Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q4Y5

Protein Details
Accession A0A5C3Q4Y5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-192VETHKKLSATRKKRKAPEGYATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-185TRKKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.333, cyto 13.5, nucl 13, cyto_mito 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF08606  Prp19  
PF04564  U-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
Amino Acid Sequences MSFFCSISGEPPQDPVVSSKSGHVYERRLILKYITENGTDPITGDKLEEADLVSVKANPKAAPPRPPSASSIPALLQTLQNEWDAAMLETFALRQQYNSLRQELSYALYAQDAAQRVVARLIKERDAAREALSSVAATMNVDVPASGGDVEMGDADQEAGGLPADALEQIVETHKKLSATRKKRKAPEGYATPEDVKSYAAKHTIPSLHSPSPAGITSLAVSSANPSQFLTGGNDKVVQLYDRDTDKVLASLKGHTKKVTHVALRERQGDATLILSASADKIAKAWAHDEASGEYIPKATIRTHKGELTGLVVHPTSTLMALSSADRTWSIHDLASFSQVYRSPEFDDPFTSLAVHPDGVLLGVGTPGGSIRVYDLRAPSQLAAELTPSNGMPFTVNTFSFSENGYHLAAPDSLSSVAVWDLRKMKISKSLPLGDSFKVNKVVYDYSANLLAVGGNEGLRVFANKSWEELARFEEGGEVSDVVFGAQSREIWGVTGREVRIWGAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.23
4 0.22
5 0.23
6 0.25
7 0.28
8 0.3
9 0.34
10 0.36
11 0.38
12 0.41
13 0.48
14 0.47
15 0.44
16 0.42
17 0.4
18 0.41
19 0.39
20 0.4
21 0.34
22 0.32
23 0.31
24 0.32
25 0.3
26 0.24
27 0.2
28 0.17
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.13
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.11
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.19
45 0.17
46 0.25
47 0.34
48 0.39
49 0.46
50 0.5
51 0.55
52 0.58
53 0.6
54 0.58
55 0.54
56 0.53
57 0.44
58 0.41
59 0.33
60 0.3
61 0.29
62 0.24
63 0.2
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.15
83 0.22
84 0.3
85 0.33
86 0.35
87 0.33
88 0.33
89 0.35
90 0.3
91 0.25
92 0.19
93 0.16
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.18
105 0.2
106 0.18
107 0.24
108 0.27
109 0.27
110 0.31
111 0.32
112 0.32
113 0.32
114 0.32
115 0.26
116 0.24
117 0.22
118 0.19
119 0.17
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.11
162 0.13
163 0.16
164 0.27
165 0.35
166 0.45
167 0.55
168 0.64
169 0.71
170 0.78
171 0.84
172 0.83
173 0.8
174 0.78
175 0.75
176 0.71
177 0.65
178 0.58
179 0.5
180 0.41
181 0.33
182 0.25
183 0.18
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.17
191 0.19
192 0.2
193 0.23
194 0.27
195 0.26
196 0.26
197 0.26
198 0.22
199 0.21
200 0.19
201 0.15
202 0.1
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.14
239 0.2
240 0.23
241 0.25
242 0.24
243 0.24
244 0.25
245 0.31
246 0.33
247 0.29
248 0.29
249 0.35
250 0.4
251 0.43
252 0.42
253 0.36
254 0.31
255 0.29
256 0.25
257 0.18
258 0.12
259 0.08
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.16
288 0.2
289 0.25
290 0.28
291 0.29
292 0.3
293 0.29
294 0.27
295 0.23
296 0.19
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.1
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.17
323 0.15
324 0.12
325 0.14
326 0.16
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.21
331 0.25
332 0.27
333 0.25
334 0.24
335 0.22
336 0.22
337 0.2
338 0.17
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.11
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.06
359 0.09
360 0.11
361 0.14
362 0.16
363 0.17
364 0.19
365 0.2
366 0.18
367 0.16
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.1
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.12
382 0.14
383 0.14
384 0.17
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.17
390 0.15
391 0.17
392 0.15
393 0.13
394 0.12
395 0.13
396 0.12
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.09
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.14
408 0.18
409 0.19
410 0.26
411 0.27
412 0.29
413 0.36
414 0.39
415 0.41
416 0.45
417 0.5
418 0.45
419 0.49
420 0.5
421 0.41
422 0.44
423 0.4
424 0.36
425 0.37
426 0.35
427 0.31
428 0.31
429 0.32
430 0.28
431 0.3
432 0.27
433 0.23
434 0.25
435 0.23
436 0.19
437 0.17
438 0.15
439 0.1
440 0.1
441 0.08
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.09
448 0.1
449 0.11
450 0.18
451 0.18
452 0.21
453 0.23
454 0.26
455 0.27
456 0.27
457 0.28
458 0.25
459 0.25
460 0.22
461 0.22
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.15
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.08
470 0.09
471 0.07
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.11
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.17
480 0.16
481 0.19
482 0.25
483 0.23
484 0.24
485 0.25
486 0.25