Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PHB0

Protein Details
Accession A0A5C3PHB0    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-203ATAKGAQKRKTPLRERSPNQDRSHHydrophilic
831-853ESEAAGPSKRRRKTKDTRSDAETHydrophilic
858-885ADEPTPKAVKVRPRPRPRRRSASAASSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-190KRKT
227-243TPKPARPAPRPVKKAAR
761-773AKPKPRPRAKGKA
839-844KRRRKT
864-878KAVKVRPRPRPRRRS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MEGYHQRLKSRGATLDTDASPATRLSQRPGSSQNAGAAFQDFGSDFASRNRASQARPPSKSRMQSGKGVTISFHDDFSDDEIDFLSGSSRHGSESPEKPRRATKRAAATSSSLPVVIDHHQADPNYKAIDFRKLKIQKKSSVVSSTVRTPENSQESSARDSGAGPSSSRLQASARAVDHATAKGAQKRKTPLRERSPNQDRSHTHRPSSPVSDKDRRDRPVKDMDETPKPARPAPRPVKKAARSSVGKSQTVPDLGAQSSQEKNQPLSRSQTAQEIIRISSDESDNEKTNSLRTAKGKGKAMTSDPFGTLSPLSTHVKKQDGEGQAKGKWKMALVDPIGTLSPLSSPARKKRKDPLTSFPMPSPLSSPGSRHSSSPPHAKEKQSSSQRKGMIVSSSDDDDAPRRALRPFPMETQVLASLCRSSPTGKRATLNSDGEDLSGTYRKKQRRASERLSFGSDSDSDDDMFLDPSVDPKTLCPWCDEPLPDEPTPHLRALISAAKRVSHPEDRLTNPLGLRAPPAAFVSVCQRHRFERDWIPRARQKGWPTTIAWDKLAERITRLKATLQAIVNDVDEDFVPGVARGSASRRRRKENEFWQEVVKNVRQQGSRQAAGVRGQFLHFNKTQPGYYGELGYVIIHQTLCDLFPPAEFHPDATLPLTPADFITLVLVPEAAVHLIMEDLSLPRGEAIETLRESVEYGVAMFPADDEGELAGGAFGSKSGKLGATEKMFMDRARVRRKELEEEERMEEEEEARLAKAQEVAKPKPRPRAKGKASGIASDVESVGPTSSPPSGGSVKRKTRAAPVSRGRSAGHGLGPGPGSIVIELSSDTGESEAAGPSKRRRKTKDTRSDAETEVAPADEPTPKAVKVRPRPRPRRRSASAASSTQGGDDARSDTLDTDGDVPPSLSPAQSTRIPALNRRGDTTAVGTDSRAPDATHGTTRGKHKVRNPGTLPTSPSPPVAGTSKGKTPMEIAREKRQHGAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.44
4 0.39
5 0.33
6 0.27
7 0.24
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.22
12 0.27
13 0.35
14 0.37
15 0.42
16 0.48
17 0.5
18 0.48
19 0.48
20 0.47
21 0.41
22 0.39
23 0.34
24 0.29
25 0.23
26 0.18
27 0.17
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.15
34 0.22
35 0.21
36 0.23
37 0.29
38 0.31
39 0.34
40 0.42
41 0.49
42 0.53
43 0.59
44 0.63
45 0.65
46 0.7
47 0.73
48 0.73
49 0.72
50 0.66
51 0.68
52 0.68
53 0.67
54 0.6
55 0.53
56 0.45
57 0.38
58 0.4
59 0.33
60 0.27
61 0.2
62 0.18
63 0.18
64 0.22
65 0.21
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.07
74 0.09
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.15
79 0.2
80 0.26
81 0.35
82 0.45
83 0.52
84 0.54
85 0.56
86 0.65
87 0.69
88 0.68
89 0.67
90 0.65
91 0.67
92 0.72
93 0.72
94 0.65
95 0.6
96 0.56
97 0.5
98 0.42
99 0.31
100 0.23
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.19
105 0.18
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.27
110 0.26
111 0.27
112 0.23
113 0.22
114 0.24
115 0.24
116 0.34
117 0.34
118 0.34
119 0.42
120 0.49
121 0.57
122 0.63
123 0.68
124 0.66
125 0.69
126 0.72
127 0.68
128 0.63
129 0.59
130 0.53
131 0.49
132 0.47
133 0.44
134 0.41
135 0.36
136 0.34
137 0.39
138 0.41
139 0.39
140 0.35
141 0.35
142 0.36
143 0.39
144 0.36
145 0.29
146 0.22
147 0.21
148 0.22
149 0.23
150 0.21
151 0.16
152 0.18
153 0.21
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.17
158 0.22
159 0.25
160 0.29
161 0.25
162 0.26
163 0.26
164 0.27
165 0.28
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.21
170 0.26
171 0.33
172 0.36
173 0.41
174 0.5
175 0.58
176 0.65
177 0.7
178 0.74
179 0.78
180 0.84
181 0.82
182 0.84
183 0.84
184 0.83
185 0.77
186 0.76
187 0.69
188 0.67
189 0.73
190 0.67
191 0.61
192 0.56
193 0.57
194 0.54
195 0.58
196 0.56
197 0.53
198 0.56
199 0.62
200 0.63
201 0.67
202 0.69
203 0.66
204 0.67
205 0.63
206 0.61
207 0.63
208 0.6
209 0.55
210 0.55
211 0.55
212 0.55
213 0.57
214 0.54
215 0.48
216 0.46
217 0.46
218 0.47
219 0.47
220 0.5
221 0.55
222 0.62
223 0.63
224 0.69
225 0.75
226 0.74
227 0.76
228 0.7
229 0.69
230 0.63
231 0.62
232 0.64
233 0.59
234 0.53
235 0.46
236 0.43
237 0.38
238 0.34
239 0.3
240 0.22
241 0.18
242 0.17
243 0.18
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.18
248 0.21
249 0.21
250 0.23
251 0.27
252 0.3
253 0.3
254 0.35
255 0.37
256 0.35
257 0.35
258 0.37
259 0.34
260 0.32
261 0.32
262 0.26
263 0.23
264 0.2
265 0.2
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.16
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.21
275 0.19
276 0.2
277 0.23
278 0.21
279 0.23
280 0.25
281 0.32
282 0.36
283 0.42
284 0.47
285 0.44
286 0.45
287 0.43
288 0.44
289 0.39
290 0.36
291 0.32
292 0.26
293 0.25
294 0.22
295 0.2
296 0.16
297 0.14
298 0.11
299 0.13
300 0.16
301 0.17
302 0.2
303 0.23
304 0.27
305 0.27
306 0.28
307 0.32
308 0.36
309 0.37
310 0.38
311 0.38
312 0.37
313 0.42
314 0.4
315 0.35
316 0.29
317 0.26
318 0.25
319 0.24
320 0.27
321 0.23
322 0.23
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.16
327 0.14
328 0.07
329 0.06
330 0.08
331 0.1
332 0.14
333 0.21
334 0.31
335 0.41
336 0.45
337 0.5
338 0.57
339 0.66
340 0.71
341 0.71
342 0.7
343 0.68
344 0.7
345 0.66
346 0.57
347 0.51
348 0.42
349 0.36
350 0.29
351 0.24
352 0.22
353 0.21
354 0.22
355 0.22
356 0.27
357 0.28
358 0.27
359 0.28
360 0.31
361 0.35
362 0.43
363 0.43
364 0.45
365 0.49
366 0.51
367 0.53
368 0.53
369 0.57
370 0.58
371 0.62
372 0.59
373 0.61
374 0.59
375 0.55
376 0.5
377 0.43
378 0.34
379 0.27
380 0.24
381 0.18
382 0.17
383 0.16
384 0.14
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.16
393 0.19
394 0.22
395 0.24
396 0.25
397 0.28
398 0.27
399 0.26
400 0.25
401 0.23
402 0.18
403 0.15
404 0.12
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.09
409 0.1
410 0.14
411 0.19
412 0.24
413 0.25
414 0.28
415 0.29
416 0.33
417 0.37
418 0.34
419 0.3
420 0.26
421 0.24
422 0.22
423 0.2
424 0.15
425 0.1
426 0.12
427 0.12
428 0.15
429 0.22
430 0.28
431 0.35
432 0.42
433 0.5
434 0.57
435 0.66
436 0.69
437 0.7
438 0.7
439 0.65
440 0.61
441 0.52
442 0.41
443 0.34
444 0.26
445 0.19
446 0.16
447 0.14
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.07
454 0.06
455 0.05
456 0.06
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.08
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.17
465 0.18
466 0.2
467 0.22
468 0.22
469 0.19
470 0.22
471 0.27
472 0.23
473 0.22
474 0.21
475 0.23
476 0.25
477 0.22
478 0.18
479 0.13
480 0.13
481 0.15
482 0.2
483 0.16
484 0.17
485 0.17
486 0.17
487 0.18
488 0.2
489 0.22
490 0.21
491 0.22
492 0.24
493 0.28
494 0.29
495 0.32
496 0.31
497 0.28
498 0.23
499 0.24
500 0.2
501 0.16
502 0.15
503 0.13
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.15
511 0.2
512 0.22
513 0.24
514 0.25
515 0.27
516 0.31
517 0.34
518 0.33
519 0.37
520 0.43
521 0.49
522 0.5
523 0.55
524 0.54
525 0.55
526 0.52
527 0.48
528 0.45
529 0.45
530 0.45
531 0.42
532 0.39
533 0.4
534 0.41
535 0.36
536 0.31
537 0.24
538 0.22
539 0.22
540 0.24
541 0.2
542 0.17
543 0.21
544 0.23
545 0.23
546 0.23
547 0.21
548 0.22
549 0.24
550 0.26
551 0.22
552 0.21
553 0.2
554 0.2
555 0.19
556 0.14
557 0.12
558 0.08
559 0.07
560 0.06
561 0.05
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.05
569 0.1
570 0.18
571 0.27
572 0.37
573 0.42
574 0.51
575 0.57
576 0.64
577 0.7
578 0.72
579 0.74
580 0.7
581 0.66
582 0.62
583 0.56
584 0.5
585 0.44
586 0.36
587 0.29
588 0.27
589 0.3
590 0.27
591 0.27
592 0.35
593 0.36
594 0.34
595 0.32
596 0.3
597 0.27
598 0.29
599 0.29
600 0.21
601 0.16
602 0.16
603 0.19
604 0.19
605 0.22
606 0.21
607 0.21
608 0.23
609 0.24
610 0.24
611 0.21
612 0.23
613 0.21
614 0.2
615 0.19
616 0.16
617 0.14
618 0.14
619 0.12
620 0.1
621 0.06
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.07
630 0.06
631 0.07
632 0.11
633 0.11
634 0.15
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.15
640 0.13
641 0.13
642 0.1
643 0.1
644 0.1
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.07
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.04
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.04
667 0.04
668 0.05
669 0.04
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.11
676 0.12
677 0.13
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.11
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.03
699 0.03
700 0.03
701 0.03
702 0.03
703 0.04
704 0.04
705 0.05
706 0.06
707 0.07
708 0.09
709 0.12
710 0.17
711 0.18
712 0.2
713 0.2
714 0.22
715 0.23
716 0.21
717 0.26
718 0.27
719 0.33
720 0.42
721 0.45
722 0.47
723 0.54
724 0.59
725 0.61
726 0.63
727 0.63
728 0.58
729 0.59
730 0.56
731 0.49
732 0.45
733 0.36
734 0.29
735 0.21
736 0.16
737 0.12
738 0.1
739 0.09
740 0.1
741 0.1
742 0.11
743 0.15
744 0.16
745 0.21
746 0.28
747 0.34
748 0.42
749 0.51
750 0.55
751 0.61
752 0.67
753 0.7
754 0.73
755 0.78
756 0.76
757 0.78
758 0.76
759 0.75
760 0.68
761 0.61
762 0.53
763 0.43
764 0.36
765 0.26
766 0.21
767 0.12
768 0.11
769 0.09
770 0.08
771 0.06
772 0.06
773 0.08
774 0.08
775 0.09
776 0.09
777 0.13
778 0.18
779 0.24
780 0.33
781 0.41
782 0.49
783 0.54
784 0.57
785 0.55
786 0.59
787 0.64
788 0.62
789 0.62
790 0.64
791 0.67
792 0.66
793 0.65
794 0.56
795 0.49
796 0.45
797 0.38
798 0.3
799 0.23
800 0.21
801 0.21
802 0.21
803 0.17
804 0.14
805 0.12
806 0.1
807 0.09
808 0.08
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.07
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.07
821 0.09
822 0.12
823 0.16
824 0.25
825 0.35
826 0.42
827 0.51
828 0.58
829 0.67
830 0.76
831 0.83
832 0.85
833 0.85
834 0.83
835 0.79
836 0.76
837 0.67
838 0.59
839 0.48
840 0.38
841 0.29
842 0.23
843 0.17
844 0.13
845 0.13
846 0.13
847 0.13
848 0.16
849 0.18
850 0.19
851 0.23
852 0.28
853 0.36
854 0.44
855 0.54
856 0.62
857 0.7
858 0.81
859 0.88
860 0.94
861 0.93
862 0.93
863 0.89
864 0.87
865 0.83
866 0.82
867 0.78
868 0.7
869 0.61
870 0.52
871 0.46
872 0.36
873 0.3
874 0.2
875 0.14
876 0.13
877 0.14
878 0.12
879 0.13
880 0.13
881 0.12
882 0.13
883 0.12
884 0.11
885 0.13
886 0.14
887 0.14
888 0.14
889 0.14
890 0.12
891 0.15
892 0.15
893 0.11
894 0.12
895 0.14
896 0.18
897 0.22
898 0.25
899 0.26
900 0.32
901 0.35
902 0.4
903 0.48
904 0.52
905 0.5
906 0.51
907 0.49
908 0.44
909 0.44
910 0.4
911 0.33
912 0.27
913 0.25
914 0.22
915 0.25
916 0.25
917 0.25
918 0.22
919 0.19
920 0.19
921 0.24
922 0.27
923 0.26
924 0.29
925 0.31
926 0.36
927 0.44
928 0.52
929 0.53
930 0.57
931 0.6
932 0.67
933 0.71
934 0.75
935 0.72
936 0.72
937 0.71
938 0.68
939 0.67
940 0.6
941 0.58
942 0.49
943 0.45
944 0.37
945 0.32
946 0.31
947 0.27
948 0.29
949 0.3
950 0.32
951 0.37
952 0.43
953 0.42
954 0.39
955 0.41
956 0.42
957 0.45
958 0.5
959 0.5
960 0.54
961 0.61
962 0.63
963 0.64