Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PFE4

Protein Details
Accession A0A5C3PFE4    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-114VDDTLKWLKRSKKKEKELAKKRQEELEAHydrophilic
264-290QPGDVGFKKPKTKKKRPSRRVAAEESDBasic
326-347AALARSRRAKLQKRKKLSPEEIHydrophilic
673-701LDSQPLSKGKTEKKNKKKQSGKDATPQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-108LKRSKKKEKELAKKR
271-283KKPKTKKKRPSRR
330-342RSRRAKLQKRKKL
602-628SHKFHGKGSGKAKTEKRLKKIAEERKK
680-691KGKTEKKNKKKQ
777-781PPKRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDKGPATDTEKLAEDNYAKQRERETKDREAKAIQDRIAKVRNKRELNAKLKGTTLGDADGDVDDTLKWLKRSKKKEKELAKKRQEELEAMDKAFQDEYTEKDLEGLKVSHDFEGMEEGEARILTLKDSRILDNEEDELQNIDLAEQEREKKNQELKLKRRDYTGYDDEEFAPGAAGMKRAVLSKYDEFLEGSKETGFRLGSSTLSAREKKDEGSGSVSVNKSLLSIDYAKNLESADYLQPGDVGFKKPKTKKKRPSRRVAAEESDIPPVNGEDQMQVDEKPIVPRPRNLDANFVDDDELQAALARSRRAKLQKRKKLSPEEIAKQIAEQRAKSEARDAIMVEDDDDGEGGGLTIDDTSEFVRAITYDPTAVKKEPAEPSLNRAKSREPSRQPSAPPARAKTEERDHPMEEIEAGEVVVKEEEEEDEEAMLNAIESAIKQAEEVEKAHASGEADAVVGTSAEQTFGQGMAATLNILRQQGVLAKPSSDQAERERVQLQRDLWLADYRRMVAQRELERAKARGGNRDQATREYENRVREQQEARQNLEAYKNYKPDVNIVYYDEFGRELTPKEAWKALSHKFHGKGSGKAKTEKRLKKIAEERKKEAMASGDTPLSMNQAFQIRQEKTGQAHFVLSVGNRGAVPQASEFLDSQPLSKGKTEKKNKKKQSGKDATPQLESTGFMTLPAPMANGSPAPGTSANGSPAPRPGFSRISTVAETETPTEGTPVPAERSKVVIGLGNKRKAAGELQGTPPPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.39
10 0.43
11 0.43
12 0.4
13 0.34
14 0.28
15 0.27
16 0.28
17 0.27
18 0.27
19 0.29
20 0.29
21 0.3
22 0.28
23 0.24
24 0.24
25 0.27
26 0.24
27 0.27
28 0.35
29 0.4
30 0.4
31 0.41
32 0.5
33 0.55
34 0.61
35 0.63
36 0.62
37 0.65
38 0.74
39 0.76
40 0.72
41 0.65
42 0.65
43 0.65
44 0.64
45 0.57
46 0.55
47 0.53
48 0.56
49 0.6
50 0.59
51 0.59
52 0.63
53 0.68
54 0.66
55 0.68
56 0.72
57 0.74
58 0.75
59 0.75
60 0.69
61 0.61
62 0.57
63 0.55
64 0.46
65 0.38
66 0.31
67 0.23
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.13
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.13
79 0.16
80 0.22
81 0.32
82 0.42
83 0.53
84 0.63
85 0.71
86 0.78
87 0.86
88 0.9
89 0.92
90 0.93
91 0.93
92 0.92
93 0.9
94 0.83
95 0.8
96 0.72
97 0.64
98 0.59
99 0.56
100 0.48
101 0.4
102 0.39
103 0.32
104 0.3
105 0.27
106 0.21
107 0.16
108 0.14
109 0.18
110 0.21
111 0.21
112 0.2
113 0.22
114 0.24
115 0.21
116 0.23
117 0.2
118 0.16
119 0.19
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.13
125 0.16
126 0.15
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.11
137 0.12
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.25
146 0.22
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.19
159 0.22
160 0.25
161 0.29
162 0.34
163 0.4
164 0.45
165 0.53
166 0.58
167 0.64
168 0.72
169 0.76
170 0.7
171 0.68
172 0.65
173 0.6
174 0.58
175 0.54
176 0.48
177 0.42
178 0.42
179 0.38
180 0.34
181 0.29
182 0.2
183 0.14
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.17
195 0.18
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.15
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.21
217 0.24
218 0.23
219 0.26
220 0.27
221 0.26
222 0.3
223 0.28
224 0.25
225 0.26
226 0.26
227 0.23
228 0.27
229 0.26
230 0.21
231 0.2
232 0.18
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.08
237 0.11
238 0.12
239 0.15
240 0.16
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.13
245 0.1
246 0.12
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.12
255 0.15
256 0.17
257 0.22
258 0.32
259 0.4
260 0.5
261 0.58
262 0.67
263 0.74
264 0.81
265 0.88
266 0.9
267 0.93
268 0.93
269 0.92
270 0.89
271 0.84
272 0.77
273 0.68
274 0.61
275 0.51
276 0.43
277 0.33
278 0.25
279 0.19
280 0.15
281 0.13
282 0.1
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.18
294 0.24
295 0.25
296 0.29
297 0.34
298 0.4
299 0.46
300 0.44
301 0.45
302 0.39
303 0.41
304 0.38
305 0.32
306 0.26
307 0.19
308 0.18
309 0.11
310 0.1
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.08
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.19
320 0.29
321 0.39
322 0.48
323 0.58
324 0.66
325 0.73
326 0.8
327 0.83
328 0.84
329 0.79
330 0.77
331 0.74
332 0.68
333 0.63
334 0.56
335 0.47
336 0.37
337 0.35
338 0.31
339 0.25
340 0.2
341 0.18
342 0.23
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.2
347 0.19
348 0.19
349 0.18
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.09
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.18
386 0.19
387 0.21
388 0.24
389 0.22
390 0.27
391 0.35
392 0.37
393 0.33
394 0.32
395 0.32
396 0.35
397 0.41
398 0.46
399 0.43
400 0.48
401 0.53
402 0.56
403 0.54
404 0.56
405 0.58
406 0.55
407 0.52
408 0.48
409 0.46
410 0.46
411 0.47
412 0.43
413 0.41
414 0.4
415 0.42
416 0.42
417 0.39
418 0.35
419 0.33
420 0.27
421 0.21
422 0.15
423 0.1
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.1
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.09
462 0.09
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.03
470 0.04
471 0.03
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.11
491 0.12
492 0.14
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.16
497 0.18
498 0.15
499 0.16
500 0.18
501 0.26
502 0.26
503 0.28
504 0.31
505 0.3
506 0.32
507 0.34
508 0.31
509 0.27
510 0.27
511 0.25
512 0.22
513 0.25
514 0.24
515 0.23
516 0.24
517 0.2
518 0.22
519 0.23
520 0.24
521 0.22
522 0.28
523 0.29
524 0.36
525 0.36
526 0.37
527 0.38
528 0.37
529 0.37
530 0.35
531 0.33
532 0.35
533 0.37
534 0.42
535 0.42
536 0.47
537 0.45
538 0.43
539 0.47
540 0.42
541 0.41
542 0.4
543 0.42
544 0.41
545 0.44
546 0.45
547 0.42
548 0.43
549 0.44
550 0.44
551 0.48
552 0.48
553 0.46
554 0.45
555 0.44
556 0.4
557 0.42
558 0.38
559 0.33
560 0.34
561 0.34
562 0.31
563 0.33
564 0.31
565 0.31
566 0.31
567 0.3
568 0.26
569 0.26
570 0.26
571 0.25
572 0.24
573 0.19
574 0.15
575 0.12
576 0.12
577 0.11
578 0.11
579 0.13
580 0.16
581 0.17
582 0.19
583 0.22
584 0.22
585 0.25
586 0.3
587 0.35
588 0.4
589 0.42
590 0.48
591 0.48
592 0.49
593 0.53
594 0.5
595 0.51
596 0.51
597 0.55
598 0.51
599 0.56
600 0.59
601 0.6
602 0.67
603 0.68
604 0.67
605 0.68
606 0.66
607 0.69
608 0.74
609 0.75
610 0.75
611 0.75
612 0.74
613 0.72
614 0.71
615 0.61
616 0.53
617 0.46
618 0.39
619 0.33
620 0.3
621 0.22
622 0.21
623 0.21
624 0.19
625 0.17
626 0.13
627 0.11
628 0.11
629 0.16
630 0.16
631 0.2
632 0.29
633 0.27
634 0.31
635 0.34
636 0.35
637 0.33
638 0.38
639 0.37
640 0.29
641 0.28
642 0.25
643 0.23
644 0.21
645 0.17
646 0.15
647 0.13
648 0.13
649 0.12
650 0.12
651 0.13
652 0.12
653 0.13
654 0.11
655 0.13
656 0.13
657 0.15
658 0.15
659 0.15
660 0.2
661 0.18
662 0.18
663 0.22
664 0.22
665 0.23
666 0.27
667 0.34
668 0.38
669 0.48
670 0.59
671 0.64
672 0.74
673 0.83
674 0.89
675 0.92
676 0.93
677 0.92
678 0.92
679 0.92
680 0.88
681 0.87
682 0.86
683 0.78
684 0.72
685 0.62
686 0.53
687 0.43
688 0.36
689 0.27
690 0.2
691 0.16
692 0.13
693 0.13
694 0.11
695 0.12
696 0.11
697 0.1
698 0.08
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.1
704 0.1
705 0.13
706 0.13
707 0.14
708 0.15
709 0.17
710 0.19
711 0.22
712 0.23
713 0.21
714 0.27
715 0.3
716 0.28
717 0.3
718 0.33
719 0.36
720 0.36
721 0.41
722 0.37
723 0.39
724 0.39
725 0.36
726 0.33
727 0.28
728 0.28
729 0.24
730 0.22
731 0.18
732 0.17
733 0.18
734 0.16
735 0.16
736 0.17
737 0.18
738 0.22
739 0.24
740 0.27
741 0.26
742 0.29
743 0.28
744 0.27
745 0.25
746 0.25
747 0.27
748 0.35
749 0.43
750 0.46
751 0.45
752 0.45
753 0.45
754 0.42
755 0.4
756 0.37
757 0.35
758 0.35
759 0.4
760 0.45
761 0.48