Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3PTR9

Protein Details
Accession A0A5C3PTR9    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSSSAQKLTKKQKKALAFRERKGGKHydrophilic
254-275SETRLEKVKKRNKELHEQRTKQBasic
330-355EGAAAAKKRGSKKGKNRPPRALGTGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-29TKKQKKALAFRERKGGKGKGK
85-96GEKGKGKKRKRG
131-135KKKRK
258-288LEKVKKRNKELHEQRTKQVLKGASGKKTGGK
335-349AKKRGSKKGKNRPPR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSSSAQKLTKKQKKALAFRERKGGKGKGKATSFDELDNDVPVAENQDLAEAGLDADAAPVEAPAGRKAGVQKGGAQDAGGVGDGGEKGKGKKRKRGAEDEGADTAAHAAGAGAAEGKEGGAQQQQQQKQAKKKRKGVDGAGVAVDGEEQAEEGGGKKEKASSKQRYILFVGNLKYTTTKEAVEKHFAKCDPPPTVRLMTPKPSATSRPTAKSKGFAFVEFSHRNALQQGLKLHQSDLEGRKINVELTAGGGGKSETRLEKVKKRNKELHEQRTKQVLKGASGKKTGGKGAGGAGQDVQLERPQRYSATSGVELVPLKQRTWSVPETGDEEGAAAAKKRGSKKGKNRPPRALGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.84
3 0.84
4 0.84
5 0.79
6 0.82
7 0.76
8 0.71
9 0.69
10 0.67
11 0.64
12 0.64
13 0.67
14 0.65
15 0.67
16 0.65
17 0.62
18 0.6
19 0.52
20 0.45
21 0.4
22 0.34
23 0.31
24 0.27
25 0.22
26 0.15
27 0.14
28 0.12
29 0.13
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.03
46 0.03
47 0.04
48 0.05
49 0.07
50 0.08
51 0.1
52 0.1
53 0.12
54 0.16
55 0.23
56 0.26
57 0.26
58 0.3
59 0.32
60 0.34
61 0.32
62 0.28
63 0.21
64 0.16
65 0.15
66 0.11
67 0.06
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.11
75 0.2
76 0.29
77 0.36
78 0.45
79 0.55
80 0.64
81 0.71
82 0.77
83 0.77
84 0.79
85 0.75
86 0.69
87 0.6
88 0.5
89 0.41
90 0.31
91 0.23
92 0.13
93 0.08
94 0.05
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.08
108 0.09
109 0.15
110 0.23
111 0.26
112 0.33
113 0.41
114 0.46
115 0.54
116 0.63
117 0.68
118 0.7
119 0.77
120 0.77
121 0.79
122 0.78
123 0.73
124 0.71
125 0.63
126 0.54
127 0.45
128 0.37
129 0.28
130 0.21
131 0.15
132 0.07
133 0.04
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.04
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.13
145 0.17
146 0.25
147 0.34
148 0.4
149 0.46
150 0.53
151 0.55
152 0.53
153 0.52
154 0.47
155 0.39
156 0.35
157 0.29
158 0.23
159 0.22
160 0.19
161 0.17
162 0.14
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.19
168 0.22
169 0.28
170 0.3
171 0.29
172 0.32
173 0.31
174 0.3
175 0.28
176 0.3
177 0.28
178 0.27
179 0.28
180 0.27
181 0.29
182 0.29
183 0.32
184 0.3
185 0.3
186 0.31
187 0.3
188 0.28
189 0.28
190 0.3
191 0.29
192 0.33
193 0.32
194 0.36
195 0.39
196 0.42
197 0.41
198 0.43
199 0.4
200 0.39
201 0.35
202 0.29
203 0.29
204 0.27
205 0.33
206 0.29
207 0.29
208 0.25
209 0.24
210 0.24
211 0.21
212 0.22
213 0.16
214 0.18
215 0.2
216 0.19
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.24
224 0.27
225 0.27
226 0.26
227 0.27
228 0.26
229 0.25
230 0.19
231 0.16
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.12
244 0.2
245 0.26
246 0.35
247 0.46
248 0.54
249 0.61
250 0.7
251 0.76
252 0.74
253 0.79
254 0.81
255 0.82
256 0.84
257 0.78
258 0.73
259 0.74
260 0.7
261 0.6
262 0.55
263 0.46
264 0.4
265 0.45
266 0.47
267 0.42
268 0.44
269 0.44
270 0.42
271 0.42
272 0.4
273 0.32
274 0.27
275 0.22
276 0.21
277 0.24
278 0.2
279 0.18
280 0.16
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.15
287 0.16
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.22
292 0.23
293 0.23
294 0.25
295 0.25
296 0.25
297 0.24
298 0.26
299 0.23
300 0.22
301 0.27
302 0.23
303 0.23
304 0.24
305 0.25
306 0.26
307 0.32
308 0.34
309 0.3
310 0.31
311 0.33
312 0.33
313 0.32
314 0.29
315 0.22
316 0.19
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.1
321 0.11
322 0.13
323 0.2
324 0.26
325 0.36
326 0.46
327 0.56
328 0.66
329 0.75
330 0.83
331 0.88
332 0.92
333 0.92
334 0.91
335 0.88
336 0.83
337 0.77
338 0.69
339 0.64
340 0.6
341 0.5