Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PTA8

Protein Details
Accession A0A5C3PTA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MEKRKRKNKKKVAPNGSTIRLBasic
400-424SVTMPSPKATQHKKKKSGKAGESASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-12KRKRKNKKKV
410-418QHKKKKSGK
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_mito 11, cyto 8, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MEKRKRKNKKKVAPNGSTIRLAWYDEWEESESSRRLSAPIDPSLPRVERLHIATHEFKSGRPLHQNQDLQNIWNNFRVFIGLISSIQPPAVRKMNAAMNHAMAQQQEQNDEEEEEEMPNAGLPKERTILVGDEQSPRNAPNPLPPTSMTEEDRQMKREYYREVRNEKSDRFLNDAEQCIRIFLSGYFRDRGLMFSEKFCRDAPILLDFFLKFLIRNRIFPEMEKSIKKAIAITELAKKELPHTFVLSKAIPDGFSQGCKLLYGSMERAHVWSTEVAAEDASESSEPEAKRQKLQEETEVLRAAAGTEEIELVTPDIMEGMEQDMKDLTAKGVDGEEANLDEEPAPAWGDPAANDWGAPEPAESWGVGPTESPFSKYLGPTALPLTHTTGVIEQSTRRIKSVTMPSPKATQHKKKKSGKAGESASLHDPEAVERELDATFAKMTLVPWPDWDTYEKADIVKPKLLPDSRGAAVTDDCEGAEVTAGPGPTHNPFKDEITVYVEPSTADKLIVGMGICATWVQLARVDPTVPIELDPRLFNNLWPYGIEKEPGGPGVPVALTNIWYMEGILAVHPSFFKDMIPLPTTADVFGEEPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.86
3 0.8
4 0.72
5 0.61
6 0.54
7 0.44
8 0.39
9 0.31
10 0.28
11 0.26
12 0.24
13 0.27
14 0.25
15 0.24
16 0.23
17 0.28
18 0.25
19 0.23
20 0.24
21 0.22
22 0.21
23 0.22
24 0.28
25 0.27
26 0.31
27 0.34
28 0.34
29 0.36
30 0.42
31 0.42
32 0.38
33 0.34
34 0.32
35 0.33
36 0.35
37 0.38
38 0.34
39 0.38
40 0.41
41 0.4
42 0.44
43 0.4
44 0.37
45 0.39
46 0.42
47 0.42
48 0.46
49 0.5
50 0.5
51 0.59
52 0.64
53 0.57
54 0.61
55 0.56
56 0.49
57 0.5
58 0.47
59 0.4
60 0.4
61 0.38
62 0.29
63 0.28
64 0.27
65 0.2
66 0.16
67 0.16
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.19
77 0.25
78 0.23
79 0.23
80 0.28
81 0.34
82 0.36
83 0.38
84 0.34
85 0.29
86 0.3
87 0.3
88 0.27
89 0.2
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.15
111 0.16
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.2
116 0.19
117 0.22
118 0.21
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.25
123 0.24
124 0.24
125 0.23
126 0.21
127 0.25
128 0.29
129 0.31
130 0.33
131 0.33
132 0.36
133 0.37
134 0.4
135 0.33
136 0.32
137 0.35
138 0.4
139 0.41
140 0.38
141 0.36
142 0.36
143 0.38
144 0.4
145 0.42
146 0.42
147 0.49
148 0.54
149 0.59
150 0.6
151 0.65
152 0.66
153 0.6
154 0.58
155 0.53
156 0.47
157 0.45
158 0.41
159 0.38
160 0.35
161 0.37
162 0.33
163 0.3
164 0.27
165 0.22
166 0.21
167 0.16
168 0.13
169 0.1
170 0.15
171 0.17
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.22
176 0.21
177 0.22
178 0.19
179 0.21
180 0.19
181 0.22
182 0.29
183 0.28
184 0.3
185 0.29
186 0.27
187 0.22
188 0.23
189 0.21
190 0.2
191 0.2
192 0.18
193 0.19
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.13
198 0.08
199 0.12
200 0.22
201 0.22
202 0.24
203 0.27
204 0.33
205 0.33
206 0.34
207 0.36
208 0.31
209 0.34
210 0.33
211 0.33
212 0.3
213 0.3
214 0.29
215 0.24
216 0.2
217 0.19
218 0.2
219 0.2
220 0.23
221 0.23
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.21
226 0.22
227 0.23
228 0.17
229 0.2
230 0.19
231 0.2
232 0.23
233 0.2
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.09
272 0.09
273 0.13
274 0.2
275 0.21
276 0.25
277 0.28
278 0.32
279 0.34
280 0.36
281 0.36
282 0.33
283 0.34
284 0.32
285 0.3
286 0.25
287 0.19
288 0.17
289 0.13
290 0.08
291 0.06
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.13
360 0.15
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.15
365 0.16
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.14
370 0.15
371 0.17
372 0.16
373 0.16
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.1
380 0.16
381 0.22
382 0.22
383 0.22
384 0.21
385 0.22
386 0.29
387 0.38
388 0.4
389 0.43
390 0.45
391 0.46
392 0.5
393 0.54
394 0.54
395 0.54
396 0.56
397 0.59
398 0.67
399 0.76
400 0.81
401 0.87
402 0.89
403 0.89
404 0.84
405 0.82
406 0.75
407 0.7
408 0.62
409 0.55
410 0.47
411 0.38
412 0.32
413 0.23
414 0.2
415 0.14
416 0.16
417 0.13
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.12
431 0.15
432 0.14
433 0.16
434 0.21
435 0.21
436 0.22
437 0.25
438 0.22
439 0.22
440 0.24
441 0.23
442 0.2
443 0.22
444 0.26
445 0.28
446 0.3
447 0.28
448 0.29
449 0.36
450 0.37
451 0.36
452 0.34
453 0.35
454 0.31
455 0.32
456 0.29
457 0.23
458 0.21
459 0.19
460 0.17
461 0.12
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.08
473 0.1
474 0.15
475 0.22
476 0.21
477 0.22
478 0.24
479 0.27
480 0.32
481 0.31
482 0.28
483 0.29
484 0.3
485 0.28
486 0.27
487 0.24
488 0.19
489 0.19
490 0.19
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.1
508 0.11
509 0.14
510 0.16
511 0.16
512 0.15
513 0.18
514 0.2
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.19
520 0.2
521 0.18
522 0.22
523 0.22
524 0.22
525 0.27
526 0.27
527 0.26
528 0.25
529 0.27
530 0.25
531 0.26
532 0.26
533 0.2
534 0.2
535 0.21
536 0.21
537 0.19
538 0.15
539 0.13
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.08
552 0.08
553 0.07
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.11
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.14
564 0.19
565 0.24
566 0.27
567 0.26
568 0.26
569 0.29
570 0.3
571 0.26
572 0.22
573 0.18