Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3P6H4

Protein Details
Accession A0A5C3P6H4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-161YSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFSVHydrophilic
406-432DPTASSVMVHRHRKKAKQSSEGPSEKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-151KKRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 14, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDVGEGSSQPNHASSSTREETIRIGDTVLLKIPSGDIRTIKLEGNSNINLGKFGSFPSSELAGQSYGLTYEIVDKKLKVLPPRPMQEVEDTEATNELINDGQYVQPLTVEEIETLKKAGLHASEIIKKQIEQHANYSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFSVLEPTMFNVCEYWFNKDQNRLRDIRPDSLAQILNLANVRPGGRYLAVDDASGVLVSGILDRLGGSGRLITICDIDSPPAYPVMVHMNFRKEVTSVMSSLNWATADEEYTPIIASVDPPAGKFKSDGQRTRLNKRKFASDALMQTREELFAGEYDGLLIASQYDPFSIIEKLYPYLGGSASIVVHSPHVQVVTSLQTQLRDRPGYLGPTVTEGFLRRYQVLPGRTHPMMNASGSGGFILHVIKIYDDPTASSVMVHRHRKKAKQSSEGPSEKDVEQPAAIVVDATGDDVEMRTSES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.28
3 0.3
4 0.32
5 0.31
6 0.3
7 0.32
8 0.33
9 0.32
10 0.23
11 0.21
12 0.21
13 0.22
14 0.23
15 0.23
16 0.19
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.21
23 0.2
24 0.23
25 0.26
26 0.28
27 0.29
28 0.28
29 0.31
30 0.29
31 0.34
32 0.32
33 0.3
34 0.3
35 0.27
36 0.25
37 0.2
38 0.18
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.18
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.11
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.14
58 0.17
59 0.2
60 0.22
61 0.21
62 0.24
63 0.3
64 0.34
65 0.35
66 0.39
67 0.46
68 0.54
69 0.59
70 0.6
71 0.58
72 0.56
73 0.53
74 0.49
75 0.43
76 0.36
77 0.31
78 0.26
79 0.24
80 0.22
81 0.16
82 0.12
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.16
109 0.2
110 0.25
111 0.26
112 0.28
113 0.26
114 0.26
115 0.28
116 0.33
117 0.34
118 0.31
119 0.34
120 0.4
121 0.41
122 0.41
123 0.38
124 0.31
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.22
129 0.27
130 0.37
131 0.42
132 0.52
133 0.61
134 0.7
135 0.78
136 0.81
137 0.85
138 0.86
139 0.9
140 0.9
141 0.9
142 0.85
143 0.77
144 0.73
145 0.64
146 0.53
147 0.5
148 0.4
149 0.3
150 0.25
151 0.24
152 0.19
153 0.18
154 0.17
155 0.1
156 0.1
157 0.15
158 0.16
159 0.2
160 0.23
161 0.27
162 0.3
163 0.39
164 0.44
165 0.44
166 0.48
167 0.45
168 0.42
169 0.48
170 0.49
171 0.44
172 0.4
173 0.35
174 0.31
175 0.32
176 0.3
177 0.21
178 0.2
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.05
228 0.06
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.19
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.14
238 0.13
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.19
270 0.26
271 0.34
272 0.39
273 0.41
274 0.5
275 0.55
276 0.64
277 0.67
278 0.63
279 0.62
280 0.59
281 0.62
282 0.55
283 0.55
284 0.49
285 0.44
286 0.45
287 0.44
288 0.44
289 0.36
290 0.34
291 0.3
292 0.26
293 0.21
294 0.14
295 0.09
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.19
343 0.2
344 0.25
345 0.3
346 0.28
347 0.27
348 0.29
349 0.31
350 0.31
351 0.3
352 0.27
353 0.2
354 0.22
355 0.22
356 0.19
357 0.17
358 0.15
359 0.19
360 0.2
361 0.23
362 0.21
363 0.21
364 0.26
365 0.32
366 0.36
367 0.36
368 0.37
369 0.41
370 0.4
371 0.4
372 0.35
373 0.33
374 0.29
375 0.26
376 0.23
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.11
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.15
399 0.21
400 0.3
401 0.4
402 0.46
403 0.54
404 0.63
405 0.72
406 0.8
407 0.83
408 0.84
409 0.84
410 0.85
411 0.84
412 0.86
413 0.83
414 0.75
415 0.68
416 0.61
417 0.52
418 0.47
419 0.4
420 0.32
421 0.27
422 0.23
423 0.2
424 0.17
425 0.16
426 0.11
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.07