Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3PSM1

Protein Details
Accession A0A5C3PSM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-76ETMNAEKEKKWRQSLERRAKKGEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-83KEKKWRQSLERRAKKGEGHKAKKAK
559-564PSGKRK
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_mito 11, nucl 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002905  Trm1  
IPR042296  tRNA_met_Trm1_C  
Gene Ontology GO:0004809  F:tRNA (guanine-N2-)-methyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02005  TRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51626  SAM_MT_TRM1  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MTVPASFVVPEGYTLHKENTSAILLPASNDAFLNPVQEFNRDLSVACIRTWGETMNAEKEKKWRQSLERRAKKGEGHKAKKAKTDGNTDTSTVTEPSTEAAPAEGPSEDTAKPQTQPEFRPHGFVILEALSATGLRSIRYANEIPSVKHVIANDLSPAAVEAMRRNVELNDLHEKEEAPAEGTEKPKVRPAKVKVNEGDACALMYNHRMERNRVDVVDLDPYGTAAPFIDAAVQCVNDGGLLCVTCTDMSVLATANYPEKCFSNYGGAPVKAEYCHEAALRLVLHTLATSAARYGRYIYPVLSLSIDFYVRLFVRVYTAPIDVKKVFSKTAVYYVCSGCQSFYEQPLGRMIENTTEKNGKVNANVHFKVQTGPSVSERCPECNSAMHVAGPMWSGSLHDKEFVSNVLSHVEANEDKYGTAARMKGMLTVAKEELDTPFYFTPSKVSSHFHCVCPSLDETASALLHAGHKISRSHACAGSLKTTATYADIHDIFRSWVKTHPVRMDKVSETSPTRVLLSKEAKIEANFKRHPDSVTPSSKVKLVRYQQNPTPNWGPGAKPSGKRKRNEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.24
4 0.24
5 0.24
6 0.26
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.19
13 0.2
14 0.17
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.15
21 0.12
22 0.15
23 0.16
24 0.18
25 0.2
26 0.2
27 0.23
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.26
32 0.25
33 0.23
34 0.24
35 0.21
36 0.22
37 0.23
38 0.2
39 0.16
40 0.19
41 0.23
42 0.28
43 0.34
44 0.33
45 0.35
46 0.43
47 0.5
48 0.55
49 0.59
50 0.59
51 0.64
52 0.74
53 0.82
54 0.85
55 0.85
56 0.84
57 0.82
58 0.79
59 0.76
60 0.75
61 0.75
62 0.75
63 0.72
64 0.75
65 0.78
66 0.78
67 0.78
68 0.75
69 0.72
70 0.67
71 0.69
72 0.65
73 0.62
74 0.59
75 0.52
76 0.45
77 0.38
78 0.33
79 0.24
80 0.19
81 0.13
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.17
98 0.18
99 0.2
100 0.24
101 0.3
102 0.33
103 0.37
104 0.42
105 0.47
106 0.45
107 0.49
108 0.45
109 0.41
110 0.35
111 0.31
112 0.26
113 0.17
114 0.17
115 0.11
116 0.11
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.23
130 0.25
131 0.25
132 0.29
133 0.31
134 0.26
135 0.27
136 0.25
137 0.22
138 0.21
139 0.21
140 0.17
141 0.13
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.25
158 0.25
159 0.26
160 0.26
161 0.26
162 0.23
163 0.23
164 0.19
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.15
169 0.16
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.27
174 0.32
175 0.36
176 0.41
177 0.47
178 0.53
179 0.56
180 0.63
181 0.58
182 0.6
183 0.56
184 0.48
185 0.43
186 0.31
187 0.26
188 0.18
189 0.16
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.17
195 0.19
196 0.22
197 0.26
198 0.31
199 0.3
200 0.28
201 0.27
202 0.23
203 0.23
204 0.23
205 0.18
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.07
217 0.06
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.16
251 0.16
252 0.2
253 0.22
254 0.22
255 0.2
256 0.2
257 0.19
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.07
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.07
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.1
302 0.1
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.17
309 0.15
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.19
316 0.16
317 0.23
318 0.22
319 0.21
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.2
324 0.19
325 0.12
326 0.12
327 0.15
328 0.14
329 0.15
330 0.2
331 0.2
332 0.21
333 0.24
334 0.24
335 0.2
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.21
343 0.21
344 0.22
345 0.25
346 0.2
347 0.21
348 0.25
349 0.29
350 0.35
351 0.36
352 0.35
353 0.32
354 0.31
355 0.3
356 0.25
357 0.22
358 0.16
359 0.18
360 0.2
361 0.23
362 0.23
363 0.26
364 0.27
365 0.27
366 0.27
367 0.27
368 0.24
369 0.23
370 0.26
371 0.24
372 0.23
373 0.2
374 0.18
375 0.16
376 0.15
377 0.13
378 0.09
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.11
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.16
413 0.18
414 0.16
415 0.18
416 0.18
417 0.16
418 0.16
419 0.15
420 0.14
421 0.15
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.16
426 0.17
427 0.17
428 0.2
429 0.18
430 0.21
431 0.19
432 0.23
433 0.25
434 0.34
435 0.38
436 0.36
437 0.36
438 0.35
439 0.34
440 0.33
441 0.31
442 0.25
443 0.21
444 0.19
445 0.18
446 0.18
447 0.17
448 0.13
449 0.12
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.1
455 0.13
456 0.14
457 0.19
458 0.24
459 0.26
460 0.31
461 0.31
462 0.34
463 0.36
464 0.37
465 0.36
466 0.32
467 0.28
468 0.24
469 0.23
470 0.19
471 0.17
472 0.15
473 0.12
474 0.17
475 0.18
476 0.18
477 0.18
478 0.19
479 0.19
480 0.22
481 0.23
482 0.18
483 0.22
484 0.3
485 0.35
486 0.42
487 0.5
488 0.53
489 0.55
490 0.58
491 0.58
492 0.53
493 0.52
494 0.47
495 0.43
496 0.4
497 0.39
498 0.37
499 0.32
500 0.31
501 0.3
502 0.3
503 0.33
504 0.35
505 0.36
506 0.37
507 0.38
508 0.39
509 0.38
510 0.45
511 0.43
512 0.46
513 0.46
514 0.47
515 0.51
516 0.5
517 0.52
518 0.49
519 0.51
520 0.5
521 0.54
522 0.54
523 0.51
524 0.5
525 0.51
526 0.49
527 0.46
528 0.47
529 0.48
530 0.54
531 0.59
532 0.66
533 0.69
534 0.74
535 0.7
536 0.68
537 0.65
538 0.56
539 0.52
540 0.47
541 0.42
542 0.39
543 0.46
544 0.45
545 0.48
546 0.57
547 0.64
548 0.69
549 0.75