0.86
355 0.85
356 0.83
357 0.78
358 0.75
359 0.72
360 0.67
361 0.61
362 0.5
363 0.41
364 0.35
365 0.29
366 0.21
367 0.15
368 0.11
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.1
373 0.15
374 0.17
375 0.25
376 0.33
377 0.43
378 0.49
379 0.58
380 0.64
381 0.7
382 0.78
383 0.8
384 0.82
385 0.81
386 0.8
387 0.8
388 0.77
389 0.7
390 0.62
391 0.59
392 0.58
393 0.53
394 0.58
395 0.56
396 0.58
397 0.65
398 0.74
399 0.75
400 0.73
401 0.76
402 0.74
403 0.71
404 0.65
405 0.61
406 0.58
407 0.51
408 0.51
409 0.49
410 0.49
411 0.44
412 0.42
413 0.38
414 0.3
415 0.29
416 0.23
417 0.21
418 0.17
419 0.2
420 0.25
421 0.26
422 0.28