FuNGI

A0A5C3PYM6

Protein Details

Accession

A0A5C3PYM6

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
493-532	ETPEEKKARKQAVKAERQARRSEKKTTKEQFSKATRQQAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-284	GKKRRRK
497-519	EKKARKQAVKAERQARRSEKKTT

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSVFRQPGAQHFQVVHRSQRDPLIHDPEASKHVLKPVVRGNLVKGKSRAELEKLLAPSDLAHDKERANIGEAAAYGIYFDDTQYDYMQHLKPVGMHEDGVDSIWLEAPSAKSKGKGRAKDPIELLDLPEGTLPSKSELPRNYEAQQDIPSSIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDEGLEDDFFGELVAHGERAPDEDLGFEFREQGVPDGGDAAVEGEVTPGEDEDESWEARFARFKREQKAAPQDEDTSDLDAYSEGGDTIGTLPQLSVIGGKKRRRKGASDASGYSMSSSSMWRNENLTILDERFDQIQHEYDSSDEEDEEPSFDDLDEAPDLIASRADFEDMMDEFLEKYEVIAGKMRPTLPGTATEKLDTVRKALGEAKIRDAEESDSDDGDILMPLDVDDKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARNDKPVPKIRLDPKTGLPSVVEEQPSKKQLPADSSTSDEDEDDSRPAHITIARSKDETPEEKKARKQAVKAERQARRSEKKTTKEQFSKATRQQAQSLTQREKSKLRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.52
4	0.51
5	0.49
6	0.46
7	0.47
8	0.47
9	0.53
10	0.51
11	0.47
12	0.52
13	0.52
14	0.47
15	0.48
16	0.47
17	0.42
18	0.42
19	0.4
20	0.33
21	0.27
22	0.31
23	0.35
24	0.33
25	0.36
26	0.41
27	0.45
28	0.47
29	0.46
30	0.47
31	0.5
32	0.52
33	0.52
34	0.47
35	0.43
36	0.44
37	0.47
38	0.45
39	0.41
40	0.43
41	0.39
42	0.43
43	0.4
44	0.36
45	0.32
46	0.27
47	0.22
48	0.22
49	0.23
50	0.19
51	0.2
52	0.22
53	0.23
54	0.27
55	0.31
56	0.27
57	0.26
58	0.25
59	0.23
60	0.22
61	0.22
62	0.18
63	0.14
64	0.13
65	0.09
66	0.07
67	0.08
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.18
81	0.19
82	0.21
83	0.24
84	0.2
85	0.19
86	0.17
87	0.17
88	0.17
89	0.15
90	0.12
91	0.08
92	0.07
93	0.09
94	0.08
95	0.07
96	0.09
97	0.11
98	0.15
99	0.18
100	0.19
101	0.22
102	0.28
103	0.38
104	0.46
105	0.51
106	0.52
107	0.58
108	0.6
109	0.62
110	0.58
111	0.51
112	0.46
113	0.39
114	0.36
115	0.28
116	0.25
117	0.19
118	0.18
119	0.14
120	0.1
121	0.11
122	0.1
123	0.1
124	0.15
125	0.17
126	0.23
127	0.27
128	0.33
129	0.37
130	0.4
131	0.39
132	0.39
133	0.39
134	0.35
135	0.34
136	0.28
137	0.24
138	0.2
139	0.18
140	0.14
141	0.13
142	0.12
143	0.09
144	0.08
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.12
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.17
153	0.17
154	0.15
155	0.16
156	0.14
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.03
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.03
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.03
177	0.03
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.07
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.08
189	0.08
190	0.1
191	0.11
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.04
217	0.06
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.15
225	0.14
226	0.21
227	0.3
228	0.35
229	0.4
230	0.46
231	0.49
232	0.52
233	0.62
234	0.56
235	0.5
236	0.47
237	0.42
238	0.36
239	0.36
240	0.28
241	0.19
242	0.15
243	0.12
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.05
248	0.05
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.06
262	0.07
263	0.14
264	0.21
265	0.28
266	0.36
267	0.41
268	0.5
269	0.51
270	0.54
271	0.57
272	0.61
273	0.63
274	0.59
275	0.54
276	0.49
277	0.46
278	0.41
279	0.32
280	0.21
281	0.13
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.12
286	0.13
287	0.13
288	0.15
289	0.15
290	0.16
291	0.16
292	0.16
293	0.14
294	0.13
295	0.13
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.08
301	0.08
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.11
309	0.1
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.05
344	0.05
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.13
349	0.13
350	0.16
351	0.19
352	0.19
353	0.18
354	0.19
355	0.2
356	0.17
357	0.24
358	0.25
359	0.26
360	0.26
361	0.25
362	0.24
363	0.23
364	0.26
365	0.2
366	0.18
367	0.16
368	0.15
369	0.17
370	0.2
371	0.25
372	0.28
373	0.29
374	0.32
375	0.34
376	0.34
377	0.32
378	0.29
379	0.25
380	0.19
381	0.22
382	0.18
383	0.15
384	0.14
385	0.14
386	0.13
387	0.11
388	0.09
389	0.06
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.07
394	0.08
395	0.1
396	0.14
397	0.14
398	0.2
399	0.24
400	0.26
401	0.27
402	0.31
403	0.29
404	0.31
405	0.35
406	0.3
407	0.28
408	0.28
409	0.24
410	0.21
411	0.22
412	0.17
413	0.14
414	0.19
415	0.19
416	0.22
417	0.24
418	0.25
419	0.27
420	0.33
421	0.4
422	0.45
423	0.51
424	0.57
425	0.63
426	0.66
427	0.72
428	0.75
429	0.71
430	0.66
431	0.67
432	0.66
433	0.67
434	0.66
435	0.62
436	0.59
437	0.61
438	0.57
439	0.49
440	0.41
441	0.36
442	0.33
443	0.34
444	0.3
445	0.23
446	0.26
447	0.32
448	0.36
449	0.34
450	0.33
451	0.33
452	0.34
453	0.39
454	0.41
455	0.39
456	0.37
457	0.39
458	0.39
459	0.36
460	0.32
461	0.26
462	0.22
463	0.19
464	0.18
465	0.16
466	0.14
467	0.13
468	0.14
469	0.14
470	0.15
471	0.16
472	0.19
473	0.26
474	0.32
475	0.34
476	0.35
477	0.36
478	0.39
479	0.44
480	0.46
481	0.46
482	0.5
483	0.56
484	0.6
485	0.66
486	0.7
487	0.73
488	0.73
489	0.73
490	0.72
491	0.75
492	0.78
493	0.81
494	0.82
495	0.79
496	0.77
497	0.8
498	0.8
499	0.79
500	0.74
501	0.76
502	0.75
503	0.76
504	0.81
505	0.81
506	0.82
507	0.81
508	0.82
509	0.81
510	0.8
511	0.82
512	0.79
513	0.8
514	0.77
515	0.72
516	0.73
517	0.69
518	0.68
519	0.66
520	0.67
521	0.64
522	0.64
523	0.66
524	0.65
525	0.68

A0A5C3PYM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer