Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3P4H8

Protein Details
Accession A0A5C3P4H8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-37VGPVRSKSKRGRTSEPYARPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-32SKSKRGRTSE
36-39RPAP
245-268GRGGRGRGRGRGRRRGGARGGGAR
Subcellular Location(s) mito 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MASLLERISLPNGAAPAVGPVRSKSKRGRTSEPYARPAPRPPKGDVEGTWKHDLFISDRSLSARLTNAPPVPKMNFGIADKALRDALGDKGLSIKGASSRGNVVQVAGLAKGTTAADVEAIFKRCGAITSAVLQSTGAGAEPVVRLTYKHEKDAQAAVAKFDGQPADGRTLAVRIVGGVNATLSGRIGAALVEGSVDVLMGDEGGVGSKLRSDELLATDSRAHVLVAPPGTDPKEYTQGPAPAQGRGGRGRGRGRGRRRGGARGGGARMEVDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.13
4 0.14
5 0.15
6 0.14
7 0.17
8 0.26
9 0.3
10 0.37
11 0.42
12 0.52
13 0.6
14 0.66
15 0.73
16 0.71
17 0.78
18 0.82
19 0.8
20 0.76
21 0.73
22 0.7
23 0.65
24 0.67
25 0.66
26 0.63
27 0.6
28 0.57
29 0.58
30 0.57
31 0.58
32 0.5
33 0.49
34 0.48
35 0.49
36 0.5
37 0.41
38 0.38
39 0.36
40 0.34
41 0.28
42 0.27
43 0.25
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.22
48 0.21
49 0.2
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.23
54 0.24
55 0.26
56 0.27
57 0.29
58 0.29
59 0.28
60 0.27
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.25
65 0.22
66 0.22
67 0.19
68 0.19
69 0.17
70 0.13
71 0.13
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.07
106 0.09
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.11
134 0.2
135 0.21
136 0.24
137 0.28
138 0.29
139 0.32
140 0.34
141 0.31
142 0.26
143 0.25
144 0.22
145 0.18
146 0.17
147 0.15
148 0.14
149 0.11
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.12
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.03
186 0.03
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.1
201 0.13
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.18
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.26
222 0.25
223 0.28
224 0.31
225 0.34
226 0.34
227 0.4
228 0.37
229 0.31
230 0.34
231 0.34
232 0.32
233 0.31
234 0.36
235 0.33
236 0.4
237 0.45
238 0.51
239 0.58
240 0.64
241 0.7
242 0.75
243 0.77
244 0.79
245 0.78
246 0.78
247 0.75
248 0.73
249 0.7
250 0.66
251 0.61
252 0.53
253 0.48