Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PDN5

Protein Details
Accession A0A5C3PDN5    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-208TEGGRRRRTKRPRTDGSGPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-181AERRQRSREIARERTWQARAGQARRKRKAL
191-201GGRRRRTKRPR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MQSSSISRTSSYTASFYSRATDVLPIIPTRSTSTSSIASSTALSISPPPVDRTLTAVEEPERPNNAFLIFHQSLIRKATALQALVTQSGQKTRKLDHSTFAAMLWKDDRNAAMRAEFTAHFERRKAEYAAKKKLYEEALREGRPTIPLPTPAERRQRSREIARERTWQARAGQARRKRKALDAESVDGTEGGRRRRTKRPRTDGSGPSSSASASSSCSSSSLDAMSMPSSPFGSDGTSLEPSSDNGDFSMDMSVSFPSFPLELGQSQGSMNLPTYQTLAFDSVVSRAAMYAPYHEGYAAAMDPENMQHNVISQTTMYASYHEGYYAAVMDSENIPLQQMTVEQEGQSGQQPSLPQQSALRTEPAEVELAVRDAHSVGLAVDTSVPPDSTDPSSIMRMQLAAAAFNMELQLTMLGVPLDGDDDTSIDFGFPPIDGEVAVDSDATGFDARLGRQYPTNDARPSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.25
4 0.25
5 0.23
6 0.22
7 0.21
8 0.21
9 0.18
10 0.2
11 0.22
12 0.19
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.22
17 0.23
18 0.24
19 0.23
20 0.26
21 0.28
22 0.28
23 0.28
24 0.24
25 0.21
26 0.18
27 0.17
28 0.14
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.15
34 0.16
35 0.19
36 0.2
37 0.22
38 0.22
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.25
43 0.25
44 0.25
45 0.29
46 0.31
47 0.32
48 0.32
49 0.3
50 0.3
51 0.29
52 0.28
53 0.22
54 0.2
55 0.25
56 0.22
57 0.22
58 0.25
59 0.25
60 0.26
61 0.29
62 0.28
63 0.19
64 0.19
65 0.24
66 0.23
67 0.22
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.2
73 0.16
74 0.14
75 0.22
76 0.24
77 0.25
78 0.28
79 0.31
80 0.41
81 0.47
82 0.47
83 0.44
84 0.46
85 0.45
86 0.42
87 0.38
88 0.34
89 0.26
90 0.26
91 0.24
92 0.2
93 0.18
94 0.19
95 0.2
96 0.18
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.17
104 0.19
105 0.24
106 0.27
107 0.27
108 0.28
109 0.31
110 0.32
111 0.36
112 0.34
113 0.35
114 0.42
115 0.49
116 0.58
117 0.59
118 0.57
119 0.54
120 0.56
121 0.53
122 0.48
123 0.43
124 0.42
125 0.43
126 0.42
127 0.42
128 0.37
129 0.33
130 0.3
131 0.27
132 0.22
133 0.18
134 0.21
135 0.25
136 0.3
137 0.35
138 0.4
139 0.49
140 0.5
141 0.54
142 0.57
143 0.61
144 0.62
145 0.64
146 0.66
147 0.65
148 0.69
149 0.67
150 0.67
151 0.63
152 0.62
153 0.56
154 0.5
155 0.42
156 0.4
157 0.43
158 0.43
159 0.48
160 0.51
161 0.59
162 0.61
163 0.65
164 0.6
165 0.59
166 0.61
167 0.58
168 0.58
169 0.51
170 0.49
171 0.44
172 0.42
173 0.35
174 0.25
175 0.2
176 0.14
177 0.13
178 0.14
179 0.2
180 0.26
181 0.31
182 0.42
183 0.53
184 0.61
185 0.69
186 0.76
187 0.77
188 0.8
189 0.83
190 0.78
191 0.74
192 0.66
193 0.55
194 0.46
195 0.38
196 0.3
197 0.21
198 0.16
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.09
285 0.07
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.14
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.17
339 0.24
340 0.24
341 0.21
342 0.23
343 0.27
344 0.3
345 0.31
346 0.31
347 0.24
348 0.24
349 0.24
350 0.22
351 0.19
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.1
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.16
378 0.18
379 0.21
380 0.22
381 0.22
382 0.19
383 0.17
384 0.16
385 0.17
386 0.15
387 0.12
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.09
433 0.13
434 0.13
435 0.19
436 0.21
437 0.23
438 0.28
439 0.31
440 0.37
441 0.41
442 0.48