Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PIX1

Protein Details
Accession A0A5C3PIX1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-27TATSEKPARLAKKKSQDLKADAPHydrophilic
42-67AAPADPSSSKPKKAKKKSEDGAKEVVHydrophilic
142-165KVETGDKKKKRKAKAAPEPQPQPEBasic
219-240DETVKRKLEKAKRKPTEDRGVIBasic
264-283VTRLRLSRNKKTGKPKHYGFHydrophilic
355-376RAEARLLKRQEQRKRKLEEAGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-86PARLAKKKSQDLKADAPAKAKKAKTVEQQPAAAPADPSSSKPKKAKKKSEDGAKEVVEPVKADAKKDRKKKESAVV
89-110QPKPDEKAEVSGEKKRKRKAAE
125-128KKKR
146-157GDKKKKRKAKAA
224-232RKLEKAKRK
362-370KRQEQRKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKATATSEKPARLAKKKSQDLKADAPAKAKKAKTVEQQPAAAPADPSSSKPKKAKKKSEDGAKEVVEPVKADAKKDRKKKESAVVVEQPKPDEKAEVSGEKKRKRKAAEPAEQETSAQPLKETKKKRTSIAEPAPAVEEEKVETGDKKKKRKAKAAPEPQPQPEEEAEEAAEEQSEKEEEDEFYGFESDDDDSSDEDEMVDDIPGIDIGKLPTIARDDETVKRKLEKAKRKPTEDRGVIYLGRIPHGFYEDQMRAYFSQFGTVTRLRLSRNKKTGKPKHYGFVEFDSSSVAKIVAETMDNYLLMGHILTCKVIPKDQVHPELWVGSNKKWRAVPRDRVVRVAHNKPRTVEETARAEARLLKRQEQRKRKLEEAGIKYDFEAVAYKKKPKATEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.63
3 0.69
4 0.77
5 0.82
6 0.83
7 0.82
8 0.8
9 0.79
10 0.79
11 0.75
12 0.67
13 0.66
14 0.62
15 0.59
16 0.6
17 0.53
18 0.51
19 0.52
20 0.57
21 0.6
22 0.65
23 0.69
24 0.66
25 0.67
26 0.61
27 0.59
28 0.53
29 0.44
30 0.34
31 0.25
32 0.24
33 0.22
34 0.24
35 0.29
36 0.32
37 0.39
38 0.48
39 0.57
40 0.63
41 0.73
42 0.82
43 0.81
44 0.87
45 0.88
46 0.9
47 0.89
48 0.83
49 0.78
50 0.68
51 0.6
52 0.52
53 0.44
54 0.34
55 0.26
56 0.23
57 0.25
58 0.24
59 0.25
60 0.31
61 0.4
62 0.49
63 0.58
64 0.66
65 0.66
66 0.73
67 0.79
68 0.79
69 0.78
70 0.75
71 0.74
72 0.72
73 0.7
74 0.67
75 0.6
76 0.53
77 0.46
78 0.41
79 0.33
80 0.28
81 0.22
82 0.22
83 0.25
84 0.29
85 0.31
86 0.37
87 0.46
88 0.51
89 0.58
90 0.59
91 0.63
92 0.63
93 0.67
94 0.7
95 0.72
96 0.74
97 0.74
98 0.72
99 0.69
100 0.62
101 0.54
102 0.43
103 0.36
104 0.27
105 0.2
106 0.15
107 0.18
108 0.25
109 0.33
110 0.39
111 0.46
112 0.55
113 0.59
114 0.64
115 0.66
116 0.66
117 0.68
118 0.7
119 0.66
120 0.57
121 0.53
122 0.49
123 0.4
124 0.34
125 0.23
126 0.15
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.09
131 0.11
132 0.16
133 0.25
134 0.32
135 0.41
136 0.48
137 0.55
138 0.64
139 0.72
140 0.76
141 0.79
142 0.83
143 0.84
144 0.86
145 0.86
146 0.82
147 0.74
148 0.65
149 0.54
150 0.46
151 0.36
152 0.29
153 0.21
154 0.16
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.08
159 0.08
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.14
206 0.2
207 0.25
208 0.27
209 0.26
210 0.28
211 0.31
212 0.39
213 0.45
214 0.5
215 0.56
216 0.64
217 0.71
218 0.76
219 0.81
220 0.81
221 0.81
222 0.74
223 0.65
224 0.56
225 0.5
226 0.42
227 0.34
228 0.28
229 0.18
230 0.16
231 0.14
232 0.12
233 0.1
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.16
243 0.18
244 0.2
245 0.13
246 0.17
247 0.15
248 0.16
249 0.2
250 0.21
251 0.2
252 0.2
253 0.23
254 0.22
255 0.3
256 0.38
257 0.42
258 0.51
259 0.58
260 0.64
261 0.73
262 0.8
263 0.8
264 0.81
265 0.74
266 0.72
267 0.7
268 0.65
269 0.57
270 0.52
271 0.48
272 0.39
273 0.35
274 0.3
275 0.24
276 0.21
277 0.17
278 0.12
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.11
299 0.13
300 0.16
301 0.21
302 0.24
303 0.32
304 0.4
305 0.45
306 0.42
307 0.42
308 0.41
309 0.38
310 0.36
311 0.34
312 0.3
313 0.3
314 0.37
315 0.37
316 0.4
317 0.43
318 0.48
319 0.52
320 0.59
321 0.64
322 0.65
323 0.74
324 0.71
325 0.72
326 0.69
327 0.69
328 0.67
329 0.67
330 0.66
331 0.63
332 0.65
333 0.61
334 0.64
335 0.58
336 0.57
337 0.51
338 0.49
339 0.48
340 0.47
341 0.46
342 0.4
343 0.37
344 0.37
345 0.37
346 0.39
347 0.38
348 0.43
349 0.51
350 0.6
351 0.7
352 0.74
353 0.79
354 0.79
355 0.83
356 0.8
357 0.8
358 0.8
359 0.79
360 0.76
361 0.74
362 0.67
363 0.59
364 0.53
365 0.47
366 0.37
367 0.27
368 0.25
369 0.19
370 0.27
371 0.32
372 0.4
373 0.43
374 0.49