Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PDN3

Protein Details
Accession A0A5C3PDN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-271QRKKRFTSFHFRKRNQDRNVHydrophilic
493-519AVPTIPANPRRKRKAKGWFCPVCRQPYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
501-508PRRKRKAK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045194  MGRN1/RNF157-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
Amino Acid Sequences MASFANWYNHQYATWNRVRDIQQTSYIARVDTNASRTAAAMAQTHVVVDINTVAGTASPQSAAGTKSNDTLFGPNIGVLGTGPEWTERPDKSEDVLTPEVVKSWIAKSKDTRYSTTTLQALVNLKRPTLRLSPLENDASEDEDHVDQHHHALEFEYDCDAPKCAIRVHVLLSPKHSMAGKPDASGLSRLLVFETVTDGGFGKTLKFEDGAMLELGRFDHHAATIVDDAARASPSEPEKPSAAETPSGEPAQQRKKRFTSFHFRKRNQDRNVAGPALAVLDADTHPAEGEDKSKDEKEEDAGVRVTISLSALDEEGKELPSPNEQVTYLHIVRFGAPPVVVEGAEQAEDKRPWVVKVVKREATIGMHTFHLHEIYGLSANSTTSTQATAPPPTAQLDTHTYPPAVPPTTTDDEPSSECLLCLSSPREVVLLPCRHLVACRECALNMIEFGAGGTIVHNDSETTAPGADAPAADVGAAEANAEGAAEGAPPVPAAVPTIPANPRRKRKAKGWFCPVCRQPYTSLLRITTTPPEKDEGRDSTSIDDHVPPPSTTAVNAPTVPPPTAQPERGRFGGLLRAFGRDRGAQPDLERGQATAATAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.39
4 0.46
5 0.49
6 0.51
7 0.52
8 0.48
9 0.47
10 0.48
11 0.48
12 0.44
13 0.42
14 0.34
15 0.28
16 0.25
17 0.23
18 0.24
19 0.26
20 0.25
21 0.25
22 0.25
23 0.25
24 0.25
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.13
33 0.12
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.13
50 0.15
51 0.18
52 0.18
53 0.22
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.2
60 0.19
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.08
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.13
73 0.19
74 0.17
75 0.21
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.32
80 0.3
81 0.32
82 0.33
83 0.29
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.19
88 0.18
89 0.13
90 0.16
91 0.22
92 0.22
93 0.27
94 0.34
95 0.42
96 0.51
97 0.53
98 0.52
99 0.5
100 0.52
101 0.49
102 0.48
103 0.4
104 0.33
105 0.29
106 0.29
107 0.3
108 0.29
109 0.34
110 0.29
111 0.29
112 0.29
113 0.3
114 0.31
115 0.31
116 0.33
117 0.31
118 0.35
119 0.38
120 0.41
121 0.42
122 0.36
123 0.33
124 0.29
125 0.26
126 0.21
127 0.18
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.13
133 0.1
134 0.12
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.15
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.23
156 0.26
157 0.25
158 0.28
159 0.28
160 0.25
161 0.25
162 0.24
163 0.21
164 0.22
165 0.28
166 0.25
167 0.23
168 0.25
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.19
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.09
220 0.12
221 0.17
222 0.18
223 0.2
224 0.2
225 0.21
226 0.23
227 0.22
228 0.2
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.23
237 0.31
238 0.36
239 0.38
240 0.42
241 0.49
242 0.55
243 0.58
244 0.58
245 0.59
246 0.63
247 0.7
248 0.73
249 0.71
250 0.74
251 0.79
252 0.82
253 0.76
254 0.75
255 0.66
256 0.61
257 0.61
258 0.51
259 0.4
260 0.3
261 0.24
262 0.16
263 0.13
264 0.08
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.05
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.11
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.16
320 0.14
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.19
340 0.27
341 0.27
342 0.37
343 0.44
344 0.45
345 0.45
346 0.46
347 0.41
348 0.35
349 0.34
350 0.25
351 0.19
352 0.16
353 0.15
354 0.15
355 0.13
356 0.12
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.08
371 0.08
372 0.12
373 0.14
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.16
378 0.17
379 0.18
380 0.14
381 0.15
382 0.19
383 0.2
384 0.22
385 0.22
386 0.2
387 0.19
388 0.2
389 0.22
390 0.17
391 0.16
392 0.15
393 0.21
394 0.25
395 0.26
396 0.26
397 0.23
398 0.23
399 0.24
400 0.25
401 0.2
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.13
406 0.11
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.15
415 0.21
416 0.23
417 0.22
418 0.23
419 0.24
420 0.23
421 0.25
422 0.28
423 0.25
424 0.26
425 0.26
426 0.26
427 0.25
428 0.27
429 0.27
430 0.21
431 0.15
432 0.12
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.04
478 0.05
479 0.07
480 0.07
481 0.1
482 0.11
483 0.17
484 0.22
485 0.3
486 0.4
487 0.47
488 0.57
489 0.65
490 0.72
491 0.74
492 0.79
493 0.82
494 0.84
495 0.85
496 0.86
497 0.85
498 0.82
499 0.85
500 0.81
501 0.78
502 0.7
503 0.62
504 0.55
505 0.55
506 0.56
507 0.51
508 0.49
509 0.42
510 0.41
511 0.4
512 0.39
513 0.39
514 0.38
515 0.35
516 0.33
517 0.36
518 0.36
519 0.38
520 0.42
521 0.37
522 0.37
523 0.36
524 0.35
525 0.35
526 0.34
527 0.32
528 0.27
529 0.26
530 0.22
531 0.24
532 0.26
533 0.22
534 0.23
535 0.24
536 0.22
537 0.19
538 0.23
539 0.22
540 0.22
541 0.23
542 0.22
543 0.24
544 0.27
545 0.27
546 0.23
547 0.23
548 0.28
549 0.34
550 0.38
551 0.42
552 0.46
553 0.51
554 0.51
555 0.51
556 0.43
557 0.39
558 0.42
559 0.34
560 0.33
561 0.28
562 0.32
563 0.31
564 0.32
565 0.34
566 0.3
567 0.32
568 0.33
569 0.34
570 0.32
571 0.33
572 0.41
573 0.39
574 0.37
575 0.35
576 0.28
577 0.27
578 0.25