Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PBA8

Protein Details
Accession A0A5C3PBA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
497-520ELTAGWKRRHREAIKSRRRRGGAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-198AKPSKKETKSGARVKTRTREPPSRARRK
502-520WKRRHREAIKSRRRRGGAA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8.5, cyto_mito 5.5, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MDEAITKRVHISGLTPAITAKDLSDRLSSFGTVKSIDGFGLLDAVGQPRKFAYVTLETTKGKLARCMNLLSGVTWKGAKLRLGEAKPDYRERIQKEHDELKRAAEASADEPAHKRRRLPRSVQGVHARDMSLVTPENVSTRGGWRVTPTGRLIRPMRMRPAHPLPEPLDTAKPSKKETKSGARVKTRTREPPSRARRKTIDPTKWGSQHLKGIFLENAAVTYPAPSRHEPIAAPVDDESSEGSQNSESESDSEHSSEESDKERSPSLPPPVPTTIKAAPARPATATKSVPQSSIDSELAEEKNQTLGLLQSLFGDKEEWGGAESVGSDVEEEVGRDHGHRNISAADGVDDVQDSMDVDEQQPDLEPSPPPITQGTVSAPEGTKAKLKDLFAPREEDAGFSLLGHLDLDLELDDDVPFDVPAPAAASAPLRPTAPVQPSTSSRIPHVVLLDHSRPLFFPSDQSGGRRRVLDPTDWKTWFYRTDSPEAIRTRWEETKGELTAGWKRRHREAIKSRRRRGGAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.24
4 0.25
5 0.25
6 0.23
7 0.16
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.24
12 0.24
13 0.25
14 0.27
15 0.26
16 0.21
17 0.22
18 0.22
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.07
31 0.11
32 0.15
33 0.14
34 0.15
35 0.14
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.2
40 0.23
41 0.28
42 0.32
43 0.37
44 0.36
45 0.37
46 0.41
47 0.38
48 0.32
49 0.34
50 0.35
51 0.36
52 0.38
53 0.4
54 0.36
55 0.37
56 0.36
57 0.3
58 0.28
59 0.23
60 0.21
61 0.19
62 0.18
63 0.17
64 0.2
65 0.22
66 0.21
67 0.27
68 0.35
69 0.36
70 0.42
71 0.44
72 0.48
73 0.49
74 0.52
75 0.5
76 0.48
77 0.54
78 0.54
79 0.57
80 0.57
81 0.59
82 0.61
83 0.66
84 0.64
85 0.62
86 0.57
87 0.51
88 0.49
89 0.42
90 0.34
91 0.26
92 0.23
93 0.18
94 0.23
95 0.2
96 0.17
97 0.2
98 0.28
99 0.35
100 0.36
101 0.42
102 0.45
103 0.56
104 0.64
105 0.69
106 0.7
107 0.73
108 0.74
109 0.75
110 0.75
111 0.67
112 0.6
113 0.53
114 0.44
115 0.33
116 0.3
117 0.22
118 0.15
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.18
132 0.24
133 0.25
134 0.28
135 0.29
136 0.32
137 0.32
138 0.39
139 0.38
140 0.4
141 0.47
142 0.48
143 0.53
144 0.5
145 0.51
146 0.52
147 0.59
148 0.57
149 0.5
150 0.5
151 0.44
152 0.42
153 0.42
154 0.36
155 0.31
156 0.26
157 0.3
158 0.29
159 0.29
160 0.3
161 0.38
162 0.39
163 0.43
164 0.48
165 0.54
166 0.59
167 0.65
168 0.7
169 0.7
170 0.72
171 0.72
172 0.73
173 0.7
174 0.69
175 0.69
176 0.69
177 0.66
178 0.71
179 0.75
180 0.78
181 0.75
182 0.72
183 0.69
184 0.68
185 0.72
186 0.72
187 0.69
188 0.64
189 0.66
190 0.65
191 0.63
192 0.59
193 0.53
194 0.45
195 0.44
196 0.39
197 0.36
198 0.3
199 0.29
200 0.25
201 0.21
202 0.19
203 0.11
204 0.11
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.12
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.17
217 0.19
218 0.22
219 0.19
220 0.19
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.11
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.21
253 0.24
254 0.26
255 0.26
256 0.29
257 0.32
258 0.33
259 0.31
260 0.31
261 0.27
262 0.3
263 0.31
264 0.27
265 0.28
266 0.28
267 0.27
268 0.23
269 0.24
270 0.2
271 0.23
272 0.23
273 0.21
274 0.26
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.23
279 0.2
280 0.23
281 0.21
282 0.15
283 0.14
284 0.17
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.09
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.15
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.12
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.16
360 0.18
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.17
369 0.19
370 0.17
371 0.21
372 0.23
373 0.25
374 0.32
375 0.39
376 0.45
377 0.42
378 0.46
379 0.42
380 0.41
381 0.4
382 0.31
383 0.24
384 0.18
385 0.16
386 0.11
387 0.11
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.12
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.15
419 0.22
420 0.26
421 0.28
422 0.29
423 0.32
424 0.35
425 0.42
426 0.43
427 0.37
428 0.34
429 0.35
430 0.33
431 0.31
432 0.3
433 0.25
434 0.25
435 0.3
436 0.3
437 0.29
438 0.28
439 0.26
440 0.24
441 0.25
442 0.26
443 0.19
444 0.2
445 0.22
446 0.27
447 0.29
448 0.33
449 0.37
450 0.38
451 0.42
452 0.41
453 0.37
454 0.4
455 0.42
456 0.46
457 0.48
458 0.5
459 0.54
460 0.53
461 0.54
462 0.47
463 0.48
464 0.45
465 0.42
466 0.44
467 0.41
468 0.47
469 0.5
470 0.51
471 0.54
472 0.52
473 0.48
474 0.44
475 0.42
476 0.41
477 0.42
478 0.43
479 0.37
480 0.38
481 0.44
482 0.4
483 0.38
484 0.33
485 0.31
486 0.36
487 0.43
488 0.46
489 0.45
490 0.49
491 0.57
492 0.67
493 0.68
494 0.7
495 0.73
496 0.76
497 0.81
498 0.87
499 0.88
500 0.87
501 0.85