Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N3D6

Protein Details
Accession A0A5C3N3D6    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-59AKEPASGKTKKKKVKTNIVYSQPAHydrophilic
242-269LAPRGAATKKKGKKNAPRQRQARITNVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-49AKEPASGKTKKKKV
245-261RGAATKKKGKKNAPRQR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MASVNSLHRPDYTAWASNPAPAAPAEASSPKQNGGAKEPASGKTKKKKVKTNIVYSQPADTGTGVNVNTQLLYAVSHLKSNPGPMRLQDIAIITNTPLDTDRVLLEKFRSHDRIEYNPKNETYSYKHDYTFNNKAALLTEIQKHTRHGGGLSIRSLKESWKEATQAVEELEQEGEVYVTRTQKDGQPRMVFWNEVKSSQEGEGRPVEKEFQDLWRSLTVPEEPDLIRQLASEGLQATAAESLAPRGAATKKKGKKNAPRQRQARITNVHLKGQIDLSRDYVPQGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.36
3 0.36
4 0.35
5 0.34
6 0.26
7 0.23
8 0.18
9 0.2
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.17
14 0.19
15 0.22
16 0.24
17 0.22
18 0.26
19 0.29
20 0.29
21 0.31
22 0.37
23 0.33
24 0.37
25 0.39
26 0.39
27 0.42
28 0.45
29 0.48
30 0.51
31 0.6
32 0.63
33 0.7
34 0.75
35 0.8
36 0.85
37 0.86
38 0.86
39 0.85
40 0.84
41 0.8
42 0.71
43 0.62
44 0.51
45 0.42
46 0.32
47 0.24
48 0.17
49 0.12
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.16
66 0.17
67 0.23
68 0.26
69 0.24
70 0.25
71 0.24
72 0.31
73 0.28
74 0.28
75 0.23
76 0.2
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.16
95 0.21
96 0.23
97 0.22
98 0.27
99 0.29
100 0.37
101 0.43
102 0.48
103 0.46
104 0.46
105 0.45
106 0.43
107 0.4
108 0.35
109 0.3
110 0.31
111 0.33
112 0.31
113 0.32
114 0.34
115 0.36
116 0.4
117 0.42
118 0.37
119 0.33
120 0.31
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.18
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.13
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.16
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.05
164 0.07
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.16
170 0.26
171 0.3
172 0.35
173 0.36
174 0.37
175 0.42
176 0.42
177 0.4
178 0.31
179 0.35
180 0.28
181 0.26
182 0.27
183 0.22
184 0.22
185 0.23
186 0.27
187 0.19
188 0.21
189 0.25
190 0.25
191 0.24
192 0.23
193 0.23
194 0.19
195 0.22
196 0.2
197 0.21
198 0.23
199 0.23
200 0.24
201 0.24
202 0.24
203 0.21
204 0.22
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.17
213 0.15
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.1
233 0.15
234 0.22
235 0.29
236 0.38
237 0.46
238 0.56
239 0.66
240 0.73
241 0.79
242 0.84
243 0.88
244 0.89
245 0.91
246 0.89
247 0.9
248 0.89
249 0.84
250 0.82
251 0.78
252 0.75
253 0.74
254 0.7
255 0.65
256 0.58
257 0.52
258 0.45
259 0.44
260 0.39
261 0.33
262 0.31
263 0.29
264 0.29
265 0.28