Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PQ40

Protein Details
Accession A0A5C3PQ40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-174AIKVRQGRHRGGPRRRGRRGGKRSRRRKCSTNTNLALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-165KRAIKVRQGRHRGGPRRRGRRGGKRSRRRK
Subcellular Location(s) nucl 8cyto 8cyto_nucl 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040151  Gfd2/YDR514C-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Amino Acid Sequences MPFDTRSSPVSPASGTVGTTGFYRFTDVFFEWHQALPNQDDVSPLKALIAYPALVHPDHPLRKPGVNGIELHLGTFESGEMRLLFSSAQLEYLRYYMHTMGLTKEPIPLPSSEYLIQQKDLVHCSPDVYNEASVLKRAIKVRQGRHRGGPRRRGRRGGKRSRRRKCSTNTNLALQTIDKNNKRLKKGMDNILGLRRLIFERVRTLWAAKLGTWCAMDFEAWDRDHTLLTEFGWRLVQWGDDKAVKEHGHLIVKERRQYTQHYVPNNREFYNFGQSLDVDKHEFRDRIRGLIDKHREHGPLFLVFHDHSQDVKYLKSEAIKAIERIDVLPDSPMTGEVYVVDTAELFAALEGDSNNTRSLERVCRHLKIDTKYLHNAGNDAYYTLEAMISMASGDPVDQQREQRWPNRTGDNMPKVEFQEWEEDSDFSDMEGIFGNPVNGANGVQPDADDDEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.16
7 0.15
8 0.12
9 0.11
10 0.15
11 0.14
12 0.15
13 0.19
14 0.19
15 0.21
16 0.22
17 0.25
18 0.23
19 0.24
20 0.26
21 0.22
22 0.24
23 0.24
24 0.26
25 0.23
26 0.22
27 0.24
28 0.23
29 0.25
30 0.22
31 0.19
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.15
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.25
45 0.3
46 0.32
47 0.35
48 0.37
49 0.4
50 0.41
51 0.44
52 0.4
53 0.38
54 0.36
55 0.35
56 0.37
57 0.33
58 0.31
59 0.24
60 0.18
61 0.15
62 0.14
63 0.11
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.09
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.13
83 0.11
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.16
88 0.19
89 0.2
90 0.18
91 0.22
92 0.2
93 0.2
94 0.21
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.22
99 0.19
100 0.22
101 0.26
102 0.26
103 0.26
104 0.24
105 0.25
106 0.25
107 0.27
108 0.24
109 0.2
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.15
124 0.18
125 0.22
126 0.28
127 0.36
128 0.45
129 0.53
130 0.6
131 0.61
132 0.67
133 0.73
134 0.75
135 0.77
136 0.78
137 0.78
138 0.8
139 0.83
140 0.83
141 0.83
142 0.84
143 0.86
144 0.87
145 0.88
146 0.88
147 0.92
148 0.93
149 0.93
150 0.89
151 0.86
152 0.84
153 0.84
154 0.82
155 0.82
156 0.74
157 0.69
158 0.63
159 0.54
160 0.45
161 0.35
162 0.29
163 0.24
164 0.28
165 0.26
166 0.31
167 0.37
168 0.43
169 0.45
170 0.48
171 0.48
172 0.5
173 0.55
174 0.58
175 0.58
176 0.54
177 0.53
178 0.51
179 0.46
180 0.36
181 0.29
182 0.21
183 0.16
184 0.17
185 0.15
186 0.13
187 0.16
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.17
193 0.19
194 0.17
195 0.14
196 0.15
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.07
215 0.07
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.19
234 0.2
235 0.22
236 0.21
237 0.26
238 0.28
239 0.31
240 0.36
241 0.34
242 0.33
243 0.32
244 0.37
245 0.4
246 0.42
247 0.44
248 0.47
249 0.51
250 0.56
251 0.61
252 0.58
253 0.51
254 0.42
255 0.39
256 0.34
257 0.36
258 0.3
259 0.23
260 0.21
261 0.2
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.13
266 0.12
267 0.15
268 0.19
269 0.21
270 0.19
271 0.27
272 0.27
273 0.27
274 0.29
275 0.3
276 0.29
277 0.38
278 0.45
279 0.38
280 0.4
281 0.41
282 0.41
283 0.37
284 0.36
285 0.29
286 0.23
287 0.22
288 0.2
289 0.18
290 0.17
291 0.18
292 0.17
293 0.15
294 0.12
295 0.12
296 0.15
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.18
304 0.18
305 0.22
306 0.23
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.2
311 0.19
312 0.18
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.04
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.18
346 0.25
347 0.26
348 0.34
349 0.38
350 0.41
351 0.44
352 0.48
353 0.51
354 0.47
355 0.54
356 0.5
357 0.51
358 0.52
359 0.52
360 0.5
361 0.43
362 0.39
363 0.31
364 0.28
365 0.22
366 0.17
367 0.15
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.09
382 0.12
383 0.16
384 0.18
385 0.23
386 0.28
387 0.37
388 0.43
389 0.47
390 0.51
391 0.54
392 0.57
393 0.61
394 0.61
395 0.6
396 0.64
397 0.65
398 0.62
399 0.58
400 0.56
401 0.52
402 0.49
403 0.42
404 0.33
405 0.32
406 0.29
407 0.31
408 0.29
409 0.26
410 0.25
411 0.25
412 0.23
413 0.14
414 0.16
415 0.11
416 0.1
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.14
430 0.13
431 0.12
432 0.14