Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q0R8

Protein Details
Accession A0A5C3Q0R8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-43QAPDHKCRKLSRPAKRSPESERQEHydrophilic
376-395EQLKEARRRARDGRKWILLFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
Amino Acid Sequences MAVSSRTREFREYVRQKEGQAPDHKCRKLSRPAKRSPESERQELLNKEYVKEAYNVFNHISTLTRMLSSVRKAYLNVDARGPPMIRHTPRTIDIAGGEQSWSDIRNLTNEERDQIDLQARVILSRCKDRVAQLEELEKRRAEHTASQQNPLTRLLPARLRQDDSTAASDFVAAHHASITWYLSRRLTEASQLLRDMQEERMKRQLERTRTLGSGAAREAAFLGSSPHLNPANITPPSPADSSASGSWLGGASNLASSFAASIGSSATFDPSHSASTIRPGGMSASTTMRDDWMSETDEEELELSASQIQQFEEENANILQNVQDTLASVQQAEARLMEISALQMELVTHLTKQTEQTEQLYEDAIATAATVEKGNEQLKEARRRARDGRKWILLFLIGASLSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.6
4 0.66
5 0.65
6 0.63
7 0.63
8 0.63
9 0.65
10 0.71
11 0.72
12 0.67
13 0.67
14 0.67
15 0.68
16 0.71
17 0.72
18 0.72
19 0.8
20 0.85
21 0.85
22 0.83
23 0.81
24 0.81
25 0.77
26 0.74
27 0.66
28 0.6
29 0.61
30 0.57
31 0.52
32 0.49
33 0.43
34 0.37
35 0.38
36 0.35
37 0.3
38 0.29
39 0.27
40 0.26
41 0.27
42 0.28
43 0.26
44 0.25
45 0.23
46 0.22
47 0.21
48 0.16
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.21
55 0.23
56 0.26
57 0.25
58 0.26
59 0.27
60 0.29
61 0.36
62 0.36
63 0.34
64 0.33
65 0.32
66 0.31
67 0.34
68 0.32
69 0.23
70 0.24
71 0.32
72 0.32
73 0.36
74 0.39
75 0.4
76 0.42
77 0.45
78 0.39
79 0.31
80 0.28
81 0.25
82 0.21
83 0.17
84 0.15
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.13
93 0.17
94 0.19
95 0.24
96 0.24
97 0.26
98 0.25
99 0.27
100 0.24
101 0.22
102 0.23
103 0.18
104 0.17
105 0.18
106 0.16
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.23
112 0.24
113 0.23
114 0.26
115 0.29
116 0.35
117 0.37
118 0.38
119 0.33
120 0.4
121 0.43
122 0.45
123 0.43
124 0.35
125 0.31
126 0.28
127 0.28
128 0.23
129 0.25
130 0.31
131 0.38
132 0.4
133 0.43
134 0.44
135 0.44
136 0.42
137 0.37
138 0.29
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.23
143 0.26
144 0.31
145 0.32
146 0.34
147 0.33
148 0.34
149 0.33
150 0.3
151 0.28
152 0.22
153 0.19
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.1
158 0.1
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.18
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.14
184 0.17
185 0.18
186 0.2
187 0.26
188 0.27
189 0.27
190 0.34
191 0.37
192 0.38
193 0.41
194 0.43
195 0.39
196 0.38
197 0.38
198 0.32
199 0.26
200 0.21
201 0.17
202 0.15
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.15
222 0.15
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.12
227 0.13
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.16
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.15
268 0.14
269 0.15
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.09
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.14
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.08
308 0.09
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.11
338 0.12
339 0.16
340 0.19
341 0.22
342 0.25
343 0.27
344 0.29
345 0.29
346 0.28
347 0.26
348 0.22
349 0.17
350 0.15
351 0.12
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.14
361 0.17
362 0.18
363 0.2
364 0.28
365 0.36
366 0.46
367 0.52
368 0.56
369 0.59
370 0.66
371 0.73
372 0.76
373 0.77
374 0.77
375 0.8
376 0.8
377 0.76
378 0.69
379 0.61
380 0.51
381 0.42
382 0.32
383 0.25
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.09
388 0.08
389 0.07