FuNGI

A0A5C3NQR0

Protein Details

Accession

A0A5C3NQR0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
962-981	LYDMGKKKLLRKVENKNFFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, mito 7, cyto_nucl 7, extr 4, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MHLYNLTLQAPTAISQAIVGNFSGSRRQEIIVSRGTRLELLRPDPDTGKVTAAVASHVFGSIRSLVLFRLTGGIKDYAIIGSDSGRIVILEYDPNTNTFVKVHQETYGKSGARTTVPGQYLATDPKGRAVMIAAIEKAKLVYILNRDAAANLTISSPLEAHKSNAIIHHIVGLDVGFENPTFAALEVDHTEADQDPTGVAFNNAEKMLAYYELDLGLNHVVRKWSGPTDTQANLLVQVPGGQSASSDSYEGPSGVLVCCEDHIIYHYMDATQHRVPIPRRGYPFQDKDRGLIITAAVMHKMKGAFFFLLQSEEGDLYKVAIEHEEGDVKSLKIKYFDTVPVATSLCILKSGFLFVAAEFGNHHFYQFVKLGDEGEDFSSTDYPSYGMADPSAPLPRMIFRPHLLENLALVDEMESLDPIIDSKVLSVLPDAGTPQIFAACGRGARSTFRTLRHGLEVEEAVREDLGAVPKALWTAKLKEDDKHDAYIILSFANRTLVLSVGETIVEAEDTGFLIEAPTVAVQQIGADALLQVHQHGIRHILADKRVNEWRTPAGETIVNATTNKRQVVVALSSGELVYFELDLEGQLNEYQDRGALGSAILALSIGEVPEGRQRTPFLAVGYQDQTVRIISLDPENTLQTVSLQALTAPPASICIAEILDTSLNRSQPTTFVNIGLQNGVLLRTVLDPLNGQLTDTRTRFLGTRPVKLTRVNVQGNPAILALSSRSWLNYTYQNILHFTPLIHRTLDCVSSFSAAAHADGLIGVSGSILSIFQVTNLGATMKQDSVPLDYTPRKFLMHPQNGLFYLIEGDHRAYSEESSQQQLKRLRAEHKTFDEEILSLPARQFGRPKAPAGVWASCIRIIDPVKGETVHVLNLDNNEAAFSLAMVPFAACNNEVHLVVGTGQDAFLAPRSCTSGFLRTYKFTEEGRRLKLLHKTEVDDIPLALLAFQGRLSAGIGKSLRLYDMGKKKLLRKVENKNFFSAVVTLNTQGSRILVGDMQESIYYVAYKPLENQLLIFADDTQPRWITSATMLDYNTVVAGDRFGNIFVNRLDTKVSDQVDEDSVLSGGPHKTSMLAHFHVGDIVTGIHKVPLVVGGREVLVYTGLHGTIGLLAPFVGKDDVDFLSTLEQHMRSQQLSLVGRDHLAWRGYYVPVKAVVDGDLCEMFARLPPGNQSAIASELDRTVGEVLKKLEQLRVTASGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.13
4	0.13
5	0.13
6	0.12
7	0.12
8	0.13
9	0.14
10	0.2
11	0.19
12	0.23
13	0.24
14	0.25
15	0.28
16	0.33
17	0.37
18	0.39
19	0.4
20	0.38
21	0.38
22	0.38
23	0.36
24	0.32
25	0.33
26	0.31
27	0.33
28	0.37
29	0.37
30	0.4
31	0.38
32	0.4
33	0.37
34	0.32
35	0.29
36	0.24
37	0.23
38	0.21
39	0.2
40	0.18
41	0.15
42	0.14
43	0.12
44	0.12
45	0.12
46	0.09
47	0.12
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.12
52	0.11
53	0.14
54	0.14
55	0.11
56	0.15
57	0.15
58	0.16
59	0.18
60	0.19
61	0.16
62	0.17
63	0.17
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.09
68	0.09
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.08
74	0.09
75	0.1
76	0.1
77	0.13
78	0.14
79	0.18
80	0.18
81	0.2
82	0.22
83	0.21
84	0.2
85	0.17
86	0.19
87	0.23
88	0.25
89	0.26
90	0.29
91	0.32
92	0.32
93	0.37
94	0.41
95	0.34
96	0.31
97	0.32
98	0.29
99	0.28
100	0.3
101	0.28
102	0.28
103	0.29
104	0.3
105	0.28
106	0.26
107	0.27
108	0.27
109	0.29
110	0.25
111	0.24
112	0.27
113	0.28
114	0.26
115	0.23
116	0.2
117	0.19
118	0.19
119	0.21
120	0.18
121	0.17
122	0.17
123	0.17
124	0.15
125	0.12
126	0.1
127	0.09
128	0.13
129	0.17
130	0.22
131	0.23
132	0.24
133	0.24
134	0.23
135	0.24
136	0.19
137	0.14
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.09
144	0.09
145	0.13
146	0.13
147	0.15
148	0.17
149	0.19
150	0.2
151	0.22
152	0.26
153	0.23
154	0.22
155	0.23
156	0.2
157	0.18
158	0.16
159	0.13
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.09
173	0.11
174	0.12
175	0.11
176	0.11
177	0.12
178	0.11
179	0.13
180	0.11
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.12
194	0.13
195	0.12
196	0.12
197	0.09
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.12
205	0.11
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.16
210	0.18
211	0.19
212	0.21
213	0.23
214	0.26
215	0.31
216	0.31
217	0.3
218	0.29
219	0.25
220	0.23
221	0.21
222	0.17
223	0.11
224	0.12
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.07
230	0.09
231	0.12
232	0.1
233	0.11
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.08
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.1
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.11
255	0.14
256	0.15
257	0.17
258	0.16
259	0.19
260	0.21
261	0.27
262	0.29
263	0.36
264	0.4
265	0.43
266	0.48
267	0.49
268	0.55
269	0.58
270	0.64
271	0.62
272	0.65
273	0.59
274	0.54
275	0.53
276	0.46
277	0.36
278	0.28
279	0.2
280	0.13
281	0.14
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.1
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.14
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.12
312	0.11
313	0.13
314	0.14
315	0.13
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.19
320	0.2
321	0.2
322	0.22
323	0.25
324	0.24
325	0.23
326	0.22
327	0.21
328	0.21
329	0.19
330	0.16
331	0.14
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.1
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.07
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.08
346	0.1
347	0.13
348	0.13
349	0.13
350	0.11
351	0.11
352	0.15
353	0.17
354	0.16
355	0.13
356	0.14
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.13
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.11
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.11
378	0.13
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.13
383	0.16
384	0.18
385	0.2
386	0.19
387	0.23
388	0.24
389	0.26
390	0.24
391	0.21
392	0.19
393	0.16
394	0.15
395	0.1
396	0.08
397	0.06
398	0.05
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.05
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.1
430	0.11
431	0.14
432	0.17
433	0.22
434	0.26
435	0.28
436	0.32
437	0.33
438	0.35
439	0.35
440	0.33
441	0.26
442	0.25
443	0.22
444	0.17
445	0.15
446	0.13
447	0.09
448	0.08
449	0.07
450	0.05
451	0.06
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.13
462	0.17
463	0.25
464	0.26
465	0.28
466	0.34
467	0.39
468	0.38
469	0.36
470	0.32
471	0.26
472	0.24
473	0.22
474	0.17
475	0.1
476	0.08
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.06
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.09
524	0.09
525	0.1
526	0.12
527	0.14
528	0.17
529	0.21
530	0.22
531	0.23
532	0.28
533	0.28
534	0.26
535	0.26
536	0.26
537	0.23
538	0.24
539	0.2
540	0.17
541	0.16
542	0.16
543	0.16
544	0.14
545	0.13
546	0.11
547	0.13
548	0.14
549	0.16
550	0.16
551	0.14
552	0.13
553	0.13
554	0.16
555	0.15
556	0.13
557	0.11
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.09
562	0.06
563	0.05
564	0.04
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.04
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.03
584	0.03
585	0.04
586	0.03
587	0.03
588	0.02
589	0.02
590	0.02
591	0.02
592	0.02
593	0.02
594	0.02
595	0.03
596	0.07
597	0.09
598	0.09
599	0.1
600	0.11
601	0.13
602	0.15
603	0.16
604	0.13
605	0.14
606	0.14
607	0.15
608	0.16
609	0.15
610	0.13
611	0.12
612	0.11
613	0.1
614	0.09
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.06
634	0.06
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.06
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.06
648	0.08
649	0.1
650	0.1
651	0.1
652	0.11
653	0.11
654	0.12
655	0.14
656	0.16
657	0.14
658	0.14
659	0.16
660	0.16
661	0.16
662	0.14
663	0.12
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.05
668	0.04
669	0.04
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.07
676	0.09
677	0.09
678	0.08
679	0.09
680	0.12
681	0.17
682	0.17
683	0.17
684	0.15
685	0.16
686	0.17
687	0.17
688	0.24
689	0.22
690	0.28
691	0.31
692	0.35
693	0.36
694	0.38
695	0.4
696	0.37
697	0.42
698	0.38
699	0.36
700	0.35
701	0.34
702	0.32
703	0.29
704	0.22
705	0.13
706	0.1
707	0.09
708	0.07
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.08
715	0.1
716	0.14
717	0.17
718	0.19
719	0.21
720	0.22
721	0.23
722	0.22
723	0.21
724	0.16
725	0.14
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.15
730	0.14
731	0.16
732	0.17
733	0.19
734	0.14
735	0.13
736	0.12
737	0.13
738	0.13
739	0.11
740	0.1
741	0.09
742	0.08
743	0.07
744	0.07
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.02
752	0.02
753	0.02
754	0.02
755	0.02
756	0.02
757	0.03
758	0.03
759	0.04
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.06
765	0.05
766	0.06
767	0.08
768	0.08
769	0.08
770	0.09
771	0.1
772	0.12
773	0.13
774	0.13
775	0.17
776	0.22
777	0.23
778	0.25
779	0.26
780	0.25
781	0.24
782	0.33
783	0.38
784	0.41
785	0.43
786	0.41
787	0.42
788	0.41
789	0.42
790	0.32
791	0.21
792	0.15
793	0.11
794	0.11
795	0.08
796	0.09
797	0.08
798	0.08
799	0.09
800	0.09
801	0.1
802	0.12
803	0.15
804	0.15
805	0.19
806	0.23
807	0.23
808	0.3
809	0.34
810	0.36
811	0.38
812	0.42
813	0.46
814	0.5
815	0.55
816	0.55
817	0.55
818	0.57
819	0.51
820	0.47
821	0.4
822	0.31
823	0.26
824	0.22
825	0.17
826	0.12
827	0.11
828	0.15
829	0.15
830	0.17
831	0.2
832	0.22
833	0.3
834	0.33
835	0.35
836	0.34
837	0.33
838	0.37
839	0.38
840	0.34
841	0.28
842	0.27
843	0.26
844	0.23
845	0.23
846	0.18
847	0.19
848	0.19
849	0.19
850	0.19
851	0.19
852	0.19
853	0.19
854	0.19
855	0.16
856	0.16
857	0.13
858	0.12
859	0.12
860	0.12
861	0.13
862	0.14
863	0.11
864	0.1
865	0.09
866	0.09
867	0.08
868	0.06
869	0.05
870	0.06
871	0.06
872	0.06
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.06
877	0.07
878	0.06
879	0.06
880	0.09
881	0.1
882	0.1
883	0.11
884	0.1
885	0.1
886	0.09
887	0.1
888	0.08
889	0.06
890	0.06
891	0.05
892	0.05
893	0.05
894	0.09
895	0.1
896	0.09
897	0.11
898	0.15
899	0.15
900	0.18
901	0.21
902	0.24
903	0.27
904	0.32
905	0.35
906	0.34
907	0.36
908	0.36
909	0.36
910	0.32
911	0.37
912	0.41
913	0.45
914	0.47
915	0.48
916	0.46
917	0.49
918	0.54
919	0.5
920	0.49
921	0.45
922	0.44
923	0.44
924	0.45
925	0.41
926	0.33
927	0.28
928	0.2
929	0.17
930	0.14
931	0.09
932	0.07
933	0.06
934	0.05
935	0.05
936	0.05
937	0.05
938	0.05
939	0.06
940	0.1
941	0.1
942	0.15
943	0.15
944	0.16
945	0.17
946	0.17
947	0.17
948	0.15
949	0.18
950	0.21
951	0.3
952	0.34
953	0.38
954	0.43
955	0.5
956	0.54
957	0.61
958	0.62
959	0.62
960	0.69
961	0.75
962	0.8
963	0.76
964	0.73
965	0.65
966	0.56
967	0.47
968	0.38
969	0.29
970	0.21
971	0.19
972	0.16
973	0.17
974	0.17
975	0.15
976	0.13
977	0.12
978	0.1
979	0.09
980	0.09
981	0.09
982	0.09
983	0.1
984	0.1
985	0.1
986	0.09
987	0.09
988	0.09
989	0.08
990	0.08
991	0.08
992	0.12
993	0.13
994	0.13
995	0.15
996	0.21
997	0.24
998	0.23
999	0.23
1000	0.22
1001	0.22
1002	0.22
1003	0.2
1004	0.14
1005	0.15
1006	0.17
1007	0.18
1008	0.19
1009	0.18
1010	0.18
1011	0.19
1012	0.18
1013	0.16
1014	0.17
1015	0.2
1016	0.19
1017	0.2
1018	0.2
1019	0.2
1020	0.2
1021	0.18
1022	0.15
1023	0.1
1024	0.09
1025	0.06
1026	0.08
1027	0.07
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.09
1031	0.12
1032	0.12
1033	0.15
1034	0.13
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.19
1038	0.2
1039	0.18
1040	0.23
1041	0.27
1042	0.28
1043	0.23
1044	0.23
1045	0.25
1046	0.25
1047	0.25
1048	0.2
1049	0.14
1050	0.13
1051	0.12
1052	0.11
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.12
1059	0.15
1060	0.19
1061	0.22
1062	0.23
1063	0.24
1064	0.24
1065	0.24
1066	0.24
1067	0.22
1068	0.17
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.13
1079	0.15
1080	0.15
1081	0.15
1082	0.15
1083	0.15
1084	0.15
1085	0.15
1086	0.1
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.08
1090	0.09
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.08
1094	0.08
1095	0.09
1096	0.1
1097	0.08
1098	0.06
1099	0.06
1100	0.07
1101	0.07
1102	0.09
1103	0.08
1104	0.07
1105	0.07
1106	0.1
1107	0.11
1108	0.12
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.14
1112	0.15
1113	0.16
1114	0.17
1115	0.18
1116	0.18
1117	0.23
1118	0.26
1119	0.23
1120	0.24
1121	0.25
1122	0.28
1123	0.3
1124	0.31
1125	0.29
1126	0.26
1127	0.26
1128	0.27
1129	0.26
1130	0.23
1131	0.22
1132	0.2
1133	0.19
1134	0.2
1135	0.23
1136	0.26
1137	0.25
1138	0.23
1139	0.25
1140	0.26
1141	0.25
1142	0.23
1143	0.21
1144	0.18
1145	0.18
1146	0.18
1147	0.14
1148	0.13
1149	0.12
1150	0.11
1151	0.1
1152	0.11
1153	0.15
1154	0.14
1155	0.15
1156	0.2
1157	0.23
1158	0.24
1159	0.25
1160	0.24
1161	0.21
1162	0.22
1163	0.22
1164	0.18
1165	0.15
1166	0.14
1167	0.15
1168	0.13
1169	0.13
1170	0.12
1171	0.15
1172	0.16
1173	0.19
1174	0.21
1175	0.25
1176	0.3
1177	0.31
1178	0.34
1179	0.33
1180	0.34
1181	0.34

A0A5C3NQR0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer