FuNGI

A0A5C3PQT7

Protein Details

Accession

A0A5C3PQT7

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-29	TLFNPRPSRPTLPKKEPSASNT	Hydrophilic
178-204	DDKGKGKDKEKGKKKFQKKTRQVFMIP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-197	KGKGKDKEKGKKKFQKKT
543-554	SPKVPKPKAGIP
591-597	GKPLKRK
611-618	PRQKKRKA

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAKKGGPTLFNPRPSRPTLPKKEPSASNTPSPGSSQTLPTAQSQPGTPKKPPTATASPRPAPPRRPTVKTEDDPAPQMPEGPFSEYRLMSSKLNGWKYDIMKFDSRKKVEINEWSKPIYLNRKDLHREDPSAQGPKQAVAPMVGSDGKLVMGADGKVVMVDAQGKIVRDADVAAAGADDKGKGKDKEKGKKKFQKKTRQVFMIPEETRQLRREEKYPWVIEDNDKQEVWTASMEEVSRSETCAMFMPAANDVFKFVPAHRWYKFRKQPSHAIIRDLNAIENYMSKAQKLNARTLSSLVAKTELASANGTSLVHNAGQSRGPLGRKLRTVDSGPSDLFGDDDDDEGGDSKRKIKRELGQEGFLDELDFEESFQDDEERMEADDNEDEETKELEERLKKEYRTANKLREGGVDESEEEEDDEAKLTGAGKNLQKTLKKLEKGGGYEDSDDEKNPYASSEEEEEEEEPPQVPNGPAILPPEPKPGLQRSPSQTPSAGPAPGAKPGVNGQGAVAVKTEPQSPSRATSPVPGPPNHGGHSIVAKRATSPKVPKPKAGIPGRAGSPLATPNGVSPAASRAASPVAANGPGAAASPGGKPLKRKATEDGAAASTDGAPRQKKRKAPAGELEDRMVIEWLRNTPNATTRECIQHFTKYLTDETKKSKFTALVKEVAQLSGGVLILRPAYRGTTGASPAPAPAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.67
3	0.68
4	0.71
5	0.72
6	0.77
7	0.8
8	0.81
9	0.83
10	0.8
11	0.77
12	0.76
13	0.7
14	0.66
15	0.62
16	0.55
17	0.48
18	0.44
19	0.4
20	0.35
21	0.33
22	0.29
23	0.29
24	0.3
25	0.31
26	0.32
27	0.33
28	0.3
29	0.29
30	0.28
31	0.35
32	0.41
33	0.45
34	0.46
35	0.51
36	0.57
37	0.6
38	0.61
39	0.6
40	0.62
41	0.64
42	0.69
43	0.69
44	0.65
45	0.67
46	0.72
47	0.71
48	0.7
49	0.69
50	0.7
51	0.69
52	0.71
53	0.7
54	0.7
55	0.72
56	0.67
57	0.65
58	0.61
59	0.56
60	0.54
61	0.5
62	0.44
63	0.34
64	0.34
65	0.27
66	0.25
67	0.24
68	0.26
69	0.26
70	0.25
71	0.3
72	0.27
73	0.29
74	0.29
75	0.3
76	0.25
77	0.27
78	0.3
79	0.34
80	0.38
81	0.37
82	0.36
83	0.4
84	0.42
85	0.45
86	0.42
87	0.39
88	0.43
89	0.47
90	0.53
91	0.56
92	0.56
93	0.54
94	0.53
95	0.54
96	0.54
97	0.59
98	0.57
99	0.54
100	0.55
101	0.53
102	0.5
103	0.46
104	0.45
105	0.45
106	0.44
107	0.45
108	0.46
109	0.53
110	0.58
111	0.6
112	0.62
113	0.57
114	0.56
115	0.5
116	0.53
117	0.51
118	0.51
119	0.47
120	0.44
121	0.38
122	0.34
123	0.34
124	0.28
125	0.23
126	0.17
127	0.18
128	0.13
129	0.15
130	0.15
131	0.12
132	0.1
133	0.1
134	0.09
135	0.08
136	0.07
137	0.05
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.04
147	0.07
148	0.07
149	0.09
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.13
154	0.13
155	0.11
156	0.11
157	0.09
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.09
168	0.16
169	0.19
170	0.23
171	0.3
172	0.4
173	0.5
174	0.59
175	0.67
176	0.72
177	0.79
178	0.86
179	0.89
180	0.89
181	0.9
182	0.91
183	0.91
184	0.9
185	0.86
186	0.79
187	0.74
188	0.69
189	0.67
190	0.57
191	0.48
192	0.42
193	0.38
194	0.38
195	0.34
196	0.33
197	0.3
198	0.33
199	0.36
200	0.36
201	0.42
202	0.46
203	0.46
204	0.44
205	0.4
206	0.39
207	0.39
208	0.41
209	0.36
210	0.31
211	0.29
212	0.27
213	0.26
214	0.24
215	0.21
216	0.15
217	0.12
218	0.09
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.13
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.11
237	0.09
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.09
243	0.17
244	0.21
245	0.27
246	0.28
247	0.35
248	0.4
249	0.5
250	0.58
251	0.59
252	0.64
253	0.64
254	0.71
255	0.71
256	0.76
257	0.66
258	0.63
259	0.55
260	0.47
261	0.44
262	0.35
263	0.28
264	0.18
265	0.17
266	0.12
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.11
272	0.13
273	0.15
274	0.2
275	0.21
276	0.26
277	0.27
278	0.29
279	0.29
280	0.29
281	0.28
282	0.26
283	0.24
284	0.18
285	0.14
286	0.12
287	0.12
288	0.14
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.12
307	0.12
308	0.16
309	0.2
310	0.23
311	0.25
312	0.27
313	0.28
314	0.28
315	0.29
316	0.27
317	0.27
318	0.25
319	0.22
320	0.2
321	0.18
322	0.15
323	0.13
324	0.1
325	0.08
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.13
336	0.17
337	0.19
338	0.23
339	0.28
340	0.35
341	0.42
342	0.51
343	0.48
344	0.47
345	0.45
346	0.42
347	0.36
348	0.29
349	0.2
350	0.1
351	0.07
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.1
379	0.14
380	0.16
381	0.21
382	0.26
383	0.26
384	0.31
385	0.39
386	0.42
387	0.48
388	0.53
389	0.54
390	0.56
391	0.58
392	0.53
393	0.47
394	0.43
395	0.35
396	0.3
397	0.23
398	0.17
399	0.16
400	0.15
401	0.13
402	0.09
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.07
412	0.08
413	0.13
414	0.15
415	0.18
416	0.21
417	0.26
418	0.28
419	0.29
420	0.37
421	0.41
422	0.4
423	0.4
424	0.42
425	0.42
426	0.41
427	0.42
428	0.36
429	0.29
430	0.28
431	0.26
432	0.24
433	0.19
434	0.18
435	0.16
436	0.14
437	0.13
438	0.12
439	0.12
440	0.1
441	0.1
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.12
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.13
461	0.16
462	0.17
463	0.18
464	0.24
465	0.23
466	0.23
467	0.27
468	0.3
469	0.33
470	0.34
471	0.4
472	0.4
473	0.47
474	0.49
475	0.47
476	0.42
477	0.36
478	0.37
479	0.32
480	0.26
481	0.19
482	0.2
483	0.19
484	0.21
485	0.22
486	0.17
487	0.16
488	0.18
489	0.22
490	0.19
491	0.18
492	0.14
493	0.18
494	0.18
495	0.17
496	0.15
497	0.11
498	0.11
499	0.12
500	0.15
501	0.12
502	0.14
503	0.17
504	0.18
505	0.22
506	0.24
507	0.25
508	0.23
509	0.26
510	0.28
511	0.31
512	0.34
513	0.32
514	0.35
515	0.38
516	0.41
517	0.37
518	0.35
519	0.3
520	0.26
521	0.33
522	0.29
523	0.27
524	0.26
525	0.24
526	0.25
527	0.31
528	0.33
529	0.34
530	0.4
531	0.46
532	0.56
533	0.59
534	0.61
535	0.61
536	0.64
537	0.66
538	0.65
539	0.63
540	0.56
541	0.57
542	0.54
543	0.48
544	0.42
545	0.33
546	0.27
547	0.23
548	0.2
549	0.16
550	0.14
551	0.13
552	0.16
553	0.16
554	0.13
555	0.11
556	0.13
557	0.15
558	0.15
559	0.14
560	0.13
561	0.14
562	0.15
563	0.14
564	0.13
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.09
570	0.09
571	0.09
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.13
577	0.18
578	0.2
579	0.24
580	0.33
581	0.43
582	0.46
583	0.49
584	0.49
585	0.54
586	0.56
587	0.54
588	0.48
589	0.39
590	0.35
591	0.31
592	0.25
593	0.17
594	0.14
595	0.15
596	0.17
597	0.22
598	0.3
599	0.39
600	0.47
601	0.53
602	0.61
603	0.68
604	0.71
605	0.74
606	0.76
607	0.76
608	0.76
609	0.71
610	0.64
611	0.55
612	0.46
613	0.38
614	0.29
615	0.2
616	0.14
617	0.15
618	0.18
619	0.2
620	0.22
621	0.23
622	0.25
623	0.32
624	0.34
625	0.35
626	0.33
627	0.34
628	0.42
629	0.42
630	0.44
631	0.4
632	0.43
633	0.42
634	0.43
635	0.42
636	0.36
637	0.39
638	0.43
639	0.45
640	0.43
641	0.5
642	0.53
643	0.52
644	0.51
645	0.52
646	0.49
647	0.52
648	0.56
649	0.53
650	0.51
651	0.49
652	0.52
653	0.48
654	0.41
655	0.34
656	0.23
657	0.18
658	0.14
659	0.13
660	0.09
661	0.07
662	0.08
663	0.1
664	0.1
665	0.11
666	0.1
667	0.12
668	0.14
669	0.15
670	0.17
671	0.2
672	0.23
673	0.25
674	0.26
675	0.24
676	0.24

A0A5C3PQT7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer