FuNGI

A0A5C3Q0F0

Protein Details

Accession

A0A5C3Q0F0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
990-1012	SNPAAQKHFKRLKSMKHTHFEGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 4.5, extr 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025574 Nucleoporin_FG_rpt IPR037665 Nucleoporin_S59-like IPR007230 Nup98_auto-Pept-S59_dom IPR036903 Nup98_auto-Pept-S59_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04096 Nucleoporin2 PF13634 Nucleoporin_FG
PROSITE	View protein in PROSITE PS51434 NUP_C

Amino Acid Sequences

MFGSGNVSSTWGSTQQTQQQQPSAFGQPSGFGSGAFGSTPSAFGQPPQQQQQPPANPMFGNLGGTGTTTGTGTTGTGFGGAFGANASGGGAFGAPKPATGFGAFGGGGTSTFGTTPGSSAFGGGGTGAFGTAANAGAGAGTGTGLFGAQPSTSTNAFGGGGMFGQPKPATGAFGATTTTTDGGAPVTTGSSTPFNAFTEKDSVNPSITLQYQSISAMPQYRSVSFEEIRYQDYQQGRKTAGAFGQTSFGAPAQPTTGLFGQPATQPAAQPAATGTTFGGFGNTSTAQTGTTGFGAFGGGTTGTAGTGGGLFGGGGAFGQTPQQQQPQQTTGFGTFGATQNPQQPSGGLFGGGGAFGANNQPKPAFGAGTGTTFGSTGTGAFGQPQNQQTNPTGGLFGGQPQQPAGGAFGGGFGANNQNKTGSIFGAGATPQPANTGFGTAFGQNNQQQPQQTAQPSGGLFGGGGLFGQNNQQQQQQQQQPQPGGLFGTQQPQQQTGGLFGGGAGGGLFGNTQQQPQQQQQGAQPQQQSTFGGGGLFGAPKPAGTTTTGTTGLFGGGFGTNTTLGQQPQQNQPSAGGLFGSTLGQQPQGQQTNNAFGGGMFGKPAAPTLGTSTSTGQQQGGLGAGNSIFGNSTLGTSTATLGGFGGSTLGQSQAPLTASIAQPISANLPIFSMLPPGPRAVTLDQQPKKKPGYFVDVPTRTPVPQLQLRYAPATTKLRGFGSTSTPPGAGSSQLGSSLLYNSGKPNALSLSKASSSKSLLGPDAFLTNGGPSPTLGSGARQSVKKLTLDKKIDAADLFSKSTVSGPSFNPKLSIAAREAEAASAAASNSLARVESPTPAARAKTPANRFVGQTSSETLETAPRSGPSASPAKGPRDPSELQEGDYWVKPDLDTLKKMGHDDLMSFSGLVVGRVGYGQITFLEPVDLTGLPRLSSLLGEVVRFDDKECSVYPDADEAEKPPPGSGLNVKARIELVRCWALDKATREPIKDESNPAAQKHFKRLKSMKHTHFEGFDIEEGKWTFTVDHF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.33
3	0.42
4	0.48
5	0.51
6	0.54
7	0.54
8	0.54
9	0.51
10	0.49
11	0.41
12	0.36
13	0.31
14	0.26
15	0.27
16	0.26
17	0.22
18	0.15
19	0.15
20	0.15
21	0.15
22	0.13
23	0.11
24	0.1
25	0.1
26	0.11
27	0.11
28	0.13
29	0.13
30	0.14
31	0.23
32	0.29
33	0.37
34	0.43
35	0.49
36	0.5
37	0.57
38	0.66
39	0.64
40	0.62
41	0.58
42	0.53
43	0.46
44	0.44
45	0.42
46	0.32
47	0.27
48	0.2
49	0.17
50	0.14
51	0.15
52	0.14
53	0.1
54	0.09
55	0.08
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.04
75	0.04
76	0.04
77	0.04
78	0.05
79	0.06
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.13
84	0.14
85	0.16
86	0.16
87	0.16
88	0.11
89	0.14
90	0.13
91	0.11
92	0.11
93	0.09
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.11
108	0.09
109	0.09
110	0.08
111	0.07
112	0.05
113	0.05
114	0.04
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.03
127	0.03
128	0.03
129	0.03
130	0.03
131	0.03
132	0.03
133	0.03
134	0.04
135	0.04
136	0.05
137	0.07
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.11
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.1
150	0.09
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.16
155	0.16
156	0.16
157	0.15
158	0.17
159	0.14
160	0.15
161	0.15
162	0.11
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.08
177	0.1
178	0.11
179	0.12
180	0.13
181	0.14
182	0.16
183	0.17
184	0.17
185	0.21
186	0.21
187	0.21
188	0.24
189	0.24
190	0.23
191	0.23
192	0.21
193	0.19
194	0.2
195	0.2
196	0.17
197	0.15
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.12
202	0.12
203	0.15
204	0.16
205	0.2
206	0.22
207	0.22
208	0.24
209	0.26
210	0.29
211	0.25
212	0.26
213	0.27
214	0.26
215	0.28
216	0.28
217	0.27
218	0.28
219	0.33
220	0.37
221	0.35
222	0.37
223	0.36
224	0.36
225	0.37
226	0.33
227	0.3
228	0.28
229	0.25
230	0.21
231	0.22
232	0.19
233	0.18
234	0.16
235	0.13
236	0.1
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.12
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.12
248	0.13
249	0.15
250	0.15
251	0.14
252	0.14
253	0.15
254	0.18
255	0.16
256	0.15
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.12
261	0.11
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.06
267	0.06
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.02
300	0.02
301	0.02
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.05
306	0.07
307	0.09
308	0.12
309	0.18
310	0.21
311	0.24
312	0.28
313	0.31
314	0.3
315	0.29
316	0.28
317	0.23
318	0.21
319	0.18
320	0.14
321	0.12
322	0.12
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.19
327	0.21
328	0.21
329	0.19
330	0.18
331	0.17
332	0.19
333	0.17
334	0.11
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.08
344	0.09
345	0.09
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.14
350	0.14
351	0.11
352	0.09
353	0.12
354	0.12
355	0.13
356	0.14
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.07
368	0.08
369	0.1
370	0.14
371	0.19
372	0.21
373	0.21
374	0.24
375	0.23
376	0.25
377	0.23
378	0.2
379	0.16
380	0.13
381	0.13
382	0.1
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.12
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.1
401	0.11
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.15
408	0.08
409	0.09
410	0.08
411	0.08
412	0.09
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.08
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.09
429	0.13
430	0.15
431	0.18
432	0.19
433	0.2
434	0.2
435	0.22
436	0.23
437	0.24
438	0.22
439	0.2
440	0.19
441	0.19
442	0.18
443	0.17
444	0.14
445	0.09
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.04
450	0.04
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.06
455	0.08
456	0.09
457	0.1
458	0.13
459	0.15
460	0.18
461	0.27
462	0.31
463	0.35
464	0.38
465	0.4
466	0.38
467	0.38
468	0.34
469	0.26
470	0.2
471	0.14
472	0.12
473	0.09
474	0.13
475	0.14
476	0.15
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.16
481	0.15
482	0.12
483	0.1
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.04
489	0.04
490	0.02
491	0.02
492	0.02
493	0.02
494	0.02
495	0.02
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.08
500	0.1
501	0.14
502	0.16
503	0.22
504	0.21
505	0.23
506	0.26
507	0.34
508	0.34
509	0.35
510	0.34
511	0.29
512	0.29
513	0.27
514	0.25
515	0.16
516	0.14
517	0.1
518	0.08
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.06
530	0.07
531	0.09
532	0.1
533	0.12
534	0.13
535	0.12
536	0.13
537	0.11
538	0.1
539	0.08
540	0.07
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.1
552	0.13
553	0.16
554	0.23
555	0.26
556	0.26
557	0.25
558	0.25
559	0.24
560	0.21
561	0.17
562	0.1
563	0.07
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.07
571	0.07
572	0.09
573	0.15
574	0.18
575	0.18
576	0.2
577	0.21
578	0.24
579	0.24
580	0.22
581	0.16
582	0.12
583	0.14
584	0.11
585	0.1
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.07
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.08
595	0.11
596	0.11
597	0.13
598	0.14
599	0.15
600	0.16
601	0.16
602	0.13
603	0.11
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.07
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.07
625	0.07
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.03
633	0.04
634	0.04
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.1
644	0.1
645	0.12
646	0.12
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.09
660	0.1
661	0.11
662	0.12
663	0.11
664	0.11
665	0.14
666	0.14
667	0.17
668	0.22
669	0.32
670	0.36
671	0.43
672	0.46
673	0.49
674	0.52
675	0.51
676	0.5
677	0.44
678	0.48
679	0.45
680	0.48
681	0.52
682	0.49
683	0.46
684	0.44
685	0.41
686	0.33
687	0.31
688	0.26
689	0.21
690	0.24
691	0.26
692	0.27
693	0.29
694	0.3
695	0.31
696	0.29
697	0.25
698	0.26
699	0.28
700	0.25
701	0.25
702	0.25
703	0.24
704	0.25
705	0.25
706	0.21
707	0.23
708	0.25
709	0.25
710	0.23
711	0.22
712	0.21
713	0.2
714	0.19
715	0.13
716	0.11
717	0.1
718	0.09
719	0.09
720	0.09
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.1
725	0.1
726	0.11
727	0.12
728	0.14
729	0.15
730	0.15
731	0.15
732	0.15
733	0.16
734	0.16
735	0.16
736	0.18
737	0.19
738	0.21
739	0.2
740	0.2
741	0.21
742	0.23
743	0.24
744	0.21
745	0.21
746	0.2
747	0.2
748	0.18
749	0.17
750	0.13
751	0.11
752	0.1
753	0.08
754	0.09
755	0.08
756	0.08
757	0.07
758	0.09
759	0.09
760	0.11
761	0.1
762	0.11
763	0.13
764	0.18
765	0.22
766	0.21
767	0.23
768	0.26
769	0.29
770	0.31
771	0.37
772	0.39
773	0.45
774	0.49
775	0.48
776	0.48
777	0.46
778	0.44
779	0.36
780	0.32
781	0.26
782	0.24
783	0.23
784	0.18
785	0.17
786	0.15
787	0.17
788	0.16
789	0.14
790	0.16
791	0.17
792	0.25
793	0.27
794	0.27
795	0.27
796	0.25
797	0.27
798	0.25
799	0.26
800	0.2
801	0.2
802	0.21
803	0.21
804	0.2
805	0.16
806	0.14
807	0.11
808	0.09
809	0.07
810	0.07
811	0.05
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.06
816	0.06
817	0.05
818	0.09
819	0.1
820	0.12
821	0.16
822	0.17
823	0.2
824	0.22
825	0.24
826	0.22
827	0.27
828	0.33
829	0.38
830	0.42
831	0.47
832	0.5
833	0.5
834	0.5
835	0.47
836	0.43
837	0.35
838	0.31
839	0.27
840	0.24
841	0.22
842	0.21
843	0.18
844	0.2
845	0.19
846	0.18
847	0.17
848	0.14
849	0.17
850	0.17
851	0.18
852	0.18
853	0.24
854	0.23
855	0.29
856	0.34
857	0.38
858	0.42
859	0.46
860	0.45
861	0.45
862	0.46
863	0.42
864	0.46
865	0.4
866	0.37
867	0.35
868	0.33
869	0.29
870	0.3
871	0.28
872	0.19
873	0.19
874	0.17
875	0.19
876	0.24
877	0.27
878	0.27
879	0.29
880	0.32
881	0.33
882	0.35
883	0.33
884	0.29
885	0.25
886	0.24
887	0.24
888	0.22
889	0.2
890	0.18
891	0.16
892	0.16
893	0.14
894	0.13
895	0.1
896	0.08
897	0.08
898	0.08
899	0.09
900	0.06
901	0.06
902	0.06
903	0.06
904	0.08
905	0.08
906	0.09
907	0.1
908	0.09
909	0.1
910	0.11
911	0.11
912	0.1
913	0.13
914	0.14
915	0.13
916	0.13
917	0.13
918	0.11
919	0.11
920	0.12
921	0.13
922	0.13
923	0.13
924	0.14
925	0.16
926	0.17
927	0.17
928	0.17
929	0.17
930	0.17
931	0.2
932	0.2
933	0.25
934	0.25
935	0.25
936	0.25
937	0.24
938	0.25
939	0.24
940	0.24
941	0.2
942	0.22
943	0.23
944	0.23
945	0.19
946	0.19
947	0.18
948	0.21
949	0.25
950	0.3
951	0.37
952	0.42
953	0.42
954	0.42
955	0.43
956	0.42
957	0.39
958	0.33
959	0.31
960	0.3
961	0.3
962	0.31
963	0.31
964	0.31
965	0.35
966	0.36
967	0.37
968	0.41
969	0.45
970	0.45
971	0.46
972	0.49
973	0.5
974	0.49
975	0.48
976	0.43
977	0.49
978	0.52
979	0.5
980	0.52
981	0.52
982	0.53
983	0.59
984	0.63
985	0.57
986	0.64
987	0.7
988	0.73
989	0.76
990	0.82
991	0.81
992	0.8
993	0.81
994	0.75
995	0.69
996	0.6
997	0.51
998	0.43
999	0.37
1000	0.3
1001	0.25
1002	0.26
1003	0.24
1004	0.24
1005	0.21
1006	0.19

A0A5C3Q0F0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer