Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3PQ22

Protein Details
Accession A0A5C3PQ22    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28AEPPVLFKRTKPKHTQRSRISTPDPDAHydrophilic
40-60AVAAKLRKKTRAKAKSTLSFGHydrophilic
232-254ERIALGKKSRKKEAQKRRAEMNEBasic
687-709IPARRRFLTRRYKLLRNLVQWRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-53LRKKTRAKA
237-249GKKSRKKEAQKRR
452-460AREARRLRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MAEPPVLFKRTKPKHTQRSRISTPDPDAAPTTGEDDSPSAVAAKLRKKTRAKAKSTLSFGGDEEEGEGEVFKLKKSSLSKKLQLGKSSIGIPPSAFEPTIARQSTGPTYDAAYLSQLKASTPTARPPVLTGESYDVDVSMDVDSPGQLSTLSSIADDAGAETAIPSASSILAAKEKRDRLRKSKVGEDFISLSLTKRDDFSQGPHPESRLMREEDELGDADDEYAEFTSAQERIALGKKSRKKEAQKRRAEMNEMIIDAEEEDEETQEWEQEQLRRGGLRPESAEPAPKPVYKPAPIPPVTPIPTMGAAIARLTQSMSELTTSHAQHSAAMSKLGEEQRLLDAREKEMREMIAKAEDKRSWFNAFREWVESVATFLDEKFPPLEKLEDEHISLVKERADMVAARRRAEDEDDLILFLGTPPSLQPQPEEVDELGRTIPSANSPHARANRNAAREARRLRRRATNQQARQEEEGFSTDSELPPGDEDDYRTAMGQLLADAKGIMADVKADEFRDPNAGLGKWFGEWRSKFGDIYTGAWGGLGMIGAWEFWVRLEILGWDPLERPRSLDSFSWYKSLYNYSRPSEADDEDEPELGPDGDLVSAMITTALIPRFCRILEGGGLDAYSATDIRRLVDLMEEIEISVDKQNPKFELLLKSVHTVFSTAVEATEATLAPFLELNQPRFDPAAIPARRRFLTRRYKLLRNLVQWRKHAGDRYGLGTLAIRLVTSSMLPVAESGWEVGGEDIMRKVVQALPSELIPPSLQHLRAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.86
3 0.92
4 0.92
5 0.92
6 0.9
7 0.88
8 0.83
9 0.8
10 0.74
11 0.71
12 0.61
13 0.53
14 0.48
15 0.39
16 0.34
17 0.27
18 0.24
19 0.18
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.1
27 0.11
28 0.14
29 0.2
30 0.27
31 0.34
32 0.41
33 0.51
34 0.58
35 0.67
36 0.75
37 0.79
38 0.79
39 0.8
40 0.83
41 0.82
42 0.8
43 0.74
44 0.66
45 0.57
46 0.49
47 0.42
48 0.32
49 0.24
50 0.18
51 0.14
52 0.12
53 0.1
54 0.1
55 0.07
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.13
60 0.13
61 0.2
62 0.29
63 0.39
64 0.45
65 0.54
66 0.61
67 0.68
68 0.77
69 0.76
70 0.72
71 0.67
72 0.6
73 0.53
74 0.49
75 0.42
76 0.34
77 0.29
78 0.24
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.14
83 0.13
84 0.15
85 0.18
86 0.26
87 0.26
88 0.25
89 0.23
90 0.27
91 0.31
92 0.29
93 0.27
94 0.19
95 0.2
96 0.22
97 0.22
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.16
104 0.14
105 0.16
106 0.19
107 0.22
108 0.22
109 0.29
110 0.33
111 0.34
112 0.34
113 0.33
114 0.36
115 0.33
116 0.31
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.25
121 0.23
122 0.16
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.13
159 0.14
160 0.18
161 0.25
162 0.33
163 0.41
164 0.5
165 0.57
166 0.6
167 0.7
168 0.74
169 0.72
170 0.74
171 0.72
172 0.69
173 0.61
174 0.55
175 0.47
176 0.4
177 0.36
178 0.27
179 0.21
180 0.18
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.17
186 0.18
187 0.21
188 0.29
189 0.31
190 0.35
191 0.34
192 0.34
193 0.36
194 0.36
195 0.36
196 0.32
197 0.31
198 0.28
199 0.28
200 0.28
201 0.24
202 0.24
203 0.19
204 0.14
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.11
221 0.16
222 0.19
223 0.22
224 0.31
225 0.38
226 0.44
227 0.52
228 0.58
229 0.64
230 0.72
231 0.78
232 0.8
233 0.83
234 0.82
235 0.82
236 0.78
237 0.72
238 0.63
239 0.58
240 0.49
241 0.39
242 0.34
243 0.25
244 0.2
245 0.14
246 0.12
247 0.06
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.1
258 0.13
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.2
264 0.24
265 0.23
266 0.23
267 0.23
268 0.23
269 0.26
270 0.26
271 0.3
272 0.24
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.26
277 0.28
278 0.33
279 0.31
280 0.34
281 0.35
282 0.41
283 0.4
284 0.4
285 0.37
286 0.38
287 0.37
288 0.34
289 0.28
290 0.21
291 0.2
292 0.19
293 0.16
294 0.1
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.08
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.11
317 0.12
318 0.1
319 0.09
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.16
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.19
331 0.25
332 0.24
333 0.22
334 0.22
335 0.21
336 0.18
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.17
341 0.18
342 0.21
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.26
347 0.25
348 0.27
349 0.26
350 0.27
351 0.28
352 0.27
353 0.27
354 0.25
355 0.2
356 0.18
357 0.16
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.06
362 0.05
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.13
371 0.1
372 0.12
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.13
377 0.13
378 0.12
379 0.13
380 0.11
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.12
388 0.18
389 0.18
390 0.19
391 0.19
392 0.2
393 0.2
394 0.22
395 0.19
396 0.14
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.12
401 0.11
402 0.08
403 0.07
404 0.05
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.06
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.13
414 0.14
415 0.15
416 0.13
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.1
427 0.12
428 0.14
429 0.16
430 0.22
431 0.28
432 0.31
433 0.3
434 0.36
435 0.39
436 0.4
437 0.42
438 0.41
439 0.4
440 0.45
441 0.51
442 0.53
443 0.56
444 0.57
445 0.58
446 0.63
447 0.65
448 0.69
449 0.72
450 0.73
451 0.72
452 0.77
453 0.76
454 0.69
455 0.64
456 0.54
457 0.44
458 0.34
459 0.28
460 0.2
461 0.16
462 0.15
463 0.13
464 0.11
465 0.11
466 0.1
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.1
473 0.11
474 0.13
475 0.13
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.11
480 0.09
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.14
503 0.14
504 0.13
505 0.14
506 0.13
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.17
511 0.18
512 0.21
513 0.26
514 0.26
515 0.26
516 0.25
517 0.29
518 0.22
519 0.24
520 0.22
521 0.17
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.09
526 0.08
527 0.06
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.04
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.07
541 0.08
542 0.1
543 0.11
544 0.1
545 0.12
546 0.15
547 0.18
548 0.17
549 0.18
550 0.19
551 0.21
552 0.23
553 0.23
554 0.25
555 0.28
556 0.29
557 0.3
558 0.27
559 0.26
560 0.25
561 0.31
562 0.3
563 0.32
564 0.36
565 0.36
566 0.4
567 0.39
568 0.42
569 0.38
570 0.35
571 0.31
572 0.27
573 0.27
574 0.24
575 0.24
576 0.19
577 0.15
578 0.15
579 0.1
580 0.09
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.03
591 0.03
592 0.07
593 0.09
594 0.1
595 0.11
596 0.12
597 0.14
598 0.14
599 0.16
600 0.13
601 0.14
602 0.15
603 0.16
604 0.15
605 0.14
606 0.14
607 0.12
608 0.11
609 0.08
610 0.07
611 0.05
612 0.05
613 0.07
614 0.08
615 0.09
616 0.1
617 0.11
618 0.1
619 0.12
620 0.13
621 0.11
622 0.12
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.08
628 0.11
629 0.14
630 0.18
631 0.21
632 0.25
633 0.26
634 0.29
635 0.3
636 0.32
637 0.34
638 0.32
639 0.34
640 0.32
641 0.34
642 0.32
643 0.31
644 0.26
645 0.21
646 0.18
647 0.16
648 0.15
649 0.12
650 0.11
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.11
655 0.09
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.17
663 0.21
664 0.24
665 0.26
666 0.27
667 0.28
668 0.29
669 0.28
670 0.21
671 0.21
672 0.29
673 0.3
674 0.36
675 0.39
676 0.44
677 0.45
678 0.49
679 0.49
680 0.5
681 0.56
682 0.58
683 0.65
684 0.66
685 0.73
686 0.77
687 0.82
688 0.8
689 0.78
690 0.8
691 0.79
692 0.79
693 0.74
694 0.73
695 0.67
696 0.64
697 0.62
698 0.55
699 0.54
700 0.49
701 0.49
702 0.43
703 0.38
704 0.33
705 0.26
706 0.23
707 0.17
708 0.14
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.07
725 0.08
726 0.08
727 0.09
728 0.08
729 0.09
730 0.09
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.12
735 0.14
736 0.18
737 0.21
738 0.23
739 0.24
740 0.25
741 0.27
742 0.25
743 0.23
744 0.19
745 0.16
746 0.18
747 0.23