Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PPB7

Protein Details
Accession A0A5C3PPB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-42QELRRNRALEEQKRRRAERIBasic
103-132APESNMQTQEKKRKNKRKGKGRATPNDQGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-145KKRKNKRKGKGRATPNDQGGQAKHKGGKTAKPS
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Amino Acid Sequences MSQDRKASFKLPPSSVRSRQTAQELRRNRALEEQKRRRAERIDSARQLDIFADLSLGQDDDDADEADGMDNVVREGISQFAGMLPSPAPQPVPTPSESEQPPAPESNMQTQEKKRKNKRKGKGRATPNDQGGQAKHKGGKTAKPSKWADKCMYAELLEMKDGLDASGVLQDGIPTDMETGWVAVTPVPVGKRCLAITHQASGVAGIVPNTTIRSRVLGKPLIKPFPSTLPPQTVLDCILDDNWRENGILHVLDVISWKGQDLADCETPFRFWWRDTRLSELDSFPPPPNAAPSASQPAKYQFPHPTTFAPIPYHTDTSLAHLLSTLIPRTRTTRTIPVTIPENPPNSISDEAAMELDNAAPLVQLQTVQAQIPPDGMLLYVAQASYEPGTSPLSTWIPLRAYQTREEQEQSGPSIAESPLDMFERLVRRRLALGVHSLPAVPEVEMES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.69
4 0.67
5 0.62
6 0.62
7 0.64
8 0.65
9 0.64
10 0.66
11 0.67
12 0.67
13 0.72
14 0.67
15 0.59
16 0.6
17 0.62
18 0.63
19 0.66
20 0.7
21 0.72
22 0.8
23 0.82
24 0.79
25 0.76
26 0.73
27 0.73
28 0.72
29 0.73
30 0.71
31 0.71
32 0.66
33 0.59
34 0.51
35 0.4
36 0.32
37 0.22
38 0.15
39 0.12
40 0.09
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.13
78 0.16
79 0.2
80 0.2
81 0.25
82 0.26
83 0.32
84 0.32
85 0.33
86 0.31
87 0.29
88 0.3
89 0.26
90 0.26
91 0.23
92 0.25
93 0.3
94 0.36
95 0.36
96 0.4
97 0.47
98 0.56
99 0.61
100 0.7
101 0.72
102 0.76
103 0.84
104 0.88
105 0.9
106 0.91
107 0.93
108 0.93
109 0.91
110 0.91
111 0.9
112 0.88
113 0.84
114 0.77
115 0.69
116 0.6
117 0.53
118 0.44
119 0.4
120 0.34
121 0.31
122 0.31
123 0.29
124 0.35
125 0.36
126 0.41
127 0.45
128 0.53
129 0.52
130 0.56
131 0.6
132 0.63
133 0.66
134 0.65
135 0.58
136 0.54
137 0.54
138 0.47
139 0.44
140 0.34
141 0.28
142 0.24
143 0.21
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.04
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.15
182 0.21
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.18
188 0.16
189 0.14
190 0.07
191 0.06
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.13
202 0.15
203 0.2
204 0.24
205 0.27
206 0.33
207 0.37
208 0.39
209 0.36
210 0.35
211 0.31
212 0.3
213 0.3
214 0.27
215 0.24
216 0.24
217 0.25
218 0.24
219 0.24
220 0.2
221 0.18
222 0.15
223 0.13
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.12
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.18
257 0.15
258 0.13
259 0.21
260 0.27
261 0.35
262 0.36
263 0.42
264 0.4
265 0.4
266 0.41
267 0.35
268 0.32
269 0.26
270 0.27
271 0.21
272 0.2
273 0.19
274 0.17
275 0.17
276 0.16
277 0.15
278 0.14
279 0.17
280 0.24
281 0.25
282 0.25
283 0.24
284 0.26
285 0.3
286 0.3
287 0.32
288 0.31
289 0.34
290 0.36
291 0.37
292 0.35
293 0.36
294 0.36
295 0.34
296 0.29
297 0.26
298 0.28
299 0.29
300 0.29
301 0.24
302 0.23
303 0.21
304 0.23
305 0.25
306 0.2
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.16
316 0.2
317 0.24
318 0.26
319 0.3
320 0.36
321 0.38
322 0.42
323 0.42
324 0.41
325 0.42
326 0.42
327 0.43
328 0.39
329 0.37
330 0.33
331 0.33
332 0.31
333 0.3
334 0.26
335 0.21
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.09
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.21
384 0.21
385 0.24
386 0.3
387 0.31
388 0.33
389 0.36
390 0.44
391 0.43
392 0.46
393 0.46
394 0.42
395 0.4
396 0.39
397 0.37
398 0.3
399 0.26
400 0.22
401 0.21
402 0.19
403 0.16
404 0.14
405 0.12
406 0.13
407 0.15
408 0.15
409 0.13
410 0.19
411 0.27
412 0.29
413 0.34
414 0.33
415 0.33
416 0.35
417 0.38
418 0.37
419 0.32
420 0.37
421 0.34
422 0.34
423 0.32
424 0.3
425 0.27
426 0.24
427 0.21
428 0.13