Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TRR1

Protein Details
Accession A7TRR1    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-51VPTNCNGKNIFKNKQKRNNSPQLKISDHydrophilic
145-169VSLDSKKRRAPRKRLTSHQKQAHNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-166KKRRAPRKRLTSHQKQA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG vpo:Kpol_367p10  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11395  bHLHzip_SREBP_like  
Amino Acid Sequences MSDNCDLTNIKRIEESMPSLDSWTVPTNCNGKNIFKNKQKRNNSPQLKISDTSSLSSSSGSWFEPLENIISSGSNSSNSSPSDNSNELNMNDVDIKLESSITDANSNQFLINGYNMKKENDENFPDLPDFNTFLRNDNSIVDLNVSLDSKKRRAPRKRLTSHQKQAHNKIEKRYRININTKIAKLQQIIPWVANEQTAFEVSDSASKGKGSPPSQDDTISLSNGANNSTKLNKSMILEKAVDYILYLQNNERLYEMEVQRLKSELQSLKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.26
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.25
8 0.22
9 0.21
10 0.23
11 0.21
12 0.21
13 0.26
14 0.31
15 0.32
16 0.38
17 0.38
18 0.38
19 0.46
20 0.53
21 0.58
22 0.61
23 0.7
24 0.74
25 0.82
26 0.86
27 0.86
28 0.89
29 0.9
30 0.89
31 0.86
32 0.83
33 0.78
34 0.72
35 0.62
36 0.54
37 0.49
38 0.41
39 0.35
40 0.29
41 0.24
42 0.2
43 0.19
44 0.17
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.21
73 0.23
74 0.2
75 0.22
76 0.19
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.06
84 0.07
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.17
103 0.17
104 0.18
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.26
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.21
114 0.18
115 0.14
116 0.13
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.15
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.06
134 0.09
135 0.12
136 0.14
137 0.2
138 0.27
139 0.37
140 0.47
141 0.58
142 0.65
143 0.74
144 0.79
145 0.84
146 0.86
147 0.87
148 0.87
149 0.83
150 0.82
151 0.79
152 0.8
153 0.79
154 0.79
155 0.72
156 0.72
157 0.73
158 0.7
159 0.68
160 0.67
161 0.66
162 0.65
163 0.69
164 0.68
165 0.67
166 0.65
167 0.6
168 0.56
169 0.5
170 0.45
171 0.39
172 0.35
173 0.3
174 0.29
175 0.29
176 0.26
177 0.25
178 0.22
179 0.2
180 0.17
181 0.14
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.23
197 0.22
198 0.28
199 0.31
200 0.36
201 0.37
202 0.37
203 0.34
204 0.31
205 0.31
206 0.24
207 0.21
208 0.16
209 0.17
210 0.16
211 0.18
212 0.14
213 0.13
214 0.16
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.23
219 0.24
220 0.24
221 0.31
222 0.31
223 0.31
224 0.3
225 0.29
226 0.29
227 0.26
228 0.24
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.17
233 0.18
234 0.17
235 0.22
236 0.23
237 0.23
238 0.21
239 0.18
240 0.2
241 0.27
242 0.27
243 0.31
244 0.34
245 0.35
246 0.35
247 0.35
248 0.33
249 0.27
250 0.34