FuNGI

A0A5C3PNZ7

Protein Details

Accession

A0A5C3PNZ7

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
67-97	EEPDDEEEERRKRRKRRKKRHHPISEDEDEG	Basic
198-224	MDEQEREAKRREKRRLEKARRRAMGSR	Basic
1246-1265	EMQARKKRAEVDRTRRVIKH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
76-88	RRKRRKRRKKRHH
204-222	EAKRREKRRLEKARRRAMG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041692 HHH_9 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR010994 RuvA_2-like IPR036860 SH2_dom_sf IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR042066 Spt6_death-like IPR032706 Spt6_HHH IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR035420 Spt6_SH2 IPR035019 Spt6_SH2_N IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF17674 HHH_9 PF14641 HTH_44 PF14633 SH2_2 PF14632 SPT6_acidic PF14639 YqgF
CDD	cd09918 SH2_Nterm_SPT6_like

Amino Acid Sequences

MSSPTREHDSARREEDDPMEGSAQEEEEEGDAVVGNDSGDSSEEPEEDAEEERRIREGFIVDEDEDEEPDDEEEERRKRRKRRKKRHHPISEDEDEGLDEDDLELLQENTGGTFGRRLTKGRPRDESPPVASSSRHRNVIDSSDEDLDDDNYPRVQDIQNIWDDERAAAGRDDDDDVDMDDMDNFIEYEDEEEDGGAMDEQEREAKRREKRRLEKARRRAMGSRPELAGIDANAWDEIHEVFGDGHEYDWALVDDEDAGYDEEQPKPEMKYQDVFEPSEIRARLLTEDDDLIRAQDIPERMQLATSALSASSTLSTHKELTENDLDEAATWVITRLSSRKERDFFRGDGQYHRYLPQLVEAITSALRYIFVQEFEVPYIWMHKRDYISCFDPDNPKLHIELLSLDDLWRIYALGQKYRSLIERRGALDALYTRLGVSDEYFDNVVRQRVETAEMAADATEWLGMKYRDNKKSNFDIQFHDDEEHVETRKHKMPSRVSAYELARKTIVSKLAEGFGIRSHEVVQNFIAGHNTHFVEEQELHPLAYAEQFVDPDATRAQPAEELLARARMIVATELGKDPLLRQEIRNAFKRNALVSVLPTERGVSKIDEHHPYYNFKYLHNKSAGDMLQSPQFLNILAAETDHLVTVSITLSPEAKSTFERKLNDAFASDSFSDTARAWNEERSRVVQEALEQHLLPVGVKWTREWIREETEDYLARQCARTLRERIDVSPFLGRDPEKRRGDTPSVLAMSWGKGDPHKDSIALVFLDEAGRLREHTKLDNLFGTENQDEFLDIVKRRAPDVIGIGGFSIATTKLARRIKELLGKTNDSNDNDATSGGGWGESSRSNELLSTPVIYVHDEVARLYQHSRRADEEFSALSPLSKYCVGLARYVQSPLNEYAALGSDITAISFEEDFQQLLPKEKLLSALERTLVDVVNKVGVDINRAVTDSYYQHLLQFVAGLGPRKAQVLVKKIASMGGNLVNRDQFIKNGLLTTKIFINAAAFLRIVQDSDPKPGKNRHGEEIDVPDPLDSTRVHPEDYELARKMATDALELDEEDIHDEHPSHVVSVIISDADNEKKLDELNLDDFAVSMYRTNQDKKRHVLNVIREELLRPYGERREPYVQPSAWQVLTMLTGETERTLHTGLIVSVQVMRAKEAFVAVRLDSGIEGTIARAFLTDAGVPCDSICKPGQTLSGVIMNVVMDLPNDNFKVELCSRETDVAAGDSQYRRVKHDEHWNLAQADRDSEMQARKKRAEVDRTRRVIKHPNFHNFNAAQAEQYLEQQQRGDVVIRPSSKGHNHLAVTWKVDDKLYQH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.49
3	0.45
4	0.39
5	0.33
6	0.28
7	0.24
8	0.23
9	0.19
10	0.17
11	0.13
12	0.11
13	0.09
14	0.09
15	0.09
16	0.08
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.06
23	0.05
24	0.05
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.1
29	0.11
30	0.11
31	0.12
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.15
36	0.15
37	0.17
38	0.19
39	0.19
40	0.22
41	0.21
42	0.21
43	0.22
44	0.22
45	0.2
46	0.22
47	0.25
48	0.23
49	0.23
50	0.24
51	0.21
52	0.19
53	0.18
54	0.14
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.13
60	0.21
61	0.28
62	0.36
63	0.45
64	0.55
65	0.65
66	0.75
67	0.83
68	0.87
69	0.91
70	0.93
71	0.95
72	0.97
73	0.98
74	0.98
75	0.95
76	0.93
77	0.91
78	0.85
79	0.75
80	0.64
81	0.53
82	0.42
83	0.34
84	0.25
85	0.15
86	0.1
87	0.08
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.1
101	0.13
102	0.19
103	0.22
104	0.25
105	0.34
106	0.44
107	0.53
108	0.58
109	0.64
110	0.62
111	0.68
112	0.73
113	0.71
114	0.66
115	0.6
116	0.55
117	0.49
118	0.45
119	0.43
120	0.45
121	0.44
122	0.45
123	0.42
124	0.41
125	0.44
126	0.47
127	0.46
128	0.39
129	0.36
130	0.31
131	0.31
132	0.28
133	0.25
134	0.21
135	0.18
136	0.16
137	0.15
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.16
142	0.15
143	0.19
144	0.22
145	0.26
146	0.3
147	0.32
148	0.32
149	0.31
150	0.3
151	0.24
152	0.23
153	0.17
154	0.14
155	0.12
156	0.13
157	0.12
158	0.13
159	0.14
160	0.12
161	0.13
162	0.11
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.09
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.07
188	0.12
189	0.14
190	0.17
191	0.24
192	0.32
193	0.4
194	0.51
195	0.61
196	0.67
197	0.76
198	0.84
199	0.88
200	0.92
201	0.93
202	0.94
203	0.94
204	0.88
205	0.84
206	0.8
207	0.77
208	0.76
209	0.7
210	0.64
211	0.54
212	0.5
213	0.44
214	0.38
215	0.3
216	0.2
217	0.16
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.09
248	0.12
249	0.13
250	0.15
251	0.16
252	0.17
253	0.2
254	0.25
255	0.26
256	0.28
257	0.31
258	0.31
259	0.37
260	0.38
261	0.36
262	0.32
263	0.31
264	0.28
265	0.3
266	0.28
267	0.22
268	0.19
269	0.19
270	0.19
271	0.18
272	0.19
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.15
277	0.14
278	0.13
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.11
283	0.12
284	0.13
285	0.16
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.11
293	0.09
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.14
305	0.17
306	0.17
307	0.23
308	0.26
309	0.25
310	0.24
311	0.23
312	0.22
313	0.19
314	0.2
315	0.13
316	0.08
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.08
322	0.1
323	0.16
324	0.24
325	0.3
326	0.38
327	0.43
328	0.47
329	0.53
330	0.55
331	0.51
332	0.5
333	0.51
334	0.45
335	0.46
336	0.47
337	0.44
338	0.4
339	0.39
340	0.34
341	0.28
342	0.27
343	0.24
344	0.21
345	0.17
346	0.16
347	0.14
348	0.14
349	0.12
350	0.12
351	0.08
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.11
359	0.12
360	0.13
361	0.14
362	0.14
363	0.12
364	0.1
365	0.16
366	0.16
367	0.18
368	0.18
369	0.21
370	0.24
371	0.27
372	0.3
373	0.3
374	0.32
375	0.31
376	0.32
377	0.31
378	0.35
379	0.34
380	0.33
381	0.3
382	0.27
383	0.26
384	0.25
385	0.22
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.08
396	0.05
397	0.05
398	0.09
399	0.12
400	0.17
401	0.19
402	0.2
403	0.21
404	0.23
405	0.28
406	0.28
407	0.3
408	0.28
409	0.32
410	0.32
411	0.33
412	0.31
413	0.26
414	0.24
415	0.2
416	0.18
417	0.14
418	0.12
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.08
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.13
431	0.15
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.16
437	0.14
438	0.13
439	0.11
440	0.1
441	0.1
442	0.09
443	0.08
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.07
450	0.07
451	0.1
452	0.2
453	0.29
454	0.38
455	0.43
456	0.46
457	0.49
458	0.57
459	0.62
460	0.59
461	0.52
462	0.48
463	0.48
464	0.47
465	0.42
466	0.35
467	0.27
468	0.21
469	0.22
470	0.19
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.2
475	0.26
476	0.3
477	0.31
478	0.38
479	0.44
480	0.52
481	0.58
482	0.55
483	0.51
484	0.52
485	0.51
486	0.5
487	0.43
488	0.35
489	0.27
490	0.25
491	0.24
492	0.22
493	0.24
494	0.17
495	0.18
496	0.18
497	0.18
498	0.19
499	0.17
500	0.14
501	0.11
502	0.12
503	0.11
504	0.1
505	0.11
506	0.14
507	0.14
508	0.15
509	0.13
510	0.12
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.09
515	0.09
516	0.11
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.11
522	0.12
523	0.12
524	0.13
525	0.13
526	0.13
527	0.12
528	0.12
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.07
561	0.08
562	0.08
563	0.07
564	0.08
565	0.11
566	0.14
567	0.14
568	0.14
569	0.22
570	0.29
571	0.33
572	0.4
573	0.39
574	0.37
575	0.39
576	0.4
577	0.33
578	0.28
579	0.25
580	0.18
581	0.15
582	0.18
583	0.15
584	0.14
585	0.13
586	0.12
587	0.11
588	0.11
589	0.12
590	0.09
591	0.11
592	0.15
593	0.19
594	0.23
595	0.25
596	0.27
597	0.28
598	0.3
599	0.3
600	0.32
601	0.29
602	0.27
603	0.34
604	0.33
605	0.37
606	0.37
607	0.35
608	0.29
609	0.33
610	0.32
611	0.23
612	0.22
613	0.17
614	0.17
615	0.17
616	0.16
617	0.11
618	0.1
619	0.09
620	0.08
621	0.07
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.09
643	0.13
644	0.17
645	0.22
646	0.23
647	0.24
648	0.27
649	0.28
650	0.26
651	0.24
652	0.2
653	0.15
654	0.17
655	0.15
656	0.12
657	0.1
658	0.1
659	0.11
660	0.09
661	0.11
662	0.09
663	0.11
664	0.12
665	0.16
666	0.18
667	0.19
668	0.21
669	0.21
670	0.22
671	0.21
672	0.21
673	0.16
674	0.16
675	0.17
676	0.18
677	0.16
678	0.14
679	0.13
680	0.13
681	0.13
682	0.1
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.14
689	0.17
690	0.2
691	0.23
692	0.24
693	0.27
694	0.28
695	0.3
696	0.25
697	0.25
698	0.23
699	0.21
700	0.19
701	0.16
702	0.15
703	0.14
704	0.13
705	0.14
706	0.16
707	0.22
708	0.24
709	0.27
710	0.33
711	0.34
712	0.34
713	0.35
714	0.33
715	0.28
716	0.27
717	0.23
718	0.17
719	0.19
720	0.18
721	0.2
722	0.26
723	0.34
724	0.34
725	0.36
726	0.38
727	0.41
728	0.45
729	0.4
730	0.36
731	0.31
732	0.28
733	0.26
734	0.25
735	0.19
736	0.15
737	0.14
738	0.12
739	0.08
740	0.09
741	0.11
742	0.13
743	0.16
744	0.16
745	0.15
746	0.15
747	0.15
748	0.15
749	0.13
750	0.1
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.06
755	0.06
756	0.05
757	0.05
758	0.06
759	0.07
760	0.11
761	0.12
762	0.14
763	0.19
764	0.2
765	0.21
766	0.21
767	0.21
768	0.19
769	0.17
770	0.19
771	0.15
772	0.13
773	0.12
774	0.11
775	0.1
776	0.09
777	0.11
778	0.11
779	0.11
780	0.12
781	0.15
782	0.15
783	0.16
784	0.17
785	0.15
786	0.13
787	0.15
788	0.15
789	0.13
790	0.12
791	0.11
792	0.1
793	0.09
794	0.07
795	0.06
796	0.03
797	0.05
798	0.05
799	0.06
800	0.14
801	0.18
802	0.19
803	0.23
804	0.27
805	0.3
806	0.38
807	0.4
808	0.4
809	0.41
810	0.43
811	0.4
812	0.42
813	0.42
814	0.35
815	0.35
816	0.27
817	0.23
818	0.21
819	0.2
820	0.14
821	0.09
822	0.08
823	0.06
824	0.05
825	0.04
826	0.04
827	0.06
828	0.07
829	0.09
830	0.1
831	0.11
832	0.11
833	0.11
834	0.12
835	0.12
836	0.11
837	0.1
838	0.09
839	0.09
840	0.1
841	0.1
842	0.1
843	0.1
844	0.1
845	0.09
846	0.09
847	0.1
848	0.1
849	0.1
850	0.12
851	0.15
852	0.21
853	0.24
854	0.26
855	0.27
856	0.3
857	0.31
858	0.3
859	0.28
860	0.21
861	0.19
862	0.18
863	0.15
864	0.12
865	0.11
866	0.09
867	0.1
868	0.09
869	0.09
870	0.09
871	0.15
872	0.16
873	0.18
874	0.19
875	0.2
876	0.21
877	0.22
878	0.22
879	0.17
880	0.19
881	0.18
882	0.18
883	0.15
884	0.14
885	0.12
886	0.12
887	0.12
888	0.09
889	0.07
890	0.06
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.04
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.07
899	0.07
900	0.08
901	0.08
902	0.12
903	0.12
904	0.16
905	0.17
906	0.16
907	0.17
908	0.17
909	0.21
910	0.18
911	0.21
912	0.19
913	0.2
914	0.21
915	0.2
916	0.2
917	0.18
918	0.16
919	0.13
920	0.11
921	0.1
922	0.1
923	0.1
924	0.09
925	0.11
926	0.11
927	0.13
928	0.14
929	0.15
930	0.13
931	0.13
932	0.13
933	0.11
934	0.13
935	0.11
936	0.12
937	0.13
938	0.13
939	0.13
940	0.14
941	0.14
942	0.11
943	0.11
944	0.09
945	0.08
946	0.1
947	0.11
948	0.1
949	0.11
950	0.12
951	0.12
952	0.13
953	0.15
954	0.21
955	0.25
956	0.3
957	0.3
958	0.3
959	0.3
960	0.31
961	0.28
962	0.22
963	0.18
964	0.19
965	0.2
966	0.19
967	0.21
968	0.18
969	0.18
970	0.21
971	0.19
972	0.13
973	0.15
974	0.16
975	0.15
976	0.17
977	0.17
978	0.17
979	0.17
980	0.18
981	0.17
982	0.15
983	0.15
984	0.13
985	0.13
986	0.13
987	0.13
988	0.13
989	0.11
990	0.1
991	0.12
992	0.12
993	0.11
994	0.09
995	0.15
996	0.15
997	0.23
998	0.28
999	0.27
1000	0.34
1001	0.4
1002	0.48
1003	0.52
1004	0.55
1005	0.54
1006	0.53
1007	0.54
1008	0.51
1009	0.51
1010	0.43
1011	0.34
1012	0.29
1013	0.22
1014	0.19
1015	0.17
1016	0.16
1017	0.09
1018	0.11
1019	0.19
1020	0.2
1021	0.21
1022	0.2
1023	0.23
1024	0.28
1025	0.31
1026	0.34
1027	0.28
1028	0.27
1029	0.26
1030	0.26
1031	0.25
1032	0.2
1033	0.17
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.14
1038	0.13
1039	0.13
1040	0.11
1041	0.1
1042	0.11
1043	0.1
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.09
1047	0.09
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.09
1056	0.07
1057	0.06
1058	0.07
1059	0.09
1060	0.11
1061	0.13
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.13
1066	0.14
1067	0.13
1068	0.15
1069	0.16
1070	0.17
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.13
1076	0.09
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.13
1080	0.18
1081	0.25
1082	0.32
1083	0.41
1084	0.49
1085	0.54
1086	0.62
1087	0.62
1088	0.66
1089	0.67
1090	0.7
1091	0.69
1092	0.65
1093	0.6
1094	0.51
1095	0.47
1096	0.41
1097	0.36
1098	0.27
1099	0.19
1100	0.2
1101	0.27
1102	0.32
1103	0.34
1104	0.37
1105	0.42
1106	0.44
1107	0.48
1108	0.5
1109	0.43
1110	0.39
1111	0.41
1112	0.39
1113	0.32
1114	0.29
1115	0.24
1116	0.17
1117	0.17
1118	0.16
1119	0.11
1120	0.07
1121	0.08
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.08
1126	0.1
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.11
1130	0.12
1131	0.11
1132	0.13
1133	0.12
1134	0.1
1135	0.11
1136	0.13
1137	0.15
1138	0.14
1139	0.15
1140	0.13
1141	0.14
1142	0.14
1143	0.16
1144	0.15
1145	0.14
1146	0.16
1147	0.14
1148	0.15
1149	0.14
1150	0.14
1151	0.11
1152	0.11
1153	0.09
1154	0.07
1155	0.07
1156	0.06
1157	0.08
1158	0.08
1159	0.07
1160	0.07
1161	0.07
1162	0.07
1163	0.09
1164	0.11
1165	0.11
1166	0.14
1167	0.15
1168	0.15
1169	0.14
1170	0.18
1171	0.16
1172	0.18
1173	0.19
1174	0.18
1175	0.19
1176	0.22
1177	0.26
1178	0.24
1179	0.24
1180	0.23
1181	0.25
1182	0.22
1183	0.21
1184	0.18
1185	0.14
1186	0.12
1187	0.12
1188	0.09
1189	0.05
1190	0.07
1191	0.09
1192	0.13
1193	0.13
1194	0.13
1195	0.13
1196	0.13
1197	0.2
1198	0.21
1199	0.24
1200	0.23
1201	0.26
1202	0.29
1203	0.31
1204	0.31
1205	0.24
1206	0.23
1207	0.2
1208	0.18
1209	0.15
1210	0.18
1211	0.17
1212	0.23
1213	0.28
1214	0.28
1215	0.31
1216	0.36
1217	0.39
1218	0.42
1219	0.52
1220	0.55
1221	0.57
1222	0.6
1223	0.62
1224	0.58
1225	0.55
1226	0.53
1227	0.42
1228	0.35
1229	0.3
1230	0.26
1231	0.22
1232	0.26
1233	0.33
1234	0.36
1235	0.42
1236	0.48
1237	0.5
1238	0.54
1239	0.61
1240	0.65
1241	0.68
1242	0.7
1243	0.73
1244	0.76
1245	0.8
1246	0.82
1247	0.76
1248	0.74
1249	0.74
1250	0.72
1251	0.72
1252	0.71
1253	0.74
1254	0.74
1255	0.72
1256	0.74
1257	0.63
1258	0.58
1259	0.54
1260	0.44
1261	0.35
1262	0.29
1263	0.29
1264	0.21
1265	0.23
1266	0.26
1267	0.22
1268	0.23
1269	0.23
1270	0.23
1271	0.22
1272	0.23
1273	0.23
1274	0.21
1275	0.25
1276	0.31
1277	0.32
1278	0.34
1279	0.35
1280	0.4
1281	0.44
1282	0.45
1283	0.46
1284	0.46
1285	0.46
1286	0.48
1287	0.53
1288	0.49
1289	0.47
1290	0.44
1291	0.41
1292	0.35
1293	0.34

A0A5C3PNZ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer